Microbio 2 - Relation hôte-microbe / Identification des microorganismes Flashcards

Question 1

Q

Quelles sont les étapes générales du processus infectieux (6) ?

Answer

A

[0. Être en CONTACT avec un pathogène]
1. ENVAHIR l’hôte
2. ADHÉRER aux cellules de l’hôte
3. COMPÉTITION avec la flore
4. RÉSISTER à la RÉPONSE IMMUNITAIRE de l’hôte
5. Envahir les TISSUS
6. Induire des dysfonctions physiologiques

Résultat : Permet à un pathogène d’induire une maladie

Question 2

Q

[0. Être en contact avec un pathogène]

Définition - Vrai ou faux? Un “réservoir” peut être humain, animal, ou environnemental (eau, terre)

Question 3

Q

[0. Être en contact avec un pathogène]
Définition - Vrai ou faux? Les réservoirs humains et animaux sont les individus malades porteurs de la maladie au sein d’une population

Answer

A

Faux. Ils peuvent être des porteurs sains ; être des réservoirs sans être malades

Question 4

Q

[0. Être en contact avec un pathogène]
Définition - Réservoir : Comment l’infection peut-elle se transmettre d’un réservoir vers un hôte?

Answer

A

(1) Transmission directe ou (2) vecteur

Définition “vecteur” : Organisme vivant, le plus souvent un arthropode (moustique, tique) qui acquiert l’agent infectieux dans un réservoir et le transmet à l’hôte

Question 5

Q

[0. Être en contact avec un pathogène]
Définition - Vrai ou faux? Réservoir = Milieu ou organisme où l’agent pathogène peut survivre ou se multiplier

Question 6

Q

[0. Être en contact avec un pathogène]

Définition de “source” ?

Answer

A

Matière biologique ou environnementale qui contient l’agent infectieux et qui peut être à l’origine d’une infection (eau, terre, goutellettes respiratoires, etc.)

Question 7

Q

[0. Être en contact avec un pathogène]
Vrai ou faux? Si on mets de la bouette dans notre bouche contenant des pathogènes, ou si on respire des gouttelettes respiratoires qui flottent dans l’air, on dit que cette bouette et ces goutelettes respiratoires sont des “vecteurs” de pathogènes.

Answer

A

Faux. Ce sont des “sources” de pathogènes.

Définition “source” : Matière biologique ou environnementale qui contient l’agent infectieux et qui peut être à l’origine d’une infection (eau, terre, goutellettes respiratoires, etc.)

Définition “vecteur” : Organisme vivant, le plus souvent un arthropode (moustique, tique) qui acquiert l’agent infectieux dans un réservoir et le transmet à l’hôte

Fun fact : les “arthropodes” sont un embranchement. Les “insectes” sont une classe de cet embranchement.

Question 8

Q

[0. Être en contact avec un pathogène]

Comment appelle-t-on un organisme vivant (ex. moustique) qui acquiert un agent infectieu dans un RÉSERVOIR et le transmet à un hôte?

Answer

A

Un vecteur

Question 9

Q

[0. Être en contact avec un pathogène]

Vrai ou faux? Il existe 4 groupes de risques pour classifier les pathogènes

Answer

A

Vrai. Groupes de risque 1 à 4 [voir Tableau p. 5]

Question 10

Q

[0. Être en contact avec un pathogène]
Comment se classifie les pathogènes en fonction de leur risque (4 groupes de risque) ?

Answer

A

Groupe 1 ) Non pahogène pour l’humain / PAS de risque pour la communauté
Groupe 2 ) Pathogène pour l’humain / risque FAIBLE pour la communauté
Groupe 3 ) Pathogène pour l’humain / risque POSSIBLE pour la communauté - ex. Mycobacterium tuberculosis
Groupe 4 ) Pathogène pour l’humain / risque ÉLEVÉ pour la communauté - ex. Fièvre hémorrhagique

Question 11

Q

[0. Être en contact avec un pathogène]
En quoi la révolution du néolitique (première révolution agricole) a-t-elle joué un rôle déterminant dans les maladies infectieuses?

Answer

A

Environ 10 000 ans av. JC.
1) Sédentarisation (passage de chasseurs-cueilleurs nomades à agriculture sédentaire) = + contacts entre humains
2) Domestication des animaux = + proximité/contacts animaux = + risque de transmission
3) Augmentation exponentielle de la taille de la population humaine = +++ contacts entre humains

Question 12

Q

[0. Être en contact avec un pathogène]

Qu’est-ce qu’une zoonose (EXAM) ?

