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A24 > Microbio > Flashcards

Microbio Flashcards

1
Q

Hans Janssen;
1. Date
2. Achievement/ experiment

A

1550, invention du microscope

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2
Q

Antoni van Leeuwenhoek;
1. Date
2. Achievement/ experiment
3. Avec qui?

A

1632-1723, marchand de tissus qui observe le monde microbiologique avec Robert Hooke pour la documentation.

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3
Q

Robert Hooke;
1. Date
2. Achievement/ experiment
3. Avec qui?

A

1632-1723, aide avec la documentation et l’observation des microorganismes avec Antoni van Leeuwenhoek.

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4
Q

Francesco Redi;
1. Date
2. Achievement/ experiment

A

1626-1697; couvrir un morceau de viande avec un gaze pour éviter les mouches.

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5
Q

John Needham;
1. Date
2. Achievement/ experiment

A

1713-1781, encourage l’idée du vitalisme, de l’énergie vitale, de la génération spontanée de la vie dans l’inorganique. Avec son bouillon qui devient brouille.

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6
Q

Lazaro Spallanzani;
1. Date
2. Achievement/ experiment

A

1729-1799, sur les travaux de Needham, il découvre que scellé le bouillon directement empêche le trouble d’apparaître. encoure le démentèlement du vitalisme.

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7
Q

Heinrich G. F. Schröder;
1. Date
2. Achievement/ experiment
3. Avec qui?

A

1850; sur les travaux sur le bouillon, mettre une ouate empêche d’apparition de trouble, avec son collègue von Dusch.

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8
Q

Theodor von Dusch;
1. Date
2. Achievement/ experiment
3. Avec qui?

A

1850; sur les travaux sur le bouillon, mettre une ouate empêche l’apparition de trouble, avec son collègue Heinrich G. F. Schröder.

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9
Q

Louis Pasteur;
1. Date
2. Achievement/ experiment

A

1822-1895; travaux sur la fermentation, fin du vitalisme et pasteurisation du vin.

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10
Q

Fracastoro;
1. Date
2. Achievement/ experiment

A

1483-1553; Les maladies sont causées par des microorganismes.

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11
Q

von Plenciz;
1. Date
2. Achievement/ experiment

A

1705-1786; Travaux sur la contagion, les différentes maladies sont causées par différents microorganismes.

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12
Q

Bassi;
1. Date
2. Achievement/ experiment

A

1773-1856; la maladie du vers à soie est causée par un champignon, donc les microorganismes causent les maladies.

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13
Q

Edward Jenner;
1. Date
2. Achievement/ experiment

A

1798; administration de vaccin, travaux avec Lady Montegue qui a observé les gens de l’Empire Ottoman s’exposer volontairement aux pathogènes.

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14
Q

Joseph Lister;
1. Date
2. Achievement/ experiment

A

1827-1912; Travaux sur les maladies post-opératoires et
stérilisation des instruments.

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15
Q

Robert Koch;
1. Date
2. Achievement/ experiment
3. Avec qui?

A

1843-1910; Travaux sur Anthrax, contagion par le sang (Bouillon organe infecté -> rat -> symptômes/ maladie), avec Ferdinand Cohn qui aide avec la publication et ses 4 postulats.

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16
Q

Quels sont les quatres postulats de Robert Koch?

A
  1. Les microorganismes doivent être présents dans tous les malades et absents dans tous les sains.
  2. Les microorganismes doivent être cultivés en culture pure à l’extérieur du malade.
  3. L’animal saint inoculé avec la culture doit développer tous les symptômes.
  4. Le microorganisme doit être identique avec le précédent.
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17
Q

Ferdinand Cohn;
1. Date
2. Achievement/ experiment
3. Avec qui?

A

1843-1910; Travaux sur Anthrax, contagion par le sang (Bouillon organe infecté -> rat -> symptômes/ maladie), avec Robert Koch et ses 4 postulats.

