Microbio1 - Bactériologie : biologie, identification et classification des bactéries Flashcards
Qu’est-ce qu’une épidémie?
Développement et propagation
rapide d’une maladie contagieuse infecieuse dans une population
Qu’est-ce qu’une pandémie
Épidémie étendue à la population de plusieurs, pays, continent ou au monde
Quelle a été la première épidémie décrite?
la peste d’Athènes (430-426 av. JC)
Par quoi (quels micro-organismes) les pandémies et les épidémies peuvent-elles être causées?
Virus, bactéries, parasites
Quelles épidémies millénaires et meurtières sont “silencieuses” dans le sens qu’elles ont une couverture médiadique moindre, et n’ont pas à ce jour de vaccin efficace?
Tuberculose (1,6M morts 2021)
— (627 K morts 2020)
Paludisme (0,6 M morts 2021)
Quelles sont les causes de mortalité à l’échelle mondiale? (statistiques de 2019)
33 % heart disease
18 % cancers
14 % maladies infectieuses (environ 7.7 millions de morts)
Peut-on avoir des conséquences à long terme après une infection?
Oui. Ex. Covid longue (insuffisance rénale, conséquence neurologiques et santé mentale, conditions cardiovasculaires, respiratoires, caillots sanguins et autres conditions vasculaires, musculosquelettiques, etc.)
Peut durer semaines, mois, et même années parfois.
Quelle est une des conséquences à long terme d’une infection au virus Epstein-Barr (mononucléose) ?
Si on a eu mononucléose infectieuse, plus de risque de scléroses en plaques, même des années plus tard.
Qu’est-ce que la drépanocytose?
L’anémie falciforme (maladie génétique la plus courante affectant les érythrocytes)
Quelle est l’origine de l’anémie falciforme?
Mutation dans une ou des chaînes de l’hémoglobine
Expliquer la sélection naturelle par les maladies infectieuses en utilisant l’exemple de la malaria et de l’anémie falciforme (drépanocytose)
Allèles de l’hémoglobine (Hb) : Allèle normale HbA ; allèle mutée HbS
HbAA : pas de drépanocytose
HbAS : drépanocytose
HbSS : drépanocytose sévère
Plus y’a de drépanocytose : + Anémie, crises vaso-occlusives, augmentation de la susceptbilité à certaines infections
On remarque que les hétérozygotes HbAS sont très répandus dans certaines zones géographiques (Afrique sub-saharienne)
Le paludisme, maladie qui se réplique dans les globule rouges, est très fréquent dans les mêmes régions géographiques affectées par drépanocytose.
En fait, le génotype HbAS est un environnement moins favorable à l’infection par le parasite Plasmodium. Les porteurs du gène de drépanocytose HbAS qui contractent le paludisme sont protégé à 90% des formes graves de paludisme. Mais ce dernier a évolué pour contourner cette protection conférée par le génotype HbAS.
La mutation peut être bénéfique ou délétère. Elle est bénéfique chez les hétérozygotes (personnes qui ne portent qu’un seul gène muté) car elle leur procure une certaine protection contre le paludisme. Mais la mutation est délétère chez les homozygotes (personnes porteuses de deux de ces gènes mutés) parce qu’elle entraîne un dysfonctionnement et une destruction possible des globules rouges qui provoquent des épisodes imprévisibles de douleur intense et souvent la mort.
Qu’est-ce que le paludisme?
Aussi appelé malaria, maladie causée par les parasites Plasmodium, transmis par les moustiques de genre Anophèle. Infecte les érythrocytes et s’y répliquent. Cause environ 620 000 de morts par an (2021).
Quelles sont les conséquences évolutives de la sélection naturelle par les infections?
Au cours de l’évolution, il y a diminution de l’expression des gènes associés à risques de maladies infectieuses. Ainsi, on devient plus résistants aux maladies infectieuses, mais plus susceptibles à maladies auto-immunes et inflammatoires (Why? car il y a “pression de sélection causée par les maladies infectieuses”)
Exemple : augmentation maladie de Crohn
Exemple de conséquence évolutive de la pandémie de peste noire (black death), une infection bactérienne, vers 1350?
Sélection naturelle du gène ERAP2, lequel est associé à (1) protection accrue aux infections bactériennes, mais associé aussi à (2) maladies auto-immunes (ex. Maladie de Crohn)
En quelle année le premier vaccin a-t-il été créé et par qui?
En 1796, par Edward Jenner. Le premier vaccin était pour la vaccine, communément appelée “variole de la vache”. Le virus de vaccine est proche du virus de la variole. Ainsi, les gens infectés préalablement par le virus de la vaccine ne développaient pas la variole.
Autrement dit, le virus de la vaccine est utilisé pour immuniser contre la variole.
Pour quelle découverte Louis Pateur est-il connu?
Vaccin contre la rage
Qui a inventé le vaccin contre la rage, quand et où?
Louis Pasteur, 1880, France
Qui a inventé la péniciline, quand et où?
Péniciline découverte par hasard, par Alexander Fleming (Grande-Bretagne) en 1928
Vrai ou faux? Il y a 3 types de micro-organismes
Faux. Il y en a 4 : (1) virus (2) bactérie (3) champignon (4) parasites
Vrai ou faux? Certaines bactéries sont plus petites que des virus
Faux
Les protéines bactériennes subissent-elles des modifications post-traductionnelles (acétylation, méthylation, phosphorylation, etc.) dans l’appareil de Golgi et le réticulum endoplasmique de la bactérie?
Nope. Pas d’appareil de Golgi, ni de RE, donc pas de modifications post-traductionnelles
Vrai ou faux? Les bactéries ont une membrane nucléaire en bicouche (membrane interne, membrane externe)
Faux. Elles n’ont pas de membrane nucléaire (donc pas de noyau). Leur ADN flottent dans leur cytoplasme.
