Brainscape's Knowledge GenomeTM


Top Flashcards (Certified)
All Flashcards

molecular biology of the cell > mboc - week 2 > Flashcards

mboc - week 2 Flashcards

(153 cards)

Start Studying
1
Q

Epigenetic regulation

A

Heritable change in gene expression or genome function, door mitose gene expression and expression states (vooral planten) veranderlijk. Door meerdere delingen doorgeefbaar maar omkeerbaar

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

If epigenetic regulation goes wrong consequences

A

disturbed development, diseases, transgene silencing, faster aging

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

In ratten epigenetische regulatie invloed –

A

likken geeft verwijdering methylatie en meer expressie glucocorticoid receptor (stress)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Epigenetische modificaties

A
  • Noncoding RNA
  • Histone variant (structure nucleosome)
  • Histone modifications
  • DNA methylations
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Bekende mutaties bij chromatinesoorten:

A

Heterochromatin: H3K9me
Euchromatin active: H3K4me3
Euchromatin inactive: H3K27me

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Genome always off modifications;

A

DNA methylation, H3K9methylation, transposons

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Genome active temporarily modifications;

A

RNAP2, activator, H3k4methylation, histonacetylation, genes

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Genome inactive temporarily modifications;

A

H3K27, repressor proteins, genes

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

euchromatine wanneer open en wanneer niet

A

H3ac, H3K4me, activator/trithorax protein open
repressor/polycombgroup (PcG) proteins, H3K27me dicht

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

wat nodig naast epigenetische modificatie -

A

sequence specific transcription factors en chromatin remodelling nodig omdat niet alles in een keer open moet

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Transposable element

A

change position in genome, regulates gene expression, can multiply itself

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Saccharomyces cerevisiae voordelen en nadelen

A

deelt snel en aseksueel, makkelijk onderhouden, homologous recombinations, tiny genome

geen DNA methylation, H3K9methylation, geenH3K27 methylation, no RNAi, unicellar, few TE and distal CREs

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Schizosaccharomyces pombe voordelen en nadelen

A

H3K9me, RNAi

geen DNA methylation, H3K9methylation, geen H3K27 methylation, unicellar, few TE and distal CREs

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Caenorhabditis elegans voordelen en nadelen

A

H3K27me/polycomb silencing, multicellular

geen DNA methylation, few TE and distal CREs

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Drosophila melanogaster voordelen en nadelen

A

betekenisvolle phenotypische veranderingen

geen DNA methylation, few TE and distal CREs

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Arabidopsis thaliana voordelen en nadelen

A

DNA methylation, lots of variants

not as many TEs as organisms with large genome

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Wat is DNA methylation, waar geplaatst

A

5-methylcytosine (5mc) in meeste eukaryoten, vooral cytosine in CG context.
* Transposable elements have DNA methylation, samen met H3K9
* CpG rich ‘islands’/Promoters are unmethylated
* Protein-coding regions have DNA methylation in gene body
Heel groot deel 5mc in transposons en repetitief DNA
trekt DNAmethyl binding proteins (MBPs) aan

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

5hydroxymethylcytosine

A

zorgt voor activaite enhancers, eerste stap in verwijderen 5mc
voorkomt MeCP2 binding en TET voorkomt DNMTs

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

Methylated cytosines ways of repression

A

Inibition of TF die RNAP stimuleren

Methyl binding proteins (MBPs) bind 5mC & recruit repressor proteins (e.g. H3-K9 methyltransferase) to repress transcription

DNA methyltransferases (DNMTs) are bound to histone deacetylases (HDACs) and histone methyltransferases (HMTs), resulting in transcription inactivation

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

Methylation meten voor specifieke regios waarmee

A
  • DNA blot analyse
  • qCPR
  • bisulfite sequencing
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

genome wide methylatie meten waarmee

A
  • immunolabeling
  • IP met 5mc antilichaam samen met qPCR/microarray/sequencing (me-DIP)
  • Sequencing DNA methylation libraries
  • Genome wide bisulfite
  • Genome wide enzymatic methyl seq
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

