Métabolisme des acides aminés Flashcards

Question 1

Q

Vrai ou faux? Tout converge vers le cycle de Krebs.

Question 2

Q

Que sont les acides aminés?

Answer

A

Les acides aminés, en plus d’être les unités monomériques des protéines, sont des métabolites énergétiques et des précurseurs de composés azotés dont l’hème, les nucléotides et les coenzymes nucléotidiques.

Question 3

Q

Les acides aminés sont classés en 2 groupes. Quels sont-ils?

Answer

A

Essentiels : doivent être présents dans l’alimentation. Si consommés en excès, ils ne sont pas mis en réserve ni excrétés mais plutôt transformés en intermédiaires métaboliques comme le pyruvate, l’a-cétoglutarate et l’oxaloacétate.

Non essentiels : synthétisés à partir de précurseurs métaboliques.

Question 4

Q

Les acides aminés sont précurseur pour la formation de quoi?

Answer

A

Les acides aminés sont des précurseurs pour la synthèse du glucose, des acides gras et des corps cétoniques.

Question 5

Q

Vrai ou faux? On peut faire du glucose à partir des acides aminés.

Question 6

Q

Vrai ou faux? Les acides aminés sont des carburants métaboliques.

Question 7

Q

Quels tissus ont une certaine capacité de synthèse des acides aminés?

Answer

A

Tous les tissus ont une certaine capacité de synthèse des acides aminés non-essentiels et de remodelage d’acides aminés.

Question 8

Q

Quel est le principal site du métabolisme de l’azote?

Answer

A

Le foie est le principal site du métabolisme de l’azote (cycle de l’urée).

Question 9

Q

En période d’excédents alimentaires, qu’est-ce qu’il arrive avec le foie avec l’azote?

Answer

A

En période d’excédents alimentaires, l’azote (sous forme d’ammoniac) potentiellement toxique provenant de la dégradation des acides aminés est éliminé par transamination, désamination, et formation de l’urée. Les squelettes de carbone restants sont généralement conservés sous forme de glucides par l’intermédiaire de la gluconéogenèse ou sous forme d’acide gras par les voies de synthèse des acides gras.

Question 10

Q

La digestion des protéines alimentaires se fait où?

Answer

A

Dans l’intestin et un peu dans l’estomac aussi.

Question 11

Q

Que se passe-t-il avec les acides aminés en excès de ceux requis pour la biosynthèse protéique?

Answer

A

Les acides aminés en excès de ceux requis pour la biosynthèse protéique ne peuvent pas être entreposés ni excrétés. Ils sont plutôt utilisés comme carburant métabolique.

Question 12

Q

Que se passe-t-il avec les protéines mal repliées ou endommagées?

Answer

A

Les protéines mal repliées ou endommagées doivent également être dégradées (suite à leur ubiquitination).

Question 13

Q

Qu’est-ce qui représente un apport continu en acides aminés dans la cellule?

Answer

A

La digestion des protéines alimentaires dans l’intestin et leur dégradation en acides aminés dans les cellules représente un apport continu en acides aminés dans la cellule. Les protéines alimentaires sont une source vitale d’acides aminés, particulièrement les protéines qui contiennent des acides aminés essentiels.

Question 14

Q

Comment se passe le processus dégradation des protéines?

Answer

A

La digestion des protéines débute dans l’estomac où l’environnement acide favorise la dénaturation.

Les protéines dénaturées deviennent davantage accessibles aux protéases dont la pepsine, une protéase de l’estomac qui est active à pH de 2. Les protéines dénaturées sont alors dégradées en polypeptides.

La dégradation se poursuit dans l’intestin. Le pancréas sécrète une variété d’enzymes protéolytiques dans l’intestin. Ces enzymes dégradent les polypeptides en acides aminés et en di- et tripeptides.

D’autres enzymes protéolytiques localisées dans la membrane cellulaire, dont l’aminopeptidase N, participent également à la dégradation.

Question 15

Q

Une fois les protéines dégradées en acides aminés, di-peptides et tri-peptides dans l’estomac, où vont-ils?