L’enveloppe nucléaire, ou membrane nucléaire, est la double membrane qui délimite le noyau qui contient l’ADN de la cellule eucaryote.
Vrai ou faux ? Les virus sont les plus petits des 4 groupes de micro-organismes
Vrai (18 à 600 nm). Il sont invisible au microscope
De quoi est formé un virus?
- Des acides nucléiques (ADN ou ARN) dans une coque (capside)
- Parfois, un manteau de membrane lipidique (enveloppe)
Vrai ou faux? Il y a environ une 50aine de virus connus qui infectent l’homme et les animaux
Faux. 2000 espèces décrites, dont 650 qui infectent l’hommes et les animaux
Quel est l’acronyme pour se rappeler de la classification (taxonomie) du vivant?
DRECOFGE
DOMAINE RÈGNE EMBRANCHEMENT ORGANISATION FAMILLE GENRE ESPÈCE
Vrai ou faux? Certains virus peuvent se reproduire entre eux
Faux. “Pathogène intracellulaire obligatoire”. Les virus dépendent de la machinerie de l’hôte (ribosomes, etc.) pour répliquer leur matériel génétique et fabriquer leurs protéines virales (capside, enveloppe, etc.).
Qu’arrive-il à la cellule infectée lorsqu’un virus s’y introduit?
(a) Destruction de la cellule ou (b) relation chronique à long terme [ex. VIH] (c) intégration possible du génome viral dans le génome cellulaire
L’Ebola est causé par une bactérie
Faux. La maladie Ebola est une maladie virale, aigue et grave causé par des virus du genre Ebolavirus
Les gastros (gastroentérites) sont causées que par des virus
Faux. La gastro peut être causée par un virus, une bactérie ou un parasite. Le norovirus est le virus qui cause le plus souvent la gastroentérite chez les adultes. Chez l’enfant, c’est le rotavirus qui est le plus souvent impliqué.
La gastroentérite, aussi appelée « gastro », est une inflammation de la paroi de l’estomac et de l’intestin qui provoque de la diarrhée et des vomissements.
Vrai ou faux? Les bactéries sont un sous-type d’eucaryotes.
Faux. Procaryote
Vrai ou faux? Les bactéries pluricellulaires sont plus
Quelles sont les différentes formes des bactéries?
Quels sont les différents arrangements spaciaux?
Formes : (1) “cocci” [coccus au pluriel] ou “coques” = spérique (2) “bacilles” = bâtonnêts ou allongée (3) “spirochètes” = forme plus ou moins spiralées
Arrangements spaciaux : unique, en chaîne, en amas
Vrai ou faux? Les bactéries sont capables de se reproduire seules
Vrai
Comment s’appelle le composant principal de la paroi des bactéries à Gram +?
[C’est un constituant de la paroi des bactéries responsable de la rigidité de la paroi et de la forme de la cellule.]
Peptidoglycane
Quelle est la taille des bactéries?
de 1 à 20 mM… probablement micromètres
Vrai ou faux? La paroi de peptidoglycanes Gram+ est mince
Faux. Gram + = paroi de peptidoglycanes très épaisse comparativement à Gram -
Vrai ou faux? La paroi de peptidoglycane des Gram - est fine avec membrane externe
Vrai
Les bactéries à Gram positif apparaissent violet foncé dans une coloration de Gram
Vrai
Décrire la paroi d’une bactérie Gram +
1) Peptidoglycane épaisse (extérieure)
Complément :
2) Membrane plasmique (intérieure) * généralement unimembranée
3) Espace périplasmique (entre les deux)
Les bactéries sont commensales
Vrai. Vivent en commensalisme.
Commensalisme : Association d’organismes d’espèces différentes, profitable pour l’un d’eux et sans danger pour l’autre (différent du parasitisme et de la symbiose).
Comment les bactéries causent-elles les maladies [2 façons] ?
1) Par la toxicité des produits bactériens (toxines)
2) Par l’envahissement des tissus ou des fluides normalements stériles
Un champignon est parfois procaryote, parfois eucaryote
Faux. Eucaryote.
Les champignons peuvent être unicellulaires
Vrai. Ex. Levures
Les champignons, comme les bactéries, n’ont pas de noyau
Faux. Ils ont un noyau bien défini
Les champignons, comme les bactéries, n’ont pas de RE ni d’appareil de Golgi
Faux. Ils ont RE et appareil de Golgi
Les champignons, comme les bactéries, sont commensaux
Vrai.
Le commensalisme est un type d’interaction biologique naturelle et fréquente ou systématique entre deux êtres vivants dans laquelle l’hôte fournit une partie de sa propre nourriture au commensal. Le commensalisme est une relation facultative, provisoire ou définitive, bénéfique pour le commensal, mais neutre (ni bénéfique, ni nuisible) pour l’hôte
Les champignons sont des pathogènes opportunistes. Qu’est-ce que cela signifie?
Opportuniste signifie que les infections vont surtout toucher personnes immunodéprimées, qui sont alors risquées et très difficile à éliminer.
Les infections fongiques touchent rarement les individus sains, immunocompétents.
Les parasites sont toujours multicellulaires
Faux. Uni- ou multi- cellulaires
Les parasites sont-ils procaryotes ou eucaryotes?
Eucaryotes
Parasite Protozoaire, helminthes, arthropodes. jsp quelle question faire
Quel groupe de micro-organisme a un cycle de vie complexe impliquant hôtes et vecteurs
Parasites
Qu’a découvert Paul Ehrlich en 1810?
Les premiers agents antibactériens (syphilis), ce qui marque le début de la chimiothérapie
Qu’a découvert Alexander Fleming en 1928?
La péniciline
Vrai ou faux. Louis Pasteur a inventé le vaccin contre la rage
Vrai, en 1880
Qui a observé un micro-organisme pour la première fois au microscope?