Answer

A

Une zoonose est une maladie infectieuse qui est passée de l’animal à l’homme

Question 13

Q

[0. Être en contact avec un pathogène]
Donnez des exemple d’espèces réservoir et d’espèces vecteurs

Answer

A

Réservoirs : Chauve-souris, rat, oiseaux
Vecteurs : tiques, puces, moustiques (arthropodes qui mordent)

La transmission se pathogène peut se faire directement des espèces réservoires aux humains, ou passer par des intermédiaires, comme les vecteurs (moustiques, tiques), ou les animaux sauvages ou domestiques (chevreuils, singes, cochons, chimkens)

Question 14

Q

[0. Être en contact avec un pathogène]
Nommer des types de transmissions humain à humain

Answer

A

1) Auto-infection (licher ses doigts et mettre dans ses yeux ; maladies opportunistes = auto-infection par notre flore normale)
2) Infection par une personne malade (Sexuel, contact direct, goutelletes voie aérienne, fécal-oral)

Question 15

Q

[0. Être en contact avec un pathogène]
Nommer des types d’infections par l’environnement

Answer

A

1) Fomites : vecteurs passif (a.k.a inanimé) de transmission, non défini. (Wiki : En épidémiologie, les fomites sont des surfaces, matières ou objets contaminées par un micro-organisme pathogène, et susceptibles de contaminer d’autres objets, des animaux ou des personnes, jouant ainsi un rôle dans la propagation d’une maladie contagieuse). Surtout les surfaces (poignées de porte, interrupteurs, ordinateurs, téléphones)

2) Environnement souillé (eau, sol, nosocomial) ex. spa dégueulasse - 9%

3) Nourriture contaminée (manger de la pâte à biscuit crue) - 21%

4) Vecteurs (insectes qui mordent) - 15%

5) Sapronose : maladie causée directement par un microorganisme qui vit et se reproduit dans un environnement abiotique, donc sans hôte.

5) ZOONOSE : Zoonoses are defined as infectious diseases that are naturally transmissible between human and non-human vertebrate hosts. Yet, zoonotic pathogens often infect both humans and other vertebrate animals through the same environmentally mediated pathways (eg, foodborne, waterborne, vector-borne, fomites) - 3 % par contact direct avec animaux

Complément - Sapronose : terme générique désignant une pathologie infectieuse humaine provoquée par un agent pathogène [champignons, bactérie aérobie ou anaérobie, parasite] contaminant une matière inerte, abiotique, végétale ou animale en décomposition ou en putréfaction dans l’environnement. Exemples : botulisme, légionellose, mélioïdose, tétanos.
*SIMPLE : SAPRONOSE = TRANSMISSION DIRECTE PAR PATHOGÈNES QUI EST CAPABLE DE VIVRE/ SE REPRODUIRE SUR DES MATIÈRES NON VIVANTES COMME LE SOL, DU MÉTAL OXYDÉ, ETC.
*Ex. Clostridium tetani.
*Ex. Legionella. (Wiki : The bacterium is found naturally in fresh water. It can contaminate hot water tanks, hot tubs, and cooling towers of large air conditioners)
*29% des pathogènes humains sont des sapronoses

*Je ne comprends pas la différence entre Sapronose et contact avec environnement souillé? Whatever. Sûrement que “souillé”, ça veut dire que le pathogène ne devrait pas se retrouvé là normalement, tandis que sapronose la bactérie vit juste là.

https://www.thelancet.com/journals/lanplh/article/PIIS2542-5196(22)00248-0/fulltext

Question 16

Q

[0. Être en contact avec un pathogène]
Vrai ou faux? La plupart des maladies ont une origine environnementale

Answer

A

Vrai. 80%

Nuance : La porportion d’origine environnementale des maladie varie beaucoup d’un pays à l’autre. Ex. Canada et USA : 0-5% vs 28-46 % Chine et Afrique de l’Ouest et RDC

Question 17

Q

[0. Être en contact avec un pathogène]

Vrai ou faux? Les zoonoses sont un problème de santé publique majeur

Answer

A

Vrai. L’OMS commence à surveiller de plus en plus

Complément - Statistiques :
- 60% des maladies infectieuses des humains sont des zoonoses
- 75% des maladies émergentes (incluant ebola, VIH, influenza) ont une origine animale
- 80% des agents ayant un potentiel pour le bioterrorisme sont des zoonoses (zoonotic pathogens)
- Plus de 200 zoonoses connues (ex. Rage, Fièvres hémorragiques, Zika, VIH)

5 new human diseases appear every year. 3/5 = animal origin

Question 18

Q

[0. Être en contact avec un pathogène]
EXAM - Qu’est-ce qu’une ZOONOSE ?

Answer

A

Zoonose : maladie ou une infection naturellement transmissible des animaux vertébrés à l’homme. L’agent pathogène peut être : virus, bactérie, parasite, champignon

Question 19

Q

[0. Être en contact avec un pathogène]
Vrai ou faux? Souvent, les maladies humains ont une origine zoonotique avant de devenir sécifique à l’humain

Answer

A

Vrai. Ex. VIH vient d’un virus similaire présent chez grands singes, Afrique subsaharienne

Question 20

Q

[0. Être en contact avec un pathogène]
Donner des exemple de zoonoses récentes (pas exam)

Answer

A

COVID-19 / SARS-Cov-2 (2019 - présent) - possiblement pangolin
Zika virus (1947 - présent) - Macaque
Influenza aviaire ou “grippe aviaire” H5N1 (2019 - présent) - poulet
Ebola (2013-2016) - possiblement chauve-souris/chimpanzé/gorille

Grippe porcine ou swine influenza virus A/H1N1 (2009-2010) - truies
Grippe espagnole Influenza H1N1 originale (1918-1919) - truies

Question 21

Q

[0. Être en contact avec un pathogène]
Quel virus a un réservoir dans le CANARD SAUVAGE, oiseau migrateur qui lui est naturellement résistant?