Answer

A

Les acides aminés de même que les di- et tripeptides sont transportés dans les cellules intestinales pour ensuite être relâchés dans la circulation sanguine pour être transportés et absorbés par les autres tissus.

Question 16

Q

Combien y a-t-il d’acides aminés en circulation comparé aux di et tri-peptides?

Answer

A

Il y a presque seulement des acides aminés en circulation.

Question 17

Q

Vrai ou faux? La demi-vie des protéines (« turnover »), la dégradation et resynthèse de protéines, se produit en permanence dans la cellule.

Question 18

Q

Comment caractériser la durée de vie des protéines?

Answer

A

Certaines protéines sont très stables alors que d’autres ont une courte vie, particulièrement celles qui participent à la régulation du métabolisme énergétique.

Question 19

Q

Les cellules doivent éliminer quelles protéines? Pourquoi est-ce important de les éliminer?

Answer

A

Les cellules doivent également éliminer les protéines défectueuses suite à des erreurs de traduction ou de repliement.

Des protéines normales au départ peuvent devenir endommagées ou être altérées avec le temps.

Il est important d’éliminer ces protéines puisque des pathologies, dont certaines formes de la maladie de Parkinson et de Huntington, sont causées par l’agrégation anormale de protéines.

Question 20

Q

Quelles sont les enzymes qui dégradent les protéines endommagées?

Answer

A

Les peptidases.

Question 21

Q

Le processus de dégradation des acides aminés converge vers quoi?

Answer

A

Comme les voies de dégradation des glucides et des acides gras, le processus de dégradation des acides aminés converge également vers le métabolisme central où le squelette de carbone de la plupart des acides aminés est dirigé vers le cycle de Krebs.

Question 22

Q

Quelle est la distinction importante à faire entre la dégradation des acides aminés et les autres processus cataboliques? Qu’est-ce que cela change?

Answer

A

Une distinction importante entre la dégradation des acides aminés et les autres processus cataboliques est la présence d’un groupement aminé.

Ainsi, la voie de dégradation des acides aminés inclut une étape clé au cours de laquelle le groupement aminé est séparé du squelette de carbone ➛ désamination.

Le groupement aminé sera dirigé vers le cycle de l’urée.

Question 23

Q

Quelles sont les 2 étapes de la dégradation classique des acides aminés?

Answer

A

Désamination (retrait du groupement aminé), où le groupement aminé donne de l’ammoniac ou bien forme le groupement aminé de l’aspartate.
Transformation des squelettes carbonés des acides aminés (les acides a-cétoniques formés par désamination) en intermédiaires métaboliques.

Question 24

Q

La dégradation des acides aminés commence toujours par quoi? Cela conduit à quoi?

Answer

A

Dégradation des acides aminés commence toujours par le départ du groupement α-aminé

Conduit à :
• L’excrétion de l’azote en excès.
• La dégradation du squelette carboné restant ou sa transformation en glucose.

Question 25

Q

Quel est le principal produit d’excrétion azoté chez les mammifères terrestres?

Answer

A

C’est l’urée.

Question 26

Q

Comment est synthétisé l’urée?

Answer

A

L’urée est synthétisée à partir d’ammoniac et d’aspartate qui eux proviennent principalement du glutamate, produit de la plupart des réactions de désamination.

Question 27

Q

Quel est le produit le plus fréquent des réactions de désaminations?

Answer

A

C’est le glutamate. Tout converge vers le glutamate.

Question 28

Q

La plupart des acides aminés sont désaminés par quoi?

Answer

A

Transamination, qui est le déplacement du groupement amine.

Question 29

Q

Qu’est-ce que la transamination? Par quoi est-elle catalysée? Quel est l’accepteur de groupement amine?

Answer

A

C’est le transfert du groupe aminé à un acide a-cétonique pour donner l’acide α-cétonique correspondant à l’acide aminé de départ et un nouvel acide aminé.

Catalysée par des aminotransférases (ou transaminases).

L’accepteur de groupement amine le plus fréquent est l’a-cétoglutarate ce qui conduit à la formation de glutamate comme nouvel acide aminé

Question 30

Q

Quel est le produit de toute transamination?

