Microbiologie 1 Flashcards
Indices pour évoquer que le patient a une infection
Fièvre, maux de gorge, diarrhée, éruption cutanée, abcès, syndrome d’allure grippal, frissons, rougeur localisée, polyadénopathie, douleur/érythème/gonflement articulaire, pneumonie, augmentation de neutrophiles dans le sang
Contrairement aux eucaryotes, qu’est-ce que les procaryotes n’ont pas?
Noyau, réticulum endoplasmique, appareils de Golgi, mitochondries
Les bactéries ont un chromosome composé…
D’ADN
Ribosome des procaryotes
70S (50S+30S)
Retrouve-on des stérols dans les membranes cellulaires des procaryotes?
Non, sauf chez les mycoplasmes
Que contient la paroi cellulaire des procaryotes?
Protéines et peptidoglycanes
+/- acide téichoique et/ou lipopolysaccharides
acide lipotéichoique
SEULEMENT GRAM +
Reproduction des procaryotes
Asexuée (fission binaire)
Production d’ATP des procaryotes
via membrane cytoplasmique et non mitochondries
Formes de bactéries
Cocci
Bâtonnet (bacille)
coccobacille
spiralé
Étapes de la coloration de Gram et couleurs
Violet de cristal
Fixation au lugol
Décoloration à l’alcool-acétone
Coloration à la safranine
Rouge = négatif
Bleu (purple) = positif
À quoi s’accroche le cristal violet sur les bactéries?
Au peptidoglycane
Qu’ont toutes les bactéries?
Paroi cellulaire Membrane cytoplasmique (sauf mycoplasme) Nucléoïde Cytoplasme Ribosome Inclusion Chromosome (ADN)
Qu’ont certaines bactéries?
Capsule Plasmide Pili Fimbriae Flagelle
Qu’est-ce qui diffère dans les bactéries Gram + et - ?
La paroi cellulaire
La couche de peptidoglycane est plus mince chez les -
Paroi cellulaire entourée d’un espace périplasmatique et membrane externe chez les -
Composantes de la membrane cytoplasmique
2 couches de phospholipides
Protéines structurales
Protéines enzymatiques
Rôle de la membrane cytoplasmique
Production d’ATP
Entrée et sortie de nutriments
Protéines structurales pour la forme (spiralée, droite, légèrement recourbée)
Eucaryotes
Algues, Fungi, Protozoaires, Plantes, Animaux
Paroi bactérienne des Gram -
Membrane externe: phospholipides, LPS, protéines, enzymes
Espace périplasmatique
Peptidoglycane
Protéines de pore: perméation de petites molécules hydrophiles, restreint certains antibiotiques
Appareils sécrétoires (I-IV): transport de protéines à travers les membranes, incluant les facteurs virulents
Membrane cytoplasmique: bicouche de phospholipides
Paroi bactérienne des Gram +
Paroi cellulaire:
Grande couche de peptidoglycane
Acide téichoïque
Acide lipotéichoïque
Membrane cytoplasmique: bicouche de phospholipides
Rôle et constituant des LPS
Lipide A, polysaccharide, antigène O
barrière de protection, activateur de la réponse innée
Rôles du peptidoglycane pour les Gram+
Forme et structure
Protection de l’environnement et du SI
Rôle de l’acide teichoïque
Renforci les murs de la cellule, séquestration des ions calcium
Rôle et constituants de la capsule
Antiphagique
Polysaccharides ou polypeptides (anthrax)
Composant et rôle du biofilm
Protection des colonies de l’environnement, antimicrobiens et réponse de l’hôte
Polysacharrides
Composantes et rôle du pili
Piline et adhesine
Mouvement, chimiotaxie
Comment les bactéries peuvent être pathogènes?
Elles peuvent:
- adhérer à certaines cellules
- Essayer d’échapper au système immunitaire
- Synthétiser des enzymes pour résister au S.I
- Synthétiser des enzymes pour détruire les tissus
- Synthétiser des exotoxines (répercussion locale et à distance)
Quels constituants de la bactérie sont responsables de l’adhésion à l’hôte? (3)
Pili, protéines et acide teichoïque
Composantes de la reconnaissance de la bactérie par l’hôte
Structures externes et peptidoglycane
Composante des anticorps
Protéine A, capsule
Composantes de la phagocytose
Capsule, Protéine M
lipopolysaccharide: Gram + ou -?