MeDIP

A

gefragmenteert DNA, 5mc antilichaam er bij en groen fluor, ander deel rood (dit is niet gemethyleerd), magnetische beads om die er weer uit te halen, daarna sequencen om te kijken welke sequences zijn enriched

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

Bisulfite sequencing

A

analysis of methylation of every cytosine in DNA. Bisulfite changes unmethylated cytosines into uracil. Gemethyleerd blijft C, niet omschrijven naar dochterstrand!! ACTA BLIJVT AUTA!! PCR en cloning voor klein fragment of sequencing voor heel genoom. Als je top en bottom strand vergelijkt bij dochtercel zie je dat code verandert.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

Methylation 5mc afwijkende targets

A
  • Normaal 5’–CG–3’
  • In embyryo; 25% non CG, mainly CA
  • Mammalian brain 1.5% non CG, mainly CA
  • Planten; CG, CHG (H = A,T or C) which is symmetric or CHH which is asymmetric because one C methylation is missing
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
25
MeCP2
bindt specifiek aan CA gemethyleerde structuur en is nodig bij x inactivatie. niet werken van dit geeft misregulatie (Rett syndroom)
26
TAD
blob van DNA. chromatine die gelijke epigenetische markers hebben, sequences daarin binden elkaar. Voorbeeld polycomb silenced, transposons en active genes. Phase separation speelt een rol, IDR (intrinsically disorganised regions) interact
27
Compartment
TADs reageren weer met elkaar. Phase separation speelt een rol
27
brain-specific gene in brain and liver type of chromatin –
brain; active euchromatin, liver; factultative heterochromatin - not expressed in liver but not permanently silent.
28
Constitutive
altijd uit, transposable elements
29
Facultative
niet altijd uit
30
accessible active chromatin marks
H3K4me, H3ac, H3K36me, trithorax (activator)
31
Inactief naar actief nodig
TF + chromatin remoddeling proteins
32
Geeft methylatie/acetylatie etc op verschillende plekken zelfde effect?
nee, bv K4 en K9 modification geven compleet ander effect
33
ChIP seq
method to check histone modifications. Ab bij chromatine, beads toevoegen die alleen gekoppeld bindt, DNA isoleren, analyse met PCR (locus), high throughput (whole genome), microarray (niet echt meer gebruikt)
34
constitutive heterochromatin marks
H3k9me dna methylation transposons hp1
35
Active euchromatin marks
h3ac h4ac trithorax (activator) h3k4me h3k36me RNApol2 genes
36
Inactive chromatin
H3K27me polycomb genes
37
Plaatsing methylatie histonen
* H3K4me3 piekt in begin * H3K36me3 piekt na H3K4me3 * H3ac/H4ac minder hoge piek maar houdt langer aan * H3K27me3 als blanket over hele gen
38
H3K4me3 kenmerken
* H3K4me3 recruits histone acetyl transferases (HATs) * Level of H3K4me3 mark correlates with transcript levels * H3K4 methylation prevents DNA methylation komt vooral op promotors voor voorkomt methylatie maar kan er niet af halen
39
Welke histonmodificaties zijn belangrijk voor genactivatie en transcriptie–
H3ac, H3K4me en H3K36me
40
How does H3K4me results in active chromatin?
Recruits acetyltransferases, prevents DNA methylation DNMT3 – de novo DNA methyltransferase DNMT3L – DNMT3 binding partner
41
H3k36 rol
voorkomt cryptic initiation of transcription * acetylation is added co-transcriptionally by HAT: facilitates disruption nucleosomes by RNA Pol II * H3K36me added behind RNA PolI complex: recruits Histone deacetylase (HDAC) -> removal Histone acetylation * H3K36me recruits DNMT3 -> de novo DNA methylation (5mC) * Kortom; Verwijderd acetyl, minder acceccible, meer stabiel. Methylation voorkomt initiatie komt vooral voor in gene body
42
H3k27me3 rol
speelt blenagrijke rol in silencing developmentally/tissuespecifically regulated genes mutatie lysine naar methionine voorkomt vorming polycomb - glioma
43
H3K9me rol