Answer

A

C’est le glutamate, car c’est le substrat sur lequel il y a un transfert est l’α-cétoglutarate.

Question 31

Q

Les réactions des aminotransférases se font en 2 étapes. Quelles sont-elles?

Answer

A

Le groupement aminé d’un acide aminé est transféré sur l’enzyme, ce qui donne l’acide a- cétonique correspondant et l’enzyme aminée :
acide aminé + enzyme = acide a-cétonique + enzyme—NH2
Le groupement aminé est ensuite transféré à l’acide cétonique accepteur (ex. l’a-cétoglutarate&raquo_space;> oxaloacétate) ce qui donne comme produit un nouvel acide animé (ex. glutamate&raquo_space;> aspartate) et régénère l’enzyme :
a-cétoglutarate + enzyme—NH2 = enzyme + glutamate
oxaloacétate + enzyme—NH2 = enzyme + aspartate

Question 32

Q

Les aminotransférases utilisent quelle coenzyme? Qu’est-ce que cela leur permet de faire? Comment sont-ils liés ensembles?

Answer

A

Pour accepter le groupement aminé, les aminotransférases utilisent une coenzyme à groupement aldéhyde, le pyridoxal-5’-phosphate (PLP), un dérivé de la pyridoxine (vitamine B6).

Le PLP est lié à l’enzyme par covalence via une base de Schiff (imine).

Question 33

Q

Il existe des aminotransférases pour quels acides aminés?

Answer

A

Il existe des aminotransférases pour tous les acides aminés sauf la thréonine et la lysine.

Question 34

Q

Comment expliquer la spécificité des aminotransférases? Les groupements aminés sont destinés à la formation de quoi?

Answer

A

Elles ont des spécificités différentes pour la première étape de la réaction (presque chaque acide aminé possède son aminotransférase).

Cependant pour la seconde étape de la réaction, la plupart des aminotransférases n’accepte que l’a-cétoglutarate ou, à un degré moindre, l’oxaloacétate ce qui conduit à la formation de glutamate ou d’aspartate.

Les groupements aminés de la plupart des acides aminés sont par conséquent destinés à la formation de glutamate ou d’aspartate qui sont eux-mêmes interconvertis par la glutamate-aspartate aminotransférase:
glutamate + oxaloacétate = a-cétoglutarate + aspartate

Question 35

Q

Quel est le rôle de la glutamate-aspartate aminotransférase?

Answer

A

Les groupements aminés de la plupart des acides aminés sont par conséquent destinés à la formation de glutamate ou d’aspartate qui sont eux-mêmes interconvertis par la glutamate-aspartate aminotransférase:
glutamate + oxaloacétate = a-cétoglutarate + aspartate

Cela a lieu pour éviter d’avoir trop de glutamate.

Question 36

Q

Dans le cycle glucose-alanine, quel est l’acide aminé produit? Où sera-t-il transporté et pourquoi?

Answer

A

C’est l’alanine qui est libère dans la circulation sanguine et transporté au foie où après transamination il forme du pyruvate qui sera utilisé dans la gluconéogénese. Le glucose formé retourne aux muscles où après glycolyse il donne du pyruvate.

Question 37

Q

Dans le cycle glucose-alanine, qu’est-ce que les aminotransférases musculaires acceptent?

Answer

A

Un groupe d’aminotransférases musculaires acceptent le pyruvate comme acide α-cétonique substrat (étape 2 de la transamination).

Question 38

Q

Le cycle glucose-alanine assure quoi? Quel est l’effet secondaire?

Answer

A

Le cycle glucose-alanine assure ainsi le transport de l’azote du muscle au foie.

L’effet secondaire est la génération de glucose, donc c’est une système doublement gagnant.

Question 39

Q

Dans le cycle glucose-alanine, le groupement amine forme quoi?

Answer

A

Le groupement aminé forme de l’ammoniac ou de l’aspartate utilisé dans le cycle de l’urée

Question 40

Q

Que se passe-t-il en cas de jeûne extrême avec le cycle glucose-alanine?

