Micro 1: Bactérie et microbiote Flashcards

1
Q

Est-ce qu’une bactérie est un procaryote?

A

Oui

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Q

Nomme les parties d’une bactérie.

A
  • Membrane cellulaire
  • Peptidoglycan
  • Un chromosome circulaire
  • Paroi cellulaire
  • Plasmide
  • Cytoplame
  • Ribosomes 70s
  • Flagelle?
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Q

Nomme des eucaryotes.

A
  • Algues
  • Fungi
  • Protozoaires
  • Plantes
  • Animaux
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4
Q

Nomme les parties d’une cellules eucaryote.

A
  • Mitochondrie
  • Membrane cellulaire
  • Cytoplasme
  • Noyau
  • Nucléus
  • Réticulum endoplasmique lise et rugueux
  • Appareil de Golgi
  • Ribosomes 80s
  • Lysosome
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Q

De quoi sont constitués les chromosomes procaryotes?

A

ADN

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6
Q

Caractéristiques des ribosomes des procaryotes?

A

70S (50S + 30S)

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7
Q

Est-ce que la membrane cellulaire des procaryotes contient des stérols?

A

Non, sauf pour les mycoplasmes

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8
Q

Décrit la paroi cellulaire des procaryotes.

A
  • Protéines et peptidoglycanes
  • +/- acide téichoïque et/ou lipopolysaccharides
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9
Q

Reproduction des procaryotes?

A

Reproduction asexuée (fission binaire)

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10
Q

Comment les procaryotes font-ils de l’ATP?

A

Via la membrane cytoplasmique

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11
Q

Nomme les 4 catégories de bactéries selon la forme.

A
  • Cocci
  • Bâtonnet
  • Coccobacille
  • Spiralée
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12
Q

Nomme les deux catégories de bactéries selon la coloration Gram.

A
  • Gram +
  • Gram -
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13
Q

Sur quoi peut être fait le prélèvement des bactéries en vue d’une coloration Gram?

A
  • Peut être faite sur certains échantillons (ex.: prélèvement de pus)
  • Peut être faite sur une colonie bactérienne présente sur une gélose nutritive
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14
Q

Décrit le protocole de la coloration de Gram.

A
  1. Coloration au violet de cristal
  2. Fixation au lugol
  3. Décoloration à l’alcool-acétone
  4. Coloration à la safranine
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15
Q

Dernière étape de la coloration de Gram pour Gram -?

A

Bactéries décolorées par l’alcool et recolorées rouge

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16
Q

Dernière étape de la coloration de Gram pour Gram +?

A

Bactéries non décolorées
par l’alcool restent bleues

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17
Q

Coloration de gram avant la coloration?

A

-: rien
+: rien

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18
Q

Coloration de gram violet de cristal?

A

-: bleu
+: bleu

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19
Q

Coloration de gram lugol?

A

-: bleu
+: bleu

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20
Q

Coloration de gram décoloration à l’alcool acétone?

A

+: bleu
-: blanc

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21
Q

Coloration de gram safarine?

A

+: bleu
-: rouge

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22
Q

Pourquoi le violet de cristal reste accroché à la paroi cellulaire des bactéries Gram positif?

A

Car elle va s’attacher au peptidoglycane qui est épais dans les gram +, mais mince chez les gram -

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23
Q

Décrit la paroi cytoplasmique d’un gram +.

A
  • Peptidoglycane
  • Acide téichoique
  • Acide lipotéichoique
  • 2 Couches de phospholipides
  • Protéines structurales
  • Protéines enzymatiques
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24
Q

Décrit la membrane cytoplasmique d’un gram -.