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18
Q

Semmelweis;
1. Date
2. Achievement/ experiment

A

1847; Travaux sur la transmission entre les humains, proposition de lavage des mains.

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19
Q

Élie Metchnikoff;
1. Date
2. Achievement/ experiment

A

1845-1916; Travaux sur larves d’étoile de mer, permière observation des phagocytes. Concept de probiotique.

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20
Q

Theobald Smith;
1. Date
2. Achievement/ experiment

A

1859-1934; Travaux sur la dénaturation des toxines.

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21
Q

Dmitry Ivanovsky;
1. Date
2. Achievement/ experiment

A

1864-1920; Découverte des virus en utilisant les filtres de Chamberland.

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22
Q

C. E. Chamberland;
1. Date
2. Achievement/ experiment

A

1884; Création des filtres de porcelaine.

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23
Q

A. Fleming;
1. Date
2. Achievement/ experiment

A

1928; Antibiotiques et péniciline

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24
Q

Stanley;
1. Date
2. Achievement/ experiment
3. Avec qui?

A

1935; Crystallisation du virus de la mosaïque du tabac, avec Northrup.

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25
Q

Northrup;
1. Date
2. Achievement/ experiment
3. Avec qui?

A

1935; Crystallisation du virus de la mosaïque du tabac avec Stanley.

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26
Q

Pourquoi utilisons-nous les microorganismes? (3)

A
  1. Conservation
  2. Propriétés nutritionnelles
  3. Propriétés thérapeutiques
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27
Q

Qu’est-ce que la génération spontanée et quels sont les deux types?

A

Il y a la biogénèse et l’abiogénèse, la première est le fait que la vie naît de la vie et la seconde est le fait que la vie provient de l’énergie vitale (un concept plus sacré).

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28
Q

À quelle échelle commence la microbiologie?

A

À 100 microns ou 1e-4 M.

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29
Q

Qu’est-ce que la biogéochimie?

A

C’est le cycle de la matière au niveau de la biosphère, entre autre le cycle de l’azote (N2) et sa fixation par certaines bactéries.

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30
Q

Sous quelles formes retrouvons-nous les bactéries fixatrices d’azote?

A

Libre ou en symbiose avec les plantes.

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31
Q

Quels sont les deux types de microscope?

A

Photonique et éléctronique

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32
Q

Quelles sont les trois parties principales d’un mircoscope photonique?

A
  1. Le condensateur
  2. L’objectif
  3. L’oculaire
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33
Q

Quel est le rôle du condensateur photonique?

A

Il redirige et alligne les photons de la source de la lumière afin qu’ils soient parallèle l’un à l’autre.

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34
Q

Quel est le rôle de l’objectif photonique?

A

Il sert à agrandir l’image projeté par le condensateur qui passe à travers l’échantillon

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35
Q

Quel est le rôle de l’oculaire photonique?

A

Il sert à agrandir l’image projeté par l’objectif.

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36
Q

Entre l’oculaire et l’objectif, lequel agrandit le plus l’image?

A

L’objectif, entre 10 à 200x. Tandis que l’oculaire se trouve plus autour de 10-15x.

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37
Q

Quel est le facteur limitant principal d’un microscope photonique?

A

La longeur d’onde (Lambda) du photon. Autrement dit, la limite de résolution de la lumière.

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38
Q

Qu’est-ce que la limite de résolution?

A

C’est la distance minimale entre deux points qui peuvent être perçus comme dinstincts. Plus petit et on voit seulement un point.

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39
Q

Quelle-est la formule de la limite de résolution?

A

Lambda/ 2 N sinThéta

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40
Q

Quelle huile utilisons nous dans l’objectif? Pour quelle raison?

A

L’huile à immersion, car elle possède essentiellement le même indice de réfraction (N) que le verre, ainsi il n’y a pas de déviation des photons hors du verre, donc une perte minimale de lumière/ d’information.

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41
Q

A. J. Kluyver;
1. Date
2. Achievement/ experiment

A

1897-1956; métabolisme des sucres, que presque tous les organismes partage le même mécanisme pour métaboliser les sucres (donc les même réactions).