is associated with silencing of transposable/repeated elements vooral samen met HP1 verwijderen van h3k9 methyltransferase geeft minder genome stability, deletions, translocations
44
hoe worden on en off state behouden
Polycomb maintains off state (h3k27me), trithorax on state (h3k4me, h3k36me)
45
Bivalent/poised
aan en uit signalen op zelfde moment. Vooral stem cell komt door combinatie h3k27me en h3k4me
46
Acetyolation writer =
HAT/KAT on lysine
47
Acetylation eraser
HDAC on lysine
48
Methylation writer
HMT-KMT on lysine/arginine
49
Methylation eraser
HDM/KDM on lysine/arginine
50
Fosforylation writer
kinase on serine
51
Fosforylation eraser
PPTase on serine
52
Ubiquitine writer
ligase on lysine
53
Ubiquitine eraser
protease on lysine
54
histone modifying enzymes recruitment –
sequence specific transcription factors such as GATA3, MyoD. Sequence specific TFs herkennen DNA sequences, determine how important that sequence is for those transcription factors.
55
Overexpression EZH2 in polycomb
silencing tumor supressor genes such as INK4A and CDKN1A. it mediates H3K27me2/3, removal acetyl
56
Histone variant
proteins with different aminoacid composition than standard histones. Encoded by different genes than standard/canonical. Differ in amino acid. Differ in properties, expressed throughout celle cycle, desposited replication independent, encoded by individual genes, contain introns, polyadenylated transcript AANVULLEN
57
canonical histone expression when
during s phase
58
Verschil histone variants tov total pool voor H3 en H2A
in mammalian cells the contribution of histone variants to the total pool of histone proteins is bigger for H3 than H2A histones
59
Functie H3.1
present in bulk of chromatin tijdens replicatie door CAF1
60
Functie H3.3
vervangt verloren histonen, mogelijke rol in transcriptie initiatie. Ook op telomeric repeats en pericentric consitutive hemochromatin vooral dus in actief chromatine, replicatie onafhankelijk. door HIRA in genen/regulatoir en door h3k9me DAXX-ATRX in repetitief/hetero gezet.
61
cenH3 (CENP-A)
is heel anders dan H3.1 en H3.3, zit bij centromeer waar spindle connect chromosomen. Kinetochore structuur assembly
62
How can the location of cenH3 be explained?
CenH3 and H3 incorporation at centromere alternates and chromatin forms helical turns
63
With whick type of chromatin is H3.3 associated?
Actively transcribed genes. Te zien aan RNApol2 en H3K4me2
64
CAF1
zet H3.1 neer tijdens replicatie
65
HIRA
zet H3.3 op genen en regulatoire sequences
66
DAXX
zet H3.3 op repetitief DNA
67
Knock out HIRA effect
geeft minder dense, meer schade DNA, limiteert nieuwe methylatie en cryptic initiation of transcription
68
Waarom H3.3 in pericentric consitutive heterochromatin
in repeated sequences histones can be lost
69
Mutation in H3.1/H3.3
geeft hersentumoren. Lys27 > met27 veroorzaakt doordat enzymatic activity of PcG proteins is hamered, facilitating gene expression. Lys27met geeft minder polycomb voor trimethylatie h3k27, minder activiteit EZH2, minder tumorsupressoractiviteit.
70
waarom kunnen H3.1 en 3.3 zomaar worden ingebouwd op elkaars plaats?
Minor amino acid differences between H3.1 en 3.3 allow replication independed incorporation of H3.3
71
incorporation of H3.3/H4 door welk protein
ATRX-mediated binding to H3K9me3. DAXX incorporates H3.3-H4 dimers
72
macroH2A functie
X inactivation door coaten met xist RNA wat silencing geeft verdere silencing door h3k27me en polycomb group proteins (pcg) modificatie h3/4 naar macroh2a 5mc aan 5 einde genen geeft irreversibele inactivatie heeft een groot c terminal domain dat uitsteekt wat remoddeling voorkomt geassocieerd met HDAC werkt als tumorsupressor
73
H2A.B functie