Answer

A

En cas de jeûne extrême, le glucose formé par cette voie dans le foie est aussi utilisé par les autres tissus périphériques ce qui arrête le cycle.

Dans ces conditions, le groupement aminé et le pyruvate proviennent tous les 2 de la dégradation des protéines musculaires permettant ainsi la formation de glucose pour d’autres tissus (rappel: les muscles ne font pas de gluconéogenèse).

Le glucose ne retourne pas au muscle mais reste dans la circulation sanguine pour maintenir la glycémie.

Question 41

Q

Vrai ou faux? La transamination est une désamination en soi.

Answer

A

Faux. La transamination n’est PAS une désamination en soi.

Question 42

Q

Quand est-ce que s’effectue la désamination? Par quoi est-elle catalysée? Qu’est-ce que cette réaction nécessite?

Answer

A

La désamination s’effectue dans un deuxième temps via une réaction catalysée par la glutamate déshydrogénase (GDH) où le glutamate subit une désamination oxydative avec formation d’ammoniac.

Cette réaction nécessite du NAD+ ou du NADP+ (une des rares enzymes qui peut utiliser l’un ou l’autre) comme agent oxydant et régénère l’a-cétoglutarate qui pourra être utilisé dans d’autres réactions de transamination.

Question 43

Q

Dans quels organes est-ce que la glutamate déshydrogénase est présente?

Answer

A

Majoritairement dans le foie et à un moindre niveau dans les reins.

Question 44

Q

Comment la glutamate déshydrogénase est régulée de façon allostérique?

Answer

A

La glutamate déshydrogénase est régulée de façon allostérique :
• INHIBÉE par : GTP et NADH, cela signifie que lorsque les besoins énergétiques sont satisfaits, la dégradation des acides aminés n’est pas nécessaire.
• ACTIVÉE par : ADP, leucine (on ne sait pas pourquoi la leucine l’active) et NAD+, lorsqu’on a besoin d’énergie

Question 45

Q

Il existe 3 mécanismes pour éliminer l’azote en excès qui résulte de la dégradation des acides aminés. Quels sont-ils?

Answer

A

Ammoniac–poissons(ammoniotéliques).
Urée : plupart des vertébrés terrestres (uréotéliques).
Acide urique : oiseaux et reptiles terrestres (uricotéliques).

Question 46

Q

Où est synthétisée l’urée? Par quelles enzymes? Où s’en va-t-elle après?

Answer

A

L’urée est synthétisée EXCLUSIVEMENT dans le foie par les enzymes du cycle de l’urée.

L’urée passe ensuite dans le sang pour être concentrée dans les reins et excretée dans l’urine.

Question 47

Q

Le cycle de l’urée comprend combien de réactions?

Answer

A

Le cycle de l’urée comprend 5 réactions: 2 mitochondriales et 3 cytosoliques.

Question 48

Q

Quelle est la réaction globale du cycle de l’urée?

Answer

A

Voir diapo 29.

Question 49

Q

Les 2 atomes d’azotés présents dans le cycle de l’urée proviennent de où? Et l’atome de carbone?

Answer

A

Les 2 atomes d’azote proviennent de l’aspartate et de l’ammoniac alors que l’atome de carbone provient du bicarbonate.

Question 50

Q

D’où proviennent les 2 groupements aminés de l’urée?

Answer

A

Un des groupement aminés de l’urée (vert) provient du NH3 produit par la réaction de la GDH. L’autre groupement aminé (rouge) est fourni par l’aspartate suite à une transamination.

Question 51

Q

Quelle est la première réaction du cycle de l’urée? Par quoi est-elle catalysée? Qu’est-ce qu’elle nécessite? Quelle est la thermodynamique?

Answer

A

C’est l’acquisition du 1er atome d’azote de l’urée.

Condensation et activation de NH3 et HCO3- catalysée par la carbamyl phosphate synthase (CPS) ➛ carbamyl phosphate.

Nécessite l’hydrolyse de 2 ATP.

Réaction pratiquement irréversible.

Réaction à vitesse limitante du cycle de l’urée ➛ régulation

Question 52

Q

Quelle est la deuxième étape du cycle de l’urée? Par quelle enzyme?