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42
Q

Avery, Mc Cleod and Mc Carthy;
1. Date
2. Achivement/ experiment

A

1944; Découvrent que c’est l’ADN qui porte l’information génétique

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43
Q

Venter;
1. Date
2. Achievement/ expriment

A

1995; premier séquensage complet d’un génome d’un organisme autoréplicatif.

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44
Q

Comment se définie le microbiote?

A

C’est l’ensemble des communautés microbiennes d’un environnement donné.

45
Q

Comment se définie le contraste en microscopie?

A

C’est la capacité à distinguer une structure de son environnement.

46
Q

Quels sont les cinq moyens vus en cours pour améliorer le contraste?

A
  1. Fond clair
  2. Fond noir
  3. Contraste de phase
  4. Contraste d’interférence différentielle
  5. Fluorescence
47
Q

Comment appelle-t-on une préparation au fond clair sans intervention? Comment se prépare-t-elle?

A

Une préparation à l’état frais, simplement déposer sur le verre l’échantillon à observer, puis y déposer par dessus une lamelle.

48
Q

Que voulons-nous étudier lorsque nous utilisons un fond clair? (5)

A
  1. La morphologie
  2. Le mouvement (motilité)
  3. Les organismes de grande taille
  4. l’axe de division cellulaire
  5. Le corps d’inclusion cytoplasmique (particule virale)
49
Q

Qu’ajoutons-nous sur un fond clair pour améliorer le contraste? (avec intervention)

A

De la coloration

50
Q

Qu’est-ce qu’un colorant vital? En existe-il beaucoup?

A

C’est un colorant qui garde les organismes en vie, il y en a peu.

51
Q

Quel processus préliminaire la coloration exige-t-elle? Comment se fait se processus?

A

La coloration nécessite une fixation, pour ce faire la goûte échantillonée doit être cuite avec une flamme. Tuant ainsi les organismes et résultant en la matière solide qui se colle sur le verre.

52
Q

Les divers colorants peuvent porter quelle charge? Sont-ils hydrophobe ou hydrophile?

A

Les colorants peuvent être chargés négativement ou positivement, de plus certains sont hydrophobes.

53
Q

Quels sont les trois types de colorants?

A
  1. Simple
  2. Différentiel
  3. Contre-colorants
54
Q

Qu’est-ce qui caractérise le colorant simple? Donner un exemple de ce type de colorant.

A

Ils impliques seulement un colorant, qui colore généralement et uniformément l’ensemble.
Le bleu de méthylène.

55
Q

Il existe plusieurs types de colorants différentiels, quels sont les deux vus en classe?

A
  1. de Gram
  2. AAR
56
Q

Qu’est-ce que AAR veut dire? Donner un exemple de ce type de colorant

A

Alcoolo-acido-résistance, la Carbol-fuchsine

57
Q

Quelles sont les deux couleurs perçues avec la coloration de Gram? Laquelle des deux est retenue seulement par certains organismes?

A

Le violet et le rouge, c’est le violet qui est retenu par les microorganismes à Gram positif.

58
Q

Pour quel organismes utilisons nous les colorant AAR? Pourquoi?

A

Pour les mycobactéries, car le colorant a une affinité particulière pour les alcides mycoliques de leur membrane.

59
Q

Que se passe-t-il avec la lumière lorsqu’on utilise un fond noir?

A

La lumière arrive de manière tangentielle sur l’échantillon, donc seulement les photons déviés par les structures vont être perçus dans l’objectif.

60
Q

Quel est l’avantage principal du fond noir?

A

Aucune fixation est nécessaire, ainsi nous pouvons observer les organismes vivants, dans leur état naturel.

61
Q

Qu’est-ce qui caractérise le contraste de phase? (3)

A
  1. C’est sur fond clair
  2. Utilisation d’anneaux de phase
  3. Aucune fixation nécessaire, donc vivant
62
Q

Dans un microscope à contraste de phase, où se trouvent les anneaux de phase?