Robert Hooke en 1665!
Les virus sont-ils obligatoirement des pathogènes INTRA-cellulaires?
Oui
Quel type de relation les différentes espèces de bactéries et ont-elles entre elles? On retrouve le même type de relation chez les champignons
Commensal (commensalisme)
Helminthe réfère à quel des 4 groupes de micro-organisme?
Les parasites. Helminthe est un synonyme de “vers parasite”
Nommer 3 grands groupes de parasites
1) Protozoaire (unicellullaires)
2) Helminthes (pluricellulaires ; communéments appelés vers)
3) Arthropodes (même embranchement d’animaux que le cloporte, mille-pattes, araignaigée, tiques (exoquelette chitine et pattes articulées)
Vrai ou faux? Certains parasites font plusieurs mètres
Vrai
Question que je comprends pas : la taille des parasites est de 4-5 mm à plusieurs mètres, mais il y a des parasites protozoaires qui sont unicellulaires… Donc des cellules au minmum 4 mm? AH attent c’est des micromètre encore. Ouais je catch
Vrai ou faux? La classification des bactéries se fait de la même manière que les êtres vivants en général, selon le modèle DRECOFGE S
Vrai. Domaine - Règne* - Embranchement - Classe - Odre - Famille - Genre - Espèce - SOUCHES
*Avec l’exception que le RÈGNE n’est pas défini pour les bactéries
Quels sont les 3 domaines du monde du vivant?
1) Eucaryote
2) Procaryote
3) Archées
[À TITRE INFORMATIF] Quels sont les règnes des bactéries?
Y’en n’a pas. On passe tout suite de domaine (procaryote) à l’embranchement
[À TITRE INFORMATIF] Quels sont les 5 EMBRANCHEMENTS du domaine des bactéries?
1) Protéobactéries -
2) Firmicutes
3) Cyanobactéries : font photosynthèse
4) Actinobactéries
5) Spirochaetes : caractérisé par flagelle périplasmique (donc dans l’espace entre la membrane plasmique et la membrane externe des bactéries à gram négatif)
Qu’est-ce que l’espace périplasmique?
Réponse Wikipédia : “Le périplasme est l’espace situé entre les deux barrières perméables sélectives que sont la membrane cytoplasmique (ou membrane interne) et la membrane externe chez les bactéries à Gram négatif, aussi appelé bactéries didermes. Cette zone de l’enveloppe bactérienne, aussi appelé espace périplasmique, contient une fine paroi constituée de peptidoglycane “
Nommer 4 genre de l’embranchement des protéobactéries, peu importe la classe (il y a 5 classes de protéobactéries, alpha, bêta, gamma, delta, epsilon) et peu importe la famile
[pas exam, mais cool]
1) Eschereshia
2) Helicobacter
3) Campylobacter
4) Neisseria
Y’en a d’autres : Xylella, caulobacter, brucella, etc.
Quelles sont les 5 classes de l’embranchement des protéobactéries?
[pas exam]
Protéobactéries alpha, bêta, gamma, delta, epsilon
Vrai ou faux? Escherichia Coli fait partie de l’ordre des Enterobacterale et de la famille des Enterobacteriaceae
[pas exam]
Vrai
Vrai ou faux? Escherichia est une espèce de bactérie
Faux. C’est un genre. (P.S. Salmonella est un genre aussi)
Escherichia et Salmonella et Enterobacter et Jejubacter sont des genres de la même famille [pas exam]
Vrai. Famille des Enterobacteriaceae
Vrai ou faux? Il y a plusieurs espèces d’Escherichia
Vrai. 10 espèces.
Vrai ou faux? Il y a une seule souche d’E. Coli
Faux. Plus de 2700 souches d’E. Coli référencées.
Comment se fait la nomenclature des bactéries?
Genre et espèce en latin, en italique.
Exemples :
Staphylococcus aureus
Escherichia coli
Listeria monocytogenes
Mycobacterium tuberculosis
Donc, “streptocoque” est un genre
Quel est le nom commun de Neisseria meningitidis
Quel est le nom commun de Neisseria gonorrhohoeae
Quel est le nom latin complet du pneumocoque?
Méningocoque
Gonocoque
Streptococcus pneumonae
Que signifient ces mots d’origine latine?
(1) Bacillus
(2) Lactobacillus
(3) Sarcina
(1) petit bâtonnêt
(2) petit bâtonnet du lait
(3) en paquet
Que signifient ces mots d’origine grecques?
(1) Micrococcus (coccus)
(2) Clostridium
(1) petit grain (coccus = graine, pépin)
(2) fuselé
Quelle genre de bactérie est nommé en l’honneur de son découvreur Louis Pasteur?
Pasteurella
Nommer 3 organelles présentes chez les cellules eucaryotes, et absentes chez les procaryotes (bactéries)
Réticulum endoplasmique, mitochondries, appareil de Golgi
(Bonus : les bactéries n’ont pas de membrane nucléaire, contrairement aux Eucaryotes)
Comment se distingue les chromosomes/génomes eucaryotes des procaryotes?
Procaryotes : un seul chromosome d’ADN circulaire, génome haploide (n)
Eucaryotes : ADN en brins, génome diploine (2n ; 2 copies de chaque chromosome)
Vrai ou faux? Les bactéries ont les mêmes ribosomes que les eucaryotes
Faux. Eucaryote = 80S (sous-unités : grande 60S + petite 40S) ; Procaryote 70S (sous-unités : grande 50S + petite : 30S)
Fun fact (Wikipédia) : Les ribosomes 70S des procaryotes sont sensibles à certains antibiotiques (amino-glycosides et chloramphénicol par exemple) qui n’ont pas d’effet sur les ribosomes 80S des eucaryotes.