A
  • Membrane extérieure
  • Peptidoglycane
  • Periplasmic space
  • 2 Couches de phospholipides
  • Protéines structurales
  • Protéines enzymatiques
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25
Rôle de la membrane cytoplasmique chez les bactéries?
* Produit l'ATP * Permet l'entrée et la sortie de certains nutriments/substances * Contient des protéines structurales qui contribuent à la forme de la bactérie
26
À quoi sert le peptidoglycan chez les gram+?
* Forme et structure * Protection de l'environnement * Tuer
27
À quoi sert l'acide teichoique chez les gram+?
* Renforce la paroi cellulaire * Séquestre le Ca et les ions
28
À quoi sert l'acide lipoteichoique chez les gram+ ?
Active le SI inné de l'hôte
29
À quoi sert le peptidoglycan chez les gram-?
* Forme et stucture
30
De quoi est fait la membrane extérieure des gram- ?
* Phospholipides * LPS * Protéines * Enzymes
31
À quoi sert la membrane externe des gram- ?
* Structure * Protection contre l'environnement de l'hôte
32
Nomme deux protéines des gram-.
* Porin channel * Secretory devices I-V
33
Rôle des porin channel?
* Perméable aux petites molécules hydrophiles * Protège de certains antibiotiques
34
À quoi servent les secretory devices I-V?
Pénètre et livre des protéines dans la membrane, incluant les facteurs de virulence
35
Nomme 3 LPS des gram-.
* Lipid A * Core polysaccaride * O antigen
36
Fonction des LPS des gram- ?
* Structure de la membrane externe * Barrière de protection * Activateur potentiel du SI inné de l'hôte
37
Différence entre la membrane cytoplasmique des gram - et des gram +?
* Contrairement aux bactéries Gram positif, la couche de peptidoglycane est mince chez les gram- * Leur paroi cellulaire est entourée d’un espace périplasmatique et d’une membrane externe
38
Nomme 4 structure des bactéries pas toujours présente.
* Capsule * Biofilm * Pili * Flagelle
39
Fonction de la membrane cytoplasmique et de la paroi cellulaire?
* Squelette * Manger et uriner * Produire de l’énergie * Bouger (si elle a un ou des flagelles) * Échanger du matériel génétique (pili)
40
Les bactéries pathogènes peuvent...
* Adhérer à certaines cellules * Essayer d’échapper au système immunitaire (S.I.) * Synthétiser des enzymes pour résister au S.I. * Synthétiser des enzymes pour détruire les tissus * Synthétiser des exotoxines
41
Comparaison Gram- vs Gram+: membrane extérieure?
Gram+: non Gram-: oui
42
Comparaison Gram- vs Gram+: Peptidoglycan?
Gram+: épais Gram-: mince
43
Comparaison Gram- vs Gram+: Lipopolyaccharides?
Gram+: non Gram-: oui
44
Comparaison Gram- vs Gram+: Endotoxin?
Gram+: non Gram-: oui
45
Comparaison Gram- vs Gram+: Acide telchoic?
Gram+: oui Gram-: non
46
Comparaison Gram- vs Gram+: Sporulation?
Gram+: des fois présent Gram-: non
47
Comparaison Gram- vs Gram+: Capsule?
Gram+: souvent Gram-: souvent
48
Comparaison Gram- vs Gram+: Lysozyme?
Gram+: sensible Gram -: résistant
49
Comparaison Gram- vs Gram+: Susceptibilité à la sécheresse et à la disruption physique?
Gram+: moins Gram-: plus
50
Comparaison Gram- vs Gram+: Production d'exotoxine?
Gram + et -: certaines souches
51
Nomme 3 cocci gram +.
* Staphylococcus * Streptococcus * Enterococcus
52
Nomme 2 cocci gram -.
* Neisseria * Moraxella
53
Nomme 5 bâtonnets gram +.
* Bacillus * Clostridium * Clostridioides * Listeria * Corynebacterium
54
Nomme 10 bâtonnets gram -.
* Yersinia * Campylobacter * Pseudomonas * Haemophilus * Bacteroides * Escherichia coli * Klebsiella * Proteus * Salmonella * Shigella
55
Nomme un cocci gram + en amas.
Staphylococcus
56
Nomme un cocci gram + en paires.
Streptococcus pneumoniae
57
Nomme deux cocci gram + en chaines.