Boundary sequence – prevents heterochromatin from spreading, prevents enhancer from activating gene. rol in mRNA splicing short c terminal, geen amino acid targets for modification. less stable -> increase in chromatin accessability. Excluded from inactive x chromosone, enriched at active. Vooral in testis, ook andere organen. vooral in tss. co localizes met h3
74
H2A.Z functie
conserved in eukaryote development. Extended acidic pathch domain wat deel is van docking domain dat interactie met andere histonen beinvloedt. Regulates gene transcription door RNApol recruit. SWR-C zet H2A-Z-H2B in NDR/NFR zoals TSS boundary/insulation - voorkomt enhancer activatie, voorkomt heterochromatine spreiding chromosome segregation
75
Relatie tussen H2A.Z en DNA methylatie
reversed, anticorrelation. Is bij transcription start site te zien
76
De novo methylatie waardoor
DNMT3 – methyleert de novo n terminal lysine 4, DNMT3L = DNMT3 binding partner
77
Active demethylation waardoor
TET
78
In welke cellen wordt methyl verwijderd -
Progenetor cells en zyoogote
79
Methylatie in verschillende species soorten
Only CG in mammals, CG, CHG and CHH in plants, no C methylation in Drosophila
80
Which histone modifications and sequences are generally correlated with the absence of DNA methylation?
H3K4 methylation, transcription start sites and active regulatory sequences
81
Hoe vindt methylatie tegen cryptic initiation of transcription plaats
* RNA pol2 bindt, Setd2 zit hier aan vast * SETD2 zet H3K26me achter RNAP2 * DNTM3b (de novo) herkent en methyleert
82
unmethylation nodig waar
transcription start site CpG islands (beschermd tegen methylation, ookal gaat dat tegen intuitie in). TF is pioneer
83
how are CpG islands protected? -
H3K4 methylation & binding transcription factors, en enzymen voor DNA demethylatie (TET)
84
How can transposable elements (TEs) threaten genome stability?
Insertional mutagenesis spreading DNA methylation from TEs Promoter inactivation Homologous recombination between TEs trnascription interference(RNAi)
85
waar vindt je vooral unmethylated en low methylated regions
Unmethylated vaak om gene, gaat om CpG eiland. Daaromheen is low methylated, cell type specific.
86
Rol methylatie
TE onder controle (tegen mutagenesis door in intron, of homologe recom door deletie, minder DNA methylatie) geen homogolous recombination Genomic inprinting x inactivatie gentranscriptie genome stability
87
Genomic inprinting
* The DNA of imprinted sequences is methylated * Genes are expressed in a parent-of-origin manner * The imprints are reset during gametogenesis * Genes show monoallelic expression dependent of their parental origin – need to be reset during gametogenesis
88
Van minst naar meest permanent metylatie plekken-
Xist RNA coating, silencing, macroH2A, DNA methylation
89
5mc for daignosis
Bloedsample sept9 is gtp binding protein, methylering CpG van SEPT9 is grote kans colonkanker 5mc beinvloedt site at which polyadenylation occurs
90
sept9 biomarker
Bloedsample sept9 is gtp binding protein, methylering CpG van SEPT9 is grote kans colonkanker
91
What is the role of 5-hydroxymethylcytosine (5hmC)?
5hmC is an intermediate in the DNA demethylation pathway
92
How can DNA methylation be lost upon cell division?
* By replication in the absence of DNA methyltransferases (passive demethylation) * Through removal by TET enzymes (active demethylation
93
DNMT1 functie
for maintanence methylation, target CG en CHG
94
DNMT3A/B/C functie
de novo methylation, targets CG/CA/CT/CC
95
Hemimethylated site
aan andere kant is het nog maintanance. Mocht beide kanten geen C gemethyleerd hebben is het de novo
96
DNMT1 hoe verzameld
kan komen door op replication form te gaan zitten of door zinc finger
97
piRNA
in germ cells de novo methylattie van TE -> recruit DNMT
98
passive DNA demethylation
door replicatie heeft helft geen methyl active DNA demethylatioin – TAT, kan ook zonder replicatie
99