La structure contenant l’ADN d’une bactérie s’appelle le “noyau”
Faux. C’est le “nucléoide”
La reproduction des cellules eucaryotes se fait de manière sexuée seulement
Faux. Sexuée et asexuée
La reproduction des cellules procaryotes (bactéries) se fait de manière asexuée seulement
Vrai. C’est la fission binaire
Complément - Fission binaire : Mode de reproduction asexuée habituel de la cellule bactérienne qui, après croissance et réplication du chromosome, forme une cloison transversale qui isole deux cellules filles identiques.
Les cellules eucaryotes ont-elles une paroi cellullaire?
Juste les champignons (fungi)
Décrire la paroi cellulaire des cellules procaryotes en général
Paroi cellulaire : Structure complexe contenant (1) protéines (2) peptidoglycanes (3) peut contenir polysaccarides, acides téchoiques, lipopolysaccharides (oui important)
Complément - définition “pepditoglycane” [Académie nationale de médecine] : Molécule constituée d’un peptide (polypeptide) et d’une chaîne polyosidique (glycosaminoglycane) liée par son extrémité réductrice à un des radicaux d’acide aminé. C’est un constituant de la paroi des bactéries responsable de la rigidité de la paroi et de la forme de la cellule
Quels sont les composants obligatoires (5) des bactéries?
(1) paroi cellulaire (2) membrane cytoplasmique (3) cytoplasme (4) chromosome (5) ribosome [rappel : 70S]
Quels sont les composants facultatifs (5) des bactéries?
(1) flagelle (2) pilli (3) plasmide (4) capsule (5) spore
Question : c’est quoi une capsule??
Ordonner, du plus interne au plus externe, les éléments suivants : capsule, membrane cytoplasmique, capsule
Membrane cytoplasmique (plus interne), ensuite paroi cellulaire (peptidoglycane), ensuite capsule (facultatif)
Vrai ou faux? Le cytoplasme bactérien contient notamment l’ADN chromosomique, les ARN messagers, les métabolites, et le cas échéant, les plasmides
Vrai
Vrai ou faux? Pour la majorité des bactéries, leur ADN chromosomique est contenu dans un chromosome UNIQUE, d’ADN à double brin CIRCULAIRE contenu dans le NOYAU
Faux. Tout est vrai, sauf que c’est contenu dans le NUCLÉOIDE, et non le noyau.
Vrai ou faux? Les bactéries ont un seul chromosome sous forme de brin
Faux. Un seul chromosome sous forme CIRCULAIRE
Vrai ou faux? Les ribosomes eucaryotes sont les mêmes que procaryotes
Faux. 70S procaryote, 80S eucaryote
Quelles sont les sous-unités qui forment les ribosomes 70S des procaryotes?
Grande sous-unité 50S et petite sous-unité 30S
[Complément : Eucaryote c’est ribosome 80S, avec sous-unités 60S et 40S]
Vrai ou faux? Une bactérie a toujours au moins un plasmide.
Faux. Composant facultatif
Complément - définition plasmide (Wikipédia) : En microbiologie et en biologie moléculaire, un plasmide est une molécule d’ADN distincte de l’ADN chromosomique, capable de réplication autonome et non essentielle à la survie de la cellule.
Vrai ou faux? Les plasmides sont des petites portions de l’ADN chromosomique de la bactérie qui se sont détachés et flottent dans le cytoplasme sous forme circulaire
Faux. Les plasmides sont de l’ADN EXTRA-CHROMOSOMIQUE
“ADN circulaire extra chromosomique de petite taille qui doit conférer un avantage sélectif.”
Prof ajoute : “En général bactéries en ont 1 ou 2 max. Certaines critères d’exclusion des bactéries empêchent l’apparition d’un deuxième”
Vrai ou faux? Dans les bactéries, la réplication et la traduction sont intimement appariés. En effet, la polymérase réplique l’ADN bactérien, et plusieurs ribosomes s’y attachent tout de suite, en un processus appelé “sapin de Noel”
Cela permet l’expresison très rapide de certains gènes, et ainsi une réponse/adaptation très rapide des bactéries à l’environnement.
Vrai
Décrire la membrane cytoplasmique des bactéries
- Bicouche lipidique (pas de stéroides, exemple: cholestérol, à l’exception des mycoplasmas)
- Barrière osmotique qui contrôle l’homéostasie ionique
- Contient des protéines de transport (import ou export) pour les échanges avec le milieu externe
- Lieu de la production d’énergie
Vrai ou faux? Comme dans les cellules eucaryotes, la membrane cytoplasmique des bactéries contient des stéroides, comme le cholestérol.
Faux. La membrane plasmique des bactéries ne contient PAS de cholestérol, à l’exception des mycoplasmas.
Vrai ou faux? Les bactéries produisent leur énergie dans leur unique mitochrondrie bactérienne
Faux. Leur énergie est produite au niveau de la membrane cytoplasmique
A) La membrane plasmique contient-elle des protéines de transport permettant des échanges avec le milieu externe?
B) La paroi de peptidyglycane en contient-elle aussi? Oui
A) Ben oui
B) Oui. Contient protéines membranaires nécessaires pour l’import et l’export
Dans laquelle de ses composantes la bactérie produit-elle son énergie?
Membrane PLASMIQUE
À quoi sert la paroi de peptidoglycane des bactéries?
Paroi RIDIGE qui assure la FORME
Vrai ou faux? Il existe trois structrures de parois de peptidoglycane différentes : Gram -, Gram 0 et Gram +
FAUX lol
Vrai ou faux? La paroi cellulaire est composée de peptidoglycane.
Vrai
Vrai ou faux? La paroi cellulaire de peptdidoglycane à gram + est + épaisse ; à gram - est mince
Ouep
Vrai ou faux? Gram + a une seconde membrane externe, par-dessus la paroi de peptidoglycane, en contact avec le milieu extérieur
Faux. C’est Gram - qui a une membrane externe
Quels sont les (3) principaux composants des parois cellulaires des Gram +? Quels sont leurs fonctions?