* Streptococcus (autres que pneumoniae) * Enterococcus
58
Dr Legendre, résidente 1, est appelée pendant sa garde. L’infirmière l’informe que la technicienne du laboratoire de microbiologie l’a avisée par téléphone d’un résultat critique : M. Tremblay a 2 hémocultures positives à cocci Gram positif en amas. Quelle est la bactérie?
Staphylococcus
59
Qu'est-ce qu'une bactérie sporulée?
Qui peut produire des spores.
60
Nomme 3 bâtonnets gram + sporulés.
* Clostridium * Clostridioides * Bacillus
61
Est-ce que certain gram - sont sporulés?
NON
62
Structure des bactéries sporulées?
Structure ronde, très résistante qui peut survivre sans nourriture
63
Quand une bactérie végétative passe-t-elle en forme sporulée?
Lorsque les conditions de survie sont dangereuses pour la bactérie.
64
Nomme les 3 principales géloses.
* Sang de mouton * Chocolat * MacConkey
65
Atmosphère d'incubation des géloses?
* Dans une étuve à l’air ambiant (21% d’O2) * Dans une étuve à CO2 (5% d’O2) * Dans une tente anaérobie (absence d’O2)
66
Nomme 2 bâtonnets gram + anaérobie stricte.
* Clostridium * Clostridioides
67
Nomme 1 bâtonnets gram- anaérobie strictes.
* Bacteroides
68
Nomme une bactérie aérobie stricte.
Pseudomonas
69
Nomme 3 bactéries qui ne peuvent pas être classifiées par la coloration de Gram.
* Mycobactéries * Mycoplasma * Chlamydia
70
Décrit les mycobactéries.
Paroi riche en acide mycolique (waxy outer shell) qui interfère avec la coloration de Gram.
71
Décrit les mycoplasma.
Absence de peptidoglycane dans la paroi cellulaire
72
Décrit les chlamydia.
Très petites bactéries, non cultivables sur des géloses, qui se multiplient uniquement dans des cellules grâce à des structures appelées «corps élémentaires» et «corps réticulés»
73
Qu'est-ce que le Human Microbiome Projet?
* Analyse la composition génétique de la population microbienne qui vit «sur» et «dans» les adultes en santé (microbiome) * Ratio bactéries : cellules humaines est de 10:1
74
Le fétus vit dans un milieu __________.
stérile
75
Que se passe-t-il à la naissance? (au niveau des bactéries)
À la naissance, le bébé entre en contact avec la flore normale de sa mère : c’est le début de la colonisation de sa peau et de son système digestif par une «flore normale»
76
Qu'est-ce que le microbiote?
Le microbiote est l’ensemble des micro-organismes qui résident sur un site donné : la peau, les narines, le tractus génito-urinaire, le tractus digestif, etc.
77
Qu'est-ce que le microbiome?
Le microbiome est l’ensemble des micro-organismes et de leurs gènes qui résident sur un site donné
78
Décrit en trois points le microbiome central.
* Espèces bactériennes présentes chez > 95% des personnes humaines à un site donné * Représente la majorité des bactéries présentes à un site donné * Moins varié que le microbiome secondaire
79
Décrit en trois points le microbiome secondaire.
* Espèces bactériennes qui diffèrent d’un individu à l’autre * Grande variété d’espèces * Chaque espèce est en plus petite quantité comparativement au microbiome central
80
Nomme 3 bactéries du microbiome central de la peau.
Staphylococcus epidermidis Corynebacterium Propionibacterium
81
Nomme 3 bactéries du microbiome central de la bouche.
Streptococcus viridans Neisseria Corynebacterium
82
Nomme 5 bactéries du microbiome central du côlon.
Escherichia coli Klebsiella Proteus Enterococcus Bacteroides (intestin)
83
Nomme une bactérie du microbiome central du vagin.
Lactobacillus
84
Par quoi est influencé le microbiote de la peau?
* Site * Présence ou non de glandes sébacés + humidité * Sexe
85
Quantité de microorganisme dans la salive?
10^9 microorganimes/mL
86
Quantité de microorganisme dans l'estomac?
10^3 organismes/mL
