Lezione 3:archea, Batteri Ed Eucarioti Flashcards

1
Q

Quali sono i 3 domini dei viventi?

A

-Archea o archeabatteri
-Batteri o Eubatteri
-Euckarya—> si dividono in 4 Regni (protisti, funghi, animali e piante)

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2
Q

Dimmi 5 caratteristiche dei procarioti

A

-non hanno il nucleo (il DNA si trova direttamente nel citoplasma, precisamente nel nucleoide)
-hanno solo la membrana cellulare e non quelle intracellulari
-gli unici organelli che hanno sono i ribosomi
-respirano allo stesso modo dei mitocondri (creano un gradiente elettrochimico e possono
produrre ATP trasformando il gradiente elettrochimico in un potenziale chimico)
-si muovono attraverso un flagello/ciglia

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3
Q

Quali sono i 3 tipi di procarioti in base al loro stile di vita?

A
  • I fototrofi—> traggono energia dal sole (fanno fotosintesi)

-I litotrofi—> producono energia metabolizzando prodotti inorganici già presenti sulla terra, composti dell’Azoto, dell’Idrogeno, acidi…,

– Gli organotronfi—> si alimentano di molecole organiche più complesse prodotte dalle altre due classi

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4
Q

Quali sono i
-procarioti
-eucarioti

A

-archea e batteri
-eucarioti: protisti (eucarioti unicellulari), funghi, animali e piante

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5
Q

Dimmi 5 caratteristiche degli eucarioti

A

-hanno il nucleo di 10-15 micrometri (delimitato da una membrana a doppio strato
fosfolipidico) in cui è contenuto il DNA;

  • hanno il nucleolo (è la sede di sintesi dei ribosomi, è una struttura interna al nucleo e
    comunica con il citoplasma attraverso i pori nucleari);

-presentano organelli cellulari
-sono prevalentemente diploidi (si dividono in maniera sessuata)

-il citoplasma è organizzato attraverso un citoscheletro fatto da proteine

– si possono muovere in vari modi (es. modificando la forma della loro cellula,
allungandosi e poi stirandosi)

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6
Q

Quali sono gli organelli vescicolari e quali quelli membranosi?

A

-organelli membranosi—->
•Nucleo: L’organello più grande, che contiene il materiale genetico (DNA) ed è delimitato dalla membrana nucleare.
•Reticolo endoplasmatico (RE): Una rete di membrane che si estende dal nucleo e si suddivide in RE rugoso (con ribosomi sulla superficie, coinvolto nella sintesi proteica) e RE liscio (senza ribosomi, coinvolto nella sintesi di lipidi e nel metabolismo).

•	Apparato di Golgi: Una serie di sacche membranose che modificano, smistano e imballano proteine e lipidi per il trasporto o la secrezione.

•	Mitocondri: Organelle membranosi coinvolti nella produzione di energia sotto forma di ATP, con doppia membrana.

•	Cloroplasti (nelle piante): Organelle che contengono clorofilla e sono responsabili della fotosintesi; anch’essi a doppia membrana.

-organelli vescicolari (a forma di vescicole)—->

•	Lisomi: Vescicole contenenti enzimi digestivi che degradano materiale extracellulare o vecchi organelli cellulari.
•	Perossisomi: Vescicole contenenti enzimi per processi come la degradazione di acidi grassi e la detossificazione di perossido di idrogeno.
•	Vescicole di trasporto: Vescicole che trasportano molecole da un compartimento cellulare all’altro (ad esempio, dal reticolo endoplasmatico al Golgi).
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7
Q

Quali sono gli organelli cellulari senza membrana?

A

I ribosomi

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8
Q

Quali sono gli organelli cellulari con una doppia membrana?

A

Mitocondri e cloroplasti

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9
Q

Come sono gli
-eucarioti
-procarioti
Da un punto di vista morfologico e biochimico?

