Microbiome Flashcards
Définition du microbiome
Totalité des microorganismes associés à un hôte
- Symbiotique ou commensal ou pathogénique
Espèces du microbiome (général)
Bactéries, virus, champignons
Masse du microbiome
200g
Vrai ou faux,
Microbiome comporte davantage de cellules que le corps humain
Vrai
Nombre d’espèces
10 000 espèces (100x plus de gènes que le génome humain)
Vrai ou faux,
Le microbiome est plastique, mais retourne à un “état de base”
Vrai
Vrai ou faux,
Les mêmes fonctions sont forcément exécutées par les mêmes espèces dans tous les contextes
Faux,
Les mêmes fonctions ne sont pas forcément exécutés par les mêmes espèces dans différents contextes
Estomac
Acid challenge
Petit intestin
- Site primaire de contact: bile et enzymes pancréatiques
- Peyer’s patch: site majeur de l’immunité adaptative
Colon (intestin large)
Bioreacteur: Forte activité métabolique
Petite chain d’acides gras
Classification du microbiome
En phylae
Dominance de quelles espèces dans le microbiome
Firmuicutes et bacteroidetes (à proportion variable)
Firmicuites
-Clostridia, Bacillli
- Gram +
- Anaerobes
Bacteroidetes
- Gram -
- Forment pas de spores
- Anaerobes ou aerobes
- Très présents dans l’environnement
E. coli
- Pseudomonadota/Proteobacteria
- Composante mineure
- 10% des humains en n’ont pas
- Souche non-pathogènes
Plasticit du microbiome gastro-intestinal
Le microbiome s’acquiert tout au long de l’enfance, pas encore stable
- Traitement antibiotique pendant la grossesse
- Mode d’accouchement (prevotella, lactobacillus)
- Allaitement (Bifidobacterium)
Vrai ou faux,
Le microbiome adulte est relativement stable
Vrai,
Les modifications sont passagères, après retourne à l’état de base
Rôle potentiel du cecum/appendix dans la stabilité du microbiome
En cas de diarrhée, l’appendice contiendrait un inoculum pour la reconstitution d’un microbiome sain
Fonctions bénéfiques du microbiome gastro-intestinal
- Colonisation
- Métabolisme
- Éducation immune
- Pré-digestion
- Production de vitamines
Fonctions nuisibles du microbiome gastro-intestinal
- Pas de colonisation
- Microbes pathogéniques
- Modulation immune (IBD)
Principaux aspects métaboliques du microbiome
1) production de vitamines
2) Modulation du métabolisme des acides biliaires
3) Digestion de carbohydrates non-digestibles
4) Productions de SCFA
Vitamines
Métabolite essentiel, qui ne peut être synthétisé par l’organisme. Il doit être pris dans la nourriture
Microbiome produit quelles vitamines?
Presque toutes les vitamines hydrosolubles (B12) et Vitamine K
Lieu absorption des vitamines de la nourriture
Ileum
Lieu synthèse des vitamines par le microbiome
Colon
Modulation du métabolisme s’Acides biliaires
Recirculation enterohépatique
Lieu acides biliaires primaires
Foie
Acides biliaires primaires
- CA
- CDCA
Lieu acides biliaires secondaires
Intestin, transformation effectuée par le microbiome dans le colon
Acides biliaires secondaires
- DCA
- LCA
- UDCA
Poucentage des acides biliaires qui atteignent le colon
1-5%
Cible des acides biliaires
- ligands de récepteurs de signalisation (TGR5 et FXR) = Influent sur l’expression génique
- Ciblent aussi autres récepteurs = propriétés de signalisation différentes
Vrai ou faux,
Les acides biliaires ne peuvent pas entrer la recirculation entérohépatique
Faux
Vrai ou faux,
Les bactéries du microbiome intestinal digèrent des carbohydrates non-digestibles (polymères)
VRai
Ruminants
L’estomac (le rumen) contient un microbiome capable de digérer de la cellulose = bioréacteur
Vrai ou faux,
Les ruminants se nourrissent des sucres dérivés de la cellulose
Faux,
Ils se nourrissent des SFCA
Qu’est-ce qui rend efficace l’absorption des produits bactériens par les ruminants?
La digestion se fait avant l’intestin
Vrai ou faux,
Chez les humains, l’effet des fibres sur le microbiome est plus important
Vrai, effet sur la composition du microbiome
Produits principaux du métabolisme microbien intestinal (fermentation)
SCFA:
- Acetate
- Propionate
- Butyrate
Pourcentage des besoins énergétiques des ruminants dérivés des SCFA
75-80%
Utilisation des SCFA
Alimenter la gluconogénèse, la synthèse de lipides, et le TCA
Carburant principal des colonocytes humains
SCFA
Utilisation des SCFA dans le foie
- Synthèse du cholestérol ou acides gras
- Alimenter la gluconéogénèse
Produits gazeux de la fermentation
H2S, H2, NH4, CH4
Vrai ou faux,
Le liquide cérébrospinal contient des SCFA
Vrai
Probiotiques
- Arrivent bien vivantes dans l’intestin
- Sont détectables dans les selles
- Ont un effet global sur le microbiome intestinal, qui n’est pas bien caractérisé
- Mais l’effet est plutôt transitoire
Vrai ou faux,
La prise de produits probiotique induit une colonisation durable de l’hôte
Faux,
Les lactobacilles ne font pas parti du microbiome normal — retour état de base