Answer

A

Virus de la grippe aviaire H5N1

(not so) Fun fact : 22 000 oiseaux de mer retrouvés morts au Pérou. Tous les oiseaux aquatiques ne sont pas résistants (ex. pélicans). 585 lions de mer morts de H5N1.

Question 22

Q

[0. Être en contact avec un pathogène]
Vrai ou faux? Le virus H5N2 de la grippe aviaire se transmet à l’humain, quoique rarement, parce qu’il est passé par d’autres animaux qui sont en contact plus étroit avec des humains (canard domestique -> volaille -> porc -> humain).

Answer

A

Vrai.

La grippe A (H5N1) est un sous-type du virus de la grippe aviaire qui infecte principalement les oiseaux, mais provoque des cas humains rares et sporadiques.
La transmission est rare entre oiseau et humain, mais possible. Transmission entre humains extrêmement rare

L’infection peut évoluer vers une maladie grave et peut être fatale.

Question 23

Q

[0. Être en contact avec un pathogène]
H5N1 c’est quel virus ? Est-ce un pathogène zooniste ou un saproniste?

Answer

A

Grippe aviaire. Zoonose

Question 24

Q

[1. Envahir l’hôte]
Qu’est-ce que que la “pathogénécité” ou “pouvoir pathogène” ?

Answer

A

Capacité d’un microorganisme à causer une maladie. Notion QUALITATIVE.
Note : Une fois que le micro-organisme entre, il doit être capable de nous infecter.

Question 25

Q

[1. Envahir l’hôte]
EXAM- Qu’est-ce qu’un pathogène PRIMAIRE ? Par opposition à un pathogène ____ ?

Answer

A

Les pathogènes PRIMAIRES sont ceux qui nduisent une maladie chez les sujets sains (ex. Mycobacterium tuberculosis). Par opposition avec un pathogène OPPORTUNISTE

Question 26

Q

[1. Envahir l’hôte]
EXAM - Qu’est-ce qu’un pathogène OPPORTUNISTE?

Answer

A

Les pathogènes OPPORTUNISTES Induisent des infections chez les personnes immunodéficientes/immunosupprimées (ex. Pseudomonas aeruginosa)

Question 27

Q

[1. Envahir l’hôte]
Si la pathogénécité est la capacité de causer une maladie, quel terme emploie-t-on pour décrire le DEGRÉ de pathogénécité?

Answer

A

La VIRULENCE (aussi une notion qualitative)

Question 28

Q

[1. Envahir l’hôte]
Si la pathogénécité et la virulence sont des notions qualitatives, comment peut-on QUANTIFIER cette virulence (4 mesures)?

Answer

A

(1) Taux de morbidité : incidence dans une population donnée /dans une période donnée
(2) Taux de mortalité : nombre de décès / nombre de personnes infectées / dans une période donnée.
(3) DL50 (Dose Léthale 50) : dose qui entraîne la mort de 50% des individus d’une population donnée
(4) Dose infectieuse : quantité de microorganismes nécessaires pour causer une infection
*Très variable : L. monocytogenes 1 million de bactéries vs. M. tuberculosis 1 bactérie

Question 29

Q

[1. Envahir l’hôte]
Si la pathogénécité et la virulence sont des notions qualitatives, comment peut-on QUANTIFIER cette virulence (4 mesures)?

Answer

A

(1) Taux de morbidité : incidence dans une population donnée dans une période donnée
(2) Taux de mortalité : nombre de décès / nombre de personnes infectées / dans une période donnée.
(3) DL50 (Dose Léthale 50) : dose qui entraîne la mort de 50% des individus d’une population donnée
(4) Dose infectieuse : quantité de microorganismes nécessaires pour causer une infection
*Très variable : L. monocytogenes 1 million de bactéries vs. M. tuberculosis 1 bactérie

Question 30

Q

[1. Envahir l’hôte]

Vrai ou faux? La virulence d’un même microorganisme est toujours la même pour les hôtes d’une même espèce (ex. l’homme).

Answer

A

Faux. La virulence est variable selon différents facteurs de l’hôte (traits génétiques, âge, mode de vie, maladies chroniques, prise de médicaments, environnement).

Question 31

Q

[1. Envahir l’hôte]
Quels sont les FACTEURS DE RISQUE qui rendent un microorganisme plus ou moins VIRULENT?

Answer

A

Traits génétiques (ex. mutation dans un récepteur antimicrobien)
Âge
Mode de vie (ex. alimentation)
Maladies chroniques (ex. diabète, VIH, cancer, [fibrose kystique?])
Prise de médicaments (ex. corticothérapie diminue la réponse immunitaire)
Environnement (ex. contact avec animaux)

Question 32

Q

[1. Envahir l’hôte]

Nommée les 3 voies d’entrée des microbes dans l’hôte

Answer

A

Muqueuses (ex. respiratoires, digestives, génitales, conjonctive de l’oeil)
Peau (ex. plaies, scratch)
Voie PARENTÉRALE (ex. piqûres, coupures, morsures par arthropodes, chirurgies)

Question 33

Q

[1. Envahir l’hôte]

Donner un exemple de bactérie pour chacune des voies d’entrée suivantes :
Ingestion :
Inhalation :
Trauma :
Aiguilles :
Morsure par arthropode (moustique, tique) :
Transmission sexuelle :