(1) Épaisse couche de peptidoglycane ; essentielles pour a) structure b) survie c) réplication de la cellule
(2) Lipoprotéines : connectent la membrane plasmique au peptidoglycane
(3) Acides téichoiques et acides lipotéicoiques ; FACTEURS DE VIRULENCE
- Utiles pour le sérotypage
- Permettent l’adhérence aux tissus/surfaces [leurs ti
boutes dépassent de la paroi sur l’image genre]
- Activent la réponse immunitaire
(4)
[Complément 1 - Le sérogroupage (anciennement, sérotypage ou sérotypie) est une technique immunologique consistant à la mise en évidence d’antigènes structuraux bactériens ou viraux permettant le diagnostic de sérovars]
[Complément 2 - Sérologie : Étude des réactions entre anticorps et antigènes dans le sérum sanguin]
[Complément 3 - Les facteurs de virulence désignent les fonctions qui permettent à ces virus de causer une maladie]
Quels sont les (2) facteurs de virulence associés aux parois de peptidoglycane des Gram + ?
Acide téichoique et acide lipotéichoique
Quels sont les (5) principales composantes des parois cellulaires des Gram - ? Quelles sont leurs fonctions?
(1) Peptidoglycane : FINE couche
(2) Membrane externe : a) maintient la STRUCTURE bactérienne. b) Barrière assurant un rôle de PROTECTION (ex. bactéries se développant dans le système digestif). Structure asymétrique, avec une couche lipidique interne « classique » (donc principalement des phospholipides), et une couche EXTERNE composée essentiellement de LPS (“lipopolysaccharides” = LPS])
(3) Lipoprotéines : comme pour Gram +, connectent les membranes aux peptidoglycane
(4) Porines : diffusion actives ou passive de molécules
(4) Contient du LPS
L’espace périplasmique est-il plus grand chez les gram + ou -?
Chez les gram négatifs, car couche de peptidoglycane est mince
Nommer un composant que Gram + a et que Gram - n’a pas, et vice versa
Uniquement Gram + a acide téichoique et acide lipotéichoique
Uniquement Gram - a une membrane externe, et LPS (lipopolysaccharides)
Le lipopolysaccharide est retrouvé chez les Gram+ et les Gram _
Faux. Seulement chez les Gram -
Quels sont les 3 domaines structuraux du lipopolysaccharide (LPS)?
(1) Lipide A : a) ancre le LPS dans la membrane EXTERNE; b) responsable du pouvoir IMMUNOGÉNIQUE
(2) partie polysaccharide au centre
(3) ANTIGÈNE O [l’extrémité en chaîne de polysaccharides répétés]
Complément (Wikipédia) : Est dite immunogène une substance dotée du pouvoir de provoquer une réaction immunitaire.
Complément (Prof) : Le lipide A est relativement conservé au sien d’un genre, mais très conservé au sein d’une espèce. Responsable du pouvoir immunogénique, endotoxine du LPS….
Complément (Wiki) : Le LPS est aussi appelé ENDOTOXINE. Le lipopolysaccharide (LPS) se lie au récepteur TLR4 et promeut la libération de cytokines pro-inflammatoires. C’est la partie lipide A qui est considérée comme la plus toxique (action sur les granulocytes et les cellules épithéliales).
Le LPS est-il retrouvé au niveau de la membrane plasmique ou de la membrane externe des Gram - ?
La membrane externe des Gram - a une couche externe de LPS
Quels sont les 4 composants externes des bactéries?
(1) Flagelle
(2) Pilus (pluriel = pili) ou fimbriae
(3) Capsule
(4)
Gram + ou Gram - ? Mes pili me permettent d’adhérer aux cellules de l’hôte
Complément : Pili sont des minces “cheveux” composés de protéine piline. Plusieurs dizaines / bactérie
Gram -
Qui suis-je ? On m’appelle parfois ADHÉSINE ou LECTINES ou FIMBRIAE. Je permets aux bactéries à Gram - d’adhérer aux cellules de l’hôte, et je permets ainsi la formation de biofilm
Les pili!
C’est quoi un “biofilm”
- Communauté microbienne adhérant à une surface
- Généralement plusieurs organismes
- Production d’une matrice protectrice (ADN,
polysaccharides) – glycocalyx - Augmente la résistance des micro-organismes aux antibiotiques et aux système immunitaire
Comment se nomme la matrice protectrice d’un biofilm?
Indice : formée d’ADN et de polysaccharides)
Glycolalyx
Vrai ou faux? Le biofilm diminue la résistance des micro-organismes aux antibiotiques et aux systèmes immunitaire, car il est composé généralement des copies du même organisme
Faux ! Généralement symbiotique, plusieurs micro-organismes différents
Quelles sont les 4 étapes de la formation des biofilms?
1) Attachement réversible
2) Attachement irréversible - Formation de la matrice polysaccharidique
3) Maturation, formation de microcolonies + colonisation par d’AUTRES ESPÈCES microbiennes
Vrai ou faux? Les pili sont présents à la surface des bactéries Gram - seulement
Vrai (Wikipédia dit exceptionnellement, positif aussi. Mais diapo dit juste “pili sont présents chez gram -“
Décrire flagelle
= antigène H ; composé de flagelline ; forme hélicoidale ; permet déplacement par chimiotactisme
C’est quoi chimiotactisme?
Quels sont les 6 types de “flagellation” des bactéries?
