Module 10: Aérovirologie Flashcards

1
Q

Les virus sont-ils des êtres vivants? Argumentez.

A

Les virus sont à la limite du vivant et du non-vivant pour les raisons suivantes:

  • Possèdent ADN ou ARN (contrairement à deux)
  • Parasites intracellulaires obligatoires (incapables de reproduction autonome)
  • Aucun gène de métabolisme ou de production d’énergie

Exceptions: Rickettsies et autres bactéries parasites obligatoires

Certains disent que les virus sont vivants lorsqu’ils se multiplient dans les cellules de l’hôte et sont inertes lorsqu’ils sont à l’extérieur des cellules hôtes.

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2
Q

Décrivez la composition et la nature des virus.

A
  • 10 à 400 nm
  • Acides nucléiques (ADN ou ARN)
  • Simple brin ou double brin
  • Nucléoprotéines (certains)
  • Capside
  • Enveloppe (certains)
  • Morphologie virale est plus complexe chez les bactériophages
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3
Q

Qu’est-ce qu’un virus?

A
  • Parasite obligatoire
  • Affecte les animaux, les humains, les plantes, les insectes, les bactéries, etc.
  • Virus bactéries: bactériophage
  • Virus libre = virion
  • ADN du virus peut s’intégrer dans l’ADN de l’hôte (chez les bactéries = prophage)
  • Chez les mammifères, 11% du génome est composée de séquences d’origine virale (rétrotransposon)
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4
Q

Expliquez la classification des virus.

A

Elle se fait selon les caractéristiques des virus

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5
Q

Nommez des virus transmissibles par l’air et décrivez les maladies infectieuses associées.

A
  • SRAS

- Fièvre aphteuse

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6
Q

Décrivez le diamètre aérodynamique des particules transportant les virus.

A
  • Le diamètre aérodynamique de la particule portant le virus joue un rôle crucial dans la dissémination
  • La déposition du virus dans l’arbre respiratoire dépend du diamètre aérodynamique
  • Particules > 10 µm = voies respiratoires supérieures
  • Particules < 10 µm = bronches, bronchioles, alvéoles

Une modification du diamètre aérodynamique des particules entraîne une modification du comportement des particules

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7
Q

Nommez des facteurs pouvant influencer le maintien du potentiel infectieux des virus.

A
  • Température
  • Radiations UV
  • Temps d’exposition
  • Humidité relative (↑= favorise les virus nus, ↓ favorise les virus enveloppés; mais ce n’est pas certain)
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8
Q

Nommez les principales méthodes d’échantillonnage et d’analyse des virus dans l’air.

A

Méthodes d’échantillonnage:

  • Impacteurs
  • Filtres
  • Précipitateurs électrostatiques
  • Écouvillonnage de surfaces
  • Échantillonnage par sédimentation
  • Utilisation d’animaux sentinelles

Notez que les principes physiques impliqués dans la récupération des particules sont différents selon la grosseur, qui peut varier entre 10 nm et 100 µm

Méthodes d’analyse des échantillons:

  • Culture
  • Biologie moléculaire
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9
Q

Décrivez ce qu’est un virus modèle et discutez de leurs limites.

A
  • Les bactériophages sont utilisés à titre de modèles viraux depuis plusieurs années
  • Certains phages possèdent des structures similaires à celles des virus eucaryotes
  • Plusieurs bactériophages sont enveloppés
  • Bactériophages MS2 et PhiX174 sont capables d’infecter E. coli et sont ainsi fréquemment utilisés
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10
Q

Décrivez le fonctionnement de la méthode d’échantillonnage suivante: impacteur.

A
  • Accélèrent l’air et provoquent la collision des particules dans une solution ou sur une surface de collection
  • Les impacteurs liquides sont les plus souvent utilisés (AGI-30, SKCbiosampler)
  • Perte de l’infectivité des particules virales souvent déplorée
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11
Q

Décrivez le fonctionnement de la méthode d’échantillonnage suivante: bioaerosols sampler de NIOSH (modèle BC251).

A
  • Impacteur par centrifugation à 3 étages
  • Répartition de bioaérosols selon le diamètre aérodynamique (débit d’air 2-3.5 L/min)

Étage 1: > 4 µm
Étage 2: 1 - 4 µm
Étage 3: < 1 µm

Très prometteur pour détecter des virus respiratoires dans l’air

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12
Q

Décrivez le fonctionnement de la méthode d’échantillonnage suivante: filtration.

A
  • Filtres poreux: pores de dimension connue, polycarbonate
  • Filtres fibreux: permettent de recueillir des particules plus petites que les dimensions des pores, polytetrafluoroéthylène
  • Filtres de gélatine: plus efficaces pour préserver l’intégrité des particules virales, plus fragiles à manipuler

Les filtres PTFF (fibreux) sont recommandés si la conservation du pouvoir infectieux n’est pas nécessaire.

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13
Q

Décrivez le fonctionnement de la méthode d’échantillonnage suivante: précipitateurs électrostatiques.

A
  • Les particules sont chargées à l’entrée de l’appareil puis récoltées par attraction électrostatique

Inconvénient: génération d’ozone qui possède des propriétés virucides

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14
Q

Décrivez le fonctionnement de la méthode d’échantillonnage suivante: précipitateurs électrostatiques.

A
  • Les particules sont chargées à l’entrée de l’appareil puis récoltées par attraction électrostatique

Inconvénient: génération d’ozone qui possède des propriétés virucides

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15
Q

Comment mesurons-nous l’efficacité des échantillonneurs?

A
  • Utilisation de traceurs: molécules fluorescentes ou radioactives, co-aérosolisation des traceurs et des particules, permettent ‘utilisation de nouveaux échantillonneurs
  • Emploi de compteurs de particules en amont et en aval de l’échantillonneur
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16
Q

Décrivez la méthode d’analyse d’échantillons suivante: la culture.

A
  • Particule virale doit être intacte
  • Mise en contact de la cellule hôte (cellule eucaryote ou bactérie) et l’échantillon de bioaérosols
  • Lyse des cellules indique la présence de virus intacts dans l’échantillon
17
Q

Décrivez la méthode d’analyse d’échantillons suivante: la biologie moléculaire.

A
  • Extraction et purification des acides nucléiques de l’échantillon (ADN ou ARN total)
  • Détection et quantification par PCR des virus à l’aide d’amorces spécifiques

Il est important de noter qu’il n’existe par d’amorces universelles pour détecter et quantifier les virus