Answer

A

L’ornithine transcarbamylase transfère le groupement carbamyle du carbamyl phosphate sur l’ornithine donnant la citrulline ➛ 2 acides aminés non standards car ne se retrouvent pas dans les protéines.

Puisque la prochaine réaction se déroule dans le cytosol, la citrulline devra sortir de la mitochondrie via un transporteur antiport.

Question 53

Q

Quelle est l’étape limitante du cycle de l’urée?

Answer

A

La première.

Question 54

Q

Quelle est la troisième réaction du cycle de l’urée? Par quelle enzyme? Qu’est-ce que cela nécessite?

Answer

A

Entrée du second azote de l’urée.

L’argininosuccinate synthétase condense le groupement uréido de la citrulline avec le groupement aminé d’un aspartate ce qui donne l’argininosuccinate.

Nécessite 1 ATP.

Avec l’argininosuccinate, tous les constituants de la molécule d’urée sont réunis.

Question 55

Q

Qui suis je? Avec moi, tous les constituants de la molécule durée sont réunis.

Answer

A

L’arginosuccinate.

Question 56

Q

Quelle est la quatrième réaction du cycle de l’urée? Par quelles enzymes?

Answer

A

L’argininosuccinase va scinder la molécule d’argininosuccinate en arginine et fumarate. L’arginine est le précurseur immédiat de l’urée.

Le fumarate sera transformé par la fumarase en malate et par la malate déshydrogénase en oxaloacétate (Krebs). L’oxaloacétate sera utilisé pour la gluconéogenèse.

Question 57

Q

Quel est le précurseur immédiat de l’urée?

Answer

A

L’arginine est le précurseur immédiat de l’urée.

Question 58

Q

Quelle est la cinquième étape du cycle de l’urée?

Answer

A

L’arginase hydrolyse l’arginine en urée et ornithine.

L’ornithine rentre dans les mitochondries (même transporteur antiport que pour la citrulline) et le cycle peut recommencer.

Question 59

Q

Le cycle de l’urée transforme quoi en quoi? Au dépend de quoi?

Answer

A

Cycle de l’urée transforme 2 groupements aminés (un de NH3 et l’autre de l’aspartate) et 1 atome de carbone fourni par le bicarbonate en produit d’excrétion relativement non toxique, l’urée.

Cela se fait au dépend de l’hydrolyse de 4 liaisons riches en énergie :
3ATP➛2ADP+2Pi+1AMP+1PPi
1PPi➛2Pi

Question 60

Q

La régulation du cycle de l’urée se fait où? Comment?

Answer

A

La régulation du cycle de l’urée se fait essentiellement au niveau de la carbamyl phosphate synthase I (CPS-I) qui est activée allostériquement par le N-acétylglutamate.

La vitesse de production de l’urée par le foie est donc fonction de la [N- acétylglutamate] : la synthèse accrue d’urée est nécessaire lorsque dégradation des acides aminés augmente. L’augmentation de la vitesse de dégradation est signalée par une augmentation de la [glutamate] suite aux réactions de transamination :

Provoque l’augmentation de la synthèse de N-acétylglutamate.
Active la CPS-I.
Stimule le cycle de l’urée.

Question 61

Q

Qu’est-ce que le N-acétylglutamate?

Answer

A

N-acétylglutamate est un métabolite synthétisé à partir de glutamate et d’acétyl- CoA par la N-acétylglutamate synthase.

Question 62

Q

Qu’est-ce que le catabolisme des acides aminés? Combien d’énergie cela représente?

Answer

A

Il transforme les acides aminés en intermédiaires du cycle de l’acide citrique et/ou en leur précurseurs de sorte qu’ils puissent être métabolisés en CO2 et H2O ou utilisés dans la gluconéogenèse. Il transforme aussi en intermédiaires de Krebs pour mener à leur oxydation complète.

Cela représente ~15% de l’énergie métabolique produite par les animaux.

Question 63

Q

Les acides aminés sont dégradés en quels intermédiaires? Quels sont les 2 groupes?