Rappel : le flagelle est un composant facultatif
1) Atriche : 0 flagelle
2) Monotriche : 1 flagelle
3) Lophotriche : Plusieurs flagelles d’un seul pôle
4) Péritriche : Plein de flagelles tout le tour
5) Amphitriche : 1 flagelle émanant de chacun des 2 pôles opposés de la bactérie
6) Amphilophotriche : 2 groupes de flagelles émanant de chacun des 2 pôles opposés de la bactérie
Nommer un exemple de bactérie pour chacun des types de flagelles
1) Atriche : Bacillus anthracis
2) Monotriche : Vibrio cholerae
3) Lophotriche : Helicobacter pylori (kinda logique, comme un hélicopter)
4) Péritriche : Escherichia coli
5) Amphitriche : Campylobacter jejuni
6) Amphilophotriche : Spirillum serpens
Phrase mémo :
C’est quoi quorum sensing ? Pas à l’exam
Moyen de communication entre bactéries. Médiateurs produits durant crx bactéries qui s’accumulent dans le milieu extérieur. Influe sur l’expression de facteurs de virulence. Induit/coordonne formation biofilm.
Pour certaines espèces de bactéries, les pilis permettent la motilité. Comment se nomme ce mécanisme?
TWITCHING.
Complément - Notes : Frontière avec flagelle devient un peu plus obscure, mais c’est pas la majorité des bactéries qui ont ce type de pili.
Twichting est important pour la VIRULENCE. Capacité d’étendre pili pour attraper morceau de surface un peu plus loin.
Mécanisme attachement/rétraction/extension permet le déplacement. Marche avant et marche arrière possible aussi
Twitching permet de se déplacer, et peut aller rejoindre d’autres bactéries pour faire biofilm or something
Vrai ou faux? La “conjugaison” réfère au phénomène de transfert horizontal de gènes par le biais des pili des bactéries
Vrai.
Note : Important pour transfert de gènes de résistance aux antibiotiques
Image : Bactére donneuse “R” résistante a un pilus qui touche une autre bactérie. Son plasmide contenant la résistance se linéarise, va dans le pili, et se transmet dans l’autre bactérie. Résultat : les 2 bactéries contiennent le gène de résistance aux antibio
Quelles composantes correspondent aux (1) antigène O (2) antigène H (3) antigène K
(1) Antigène O : LPS (lipopolysaccharides) de la membrane externe de la paroi des bactéries à Gram -, plus spécifiquement la chaine polysaccharidique
(2) Antigène H : flagelles [composante facultative]
(3) Antigène K : la capsule [composante facultative]
Vrai ou faux? Toutes les bactéries ont une capsule
Faux. Composante facultative
Vrai ou faux? La capsule peut se retrouver à la fois chez les Gram- et les Gram+, comme les flagelles
Vrai
Vrai ou faux? La capsule d’une bactérie est essentielle à sa survie dans l’hôte, mais non nécessaire à sa croissance.
Vrai. Rôles de la capsule :
(1) Barrière physique contre les molécules hydrophobiques (détergents)
(2) Favorise l’adhérence aux surface/tissus
(3) Empêche la phagocytose
Vrai ou faux? Streptococcus pneumoniae possède une capsule
Vrai
Question d’exam : les bactéries à quel gram possède du LPS (lipopolysaccharide)
Négatif
Quels sont les 2 exceptions à la classification Gram+ et Gram-?
Mycoplasma et Mycobactérium [ex. Mycobacterium tuberculosis ; lèpre]
En quoi (A) Mycobacterium et (B) Mycoplasma sont-ils des exceptions à la classification Gram +/- ?
(A) Mycobacterium a une couche de peptidoglycan, comme les Gram +, mais a un MANTEAU LIPIDIQUE [caractéristique unique des mycobacterium] contenant des ACIDES MYCOLIQUES
[Complément : Le manteau lipidique est une caractéristique unique des mycobactéries qui confère résistance à certains antibiotiques et certains détergents. C’est pourquoi coloration Gram ne fonctionne pas sur mycobactéries
(B) Mycoplasma n’a pas de paroi ni de peptidoglycane. [Complément - notes : Juste une membrane lipidique qui va contenir stérol. *C’est le seul genre bactérien qui a cholestérol dans les membranes]
Quel genre de bactéries a des acides mycoliques dans son manteau lipidique?
Incide : c’est une des exceptions à la classification Gram +/-
Mycobacterium
Vrai ou faux? La réplication des bactéries se fait de manière ASEXUÉE, par FISSION BINAIRE
Vrai
Étapes fission binaire : fafa bb. Initiation de réplication (attachement à la MP) - Duplication ADN - Cell s’allongent + septum de division - Les parois des 2 bactéries se referment = 2 cellules filles.
Les bactéries de quel Gram peuvent faire de la sporulation?
Certaines bactéries gram +
BACILLUS ET CLOSTRIDIUM
QUESTION D’EXAM - Quels genres de bactéries (2) sont capable de faire sporulation?
Bacillus et Clostridium [bactéries à Gram +]
Comment se nomme le phénomène de transition d’une bactérie d’un état végétatif à un état dormant?
*État végétatif signifie … jsp capable de croitre + se multiplier par fission binaire et faire cellules filles
*État de dormance : la bactérie survie mais pas de multiplication
Sporulation (ou sporogenèse)
Que contient le spore d’une bactérie?
[Rappel : composant facultatif, présent dans certaines bactéries à gram+ ; soit clostridium et bacillus]
Une copie du génome bactérien (son unique chromosome)
C’est quoi ça un spore ?
La spore représente un état DÉSHYDRATÉ de la bactérie, et peut lui permettre de survivre pendant de longues périodes dans des conditions défavorables.
Les bactéries peuvent se classer/être identifiée selon 4 caractéristiques, lesquelles?
(1) Morphologie : taille, forme, arrangement spatial
(2) Biochimie
(3) Sérologie (anticorps)
(4) Génétique
Nous pouvons identifier/classer les bactéries selon leur MORPHOLOGIE, c’est à dire leur ___, ___, et leur ___. Sur gélose, on peut observer la morphologie des colonies par ___, ___, et ____.