87
Quantité de microorganisme dans l'intestin grêle?
10^4 organisme/g
88
Quantité de microorganisme dans le côlon?
10^11 organismes/g
89
Qu'est-ce que le tractus digestif?
Système ouvert de la bouche à l’anus
90
Selon quoi varie la diversité et la quantité de bactérie du tractus digestif?
Selon le segment
91
Décrit les bactéries du côlon.
* 100,000,000,000 bactéries * Bactéries anaérobies strictes plus nombreuses que les bactéries aérobies * > 200 espèces * Dont la majorité sont non cultivables * Identifiées principalement par séquençage moléculaire
92
En fonction de quoi le microbiote humain varie-t-il?
* D’une personne à l’autre * D’une région géographique à l’autre * En fonction de l’âge
93
Qu'amène une alimentation variée au niveau du microbiote?
Microbiote diversifié
94
Vrai ou faux? L’analyse du microbiote ne permet pas de prédire le développement éventuel d’une maladie.
Vrai
95
Microbiote d'un nouveau-né?
Dépend du mode d'accouchement
96
Microbiote d'un accouchement vaginal?
Vient de la mère
97
Microbiote d'une césarienne?
* Plus de risque de contamination par certains pathogènes * Plus de risques de maladies atopique
98
Microbiote de l'enfance?
* Nouvelles souches qui vont être en plus grand nombre que les anciennes * Diversité +++ * Instabilité du microbiote * Dépend de la diète et des maladies
99
Microbiote de l'adulte?
* Distinct * Le microbiote pet continuer de changer, mais plus lentement
100
Microbiote d'une personne âgée?
Très différent de celle des adultes
101
Nomme les 3 rôles du microbiote intestinal.
1. Fonctions métaboliques 2. Stimule l’immunité innée 3. Prévient la colonisation par des bactéries pathogènes
102
Que permet le métabolisme par le microbiote intestinal?
* Grosses molécules d’hydrates de carbone comme la cellulose sont transformées en petites molécules (acétate, propionate et butyrate) facilement absorbées par les cellules hôtes. * Les acides comme l’acétate, le propionate et le butyrate limitent la croissance de certaines bactéries indésirables.
103
Nomme les 2 rôles du microbiote intestinal.
* Métabolise certains nutriments plus facilement ce qui les rend disponibles aux cellules hôtes * Protège contre certaines infections entériques…
104
Comment le microbiote intestinal nous protège-t-il des infections entériques?
* En tapissant la muqueuse (sert de rempart) et en consommant les nutriments (affame les pathogènes) * En stimulant la production de mucine, d’immunoglobuline IgA et des peptides antimicrobiens (AMPs) * En stimulant la production d’IL-22 (↑ résistance cell épithéliales) et d’IL-1β (↑ recrutement de cellules inflammatoires).
105
Nomme 4 facteurs externes qui influencent le microbiote.
* Hygiène personnel (savon, déodorant, rince-bouche, douche vaginale) * Diète (riche en fibre, en graisse, en sucre) + diversifiée ou non * H2O (avec chlore vs eau de puits) * Prise d’antibiotique
106
Nomme 5 dysbiose.
1. Diarrhée à Clostridioides difficile (DACD) 2. Colite ulcéreuse 3. Maladie céliaque (entéropathie au gluten) 4. Vaginite à Candida 5. Obésité
107
Décrit la diarrhée à Clostridioides difficile.
* Prise d’antibiotique qui altère la flore normale du côlon * Prolifération du C. difficile (perte de la compétition alimentaire) * C. difficile qui produit des toxines responsables de la diarrhée
108
Décrit la colite ulcéreuse.
* Prolifération de la bactérie **Akkermansia** muciniphila qui produit une sulfatase qui dégrade la couche de mucine. * Augmentation de **Prevotellaceae** qui produit des chemokines inductrices d’inflammation.
109
Décrit l'obésité (dysbiose).
Personnes qui ont des bactéries intestinales plus efficaces à transformer des gros hydrates de carbone en petites molécules facilement absorbables