Answer

A

Les acides aminés sont dégradés en l’un des 7 intermédiaires suivants : pyruvate, α-cétoglutarate, succinyl-CoA, fumarate, oxaloacétate, acétyl-CoA et acétoacétate (corps cétonique).

On peut donc répartir les acides aminés en 2 groupes selon leur catabolisme :

glucoformateurs (vert): forment a-cétoglutarate, succinyl-CoA, fumarate, oxaloacétate et qui sont des précurseurs du glucose.
cétogènes (rouge): forment acétyl-CoA ou acétoacétate et qui seront transformés en acides gras ou corps cétoniques.

Ceux qui forment du pyruvate sont glucoformateurs OU cétogènes

Certains acides aminés sont cétogènes ET glucoformateurs (Phe, Tyr).

Question 64

Q

Quels sont les acides aminés qui forment du pyruvate?

Answer

A

Alanine, cystéine, glycine, sérine, thréonine et tryptophan.

Answer 61

A

Alanine, cystéine, glycine, sérine, thréonine.

On pourrait rajouter le tryptophane à ce groupe car un de ses produits de dégradation est l’alanine.

Answer 62

A

La cystéine peut être transformée en pyruvate par des voies différentes dans lesquelles le groupement sulfhydryle est libéré sous forme de H2S, SO32- ou SCN-.

Answer 63

A

Via transamination par l’alanine aminotransférase.

Answer 64

A

Via déshydratation par la sérine déshydratase.

Answer 65

A

Via le complexe de clivage de la glycine qui fonctionne un peu comme complexe pyruvate déshydrogénase et comprend 4 protéines :

i. Décarboxylase
ii. Transporteur d’aminométhyle à lipoamide
iii. Aminométhyletransférase
iv. Dihydrolipoyl déshydrogénase à FAD, NAD+- dépendante.

Passe par la dégradation de la serine.

Answer 66

A

L’asparagine et l’aspartate.

Answer 67

A

L’asparagine est d’abord hydrolysée en aspartate par la L-asparaginase.

L’aspartate est transformée en oxaloacétate par transamination.

Answer 68

A

La L-asparaginase est un agent chimiothérapeutique efficace pour le traitement de certains cancers, dont la leucémie lymphoblastique. Ces cellules cancéreuses doivent acquérir leur asparagine par le sang et n’ont que très peu d’asparagine synthétase.

Answer 69

A

Arginine, glutamate, glutamine, histidine, proline

Answer 70

A

Via la glutamate déshydrogénase (NAD(P)+-dépendante).

Answer 71

A

Elle est transformée en glutamate via la glutaminase. Le glutamate est ensuite transformé via la glutamate déshydrogénase (NAD(P)+-dépendante) en α-cétoglutarate.

Answer 72

A

L’arginine est transformée en ornithine via l’arginase et libération d’urée (enzyme du cycle de l’urée).

L’ornithine est transformée en glutamate-5-semialdéhyde par l’ornithine-d-aminotransférase.

Le glutamate-5-semialdéhyde est ensuite transformé en glutamate par la glutamate 5-semialdéhyde déshydrogénase puis en a-cétoglutarate par la glutamate déshydrogénase.

Answer 73

A

Elle est transformée en pyrroline-5-carboxylate par la proline oxydase.

La pyrroline-5-carboxylate est transformée spontanément en un autre intermédiaire, le glutamate-5-semialdéhyde, pour ensuite être transformée en glutamate puis a-cétoglutarate.

Answer 74

A

Ce sont les acides aminés non-polaires.

La méthionine, l’isoleucine et la valine.

Answer 75

A

Dégradation de la méthionine implique la synthèse de SAM, S-adénosylméthionine (un important donneur de groupement méthyle dans la cellule), et de cystéine.