Morphologie bactérie : Forme, taille, arrangement spatial.
Morphologie colonie sur gélose nutritive :
- Forme (punctiforme, circulaire, rhizoide, etc.)
- Élévation (bombée, plane, convexe, etc.)
- Bord (ondulé, régulier, filamenteux, etc.)
Ex. Staphylococcus aureus est vraiment rond parfait.
Quelles sont les différentes formes des bactéries?
Quels noms leurs donnent-on alors?
Bâtonnets : Bacilles, coccobacilles
Sphères : Cocci (…coques)
Spirales : Vibrio et Spirochètes
Difformes : (Pléïomorphes)
[Complément : outre les coques, les bacilles et les cocobacilles, il y a : Massue , Vibrio ( bacille courbé), spirille, hélice, spirochète (long spaghetti tortillé), filamenteuse]
Quel arrangements spaciaux peuvent prendre les bactéries? Quels noms leurs donnent-on alors?
(1) Individuel : ex. coque, bacille, cocobacille
(2) Paire : “DIPLO”(… coque …bacille)
(3) Chainette : “STREPTO” Ex. streptocoque = plein de boules comme un collier de perles ; Ex. streptobacille = plein de grain attachées en chainette
(4) Amas : organisés ou non (ex. Staphylocoque, c’est pas organisé)
Avec quoi on marque/colore les membranes des bactéries/cellules eucaryotes/champignons?
Cristal violet/bleu de méthylène/safranine
À quoi sert la coloration de Gram?
But : colorer les gram + en violet foncé (cristal violet), et les gram - en rose/rouge (safranine)
Détails (pas exam) : (1) cristal violet + iodine = colore en mauve les gram + et les gram - (2) Ajoute alcool : les gram - deviennent incolore, et (3) on ajoute safranine pour leur donner couleur rose
À quoi sert la coloration de Gram?
But : colorer les gram + en violet foncé (cristal violet), et les gram - en rose/rouge (safranine)
Détails (pas exam) : (1) cristal violet + iodine = colore en mauve les gram + et les gram - (2) Ajoute alcool : les gram - deviennent incolore, et (3) on ajoute safranine pour leur donner couleur rose
Quel genre de bactérie possède une couche de pepditoglycane épaisse, mais sur laquelle la coloration de Gram ne fonctionne pas?
Mycobacterium. Car sa paroi est recouverte d’un manteau lipidique protecteur (rappel : contenant acides mycoliques)
Inutile, mais vrai ou faux ? Il existe des colorants spécifiques pour marquer les capsules, les acid fast, les endospores, et les flagelles
Vrai
Capsule : Encre de Chine ex. Anthony
Endospore : Schaffer Fulton (vert Malachite)
M. tuberculosis Acid Fast : Coloration de Zielh Neelsen
Flagelles : Fushine
Comment peut-on observer les bactéries? [Pas à l’exam]
Microscopie optique (brightfield vs. darkfield microscopy; phase contrast microscopy)
Microscopie à fluorescence (ex. sert à identifier S. aureus qui contiel telle ou telle protéine) : jouer avec fluochromes exprimés par bactéries et longueurs d’ondes, filtres de spectres d’émissions de couleur avec microscope, whatever.
Microscopie à fluorescence - type confocal laser scanning microscopy : vrm cool, reproduit images 3D et fluo des cellules. On voit relief
Microscopie électronique : image 3D super méga détaillées
Décrire brièvement les milieux de culture synthétiques vs les milieux de culture complexe.
Milieu de culture syntéthique : composition chimique connue et précise. Sert à étudier le rôle d’un composé précis sur la crx. Donc contrôle du milieu
Milieu de culture complexe : Composition chimique non rigoureusement déterminée, doesn’t matter. But : favoriser la crx de tout organisme présent dans un échantillon, ou d’exigence nutritionnelle fastidieuse
Qu’est-ce qu’un milieu de culture (1) Enrichi (2) Sélectif (3) Différentiel. C’est juste logique.
(1) Enrichis : additionnés de produits (ex. sang, protéines, vitamines) favorisant la CROISSANCE de microbes ayant des besoins nutritifs complexes ou particuliers.
(2) Sélectifs : ajout d’INHIBITEURS de croissance (antibiotiques, sels, colorants, composés chimiques) pour inhiber la croissance de microbes indésirables et favoriser ceux recherchés.
(3) Différentiels : addition d’éléments (sucres, indicateur de pH) pour DISTINGUER des espèces apparentées. Permet de mettre en évidence un caractère particulier du microorganisme étudié
C’est quoi un facteur de croissance dans un milieu de culture?
Facteur de croissance :
* Métabolite ESSENTIEL dont le microbe ne sait pas faire la synthèse
* DOIT être apporté par les ALIMENTS
* Peut intervenir à tous les stades du métabolisme
* Est une petite molécule (ACIDE AMINÉ, BASE NUCLÉIQUE, VITAMINE)
* Relatif à un microbe donné pour un milieu spécifique
Vrai ou faux? Les milieux de cultures peuvent être liquide (bouillon) ou solide (gélose)
Vrai
A) Comment on fait un milieu de culture solide “gélose” ?
B) C’est quoi l’intérêt de faire des cultures sur géloses ?
A) Ajouter agar au bouillon, solide jusqu’à 45 degrés.
B) La culture sur gélose permet l’obtention de colonies isolées et de cultures pures.
C’est quoi l’opposé d’une “culture pure”
Culture MIXTE.
Culture pure : Culture ne contenant qu’un seul type de microorganisme.