Answer

A

Ingestion : SALMONELLA spp, LISTERIA spp, ESCHERICIA COLI
Inhalation : MYCOBACTERIUM spp, LEGIONELLA spp, STREPTOCOCCUS spp, Mycoplasma pneumoniae,
Trauma : CLOSTRIDIUM TETANI, STAPHYLOCOCCUS AUREUS
Aiguilles : STAPHYLOCOSSUS AUREUS
Morsure par arthropode (moustique, tique) : Rickettsia (whatever)
Transmission sexuelle : NEISSERIA GONORRHOEAE, CHLAMYDIA TRACHOMATIS

spp = espèce

Question 34

Q

[1. Envahir l’hôte]

Vrai ou faux? Les espèces du genre mycobacterium entrent dans l’hôte par voie d’ingestion

Answer

A

Faux. Inhalation

Question 35

Q

[1. Envahir l’hôte]

Vrai ou faux? Les espèces du genre salmonella entrent dans l’hôte par voie d’ingestion

Question 36

Q

[1. Envahir l’hôte]

Vrai ou faux? Clostridium tetani entre dans l’hôte par morsure d’arthropode (moustique, tique).

Answer

A

Faux. Par trauma (de la peau)

MODE DE TRANSMISSION (Info site gouv Canada) : Contamination des plaies par des corps étrangers ou un sol contaminés par des spores de C. tetani. C. tetani colonise les petites plaies bénignes, comme les plaies perforantes causées par des échardes, et il libère la TeNT au siège de la lésion

Question 37

Q

[1. Envahir l’hôte]

Vrai ou faux? Staphylococcus aureus se transmet par trauma (de la peau) et peut aussi se transmettre par des piqures d’aiguilles

Question 38

Q

[1. Envahir l’hôte]

Vrai ou faux? Neisseria gonorrhoae entre dans l’hôte par voie d’inhalation

Answer

A

Faux. Par transmission sexuelle

Question 39

Q

[1. Envahir l’hôte]

Par quelle voie le virus de la grippe aviaire entre-t-il dans l’humain?

Answer

A

Muqueuse respiratoire - Inhalation de particules aérosoles qui contiennent particules virales. Dans environnements de proximité avec animaux, comme élevages, abattoirs, marchés.

Question 40

Q

[2. Adhérer aux cellules de l’hôte]

EXAM - L’adhérence aux cellules de l’hôte se fait par une interaction COMPLÉMENTAIRE et SPÉCIFIQUE entre quels composants?

Answer

A

Entre une ADHÉSINE (du pathogène) et un RÉCEPTEUR (de l’hôte)

Ex. d’adhésines : glycoprotéine, lipoprotéine sur la surface bactérienne/virale.
Ex. de récepteur : hydrate de carbone (a.k.a glucide, sucre, carbohydrate) à la surface de la cellule hôte.

Question 41

Q

[2. Adhérer aux cellules de l’hôte]

EXAM..? - Quel est l’adhésine de Staphylococcus aureus? Quelle est l’adhésine de Vibrio cholerae?

Answer

A

Staphylococcus aureus : Clumping factor A (récepteur fibrinogène)
Vibrio cholerae : Pilli de type 4

Question 42

Q

[2. Adhérer aux cellules de l’hôte]
À quoi servent les pili (de type 4) de Vibrio cholerae?

Answer

A

Adhésine qui permet adhérence aux récepteurs (sucres) à la surface des cellules de l’hôte.

Question 43

Q

[2. Adhérer aux cellules de l’hôte]
Dans le cours 1, on a vu les acides lipoteichoiques, présents dans la paroi des ____. Il s’agit de facteurs de virulence. Ils permettent l’adhérence aux tissus/surfaces. Ce sont adhésines (notamment pour streptococcus groupe A)

Question 44

Q

[1. Envahir l’hôte]
Comment le virus de l’influenza adhère-il aux cellules de la muqueuse respiratoire (cellules épithéliales)?

Answer

A

Le virus influenza exprime des adhésines (protéine hemagglutine) à sa surfaces, qui reconnaîssent et s’attachent aux récepteurs d’acide sialique des cellules du tractus respiratoire. Like a key to a lock.

Le virus est ensuite capable d’entrer et d’infecter les cellules. C’est le début d’une infection de grippe

Question 45

Q

[3. Compétition avec la flore]
Vrai ou faux? Il y a plus de micro-organismes dans le corps humain que de cellules humaines

Answer

A

Vrai. Ratio estimé de 10 microbes/cellule humaine.

10-100 mille milliards de bactéries symbiotiques dans le corps humain. Plus de 10 000 espèces.

Question 46

Q

[3. Compétition avec la flore]
Vrai ou faux? Les bactéries symbiotiques sont potentiellement pathogènes si elles se retrouvent dans un autre organe

Answer

A

Vrai. Ex. Mauvais si contacte poumons, mais pas juste la bouche.

Bactérie sur la peau, voies respiratoires, cavité buccale, tractus digestif, système urogénital.