Answer 76

A

Méthionine est transformée en SAM par la méthionine adénosyltransférase ce qui nécessite une molécule d’ATP (ATP ➛ PPi + Pi).
SAM est ensuite déméthylé par une méthyltransférase pour former le S-adénosylhomocystéine.
Cet intermédiaire est hydrolysé en adénosine et homocystéine par l’adénosylhomocystéinase.
Homocystéine peut être méthylée pour reformer de la méthionine.
Homocystéine est condensée avec la sérine par la cystathionine b-synthase pour former la cystathionine.
Cystathionine est hydrolysée en cystéine et a-cétobutyrate par la cystathionine g-lyase.
L’a-cétobutyrate est transformé en propionyl- CoA par l’acide a-cétonique déshydrogénase.
9.10. Le propionyl-CoA forme du succinyl-CoA sous l’action successive de la propionyl-CoA carboxylase, méthylmalonyl-CoA racémase, méthylmalonyl-CoA mutase (tel que vu dans la dégradation des acides gras à nombre impair de carbones).

Answer 77

A

Le fumarate et l’acétoacétate.

Answer 78

A

La phénylalanine est hydroxylée en tyrosine.

Une même voie assure la suite de la dégradation de ces 2 acides aminés.

L’acétoacétate donnera 2 acétyl-CoA (cétogène).

Le fumarate est glucoformateur.

Answer 79

A

La phénylalanine hydroxylase (PAH) amorce la détoxification de hautes [phénylalanine] ainsi que la synthèse des catécholamines (à venir).

PAH est activée allostériquement par son substrat phénylalanine.

PAH est également activée par phosphorylation par PKA.

PAH est inhibée par le second substrat tetrahydrobioptérine.

Answer 80

A

Voir diapo 58.

Answer 81

A

La dégradation des acides aminés commence tout le temps par le retrait de l’azote. Cela s’effectue généralement par les transaminases qui transfèrent le groupement amine de l’acide aminé à dégrader sur un a-cétoglutarate pour former un glutamate. Et c’est ensuite le glutamate qui est désaminé (par la GDH).

Answer 82

A

En plus du glutamate, il y a quelques autres acides aminés qui sont désaminés directement. C’est le cas de la sérine (diapo 44).

Answer 83

A

La dégradation de l’arginine qui s’effectue généralement dans le contexte du cycle de l’urée (c’est pour cela qu’à la diapo 51 on voit que la dégradation de l’arginine commence avec le relâchement d’urée).

Answer 84

A

Donc ce qu’il faut retenir c’est qu’avant d’arriver à la dégradation du squelette carboné d’un acide aminé, il faut que le groupement amine soit retiré et que bien qu’il ne s’agisse pas toujours de la première réaction, il y a pratiquement toujours une réaction de transamination d’impliquée (diapos 44, 49, 51, 58).

Answer 85

A

Nucléotides
Coenzymes nucléotidiques
Hème
Hormones et neurotransmetteurs = amines biologiquement actives
Glutathion

Answer 86

A

Adrénaline qui stimule adénylate musculaire qui stimule glycogénolyse
Noradrénaline qui est impliquée dans l’attention, émotions, sommeil, apprentissage
Dopamine dont la carence cause le Parkinson
Sérotonine qui stimule la contraction des muscles lisses
Acide g-aminobutyrique (GABA) qui est un neurotransmitteur inhibiteur
Histamine qui est impliquée dans réponses allergiques et dans contrôle sécrétion d’acide par l’estomac

Leur biosynthèse implique la décarboxylation de l’acide aminé précurseur correspondant.

Answer 87

A

Le glutamate est transformé en GABA par la glutamate décarboxylase (PLP dépendante).

Answer 88

A

L’histidine est transformée en histamine par l’histidine décarboxylase (PLP dépendante).

Answer 89

A

La synthèse de la sérotonine à partir du tryptophane débute par une réaction d’hydroxylation par la tryptophane hydroxylase suivie de la décarboxylation par la décarboxlase des acides aminés aromatiques.

Answer 90

A

La mélatonine.

Answer 91

A

La transformation de la tyrosine en dopamine, noradrénaline et adrénaline se fait en 4 étapes :

Tyrosine est hydroxylée en L-DOPA par la tyrosine hydroxylase.
L-DOPA est décarboxylé en dopamine.
Seconde hydroxylation forme la noradrénaline.
Méthylation du groupement amine de la noradrénaline par SAM donne l’adrénaline.

Answer 92

A

En fonction des enzymes qu’elle exprime.