A

Un devant le condensateur et l’autre derrière l’objectif

63
Q

Sur quelle théorie le contraste de phase est-il fondé?

A

Sur la théorie ondulatoire.

64
Q

Qui a créé le contraste d’interférence différentielle?

A

Nomarski

65
Q

Quelle sorte de lumière est-ce que le contraste d’interférence différentielle utilise?

A

La lumière polarisée

66
Q

Quelles sont les caractéristiques des images à contraste d’interférence différentielle? (3)

A
  1. Effet 3D
  2. Aucun halo
  3. Gris avec certaines couleurs vives
67
Q

Où se trouve la différence du contraste d’interférence différentielle avec les autres contrastes?

A

Dans le condensateur, l’ordinateur influt sur le système de lentilles polarisantes.

68
Q

Quelle est la particularité principale du contraste d’interférence différentielle? Est-ce qu’une fixation est nécessaire?

A

L’échantillon ne doit pas être opaque et une fixation n’est pas nécessaire.

69
Q

Quel est le type de colorants utilisé avec la fluorescence? Quelle est leur particularité principale?

A

Les fluorochromes (colorants fluorescents), ils absorbent les rayons UV et emettent en retour une lumière visible.

70
Q

Comment se nomme le filtre utilisé lors d’imagerie à fluorescence? Et quelle pièce du microscope se trouve tout juste après?

A

C’est le filtre d’excitation, il filtre la source d’UV pour en laisser passer seulement une longeur d’onde spécifique.
Cette onde hurt ensuite le miroir dichroïque qui reflete les rayons UV et laisse passer les photons.

71
Q

Dans un microscope à fluorescence, les rayons UV arrivent de par où?

A

D’en haut

72
Q

Quelles sont les quatres applications vues en cours de la microscopie à fluorescence? Quelle méthode utilisent-elles?

A
  1. La distinction des cellules mortes à celles vivantes (fluorochromes vitaux)
  2. L’immunofluorescence (anticorps spécifiques marqués)
  3. Détection d’une espèce (marqueurs fluorescents spécifiques)
  4. FISH (sondes d’ADN fluorescentes)
73
Q

Qui a créé le microscope électronique? En quelle année?

A

Ruska en 1931

74
Q

Quelle est le grossissement maximal du microscope photonique? Électronique?

A

3 000x versus 400 000x pour l’électronique

75
Q

Quelle est la limite de résolution d’un microscope électronique?

A

0.05 nm

76
Q

En ce qui concerne le condensateur, l’objectif et l’oculaire, quelles sont leur particularité commune dans un microscope électronique? Pourquoi cette particularité?

A

Ce sont des éléctro-aimants, des lentilles magnétiques.
Car les éléctrons voyagent uniquement dans le vide, pour les déplacer il faut donc créer des champs de force éléctromagnétiques. Utiliser des lentilles de verre bloquerait complètement le trajet des éléctrons.

77
Q

Trois constituants du microscope électronique participent à la formation de l’image, quels sont-ils? Quels sont leurs rôles?

A
  1. Écran fluorescent (excitation par les éléctrons, émition photons)
  2. Plaque photographique (enregistrement permanente de l’image)
  3. Détecteur numérique (traduction du signal électronique en image numérique)
78
Q

À quel endroit les microscopes électroniques doivent-ils être placés? Pourquoi?

A

Le plus bas possible dans le sous-sol, car les moindres vibrations/ mouvements, même si seulement quelques nm, feront en sorte que les images seront ininterprétables.

79
Q

Pourquoi est-il impossible d’avoir un échantillon vivant lors d’une observation au microscope électronique?

A

Car les éléctrons voyagent dans le vide, ainsi l’intérieur du microscope est un vide. Pour cette raison, au moment où l’échantillon entre dans le microscope, le vivant meurt.

80
Q

Pourquoi faut-il utiliser des coupes ultra-fines comme échantillons dans un microscope électronique?