-
Endotoxine: Gram + ou -?
-
Sporulation: Gram + ou -?
Certaines +
Capsule: Gram + ou -?
parfois + et -
Sensitivité aux lysozymes: Gram + ou -?
+
Les - sont résistantes
Sensibilité à la péniciline: Gram + ou -?
+
Séchage et disruption physique Gram + ou -?
surtout -
Production d’endotoxine: Gram + ou -?
-
Cocci Gram +
Staphylococcus
Streptococcus
Enterococcus
Cocci Gram -
Neisseria
Moraxella
Bâtonnets Gram +
Bacillus Clostridium Clostridioides Listeria Corynebacterium
Bâtonnets Gram -
Escherichia coli Klebsiella Proteus Salmonella Shigella Yersinia Campylobacter Pseudomonas Haemophilus Bacteroides
Cocci Gram + en amas
Staphylcoccus
Cocci Gram + en paires (ou courtes chaines)
Streptococcus pneumoniae
Cocci Gram + en chaînes
Streptococcus (autres que pneumoniae)
Enterococcus
Bâtonnets Gram + sporulés
Clostridium
Clostridioides
Bacillus
Bâtonnets Gram + non sporulés
Listeria
Corynebacterium
Les bactéries sporulées sont seulement chez certains …
bâtonnets Gram +
Qu’est-ce qu’une bactérie sporulée?
Structure ronde, résistante peut survivre sans nourriture
Passage de la bactérie de la forme végétative vers la forme sporulée lorsque les conditions de survie sont dangereuses
Géloses
Sang de mouton
chocolat
MacConkey
Atmosphères d’incubation
Étuve à air ambiant (21% O2)
Étuve à CO2
Tente anaérobie
Bactéries anaérobies strictes
Clostridium
Clostridioides
Bacteroides
Bactéries aérobies strictes
Pseudomonas
Dans quelle atmosphère la plupart des bactéries peuvent-elles croître?
En aérobie ou anaérobie
Mycobactéries et coloration de Gram
Paroi riche en acide mycolique qui interfère avec la coloration
Mycoplasma et coloration de Gram
Absence de peptidoglycane, donc on ne voit pas
Chlamydia et coloration de Gram
Très petite, non cultivable sur des géloses
se multiplie dans des cellules par des corps élémentaires et corps réticulés
À quoi sert la gélose au sang de mouton?
La croissance de la majorité des bactéries fréquemment impliquées en pathologie humaine
Permet d’initier l’identification des cocci gram positif
Catalase des Cocci Gram +
Positif: staphylococcus (en amas)
Négatif: streptococcus et enterococcus (en paire ou chaîne)
Types d’hémolyse
Bêta: hémolyse complète
Streptocoque
ex. pyogenes (groupe A), agalactiae (groupe B) et dysgalactiae (groupe C et G)
Gamma: absence
Alpha: verdâtre
Manifestations suppuratives de streptococcus pyogenes
- pharyngite
- cellulite
- impétigo
- scarlatine
- syndrome du choc toxique
- mangeuse de chair
Manifestations non suppuratives de streptococcus pyogenes
Rhumatisme articulaire aigu avec critère de Jones: - arthrite - atteinte cardiaque (valve mitrale) - nodules - érythème marginé - chorée de Sydenham
Glomérulonéphrite
Anticorps de streptococcus pyogenes
Anti-Streptolysine O (ASO)
Cocci Gram + / Test catalase négatif / Colonies alpha hémolytiques
Streptococcus pneumoniae ou Streptococcus viridans
Pneumocoque et Streptococcus viridans: capsule, optichin et bile
Pneumocoque: capsule=armure
Sensible à l’optochin
Lysé par la bile
Streptococcus viridans: résistant à l’optochin
Pas lysé par la bile
Maladies de pneumocoque
MOPS
Méningite
Otite
Pneumonie
Sinusite
Maladies de Streptococcus viridans
Endocardite (valve mitrale surtout)
Caries dentaires
Cocci Gram + et test positif à la catalase: comment différencier ensuite?
Staphylococcus
Test à la coagulase
Positif: aureus
négatif: epidermis ou saprophyticus
Qu’est-ce que le microbiote?
L’ensemble des micro-organismes sur un site donné: la peau, les narines, la tractus génito-urinaire, etc.
Qu’est-ce que le microbiome?