Culture MIXTE : contenant plusieurs types de microorganismes
Bonus : un milieu de culture peut être sélectif et différentiel en même temps
Ouep. Ex. Gélose avec sel + mannitol : Inhibe les bactéries qui ne tolèrent pas le sel, et différencie celles fermemtant le mannitol
- La fermentation donne une couleur rouge
Vrai ou faux? Utiliser une gélose au sang ou gélose chocolat permet de distinguer des bactéries faisant de l’hémolyse bêta, alpha, ou pas d’hémolyse
Vrai.
Vrai ou faux? On peut ajouter du lactose dans un milieu de culture pour différencier des bactéries
Vrai. La capacité de fermentation des bactéries peut s’observer
E. Coli : Fermentation ++++ lactose = rouge
Enterobacter aerogenes : Fermentation faible = rose
Shigella flexneri : Pas de fermentation = incolore.
Comment isoler des colonies de bactéries sur une gélose?
En faisant des séries de stries tout le tour, de moins en moins épaisses
Comment énumérer bactéries d’un milieu de culture?
Diluer la culture bactérienne liquide, sinon sont trop nombreuses
Décrire la COURBE DE CROISSANCE des bactéries en milieu liquide
(1) Phase de LATENCE : taux crx nul, adaptation au substrat
(2) Phase EXPONENTIELLE : taux crx maximum, temps de doublement le + court
(3) Phase stationnaire : taux de crx nul [équilibre mort et doublement]
(4) Phase DÉCROISSANCE : Nutriments épuisés, diminution viabilité
Citer 4 températures pertinentes lors de cultures bactériennes
1) Réfrigération 4 ○C
2) Corps humain 37 ○C
3) Pasteurisation 66-71 ○C
4) Autoclave 120 ○C
Note : les bactéries ont toutes une température optimale de croissance, ainsi qu’une température minimal et maximal permettant leur crx.
Citer les 5 types de bactéries selon leur range de température permettant leur crx
1) Psycrophile “AIME FROID” : - temp optimale = 10-15 ○C
2) Psychotrophes “CRX FROID” : temp optimale = 25-30 ○C
*Psychotrophes sont souvent retrouvées dans le réfrigérateur
3) Mésophile : temp optimale env. 37 ○C
*Mésophiles sont en grande qté dans le corps humain
4) Thermophile : de 45-70 ○C
* En général, sources chaudes au fond des océans
4) Hyperthermophiles : capable de croitre au-dessus de 80 ○C
Psychro signifie : relatif au froid
Trophie signifie : relatif à la croissance
Méso signifie : milieu en grec
Thermo signifie : chaud en grec
Définir les 5 mots décrivant les besoin/tolérance en oxygène des bactéries
(1) Aérobies : Oxygène indispensable
(2) Anaérobies stricts : Requiert absence totale d’oxygène (tuées par l’O2)
(3) Anaérobies facultatives : Croissance +++ en présence d’oxygène, mais capable de pousser sans
(4) Anaérobies aérotolérantes : Indifférence. Pas besoin d’oxygène mais n’y sont pas sensibles
(5) Microaérophiles : Faible présence d’oxygène requise
Ma question : ça existe tu aérobie facultative? Pousse +++ sans O2, mais capable pousser avec?
QUESTION EXAM : Que signifie acidophile, neutrophile, alkalophile, lorsqu’on parle de bactéries?
Acidophile : croissance optimale milieux acides (pH 3)
Neutrophile : croissance optimale pH 7
Alkalophile : croissance optimale milieux alcalins (basiques ; pH 8-10)
Quel est le pH intestinal, grastrique, de la cavité orale, et du duodenum
Cavité orale : pas mal neutre 6,8 - 7,5
Estomac : acide 1,5 - 2
Duodenum : 5,6 - 8
Petit intestin : pas mal neutre 7,2 - 7,5
Colon : basique 7,9 - 8,5
Vrai ou faux? La tuberculose et la malaria (paludisme) sont des maladies très vieilles, plus de 50 000 - 100 000 ans.
Vrai
Trucs en rouge dans le PPT1 :
(1) Antigène O
(2) Antigène H
(3) Antigène K
(4) Acides mycoliques : composants du manteau lipidique des Mycobacterium, qui font exception à la classification Gram +/-
(5) Les genres de bactéries qui font de la sporulation?
(6) Tailles et formes et arrangements spatial
(7) Milieux sélectifs et différentiels - exemple de la fermentation du lactose
(8) Acidophle, neutrophile, alkalophiles
(1) Antigène O : l’extrémité chaîne polysacchadirique du LPS de la membrane externe des Gram -
(2) Antigène H : Flagelles
(3) Antigène K : Capsule
(4) Acides mycoliques : composants du manteau lipidique se trouvant par dessus l’épaisse couche de peptidoglycan des Mycobacterium, qui font exception à la classification Gram +/-
Complément - Tuberculose : Mycobactéries ont besoin acide mycoliques pour leur survie, donc une des cibles pour développer médicament anti-tubertulose, c’est cibler toutes les enzymes impliquées dans la synthèse des acides mycoliques.
(5) Sporulation : Bacillus et clostridium
(6) Bacilles, cocobacilles, cocci, vibrio, spirochètes, pléiomorphe / individuel, diplo, STREPTO, amas
Que signifie “strepto”, ex. Streptocoque/streptobacille?
En chainette.
Quel type de bactérie est Escherichia coli, par rapport à sa température optimale de croissance?
Mésophile, température optimale d’environ 37 degrés Celcius
Quel type de bactérie est Listeria monocytogenes, par rapport à sa température optimale de croissance?
Psychrotrophes, température optimale de 25-30 degrés Celcius
Quelles sont les 2 définitions de “neutrophile” ?
1) bactéries dont la crx optimale se situe à pH d’environ 7 (neutre)
2) cellule immunitaire. Les neutrophiles sont un type de globules blancs qui entourent et détruisent les bactéries présentes dans le corps