A

Car les éléctrons sont non-pénétrants, ainsi pour avoir une image relativement interprétable, il faut une surface minimalement mince pour que les éléctrons la traversent bien.

81
Q

Comment est le contraste d’un microscope électronique?

A

Minimale, très difficile à voir les détails d’une structure.

82
Q

Quel est le moyen utilisé pour augmenter le contraste des images d’un microscope électronique?

A

Par une “coloration”, cependant elle ne se fait pas avec des pigments ou des fluorochromes.

83
Q

Quels sont les quatres techniques de coloration vus en classe pour augmenter le contraste des images d’un microscope électronique?

A
  1. La technique d’ombrage (shadow casting)
  2. La coloration négative
  3. Le cryodécapage
  4. L’immunolocalisation cellulaire
84
Q

Décriver la technique d’ombrage (shadow casting).

A

C’est la vaporisation de métaux sur l’échantillon. Avec un angle précis et l’ajout de billes à l’échantillon, nous pouvons alors percevoir les structures ainsi que leur ombres. Les billes servent alors de points de référence pour mesurer les tailles relatives des ombrages.

85
Q

Décriver les caractéristiques de la technique de la coloration négative.

A

En utilisant l’acide phosphotungstique, qui a comme propriété de se loger dans les creux, nous pouvons bien faire contraster les protubérences (qui seront claires)

86
Q

Décriver les caractéristiques de la technique du cryodécapage.

A

L’idée est de faire congeler rapidement une structure, pour éviter la formation de crystaux, pour ensuite appliquer une force latérale qui va fracturer la structure. L’un des deux segments pourra alors être ombragé (à l’aide du métal) et observé.

87
Q

Décriver les caractéristiques de la technique de l’immunolocalisation cellulaire.

A

C’est l’utilisation d’anticorps spécifiques marqués par des billes de métal (Fe ou Au), ainsi on peut localiser les structures visées. À savoir que c’est seulement périphérique.

88
Q

Quels sont les trois types de microscope électroniques? Quels sont leurs points distincts?

A
  1. À transmission
  2. À balayage
  3. Cryoéléctromicroscopie (CEM)

À transmission nous voyons les structures internes en coupe transversales, tandis qu’à balayage nous voyons l’extérieur de la structure comme modèle 3D. Pour sa part, à CEM (ou crytomographie) utilise la technique de cryodécapage.

89
Q

Quels sont les deux types de microscopie cryo? Quels sont leurs caractéristiques?

A
  1. Cryotomographie électronique; imagerie en strate de l’échantillon, ce qui permet la reconstruction 3D.
  2. Cryoéléctromicroscopie (CEM); vitrification de l’eau, ce qui permet d’observer les organismes dans leur état intègre.
90
Q

Qu’est-ce que la microscopie confocal à balayage laser?

A

C’est la microscopie qui utilise un laser et des pinholes pour filtré la lumière qui se trouve hors-focus. Créé dans l’optique de minimaliser le flou généré en fluorescence widefield.

91
Q

Quel est l’avantage principal qu’offre la microscopie confocal à balayage laser? Quels sont les désavantages principaux? (3)

A

Elle permet de former un modèle 3D d’un spécimen qui peut aussi se faire dans le temps.

Les désavatanges sont:
1. Le processus est très lent
2. Est peu sensible, donc peu évident pour les organismes sensibles ou les fluorophore faibles.
3. Peu pertinent pour les organismes minces

92
Q

Quels sont les deux types de microscopie à balayage à sonde? Quels sont leur mode de fonctionnement? Quels sont leurs deux points en commun?

A
  1. À force atomique; utilise une pointe placée au bout d’un levier pour visualiser la topographie d’une surface.
  2. À effet tunnel; utilise une pointe chargée pour mesurer le courant, ou l’interaction éléctronique, entre la molécule et la pointe.

Ces deux types (1) font du balayage de surface et (2) sont à l’échelle atomique, donc au-delà du vivant.

