Module 1 : Introduction à la biochimie Flashcards
Quel est le nom de la doctrine dans laquelle il était cru que les êtres vivants utilisaient la force « vitale »?
Vitalisme
Quelle est l’unité fondamentale à la vie?
La cellule
Comment est appelé le contenu intracellulaire d’une cellule?
Cytoplasme
Comment est appelé la partie aqueuse du cytoplasme?
Cytosol
Quelles sont les principales différences des cellules procaryotes et eucaryotes?
Procaryotes : N’ont pas de noyau et d’organites, petites cellules, unicellulaires
Eucaryotes : Présence d’un noyau et d’orgnaites, grosses cellules, unicellulaires et pluricellulaires
Quels sont les organismes vivant les plus abondants sur Terre?
Procaryotes
Dans quelle région d’une cellule procaryote se trouve le matériel génétique?
Nucléoïde
Comment se différencient les cellules végétales des cellules animales?
Présence de chloroplaste et d’une paroi cellulaire
Quelles sont les principales similarité entre toutes les cellules?
1 - Constituées à partir des mêmes molécules
2 - Utilisent le même code génétique
3 - Sentiers métaboliques centraux similaires
Quels sont les six éléments chimiques principaux?
Carbone (C), Hydrogène (H), Oxygène (O), Azote (N), Phosphore (P), Soufre (S)
Que sont les groupements fonctionnels?
Regroupements d’atomes à l’intérieur d’une molécule qui forme la partie réactive d’une molécule
Quelles propriétés particulières d’une molécules sont déterminés par les groupements fonctionnels?
Réactivité chimique
Solubilité
Odeur
Degré d’absorption de la lumière
Comment est formé un groupement hydroxyle?
R-OH
Quelles biomolécules sont un groupe caractérisées par la présence d’un groupement hydroxyle?
Glucides
À quoi correspond un groupement carbonyle?
Un atome de carbone et un atome d’oxygène liés entre eux par une double liaison
Comment est formé un groupement carbonyle aldéhyde?
H
|
R-C=O
Comment est formé un groupement carbonyle cétone?
H
||
R-C-R’
Quelles biomolécules sont un groupe caractérisées par la présence d’un groupement carbonyle?
Aldéhyde : Glucides (aldoses)
Cétone : Glucides (cétoses)
Pourquoi la distinction entre les groupement carbonyles aldéhydes et cétones est-elle importante?
Il s’agit de la base de la classification des glucides
À quoi correspond un groupement carboxyle?
Un carbone lié à un groupement hydroxyle et à un oxygène par une double liaison
Comment est formé un groupement carboxyle?
O
||
R-C-OH
Quelles biomolécules sont un groupe caractérisées par la présence d’un groupement carboxyle?
1 - Lipides de types gras
2 - Acides aminés
Comment est formé un groupement amine?
H H
| ET |
R-N-H R-N-R’
Quels sont les deux types de groupements amines?
Amine primaire : R - Azote - Hydrogène
Amine secondaire : R - Azote - R’
Quelles biomolécules sont un groupe caractérisées par la présence d’un groupement amine?
Amine primaire : acides aminés
Amine secondaire : proline
Comment sont formé les groupements phosphate et phosphoryle?
O
||
R-O-P-O~
|
O~Quelle est la différence entre un groupement phosphate et un groupement phosphoryle?
Phosphate : Phosphore lié à 4 oxygène
Phosphoryle : Phosphore lié à 3 oxygène
Quelles biomolécules sont un groupe caractérisées par la présence des groupements phosphate et phosphoryle?
Principalement : Acides nucléiques
Parfois : Lipides, Acides Aminés et glucides
Comment appelle-t-on aussi les groupements sulfhydryles?
Groupement thiol
À quoi correspond un groupement sulfhydryle (ou thiol)?
Atome de soufre lié à un atome d’hydrogène
Comment est formé un groupement sulfhydryle (ou thiol)?
R-SH
Quelle biomolécule est caractérisée par la présence d’un groupement sulfhydryle (ou thiol)?
1 acide aminé : Cystéine
Quels sont les composés, autres que les groupements fonctionnel, important en biochimie?
Certains composés cycliques contenant de l’azote
Où trouve-t-on le composé cyclique suivant :
Imidazole
1 acide aminé : Histidine
Où trouve-t-on le composé cyclique suivant :
Indole
1 acide aminé : Tryptophane
Où trouve-t-on le composé cyclique suivant :
Prymidine
Acides nucléiques : Thymine, Cytosine, Uracile
Où trouve-t-on le composé cyclique suivant :
Purine
Acides nucléiques : Adénine, Guanine
Quelle est la structure des liens amides?
O
||
R-C-N-R'
|
HOù trouve-t-on les liens amides?
Liaisons peptidiques (protéines)
Quelle est la structure des liens esters?
O
||
R-C-O-R’
Où trouve-t-on les liens esters?