Ainsi dans les médullo-surrénales, l’adrénaline est le produit principal. Dans certaines régions du cerveau, la noradréaline est plus abondante. Dans la substantia nigra (substance noire), la voie s’arrête à la synthèse de la dopamine.

Answer 93

A

La maladie de Parkinson est causée par la dégénérescence des neurones de la substance noire.

On traite avec L-DOPA parce qu’il peut traverser la barrière hémato-encéphalique tandis que la dopamine ne peut pas.

Answer 94

A

De nombreux acides aminés sont uniquement synthétisés par des plantes et des microorganismes. Les mammifères doivent donc trouver ces acides aminés dans l’alimentation. Ce sont les acides aminés essentiels

Les autres acides aminés peuvent être synthétisés. Ce sont les acides aminés non essentiels.

Answer 95

A

La réponse est qu’au fil du temps évolutif, l’alimentation humaine a fourni des quantités suffisantes de ces acides aminés classés maintenant comme «essentiels».

Ainsi, la perte des voies métaboliques pour la synthèse des acides aminés essentiels n’a pas nuit à l’aptitude ou la forme (fitness) de l’espèce humaine.

La synthèse de ces acides aminés essentiels est donc devenue superflue et aucune pression évolutive n’a été imposée aux êtres humains pour conserver les gènes codant pour les enzymes de ces voies.

Answer 96

A

Oui.

Acides aminés non essentiels nécessitent moins d’étapes de synthèse que les acides aminés essentiels. Sauf la tyrosine (plus d’étapes mais peut être synthétisée).
Acides aminés non essentiels ont tendance à être plus abondamment représentés dans les protéines que les acides aminés essentiels.
Ainsi, la perte évolutive n’est pas aléatoire; les voies de biosynthèse perdues étaient celles pour les acides aminés nécessitant le plus de réactions.

Answer 97

A

La biosynthèse des acides aminés est d’avoir le squelette carboné de l’acide a- cétonique correspondant, “l’intermédiaire”, et de lui ajouter un groupement aminé (réaction de transamination) en utilisant le glutamate.

Answer 98

A

Tous les acides aminés non essentiels, sauf la tyrosine, sont synthétisés par des voies simples à partir de 4 intermédiaires classiques :
• Pyruvate
• Oxaloacétate
• a-cétoglutarate
• 3-phosphoglycérate

La tyrosine, classée comme non essentielle, est synthétisée par l’hydroxylation en 1 étape de l’acide aminé essentiel phénylalanine.

Answer 99

A

Par une réaction de transamination classique, tel que vu dans le cycle du glucose-alanine.

Answer 100

A

Par une réaction de transamination classique.

Answer 101

A

Suite à la réaction de transamination, l’aspartate est transformé en asparagine par une réaction d’amidation catalysée par l’asparagine synthétase.

Le second groupement amine est fourni par la glutamine qui elle générera du glutamate.

Cette réaction nécessite l’hydrolyse d’un ATP en AMP + PPi.

Answer 102

A

Par une réaction de transamination classique.

Answer 103

A

Suite à la réaction de transamination, le glutamate est transformé en glutamine par une réaction d’amidation catalysée par la glutamine synthétase.

Cette réaction hydrolyse une molécule d’ATP en ADP et le Pi est transféré sur l’intermédiaire g-glutamylphosphate.

Par la suite, le Pi est remplacé par un second groupement amine qui provient de l’ion ammonium (NH4+).

Answer 104

A

La sérine est formée à partir du 3-phosphoglycérate, un intermédiaire de la glycolyse, via un processus impliquant 3 réactions:

Le groupement 2-OH du 3-phosphoglycérate est transformé en cétone par la 3-phosphoglycérate déshydrogénase pour donner le 3-phosphohydroxypyruvate (acide cétonique phosphorylé analogue de la sérine).
Le 3-phosphohydroxypyruvate est transaminé en phosphosérine.
La phosphosérine est hydrolysée en sérine par la phosphosérine phosphatase.

Answer 105

A

La sérine peut ensuite être transformée en glycine par la sérine hydroxyméthyl transférase.

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Métabolisme des acides aminés Flashcards

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