microbiome et sciences omiques

Question 1

quels sont les 4 niveaux d’analyse omique?

Answer 1

génomique, transcriptomique, proteomique, metabolomique

Question 2

quel niveau d’analyse omique est le plus proche du phénotype ?

Answer 2

metabolomique

Question 3

quels sont les deux niveaux d’analyse omique qui sont fait avec du séquencage ?

Answer 3

genomic et transcriptomic

Question 4

quels sont les deux niveaux d’analyse omique qui sont fait avec la spectrométrie de masse?

Answer 4

proteomic et metabolic

Question 5

quel est le concept général de la génomique?

Answer 5

détecter le monomère à chaque position 1 nucleotides à la fois

Question 6

comment marche la méthode de Sanger mais avec des nucléotides fluorescents?

Answer 6

salon le pic de fluorescence créer par les nucléotides fluorescents on peut déterminer la séquence d’un gène

Question 7

comment marche le séquençage de génomes à l’ancienne ?

Answer 7

on clone les vecteurs plusieurs fois pour ensuite les briser en petit morceaux et des rassembler selon leurs séquences qui se chevauche

Question 8

pourquoi devrions nous s’intéresser au séquencage ?

Answer 8

• voir les différences entre les espèces
• voir les différences dans une meme espèce
  -voir les différences dans les cellules humaines provenant du meme corps
• decrier les mechanisms cellulaires

Question 9

quels sont les 4 types d’expériences avec le séquencage et leurs caractéristiques?

Answer 9

• transcriptomics: analyser l’expression des gènes
• miRNomics: étude des micro ARN qui aide à la régulation
• epigenomics: étudie les protéines structurelles
• genomics: détermine les séquences des gènes

Question 10

quel est un étude de protéomique ?

Answer 10

étude d’un contenu en protéine d’un échantillon

Question 11

les protéines sont séparer par quel deux facteurs en protéomique?

Answer 11

point isoélectrique et le poids moléculaire

Question 12

quels sont les deux approches à la protéomique ?

Answer 12

• quantification, digestion, spectromètre de masse
  -digérer, séparer, spectromètre de masse

Question 13

comment preparons-nous les échantillons en protéomique?

Answer 13

extraction de proteines d’un tissu ou des cellules puis on les digère en peptides

Question 14

quel est une analyse metobolomique?

Answer 14

études des petites molécules dans un fluide biologique ou est-ce qu’on va rechercher des liens entre un phénotype et le métabolisme

Question 15

la spectrometrie de masse est une méthodes exoerimentale qui permet …..

Answer 15

de mesurer des molecules ou des métabolites dans un échantillon

Question 16

un spectrometre de masse quantifie les métabolites en fonction de quoi?

Answer 16

masse et charge

Question 17

la métabolomique ciblée est utiliser pour quoi?

Answer 17

mesurer précisément le nombre de métabolites dans un échantillon

Question 18

la métabolomique non-ciblée permet quoi?

Answer 18

permet d’avoir une image de l’ensemble des métabolites

Question 19

quel est la définition de microbiome?

Answer 19

le microbiote et son environnement

Question 20

vrai ou faux: le microbiote reste pareille dans chaque partie du corps

Answer 20

faux! il diffère selon sa localisation

Question 21

certains appellent le microbiote notre deuxième génome, pourquoi?

Answer 21

parce-qu’il y aurait plus de genes dans notre microbiote intestinale que dan notre génome

Question 22

quel est l’abondance relative d’un microbiome?

Answer 22

la distribution relative des espèces dans le microbiome

Question 23

quel est la richesse du microbiome?

Answer 23

nombre d’espèces trouvés dans un microbiome

Question 24

quel est l’équitabilité du microbiome?

Answer 24

répartition des individus dans le microbiome

Question 25

quel est une bonne équitabilité dans un microbiome?

Answer 25

lorsque tout les bactéries se ressemble en nombre, il ne doit pas en avoir une qui domine

Question 26

la diversité microbienne combine quel notions?

Answer 26

notions d'équitabilité et de richesse

Question 27

en quoi consiste l'identification des espèces bactériennes par le 16S?

Answer 27

comparer leur ARNr 16s et comme ca on est capable des identifier et de connaitre combien il en a

Question 28

l'analyse métagénomique est utiliser pour faire quoi?

Answer 28

- déterminer a qui appartient les différents fragments et donc d'identifier les bactéries présente

Question 29

pourquoi est-ce que la culture microbienne ne donne pas toujours des résultats représentatifs ?

Answer 29

parce-que certaine bactérie sont très représenté en culture mais ils sont peu abondant dans le microbiome

Question 30

vrai ou faux: connaitre un seul microbiome peut en dire beaucoup?

Answer 30

faux

Question 31

quel sont les rangs taxonomiques de général à spécifique ?

Answer 31

phylum, classe, ordre, famille, genre, espèce

Question 32

a la naissance notre microbiome est dominé par quel bactéries?

Answer 32

bifidobactéries

Question 33

a l'age adulte notre microbiome est dominé par quoi?

Answer 33

bacteriodetes et firmicutes

Question 34

à des âges avancés la diversité du microbiome ___________

Answer 34

diminue

Question 35

inoculation de la peau du bebe est faite par quoi lors d'une naissance naturelle? une césarienne?

Answer 35

1. microbiome vaginal et fécal de la mere 2. peau de la mère et environnement

Question 36

le microbiome du nouveau-né dépend de quoi?