Question 47

Q

[3. Compétition avec la flore]
Qu’est-ce que le microbiote?
Qu’est-ce que le microbiome?
[P.S. c’est presque la même chose]

Answer

A

MICROBIOTE = FLORE NORMALE : Communauté de microorganismes qui vivent sur et dans un individu
MICROBIOME : Regroupe l’ensemble des génomes du microbiote

Question 48

Q

[3. Compétition avec la flore]

Vrai ou faux? Le core microbiome représente les espèces microbiennes COMMUNES entre les individus, dans des endroits SPÉCIFIQUES du corps

Question 49

Q

[3. Compétition avec la flore]
Qu’est-ce que la diversité ALPHA et BETA d’un microbiote?

Answer

A

Diversité : nombre d’espèces qui composent le microbiote
- alpha : diversité dans un seul échantillon (nombre d’espèces composant un microbiote)
- beta : diversité entre deux échantillons (nombre d’espèces COMMUNES entre deux microbiotes)

Question 50

Q

[3. Compétition avec la flore]
Qu’est-ce qu’un micro-organisme PROBIOTIQUE?

Answer

A

Micro-organisme vivant du microbiote qui a une action bénéfique sur l’hôte (ex. micro-organismes qui équilibrent la flore intestinale).

Question 51

Q

[3. Compétition avec la flore]
C’est quoi une DYSBIOSE ?

Answer

A

Un DÉSÉQUILIBRE/PERTURBATION du MICROBIOTE

Question 52

Q

[3. Compétition avec la flore]
Comment appelle-t-on un déséquilibre ou perturbation du microbiote?

Question 53

Q

[3. Compétition avec la flore]
À quoi sert le microbiote?

Answer

A

1) PROTECTION contre pathogènes (effet de barrière)
2) Fonctions tissulaires (maturation tube digestif, production mucus)
3) Fonctions neurologiques (DOULEUR/HUMEUR/SATIÉTÉ)
4) Fonction MÉTABOLIQUES (digestion, synthèse métabolites)
5) Rôle sur le système IMMUNITAIRE (développement, maturation, fonctions des cellules INNÉES et ADAPTATIVES)

Question 54

Q

[3. Compétition avec la flore]
Vrai ou faux? Le microbiote peut réguler fonctions neurologiques, comme sur la douleur, l’humeur, la satiété

Question 55

Q

[3. Compétition avec la flore]
Vrai ou faux? Le microbiote peut synthétiser des métabolites que le corps ne peut synthétiser lui-même

Question 56

Q

[3. Compétition avec la flore]
Vrai ou faux? Le microbiote signifie la flore bactérienne normale d’un individu

Answer

A

Faux. Pas seulement bactéries. Aussi microbiote FONGIQUE (“mycobiome”), microbiote VIRAL (“virome” ou “virobiote”), et macrobiote (HELMINTHES)

MICROBIOTE = FLORE NORMALE : Communauté de microorganismes qui vivent sur et dans un individu

Question 57

Q

[3. Compétition avec la flore]
Vrai ou faux? La diversité de la flore de la peau varie en fonction de la localisation sur le corps… duh. Ok d’abord, donner un exemple

Answer

A

Il y a des mycètes entre les orteils en plus grande proportion qu’ailleurs sur le corps. Sur le front, le seul mycète est malassezia

Question 58

Q

[3. Compétition avec la flore]
POP QUESTION ! Nommer un genre de bactérie retrouvé dans la flore bactérienne normale de la peau

Answer

A

Staphylococcus

Question 59

Q

[3. Compétition avec la flore]
Où se trouve le microbiote sur la peau?

Answer

A

Épiderme, grandes sudoripares et follicules pileux.

Image : Sur toute la surface de la peau (épiderme). Au niveau du derme, les micro-oranismes vont envahir les grandes sudoripares, le long des follicules pileux et les glandes sébacées qui sont rattachées à ces derniers. Note : les virus eux semblent rester à la surface, mais whatever.

Question 60

Q

[1. Envahir l’hôte]
Quelle est la différence entre taux de MORBIDITÉ et taux de MORTALITÉ ?

Answer

A

Morbidité fait état des malades, mortalité fait état des morts

Question 61

Q

[3. Compétition avec la flore]
Nommer des fonctions du microbiote de la peau

Answer

A

(1) Important pour le maintien de l’homéostasie immunitaire (en agissant sur les cellules dendritiques et les lymphocytes T)
(2) Maintien les défenses immunitaires (ex. production de peptides ANTIMICROBIENS) = EMPÊCHE COLONISATION PAR ESPÈCES PATHOGÈNES

Question 62

Q

[3. Compétition avec la flore]
EXAM - Quelle bactérie, présente dans le microbiote de la peau (qui colonise les glandes sébacées et les follicules pileux), est responsable de l’acné?

Answer

A

Propionibacterium acnes

Question 63

Q

[3. Compétition avec la flore]
Le microbiote retrouvé à la surface de la peau et celui dans les glandes sudoripares et les follicules pileux sont différents. Pourquoi?

Answer

A

Diversité en fonction de l’accès à l’O2. Bactéries aéorobie à la surface, bactéries anaérobie dans les glande/follicules.

Question 64

Q

[3. Compétition avec la flore]
Donner un exemple d’une DYSBIOSE du microbiote de la peau

Answer

A

Acné!

Complément : Aussi les infections chroniques des plaies et la dermatite atopique.