waarom altijd meteen mannelijk DNA ge unmethylated na bevruchting
beide kopieen aanwezig, beide expressed zou growth problems geven, daarom DMRs moeten gemethyleerd blijven in zygote
100
IncRNA function
gene regulation, x inactivation, genomic imprinting,
101
microRNA funciton
fine tuning gene expression coderen voor longRNA die weer coderen voor miRNA perfect match - degradation, mismatch - translation inhibition kan mirtrons maken - moeten gespliced ipv drosha
102
long-non coding RNAs kenmerken
RNAs from intergenic regions that are at least 2kb long. Bevatten meestal wel ORFs voor microproteins, maar meestal niet translated. Door RNAp2 gelezen, gecapt en polyA. Tot expressie cel/weefsel/ziekte specifiek. Kunnen gemaakt worden uit intron, coding, cis regulatoire regios.
103
circRNA kenmerken
closed loop. Door back-splicing met downstream splice site joining upstream splice site, heel stabiel, niet exonuclease mogelijk. Sequestering microRNAs or proteins.
104
enhancerRNA (eRNA) kenmerken
komt vn enhancer af, bidirectional, capped, unspliced, niet polyA, instabiel
105
enhancer associated inRNA (elncRNA) kenmerk
meestal unidirectional
106
long non coding RNA categorieen
* niet-functioneel – transcriptional noise * non functional waarbij transcription process sufficient for function * functional die cis of trans werking kunnen hebben. Bijvoorbeeld Xist, Tsix, HOTAIR ONTHOUDEN
107
wat gebeurt er bij transcriptie twee kanten tegelijk op
interference gebeur tbij lncRNA
108
wat gebeurd er bij binden aan polycomb proteins
transcriptional repression
109
Decoy model
lncRNA bindt aan activator, protein complex laat los voorbeeld gas5
110
guide model -
Protein binds dna, makes it that protein can bind the targer. LncNRA bindt activator, conformational change, allowing binding protein
111
Scaffold model:
lncRNAs can, by binding, bring multiple proteins together in a complex that together exert a particular function voorbeeld HOTAIR bindt PRC2 en H3K4me2/3 demethylase, zorgt voor H3K27me3 en verwijderen H3K4me2/3 - repressie in trans voorbeeld xist RNA coat x en recruit polycomb. tsix voorkomt opstapeling xist voorbeeld ncRNA a7 voor trnscription factor voorbeeld HOTTIP guides H3K4methyltransferase naar TSS
112
Xist –
scaffold lncRNA, coats chromosome, dosage compensation; niet twee keer meer dosis door vergeten x uit te schakelen
113
Functie lncRNA bepalen
knockdown door smallRNAs. Niet met crispr omdat je dan enhancerregio er uit zou halen, kan je niks meer zeggen over specifieke functie lnc RNA. Kan met bijvoorbeeld ncRNA-a7 of HOTTIP, geeft decreased expression
114
RNAi general characteristics (small RNA pathway);
dsRNA wordt hetkend door dicer en geknipt in stukjes van 20-30bp tussen PAZ en catalytic residues, die stukjes op ARGONAUTE in RISC complex gezet en uit elkaar getrokken waarbij een strand overblijft (antisense), wordt geplakt aan mRNA, waardoor mRNA geknipt wordt. Geeft silencing, translation inhibition, heterochroma. Sequence specific
115
IR transgenes
produce dsRNA gevolg dat planten veel kleurcombi’s hebben. Kan een hairpin vormen
116
Sources of dsRNA
inverted repeat transgene endogenous microrNA sense and antisense van zelfde sequence externally viral RNA action of RNA dependent RNA polymerase transposable element sense en antisense van zerlde sequence
117
miRNA functie
fine tuning expression developmental regulation biomarker
118
piRNA functie
inhibition TEs transposons genome stability germline development
119
transcriptional (TGS) silencing
transcription is hampered
120
post-transcriptional gene silencing (PTGS)
RNA is degraded or translation blocked
121
What are the components (nucleic acids and proteins) of the microRNA pathway?
Pre miRNA drosha, exportin 5
122
PTGS welke soort RNA –
miRNA, piRNA, siRNA.
123
