Mikrobiologie Flashcards
Karies
Milchsäurebakterien
Scharlach
Streptococcus pyogenes (Milchsäurebakterium)
Milzbrand (Anthrax)
Bacillus anthracis
Lungentuberkulose
Mycobacterium tuberculosis
Cholera
Vibrio cholerae
Färbung von Gram- positiv und negativ
1: Hitzefixierung und Färbung in Jodlösung
2: Kurze Entfärbung in Ethanol. Gram-negativ entfärbt sich.
3. Evt Gegenfärbung mit Safranin
Schichten von Gram-pos und Gram-neg
Pos:
- Peptidoglykan (dicke Schicht)
- Membran
Neg:
- Äußere membran
- Periplasma
- Peptidoglykan (dünne Schicht)
- Periplasma
- Membran
Aufbau des Peptidoglykan
Zwei Zucker, an den einem Lactyl-Rest.
An Lactyl-Rest 5 D-Aminosäuren.
Die Vierte Aminosäure macht Quervernetzung, letzte wird abgespaltet.
Bei Gram-Pos: Oft keine direkte Quervernetzung.
Aufbau des Ribosoms
Kein Organell - keine Membran.
Zwei Untereinheiten: 30s und 50s, aber art ist 70s (basiert auf verhalten in Centrifuge, dh Größen/gewichts Verhältnis)
Große untereinheit hat 3 Räum.
A: neuen tRNA mit Aminosäure bindet hier an mRNA. Macht Peptidbindung zum nächster Aminosäure.
E: Leeres tRNA wird freigegeben.
Verlauf von Translation
Initiation:
- Untereinheiten sind geteilt
- IF binden 30s an mRNA
- Untereinheiten werden vereinigt
In der Großen Untereinheit:
- A-Bereich: Passendes tRNA mit Aminosäure bindet an mRNA. Peptidbindung zw dieser Aminosäure und der Peptidkette (falls nicht die erste)
- E-Bereich: tRNA löst sich von Peptidkette, wird hier freigegeben.
Termination:
- UAG-Codon: Kein passendes tRNA. Hier bindet RF, teilt die Untereinheiten wieder auf.
Fischer-Projektion und Chiralität
2-dimensionale Darstellung eines Organischen Moleküls. Höchst oxidierte Kohlenstoff oben.
- L-Chiral wenn funktionelle Gruppe Links.
- D-Chiral wenn rechts
Grundlegender Aufbau einer Aminosäure
Zeichnung
Wirkung von Penicillinen
Blockieren das aktive Zentrum von Transpeptidase und verhindern Quervernetzung der Peptidoglykane
Resistensmechanismen zu Penicillin
- Veränderung der Tranpeptidase, so dass Penicilline nicht mehr in das aktive Zentrum des Enzyms passen.
- Ausscheiden von Verdauungsenzymen, die Penicilling abbauen.
Enzyme die Spiralisierung der DNA machen
- DNA-Gyrase: Überspiralisiert negativ
- Topoisomerase: Überspiralisiert positiv. Trennung von Tochterchromosomen
DNA-Polymerasen
I und III: Normale DNA-Replikation
II, IV und V: Reparaturprocesse
Bestandteile des Replisoms
- DNA-Helikase: Trennt DNA-Stränge
- DNA-Polymerase III: Katalysiert Nukleotidpaarung und erkennt falsche Paarungen
- Beladungskomplex der Beta-Ringklemme
- Beta-Ringklemme: Hält Mutter und Tochter-Strang zusammen.
- DNA-Primase: Bildet einen Kurzen RNA-Strang, der Ansatz für DNA-Polymerase seien kann.
- SSB: Single Strand Binding Proteins. Verhindern Hydrolyse des Folgestrangs
- Exonuklease: entfernt falsch gepaarte Nukleotide, die von Polymerase erkannt sind.
Strahlenschäden in der DNA
UV-Schaden –> Pyrimidin-Dimere:
Kovalente Verknüpfung von benachtbarten Thymin-Basen oder zw. Thymin und Cytosin.
Polymerase kann hier nicht ablesen - keine Replikation
Röntgen oder Gamma-Strahlung:
Doppeltstrangbruch.
Reparaturmechanismen nach Strahlenschaden
Reperatur Reparatur von Pyrimidindimeren:
Mit Photolylase. Enzym dass Sich auf Schaden legt und bei erneuter UV-Strahlung repariert.
Exzisionsreparatur:
Ausgelöst von SOS-Mechanismus
1: Zucker-Phosphatbindung gelöst
2: Entfernen der beschädigten Nukleotide
3: RNA-Polymerase setzt passende Nukleotide wieder ein.
4: Zucker-Phosphatbindung wieder erstellt von DNA-Ligase.
Homologe Rekombination (Doppeltstrangbruch):
Bakterien sind haploid, aber haben oft mehr Chromosome von DNA-Replikation.
Homologe Gegenden werden genutzt um verlorene Information bei Doppelstrangbruch zu ergänzen.
Wie wird ein SOS-Mechanismus ausgelöst und welche Mechanismen werden verwendet?
Viele Strahlenschäden –> DNA-Replikation geht nicht, photolylase nicht ausreichend.
Regurlierer:
LexA: Repressor von SOS-Genen
RecA: Bindet an freien Einzelsträngen. Viele hiervon bei sehr beschädigten DNA.
RecA bindet zufällig an LexA –> LexA wird gelöst, expression der SOS-Gene.
Mechanismen:
- Priorität: Exzisionsreparatur
2: DNA-Polymerase V. Kann Trotz UV-Schaden Strang ablesen, ist aber nicht selektiv. Eher Überlebungsmechanismus als Reparaturmechanismus.