Answer 56

A

STAPHYLOCCOCCUS EPIDERMIS

Answer 57

A

FAUX. Très diversitié. Streptococcus

Answer 58

A

Alcoolisme
Tabagisme
Maladies chroniques
Cancers
Régime alimentaire
Antibiotiques

Answer 59

A

(1) CARIES - STREPTOCOCCUS MUTANS
(2) MALADIES PARODONTALES - PORPHYROMONAS GINGIVALIS
(3) CANDIDOSE ORALE - CANDIDA ALBICANS (“muguet buccal”, truc pseudomembranaire blanc sur la langue)

Complément : Qu’est-ce qu’une maladie parodontale ? C’est une maladie d’origine infectieuse (bactéries) qui touche et détruit les tissus de soutien des dents (gencives et os)

Answer 60

A

PORPHYROMONAS GINGIVALIS

Answer 61

A

STREPTOCOCCUS MUTANS

Answer 62

A

Vrai (selon le ppt)

Selon Google, ça semble controversé pour la vessie.

Fun fact : le sang est normalement stérile aussi, donc détection de microbes dans le sang est toujours anormal

Answer 63

A

Staphylocoques (comme peau), streptocoques (comme bouche), entérocoques, bacilles anaérobies

Answer 64

A

Vrai. Enfance vs. âge reproductif vs. ménopause = tous différents

Answer 65

A

Vrai

Avant puberté et après ménopause : pH alcalin (7+)
Vie adulte : pH acide (3,8 - 4,5) [Why? Colonisation de bactéries sécrétant acide lactique]

Answer 66

A

CANDIDA ALBICANS

Answer 67

A

LACTOBACILLES [QUI PRODUIT L’ACIDE LACTIQUE]

↑ lactobacilles à la puberté = ↓ pH

Answer 68

A

Prolifération des micro-organismes opportunistes ex. CANDIDA ALBICANS [candidose vaginale, infection urinaire]

Complément :
How? Ex. Diminution lactobacilles = ↑ pH ; ↓ défenses immun ; ↑ inflammation
Why? âge, stress, manque d’hygiène, antibiotiques
Conséquences ?
- Prolifération des microorganismes opportunistes (Candida albicans)
- Infection par des microorganismes pathogènes (Gardnerella vaginalis – vaginose ; Trichromonas vaginalis – trichomonase)
- Augmente le risque de naissances prématurées
- Augmente le risque de dommages aux trompes et d’infer’lité
- Augmente le risque d’IST (VIH)

Answer 69

A

Voies aériennes supérieures : cavité nasale, pharynx (nasopharynx, oropharynx), larynx
Voies aériennes inférieures : Trachée, bronches, bronchioles, alvéoles

Fun fact : La surfaces des alvéoles = 75 m^2

Answer 70

A

Faux.

Oropharynx +++ dense et diversitié, et de moins en moins plus on descend.

Answer 71

A

TOLÉRANCE / IMMUNOMODULATION : Action sur l’immunité innée et adaptative, maintien de l’homéostasie tissulaire

Aussi : production de mucus, diminution du risque allergique

Answer 72

A

Maladies chroniques (fibrose, BPCO a.k.a bronchite chronique), tabagisme, cancer, nutrition, antibiotiques

Answer 73

A

Atténuation des réponses immunitaires innées et adaptatives
Augmentation de la susceptibilité aux infections respiratoires
Risque plus élevé de développer la fibrose pulmonaire ou des cancers

Wow

Answer 74

A

Vrai. Il a des liens avec les autres organes

Bonus : Il module réponses soit (1) directement [axe intestins-poumons : aller coloniser poumons à partir t.d.], soit (2) indirectement avec sécrétion de MÉDIATEURS SOLUBLES, pour contrôler réponse immunitaire ou réponse tissulaire, par exemple.

Answer 75

A

Vrai. 90% sont des bactériophages

Answer 76

A

Estomac

Présente chez environ 50% des humains
Majorité des ulcers gastroduodénaux = infection à helicobacter PYLORI

Answer 77

A

Vrai

Les bébés ont moins de diversité alpha, donc moins de réponse immunitaire. Ils l’a développent en grandissant, ça grandit jusqu’à âge adulte avancé, et là ça diminue.

Answer 78

A

Juste savoir les 4 grands titres

(1) Modification de la PHYSIOLOGIE : Digestion, motilité intestinale, régulation de l’immunité intestinale, protection de l’épithélium intestinal, homéostasie de l’énergie du corps

(2) Fonction MÉTABOLIQUE : a) synthèse de NEUROTRANSMETTEURS et autres MÉTABOLITES, b) sécrétion de PEPTIDES ANTIMICROBIENS, c) synthèse de VITAMINES (notamment vitamines B) !! d) biosynthèse acides aminés

(3) Régulation de l’axe intestin-cerveau (communication bi-directionnelle du microbiote gut-brain)

(4) Métabolisme : Métabolise les composants de la bouffe, certains groupes de AA, les médicaments…

Answer 79

A

Yayaya. Y’a aussi un axe intestin-cerveau

Notes : bactéries remontent parfois pour aller coloniser poumons.
Le Quotidien du Médecin (Google) : l’axe intestin-poumon dans lequel le microbiote intestinal conditionne les réponses immunologiques pulmonaires à des provocations exogènes (allergènes, infections) et même endogènes (cancer, autoantigènes).

Answer 80

A

Vrai. Sur le cerveau, système endocrinien, coeur, poumons, foie, pancréas, muscles, etc., etc., etc.