Transcriptional of posttranscriptional RNA block testen
* RT(Q)PCR of blotting – kijken of er RNA is. Geen RNA dan niet betekent dat het erniet is. Dan run on transcription assay * Wel RNA dan western blotting of immunolabeling
124
microRNA pathway -
dsRNA pri-mi RNA gemaakt, Drosha knipt poly A en cap waardoor pre-miRNA ontstaat. Exportin 5 stuurt het uit de kern naar dicer, short double stranded geladen op RISC, enkele streng bindt daardoor aan mRNA. miRNA gecodeerd door endogenous genes. miRNA kan gevonden worden in bloed, daarom gebruikt als biomarker
125
piRNA pathway –
piRNA cluster gets trnscribed processing loading into PIWI transport uit nucleus piRNA bindt TE RNA (secondary piRNA) knippen TE TE kan weer TE/piRNA herkennen, ping pong cycle
126
siRNA kenmerken
tegen virussen in plant, worm, insect. In mensen ook aanwezig; alleen in early development stage, IFNI later. siRNA als behandeling – in nanoparticles tegen degradatie en om zeker te zijn van opname repression viral expression and TE. RNA decay of translational silencing
127
voornamelijkste reden dna methylatie in transposons
voorkomen van insertional mutagenesis. zo;n 45% bestaat uit transposable elements threatens genome stability als dit niet wordt gedaan
128
is een lethal mutation vaak niet lethal in een groot of klein genoom?
klein
129
waarom kan methylatie een biomarker zijn
meer methylatie bij kanker - repressie van kankerremmend gen
130
op welke histonstaart vooral modificaties
n terminal histone tails
131
cross talk set1
set1 methyleert h3k4 h3k4 faciliteert binding nuA3 HAT H3k14 wordt geacetyleerd3h3k4
132
H3K4me1 locatie
enhancers
133
effect acetylatie
tf bindt en neemt HAT mee
134
expression of canonical and non canonical histones
canonical - during s phase non canonical - replication independent
135
welke histone variants komen overal voor, welke alleen bij vertebrates
overal; H3.3, cenH3, H2A.x, H2A.Z alleen in vertebrates; macroH2A, H2A.B
136
waar is replicatie coupled deposition van histonen van afhankelijk
aminozuren van n terminal
137
H2A.X functie
is voor DNA reparatie, random ingebouwd In alle eukaryoten. Soms de vervanger voor H2A. Serine at c terminal extension; phosphorylated upon DNA damage.
138
targets van dna methylatie
transposable/repeated gene bodies nucleosomal dna
139
non targets van dna methylatie
h3k4me - voorkomt DNMT3, dus geen de novo methylatie TSS en 3 end - dan stopt initiation active promotors/regulatory CpG island at promotor enhanser/insulator
140
waarop wijzen low methylated regions
distant enhancers, kan celspecifiek zijn
141
waarop wijzen unmethylated regions
CpG island
142
`reden van dna methylatie
genome stability gene regulation x inactivation gene transcription regulation
143
DNMT3a/b
komen vooral voor in ESC waar ze CHH methyleren, maar vooral CG (soms non CG) worden gemethyleerd
144
lncRNA functie
generegulation genomic imprinting x chromosome inactivation
145
lncRNA kenmerken
langer dan 200nt non coding maar wel cryptic ORF niet vertaald transcribed, capped, spliced, polyadenylated korter en minder expressed dan mRNA cell tissue en developemntal stage/disease stage specific active enhancers maken vaak lncRNA (eRNA) promotor zelfde als coding
146
run on transcription assay
nuclei isolated radioactively labeled nucleotiden toegevoegd rna isoleren en radioactiviteit meten
147
siRNA pathway
zelfde als miRNA
148
siRNA functie
beschermen pathogenen genomic stability (silencing TE) genome offence
149
methylatie meten
DNA blot bisulfite seq meDIP
150
histonmodificatie meten
CHIPseq
151
TGS door welke small RNA
pi en si
152
patirisan
eerste RNAi drug voor amyloidose bij neuropathie

molecular biology of the cell (3 decks)

Brainscape helps you reach your goals faster, through stronger study habits.
© 2025 Bold Learning Solutions. Terms and Conditions