110
Est-ce qu'il est possible de manipuler le microbiote humain à des fins thérapeutiques?
Oui
111
Que sont les probiotiques?
Mélanges de bactéries et/ou de levures ingérées dans le but de coloniser, même temporairement, l’intestin.
112
Que contiennent la majorité des probiotique?
La majorité des probiotiques contiennent des bactéries **Gram positif** comme les Bifidobacterium et les Lactobacillus et des levures comme les Saccharomyces.
113
De quoi dépend l'efficacité des probiotiques?
L’efficacité dépend des microorganismes choisis, de la dose, de la survie des microorganismes après le passage dans l’estomac (acidité).
114
Différence entre un médicament et un probiotique?
Contrairement aux médicaments, moins bon contrôle sur la composition exacte et la [ ] résiduelle de microorganismes après le passage dans l’estomac.
115
Qu'est-ce que la pouchite?
Inflammation du réservoir dans le cas d'une colectomie totale avec anastomose iléo-rectale
116
Qu’est-ce que l’entérocolite nécrosante?
* Maladie qui touche l’intestin * Enfant né prématurément (< 37 semaines de grossesse) * Se manifeste par un gonflement de l’abdomen, du sang dans les selles et de l’air dans la paroi de l’intestin. * Prédisposition génétique + intestin immunoréactif + réponse inflammatoire immature * Dysbiose du tractus digestif? * Mortalité : 20 -30%
117
Est-ce que l'INESSS recommande l'usage de probiotique pour la prévention/traitement de la DACD?
Non
118
Contre-indication des probiotiques?
Immunosupprimés
119
Nomme 3 probiotiques en vente libre.
* Lactobacillus acidophilus CL1285 * Lactobacillus casei LBC80R * Lactobacillus rhamnosus CLR2
120
Nomme 3 bactéries dans le yaourt.
* Bifidobacterium lactis * Lactobacillus casei * Lactobacillus acidophilus
121
Qu'est-ce qu'une dysbiose?
Altération de la flore normale
122
Qu'est-ce qu'une transplantation fécale?
Transfert de microorganismes de la flore fécale d’un donneur sain à une personne malade. Quatre méthodes possibles : colonoscopie, tube naso-gastrique, lavement intestinal ou ingestion de capsules (non commercialisées jusqu’à maintenant)
123
Qu'est-ce qu'un probiotique?
Mélange d’espèces spécifiques de bactéries et/ou de levure ingérées dans l’espoir d’apporter un bénéfice à l’hôte
124
Qu'est-ce qu'un prébiotique?
Produits alimentaires administrés pour favoriser la croissance de microorganismes endogènes désirables
125
Pourquoi le violet de cristal ne tient pas sur les gram -?
Car la couche de peptidoglycan est trop mince
126
Qu'est-ce qui est sur la membrane des gram - qui est très dangereuse pour l'humain?
LPS *lipopolysaccharide*
127
Que contient la paroi cellulaire des gram +?
* Peptidoglycane * Acide telchoic * Acide lipotelchoique * Protéines
128
Que contient la paroi cellulaire des gram -?
* Peptidoglycane * Espace périplasmique * Membrane externe * Protéines * LPS
129
De quoi est faite la capsule?
Polysaccharides ou polypeptides
130
À quoi sert la capsule?
Antiphagocyte
131
De quoi est fait le biofilm?
Polysaccharides
132
À quoi sert le biofilm?
S'attache aux corps étrangers
133
De quoi est fait le pilli?
Pilin Adhésine
134
À quoi sert les pillis?
* Adhérence * Échange de plasmides
135
De quoi est fait la flagelle?
* Protéines motrices * Flagelline
136
À quoi sert la flagelle?
Mobilité
137
Est-ce que la forme spore est pathogène?
Non
138
Nomme la bactérie aérobie stricte.
Pseudomonas
139
Pourquoi la coloration de gram ne fonctionne pas dans les selles?
Il y a trop de bactéries de la flore normale
140
Est-ce que les probiotiques sont tous reconnus comme étant bénéfiques?
Non, seulement certains mix particuliers