Pas à savoir :

Cerveau : stress, anxiété, dépression, AUTISME?
Système endocrinien : désordres hormonaux
Coeur : maladies cardiovasculaires
Pancréas : DIABÈTE
etc.

Answer 81

A

Vrai

Microbiote moins diversifié
moins intégrité tight JUNCTIONS epithélium gut
+ de LPS (lipopolysaccharides, présent sur paroi gram plus, contient l’antigène O et le lipide A)
Résultat sur métabolisme : + insuline résistante ; + adiposité

Answer 82

A

[Pas en gras, mais whatever c’est cool]

(1) Mécanisme le plus connu : PRODUCTION SHORT CHAIN FATTY ACIDS (SCFA), ACIDES GRAS À COURTES CHAÎNES (BUTYRATE, PROPIONATE)*** Juste savoir celui-ci

(2) les bactéries libèrent molécules bactériennes qui seront reconnues et promotion tolérence immunitaire…

(3) Métabolisme acides biliaires

(4) Métabolisme du tryptophane

(5) Production de MÉDIATEURS IMMUNOMODULATEURS* (celui-ci aussi est cool)

Gros schéma : tout ça, tous les poduits et métabolites, ça joue sur la tolérance immunitaire, cellules dendritiques, T cell régulateurs et tout.

Answer 83

A

(1) Maintien de la TOLÉRANCE IMMUNITAIRE : SCFA agit sur :
- Cellules dentritiques tolérogéniques
- Lymphocytes T régulateurs
[les acides gras à courtes chaines (SCFA) produits par les gut bactéries agissent sur les entérocytes, grosse cascade de contrôle de l’immunité innée et adaptative de la muqueuse intestinale]

(2) Production de PEPTIDES ANTIMICROBIENS

(3) Maintien de l’intégrité barrière intestinale
- Renforcement des JONCTIONS cellulaires : tight junctions, maintient imperméabilité barrière intertinale (lumière intestinale vers tissus)

(4) Activation des LYMPHOCYTES B et production
d’IgA
- [SCFA -> B CELL -> ANTICORPS IgA = élimination pathogène + tolérance immunitaire ]

Answer 84

A

(1) Survivants : diversité + abondance diminue drastiquement pour la plupart des espèces et genres bactériens

(2) Opportunistes : colonisation par bactéries opportunistes, d’abondance assez faible avant antibiothérapie, et après cet antibiotique, vont coloniser à des niveaux + importants

(3) Colonisateurs de novo : colonisateurs de novo qui n’existait pas, et profite de cette perturbation pour aller coloniser. Ex. de cela qui pose problème santé publique : clostrium dificile..

(4) Perdus : Et y’a aussi bactéries qui sont perdues, qui reviendront jamais, sauf si on prend probiotiques.

Answer 85

A

Infection par Clostridium difficile.

Explication : Clostridium est difficile à éliminer, l’antibiothérapie ne fonctionne souvent pas, car antibiotique tue les bactéries, mais pas les spores. C difficile est un colonizateur de novo qui profite du microbiote affaibli par l’antibiotique pour “faire germer” ses spores.

Solution : donner jus de selles de personne saine par voie orale.
Pourquoi? Restaurer microbiote sain/normal et empêcher colonisation de C. difficile

Answer 86

A

(1) MASQUER leurs composants vulnérables [masquer leurs antigènes reconnus = échapper à surveillance]

(2) Se protéger de la PHAGOCYTOSE [Rappel : la capsule (antigène K) permet cela]

(3) Survivre à l’intérieur des leucocytes [une fois phagocyté, inhibe la destruction par leucocytes, ex. bloquer la fusion entre phagosome contenant pathogène et lysozome]

(4) Sécréter des enzymes détruisant les leucocytes (ex. leucocidines des staphyloccoquues]

(5) Interférer avec les anticorps et le COMPLÉMENT [et échapper à lyse]

Leucocyte = globule blanc

Answer 87

A

Vrai. Capsule (Gram + et -) empêche la phagocytose

Rappel : capsule = antigènes K

Answer 88

A

Faux. Certaines bactéries ont des mécanismes pour survivre à l’intérieur des macrophages

Answer 89

A

Zipper et Trigger

Answer 90

A

EN GROS : ZIPPER, PARCE QUE PLUS Y’A DE LIAISON ADHÉSINE-RÉCEPTEUR, PLUS ÇA INVAGINE ET = ENDOCYTOSE

Détail :

1- Interactions entre les ADHÉSINES de la bactérie et les RÉCEPTEURS de
l’hôte (+ y’a de liaisons, plus ça invagine = ZIPPER)

2- Modulation du CYTOSQUELETTE
d’actine

3- La bactérie est ensuite entourée par la MEMBRANE PLASMIQUE (invagination) qui forme un ENDOSOME (vésicule) pour permettre l’invasion

Answer 91

A

Listeria monocytogenes

Answer 92

A

EN GROS : TRIGGER = INJECTER (PAR SYSTÈME DE SÉCRÉTION, genre de big seringue) DES PROTÉINES QUI VONT TRIGGER ENDOCYTOSE DE LA BACTÉRIE

Détails :

1- La bactérie utilise une seringue appelée système de sécrétion de type 3 (SST3) pour injecter des protéines effectrices directement dans le cytoplasme de la cellule hôte

2- Les effecteurs bactériens modulent le cytosquelette d’actine

3- La bactérie est ensuite entourée par la membrane qui forme un endosome pour permettre l’invasion

Answer 93

A

Salmonella (ex. Salmonella enterica a cette big seringue)
Shigella
[On a vu ça dans le texte de mycobacterium tuberculosis aussi, un système de sécrétion ESX-1 qui injecte produits bactériens]

Answer 94

A

Ouep. Pas d’endocytose, microtubules hug C. difficile

Implique des microtubules.
C. difficile fait des toxines qui sont endocytées par cell. épith. intestin = sous-unité A de la toxine relâchée dans cytosol = +++ pousse incontrôlée microtubules qui entourent C. difficile = +++ adhérence.