Answer 36

- mode de naissance - âge gestationnel - hospitalisation - antibiotiques -nutrition

Question 37

lors de l'allaitement, le lait est enrichi en quoi?

Answer 37

bifidobactéries

Question 38

les olisaccharides du lait humain a un effet pré biotique sur le microbiome, pour quoi?

Answer 38

parce-qu'ils ne sont pas directement absorbés par l'intestin donc le microbiome va sélectionner des bactéries qui vont digérer les oligosaccharides pour que l'enfant puissent les absorber

Question 39

il y'a une différence entre les gens et les âges selon quoi?

Answer 39

- modification du mode de vie - comportements nutritionnels - maladies - médication -environnement de vie

Question 40

lors d'un dysbiose le microbiome est déstabilisé par quoi?

Answer 40

un stress, réduction des bactéries importantes, augmentation des bactéries opportunistes

Question 41

que sont les prébiotique, pro biotique, et les post biotique ?

Answer 41

pré: nutriment qui module la flore microbienne pro: souche de bactérie considérée comme bénéfique utilisée pour prévention ou comme médicament post: métabolites produits par les bactéries qui ont un effet sur l'hôte

Question 42

quels sont les fonctions du microbiome?

Answer 42

- contribuent à la nutrition - développement du système immunitaire - effet barrière (protection contre pathogènes) - axe cerveau-intestin (

Question 43

quel sont les fonctions possible des métabolites produites par le microbiote?

Answer 43

- favoriser communication entre bactéries pour qu'Elles collaborent - controler la composition du microbiote - complementer les fonctions de l'hôte (métabolisme, immunité

Question 44

comment est-ce que le microbiote peut contrôler sa composition? avec quels métabolites?

Answer 44

les microbes résidentes vont inhiber certains pathogénes, avec de l'Acide lactique, peroxyde d'hydrogène, bacteriocines, et autres antimicrobiens

Question 45

comment est ce que les bactéries du microbiote peuvent réguler la fonction immunitaire ?

Answer 45

-certaines bactéries sécrètent des métabolites qui vont moduler les cellules immunitaires (macrophages, cellules dendritique, lymphocytes) - batteries gentilles vont aussi réduire l'inflammation intestinale en émoussant l'effet de cytokines et autres molécules pro-inflammatoire

Question 46

comment est ce que les bactéries du microbiome améliore la barrière intestinale ?

Answer 46

sécrétes metabolites qui modulent la fonction des cellules épithéliales de l'intestin

Question 47

de metabolites peuvent moduler la fonction des cellules épithéliales de l'intestin en faisant quoi?

Answer 47

- favorisant la sécrétion de mucus protecteur - améliorant la jonction entre les cellules - favorisant la sécrétion de molecules comme les IgA

Question 48

la dégradation des sucres complexes est _______________________ du microbiome

Answer 48

une fonction importante

Question 49

l'influx de glycans alimentaires module quoi?

Answer 49

la composition et activité du microbiote

Question 50

quels sont les étapes de la digestion de l'Amidon ?

Answer 50

1. amidon est brisé en oligosaccharides 2. oligo sont importés entre les membranes externes et internes via un pore membranaire 3. oligo sont briser en monosaccharide 4. monosaccharides sont importés par un pore dans la membrane interne

Question 51

pourquoi avons- nous besoin de l'aide des bactéries pour digérer certaine glycans ?

Answer 51

parce-que nous n'avons pas tout les enzymes nécessaires pour digérer tout les glycans

Question 52

quels bactéries coopèrent pour digérer les glycans du lait maternel? ils métabolisent quoi exactement?

Answer 52

lactobacillus ( monosaccharides) et bifidobacterium (oligosaccharides)

Question 53

lorsqu'on donne la Digoxine comme médicament on recommande de manger quoi en meme temps? pourquoi?

Answer 53

diète riche en acides-aminés et protéines parce que ca réduit l'Expression de l'enzyme qui dégrade la digoxine ce qui peut être mortel

Question 54

un microbiote avec une diversité basse ou haute sera affecter le plus par un antibiotique ?

Answer 54

diversité basse

Question 55

quels sont les trois étapes facile du microbiome et le cancer?

Answer 55

1. inflammation chronique 2. génotoxicité 3. cancer

Question 56

quel est le lien entre le micorbiome et le cancer colorectal?

Answer 56

lorsque le microbiote changera il y aura un dysbiose et des bactérie associés avec le cancer colorectal vont apparaitre, l'épithélium du colon sera détériorer et il y aura infiltration de mauvaise bactéries qui vont favoriser des mutations dans l'épithelium

Question 57

qu'est-ce qui a été démontré par les souris sans microbiome et l'obésité ?

Answer 57

pas de microbiome = pas d'obésité

Question 58

quel sont les mécanismes d'Action du microbiote qui favorise l'obésité?

Answer 58

- augmente énergie générée par diete - reprogramme genes du colon - modifie production des molecules bioactives - augmente perméabilité intestinale - induit inflammation chronique

Question 59

une microbiome intestinal en santé va produire des acides gras à courte chaine qui favorisent quoi?

Answer 59

- intégrité intestinale - homeostasie energetique -reduction de l'inflammation -réparation des tissus

Question 60

un microbiome intestinal du diabète de type 2 va produire quel molécule associés avec la dysfonctionnelle métabolique et l'inflammation?

Answer 60

LPS, sulfate hydrogène