L’ensemble des micro-organismes et de leurs gènes sur un site donné
Qu’est-ce que le microbiome central?
Espèces bactériennes présentes chez plus de 95% des humains à un site
La majorité des bactéries à un site
Moins varié que le microbiome secondaire
Qu’est-ce que le microbiome secondaire?
Espèces bactériennes qui diffèrent d’un individu à l’autre
Grande variété d’espèces
Chaque espèce est en plus petite quantité comparativement au microbiome central
Microbiome central de la peau
Staphylococcus epidermidis
Corynebacterium
Propionbacterium
Microbiome central de la bouche
Streptococcus
Neisseria
Corynebacterium
Microbiome central du côlon
Escherichia coli
Enterococcus
Bacteroides
Microbiome central du vagin
Lactobacillus
Par quoi est influencé le microbiome de la peau
La présence de glandes sébacés et de l’humidité
le sexe
Retrouve-on beaucoup de bactéries dans l’estomac?
Non, comparément au côlon
Microbiote du tractus digestif
Diversité et quantité de bactéries varient selon le segment du tube digestif
10^14 bactéries
plus de 500 espèces: majorité non cultivables, identifiés surtout pour séquençage moléculaire
Rôles du microbiote intestinal
Fonctions métaboliques
- grosses molécules d’hydrate de carbone (ex. cellulose) en petite molécules (acétate, propionate et butyrate) facilement absorbés par les cellules hôtes
- acides comme acétate, propionate et butyrate limitent la croissance de certaines bactéries indésirables
Stimule l’immunité innée
Prévient la colonisation par des bactéries pathogènes
Protège contre certaines infections entériques
Comment le microbiote protège-il contre certaines infections entériques?
I. en tapissant la muqueuse et en consommant les nutriments (affame les pathogènes)
II. En stimulant la production de mucine, d’immunoglobine IgA et des peptides antimicrobiens (AMPs)
III. En stimulant la production d’IL-22 (+ résistance cell épithéliales) et d’IL-1bêta (+ recrutement de cellules inflammatoires)
Facteurs externes qui influencent le microbiote
Hygiène personnel
Diète
Eau (chlore vs eau de pluie)
prise d’antibiotique
Diarrhée à Clostridioides difficile (DACD)
Prise d’antibiotique qui altère la flore normale du côlon
Prolifération du C. difficile (perte de compétition alimentaire)
C. difficile produit toxines responsables de la diarrhée
Colite ulcéreuse
Prolifération de la bactérie Akkermansia muciniphila qui produit sulfatase qui dégrade couche de mucine
Augmentation de Provotellaceae qui produit chemokines inductrices d’inflammation
Maladie céliaque liée à la dysbiose
Entéropathie au gluten
Dysbiose liée au vagin
Vaginite à Candida
En quoi l’obésité peut être liée à la dysbiose?
Bactéries intestinales plus efficaces à transformer des gros hydrates de carbone en petites molécules facilement absorbables
Que permet une symbiose du microbiote gastro-intestinal? (3)
Tolérance immune
Homéostasie intestinale
Métabolisme sain
Que peut causer une dysbiose du microbiote gastro-intestinal? (3)
Maladie de système immunitaire (atopie, asthme, sclérose en plaque)
Maladie intestinale (maladie inflammatoire de l’intestin, entérocolite nécrosante du nouveau-né)
Maladie métabolique (diabète, obésité)
Que sont les probiotiques? Que contiennent-ils généralement? De quoi dépend l’efficacité?
Mélanges de bactéries et/ou de levures ingérées dans le but de coloniser l’intestin
Bactéries Gram positif comment bifidobacterium et lactobacillus et levures comme saccharomyces
L’efficacité dépend des microorganismes choisis, de la dose et de la survie des microorganismes après le passage dans l’estomac (acidité)
Qu’est-ce que la pouchite?
Inflammation du réservoir créé après une colectomie totale avec anastomose iléo-rectale
Qu’est-ce que l’entérocolite nécrosante?
Maladie qui touche l’intestin
Enfant né prématurément
Gonflement de l’abdomen, du sang dans les selles et de l’air dans paroi de l’intestin
Prédisposition génétique + intestin immunoréactif + réponse inflammatoire immature
Dysbiose du tractus digestif possible
Que sont les prébiotique?
Produits alimentaires administrés pour favoriser la croissance de microorganismes endogènes désirables
