Lezione 5:replicazione DNA Flashcards
Qual è la differenza tra cellule somatiche e cellule germinali?
Cellule somatiche—-> organizzano struttura organismo e non trasmettono niente alla prole. Devono essere protette da un’alta frequenza di mutazioni per mantenere organizzata la struttura del corpo
Cellule germinali —-> trasmettono l’informazione genetica del genitore alla prole. Devono essere prodotte da un’alta frequenza di mutazioni per mantenere la specie.
Il cancro si è originata l’eccessiva proliferazione delle cellule somatiche o germinali
Somatiche
Cos’è una mutazione?
cambiamento permanente nel DNA che può portare alla morte dell’organismo se avviene
in una sequenza vitale
Qual è la probabilità di mutazione
-nell’uomo
-nell’E.Coli
Dimmi due esempi di errori durante la sintesi di DNA
1) tra le basi azotate si forma un numero sbagliato di legami idrogeno (cambia la geometria della doppia elica)
2) le forme tautomeriche rare delle basi azotate si possono appaiare con basi sbagliate (es. La forma automatica rara della C si appaia con A invece che con G)
Perché le DNA polimerasi presentano meccanismi di autocorrezione e invece le RNA polimerasi no?
-le DNApol—-> non possono fare la sintesi de novo del nuovo filamento di DNA perché necessitano di Primers con l’estremità 3’-OH perfettamente appaiata
-le RNApol—-> possono fare la sintesi de novo del nuovo filamento di RNA (quindi no primers).
Cosa succede al nuovo filamento di RNA se è stato commesso un errore durante la sua sintesi?
Ha vita breve nella cellula (quindi l’errore non viene corretto, invece nel DNA l’errore viene corretto)
Qual è la frequenza di commettere errori durante la sintesi dell’RNA da parte dell’RNA polimerasi?
1 errore ogni 10^4 nucleotidi (frequenza più alta rispetto a quella del DNA!!!!)
Perchè soltanto la replicazione nella direzione 5’-3’ permette una correzione efficiente degli errori?
Perchè se ci fosse una DNA polimerasi che aggiunge deossiribonucleosidi trifosfato nella direzione 3 -5 , l’estre-
mità 5 della catena in crescita, e non il mononucleotide in arrivo, porterebbe il trifosfato attivatore necessario per il legame covalente.
In questo caso gli errori di polimerizzazione non potrebbero essere semplicemente idrolizzati, perché l’estremità 5’ nuda terminerebbe immediatamente la sintesi del DNA (perché non ha il fosfato necessario per creare il legame fosco stereo con un altro nucleotide)
Qual è la differenza tra il filamento leader e quello ritardato?
-filamento leader—> sintesi continua (ha come stampo il filamento di DNA vecchio 5’->3’)
-filamento ritardato—->sintetizzato in maniera discontinua (grazie ai frammenti di Okazaki) (ha come stampo il filamento 3’->5’)
Di quanti primers necessita la DNASpol per la sintesi del filamento
-leader
-ritardato?
-filamento leader—-> 1 solo
-filamento ritardato—-> tanti primers quanti sono i frammenti di okazaki
In che modo un filamento di DNA può crescere in direzione 3 -5 ?
Grazie ai frammenti di okazaki (sono sintetizzati in direzione 5-3’ e poi vengono uniti dando origine al filamento ritardato)
Perché il filamento riportato man mano che viene sintetizzato si ripiega all’indietro?
-per aumentare l’efficienza della polimerizzazione
-per facilitare il caricamento della pinza della DNApolimerasi ogni volta che viene sintetizzato un frammento di Okazaki:
il caricatore della pinza e la polimerasi del filamento ritardato sono tenuti in posizione come parte della macchina proteica anche quando si staccano dal DNA stampo.
Cosa succede nell’uomo se il sistema di mismatch repair non funziona?
In che modo viene regolata la replicazione del DNA negli eucarioti per fare in modo che un tratto di DNA venga duplicato una sola volta dal momento che ci sono più ORC?
Si forma un complesso pre replicativo (DNA ELICASI + ORC) che viene attivato tramite la fosforilazione e fa in modo che un ORC si attivi una sola volta durante un ciclo cellulare