Acylglycérol (lipides)
Quelle est la structure des liens éthers?
R-O-R’
Où trouve-t-on les liens éthers?
Liens O-glycosidiques (Liaisons osidiques) (Glucides)
Quelle est la structure des liens esters phosphoriques (phosphoesters)?
O
||
R-O-P-OH
|
OHOù trouve-t-on les liens esters phosphoriques (phosphoesters)?
Protéines phosphorylées
Quelle est la structure des liens phosphodiesters?
O
||
R-O-P-O-R'
|
OHOù trouve-t-on les liens phosphodiesters?
Nucléotides (acides nucléiques)
Phospholipides (lipides)
Quelle est la structure des liens phosphoanhydrides (anhydrides phosphoriques)?
O O
|| ||
R-O-P-O-P-OH
| |
OH OHOù trouve-t-on les liens phosphoanhydrides (anhydrides phosphoriques)?
Nucléotides (acides nucléiques)
Quelle est la structure des liens sulfures (thioéthers)?
R-S-R’
Où trouve-t-on les liens sulfures (thioéthers)?
1 seul acide aminé : Méthionine
Quelle est la structure des liens disulfures?
R-S-S-R’
Où trouve-t-on les liens disulfures?
Pont disulfure (protéines) Liens Cystéine-Cystéine
Quelle est la structure des liens thioesters?
O
||
R-C-S-R’
Où trouve-t-on les liens thioesters?
Acétyl-CoA
Comment se forme une liaison covalente?
Mise en commun d’une paire d’électron
À quoi servent les liaisons covalentes?
Maintient des atomes à l’intérieur d’une molécule
Comment appelle-t-on la tendance qu’on certains atomes d’attirer vers eux les électrons impliqués dans un liens covalent?
Électronégativité
Comment appelle-t-on le lien formé lorsque deux atomes montrant une grande différence d’électronégativité forment un lien covalent?
Liens polaires
Comment appelle-t-on la distribution inégale des charges?
Dipôles
Quels groupements fonctionnels sont polaire?
Groupements amines
Groupements hydroxyles
Groupements carboxyles
Groupements carbonyles
Que signifie une charge nette?
Le nombre d’électrons d’un atome est différent du nombre de protons
Quelles sont les 4 types de liaisons non-covalentes?
Liaisons hydrogènes
Liaisons ioniques
Forces de Van der Waals
Interactions hydrophobes
Où trouve-t-on les liaisons hydrogènes?
Entre deux groupements polaires
Quel est le type d’interaction dans une liaison hydrogène?
Dipôle-Dipôle
Où trouve-t-on les liaisons ioniques?
Entre deux groupements fonctionnels de charges nettes opposées
Où trouve-t-on les forces de Van der Waals?
Entre des atomes ou des molécules qui sont très près les un des autres
Où trouve-t-on les interactions hydrophobes?
L’agrégation de ces molécules n’est pas réellement due à une attraction mutuelle, mais plutôt à la réorganisation des clathrates en une seule cage.
Quelles caractéristiques de l’eau rendent cette molécule essentielle à la vie?
Polarité
Capacité à former des liens H
Propriétés thermiques
Différente densité eau/glace
Quelles sont les propriétés de l’eau qui la différencie des autres molécules semblables?
Température de fusion
Température d’ébullition
Chaleur spécifique (capacité thermique)
Chaleur de vaporisation
Pourquoi la glace est-elle moins dense que l’eau?
La glace est moins dense que l’eau liquide, parce que les molécules d’eau ne sont pas libres de se rapprocher les unes des autres.
Pourquoi l’eau est-elle un bon solvant?
Polarité, taille de la molécule, constante diélectrique élevée
Comment appele-t-on la « cage » de molécule d’eau qui se forme autour des molécules non polaire?
Clathrate
Que font les agents chaotrophique?
Augmentent la solubilité des composés non polaires en désordonnant les molécules d’eau, ce qui déstabilise les clathrates
Qu’est-ce qu’une molécule amphipathique?
Contient une portion hydrophile et une autre hydrophobe
Qu’est-ce que la diffusion?
Mouvement aléatoire des molécules de soluté dans une solution
Que favorise l’encombrement moléculaire?
La rencontre entre les réactifs et les enzymes
Qu’est-ce que l’osmose?
Mouvement de l’eau à travers une membrane semi-perméable
Dans quel sens se produit l’osmose?
Les molécules de solvant traversent la membrane de la solution la moins concentrée vers la solution la plus concentrée.
Qu’est-ce que la pression osmotique?
La pression requise pour empêcher le flux de solvant
Quelles sont les deux stratégie pour éviter que la pression osmotique ne devienne trop élevée et que la cellule n’éclate?
1 - La membrane cellulaire réduit jusqu’à un certain point l’entrée massive de solvant.
2- La cellule conserve les biomolécules sous forme de macromolécules complexes. La pression osmotique dépend de la concentration molaire du soluté et non de sa taille.