Answer 95

A

(1) CYTOLYSINE : détruisent les composantes cellulaires des cellules de l’hôte (ex. phospholipases détruit membranes, collagénases)

(2) HÉMOLYSINE : lysent les érythrocytes (globules rouges)

(3) COAGULASE ET FIBRINOLYSINE : agissent sur la coagulation du sang (favorisent ou empêchent). [Rappel : Fibrinogène est le facteur 1 de coagulation]

(4) LEUCOCIDINES : forment des PORES dans les membranes des leucocytes et induisent leur LYSE

Answer 96

A

Enzyme qui détruit leucocytes (formation de pores dans MP -> lyse)

Answer 97

A

Protéine d’un microorganisme qui lui permet de provoquer une maladie

Answer 98

A

Une toxine présente dans le CYTOPLASME des microorganismes qui est ENSUITE SÉCRÉTÉE dans le milieu extracellulaire ou directement INJECTÉE dans la cellule hôte (ex. SST3, l’aiguille qu’on a vue pour le mécanisme TRIGGER)

Answer 99

A

Portion lipidique (lipide A) du lipopolysaccharide (LPS) de la MEMBRANE EXTERNE des bactéries à Gram négatif qui est libérée lors de la LYSE ou de la CROISSANCE

SYNONYME DE LPS = ENDOTOXINE !!!!
*Rappel : c’est la partie Lipide A qui est ancrée dans la membrane externe !
*Rappel : le lipide A est conservé au sein d’une espèce
*Rappel : LPS = uniquement Gram négatif

Answer 100

A

Exo : toxine dans cytoplasme de m-o
Endo : toxine dans la membrane externe de bactéries gram négatif (lipide A)

Answer 101

A

ANATOXINE

Answer 102

A

Toxine qui a perdu son pouvoir toxique mais reste IMMUNOGÈNE et peut être utilisée comme VACCIN

Answer 103

A

(1) Lipopolysaccharide (plus spécifiquement, la portion lipide A QUI EST DANS LA MEMBRANE EXTERNE)

(2) Lipide A

(3) Antigène O

Answer 104

A

Vrai. Qqn s’est injecté LPS purifié par IV = hospitalisé 2h plus tard.

LPS = ENDOTOXINE

Answer 105

A

FAUX. C’est les EXOTOXINES ça

Answer 106

A

(1) CLASSE 1 : Toxines qui agissent à la surface de la cellule - récepteurs de l’hôte -> signal -> PORES dans MP -> lyse

(2) CLASSE 2 : Toxines ENDOCYTÉES qui agissent sur des cibles intracellulaires (voies de signalisation, cytosquelette, synthèse protéique)

(3) CLASSE 3 : Toxines INJECTÉES qui agissent aussi sur des cibles intracellulaires (voies de signalisation, cytosquelette, synthèse protéique)
* On a vu, ex. système de sécrétion, mécanisme TRIGGER, injecte des protéines
* Ex. Salmonella

Answer 107

A

Classe 1 : surface, récepteurs, pores dans membrane
Classe 2 : endocytées, cibles intracellulaires
Classe 3 : injectées, cibles intracellulaire (ex. salmonella)

Answer 108

A

Botox.

Neurotoxine très puissante qui agit à faible dose. Agent causal du botulisme. Bloque contraction muscles.

Answer 109

A

Pathogène induit la maladie

Answer 110

A

FERMENTATION (anaérobie) et RESPIRATION AÉROBIE

Answer 111

A

Lactique : formation de lactate
Alcoolique : formation éthanol + CO2

Answer 112

A

Respiration aérobie (34 ATP) vs fermentation (2 ATP)

Answer 113

A

Glycolyse

Answer 114

A

Glycolyse = pyruvate => cycle de Krebs = NADH et FADH2 (donneurs d’électron) => chaine de transport d’électrons = ATP

Answer 115

A

Le pyruvate provenant de la glycolyse.

Answer 116

A

Vrai (i guess parce que différents produits, ex. acide lactique, éthanol)

Answer 117

A

Méthodes moléculaires basées sur la détection:
- des acides nucléiques ARN/ADN (ex. détection d’ADN spécifique à un m-o)
- des protéines des microorganismes (immunoblot, ELISA, Maldi-TOFF, etc)
- séquençage des m-o

Answer 118

A

Réaction en chaîne de la polymérase : Se fait à partir de l’ADN et génère grandes qté d’ADN à partir de concentration relativement faible. Amplifier.

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Microbio 2 - Relation hôte-microbe / Identification des microorganismes Flashcards

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