93
Q

Quels sont les six formes des cellules bactériennes vues en classe?

A
  1. Sphère (cocci)
  2. Bâtonnets (bacilles)
  3. Bâtonnets incurvés
  4. Spirales (spirilles ou spirochètes)
  5. Hyphes
  6. Pléomorphes
94
Q

Quels sont les tailles des cellules bactérienne de manière générale?

A

Diamètre: 0.5-1.5 microns
Longueur: 1-10 microns

95
Q

Quels sont les quatres association bactériennes possible vues en classe?

A
  1. Bacilles (1-2 cellules ensemble)
  2. Grappes
  3. Chaîne
  4. Autre (Cubes, Octades, Rosettes, diplocoques[paires])
96
Q

Où se trouve la paroi cellulaire bactérienne? Est-ce que tous les bactéries ont un paroi cellulaire? Quelle sera la différence principale entre les organismes dépourvus et pourvus d’une paroi?

A

Collée sur l’extérieur de la membrane cytoplasmique. Non, par exemple les mycoplasma et les thermoplasma.
La différence principale sera la rigidité de leur corps, les mycoplasma et les thermoplasma auront un flexibilité qui ressemble aux amibes.

97
Q

La paroi cellulaire est composée de quoi chez les eubactéries?

A

De peptidoglycanes; La partie glycane est composée de N-acétylglucosamine (NAG) et de N-acétylmuramique (NAM). Tandis que la partie peptidique est formé de tétrapeptides surtout de forme D; donc D-Alanine et D-Glutamate.

98
Q

Que pouvons nous dire sur la structure et la composition chimiques des archées?

A

Ils partagent une structure quasi identique aux bactéries, seulement la composition biochimique sera différente.

99
Q

Qui à découvert la coloration qui utilise le violet de Crystal et le rouge safranine et en quelle année?

A

Christian Gram en 1883

100
Q

Quels sont les étapes de coloration de Gram? (5) Que se passe-t-il à l’étape de décoloration?

A
  1. Fixation
  2. Violet de crystal
  3. Iode/ lugol (fixation)
  4. Éthanol (décoloration)
  5. Rouge de safranine (contre-colorant)

Pendant l’étape de décoloration à l’alcool, les pigments (de violet de crystal) qui ne sont pas fixé aux structures sont débarrasés.

101
Q

Sur quelle structure se fixe le violet de crystal? Sur quel type d’organisme retrouvons-nous cette structure?

A

Sur les acides téichoïques ou les lipotéichoïques, nous retrouvons ces structures seulement sur les bactéries Gram positif.

102
Q

Qu’est-ce que la transpeptidation?

A

C’est le processus auquel les transpeptidase forment des liens peptidiques entre les chaînes glycanes. On appelle ces liens des ponts interchaîne.

103
Q

Entre les bactéries Gr+ et celles Gr-, laquelle des deux possède la plus grande quantité de peptidoglycanes? Quelle caractéristique cela leur accorde-t-il?

A

Celle Gr+, possède une plus grande rigidité au niveau de la paroi.

104
Q

Chez les Gr-, quels sont les trois sections de la paroi cellulaire?

A
  1. La portion externe
  2. L’espace périplasmique
  3. Portion intérieur
105
Q

Que contient la portion externe de la paroi cellulaire des bactéries Gr-? Dans cette structure, quels sont les trois principaux constituants?

A

La membrane externe, contient principalement des protéines, les phospholipides et des lipopolysaccharides (LPS).

106
Q

Chez les Gr-, quelle protéine est la plus présente dans la membrane externe? Quels sont ses deux rôles?

A

La porine; permet le transport et offre une sélection physique du milieu extracellulaire.

107
Q

Chez uniquement quel organisme retrouvons-nous des lipopolysaccharides (LPS)? Quel est leur rôle principal ainsi que leur effet chez les mammifères?

A

Chez les Gr- uniquement. Ils ont le rôle d’antigène O et sont des toxines violentes pour les mammifères.

108
Q
A

A24 (3 decks)

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