A

-eucarioti—-> sono morfologicamente molto differenziati tra loro ma biochimicamente sono molto simili

-procarioti—-> sono morfologicamente simili tra loro, ma sono biochimicamente molto differenziati tra loro

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10
Q

Dimmi 3 cose che si deducono dall’albero filogenetico

A

-Batteri—-> sono molto differenziati tra di loro
-Archea—-> sono molto meno
diversificati biochimicamente dei batteri, ma molto più diversificati degli eucarioti.
-Gli Archea e gli eucarioti sono molto vicini tra loro nell’albero filogenetico, questo vuol
dire che la loro differenza è molto più piccola rispetto alla differenza tra Archea e batteri o
tra gli Eucarioti e Batteri: studi recenti indicano che presumibilmente Eucarioti e Archea
abbiano avuto un progenitore comune, per cui gli eucarioti derivano da una branca degli
Archea (sono alcuni Archea che hanno sviluppato la capacità di fare membrane interne).

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11
Q

Cos’è LUCA?

A

Last Universal Common Ancester
È un ipotetico progenitore comune tra archea, eucarioti e batteri (ma non è stato ancora identificato)

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12
Q

Dimmi 3 cose sulla teoria di Lynn Margulin/ teoria endosimbiontica

A

-spiega come si sono originati mitocondri e cloroplasti

-Circa 1,5 miliardi di anni fa, quando la terra stava cominciando a diventare ricca di ossigeno, un organismo eucariote anaerobico primitivo ha inglobato una cellula batterica aerobica. Tra questi due organismi si è sviluppata una simbiosi (la cellula procarioti protegge il batterio che in cambio utilizza O2 per produrre energia)

-i mitocondri e i cloroplasti si sono originati dalla simbiosi tra un organismo eucariotico e un battere diversi tra loro

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13
Q

Dimmi 2 cose sulla parete batterica

A

-è una struttura proteica che:
*riveste il batterio
*definisce la forma del batterio
* protegge il batterio dalla lisi cellulare

-possono presentare dei pili—-> che partono dalla membrana e attraversano la parete e servono come strutture di adesione per attaccarsi molto spesso ad altre cellule
(Es. se due batteri (anche di specie diverse) si attaccano tramite dei pili riescono a
scambiarsi materiale tra di loro ( trasferimento orizzontale) come es. DNA)

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14
Q

Dimmi 4 forme dei batteri

A

-cocchi—-> sferici si muovono grazie al flagello
-bacilli—-> forma di bastone (sono di vari tipi Streptococchi Stafilococchi etc… e
Streptobacilli, Diplobacilli etc…; hanno spesso il flagello per muoversi)
-vibrioni—-> a forma di virgola
-Spirochete—-> strutture elicoidali (queste forme elicoidali sono dovute al fatto che il falgello
non si trova all’esterno della parete del batterio, ma tra la membrana e la parete del
batterio, così il flagello fa muovere tutto il corpo del microrganismo. Ciò è utile ai batteri
che si devono muovere in un ambiente viscoso come il fango).

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15
Q

In cosa consiste il trasferimento orizzontale dei batteri?

A

se due batteri (anche di specie diverse) si attaccano tramite dei pili riescono a
scambiarsi materiale tra di loro ( trasferimento orizzontale) come es. DNA.

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16
Q

Dimmi 3 cose sul DNA batterico

A

-DNA circolare (ci sono eccezioni senza genoma circolare)

-è grande circa 10micron (dal momento che si torva in cellule grandi 2 micron è molto ripiegato)

  • quasi tutto il DNA codifica per proteine (invece negli eucarioti circa il 3% del DNA codifica per
    proteine, il resto contiene le informazioni per utilizzare queste proteine.
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17
Q

Cosa 3 sono i plasmidi

A

-Sono genomi accessori circolari dei batteri che contengono informazioni non essenziali

-Grazie ai plasmidi i batteri di una stessa specie possono avere caratteristiche diverse

-i plasmidi possono:
*codificare proteine che attribuiscono al batterio la resistenza agli antibiotici,
*codificare per proteine che servono al batterio per produrre antibiotici (gli antibiotici
sono delle armi che alcuni batteri utilizzano per uccidere gli altri batteri e che quindi gli
permettono di avere spazio libero in una nicchia ecologica).
*mangiare idrocarburi,
*permettono ai batteri di fare la fissazione dell’azoto o di degradare molecole
organiche complesse.

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18
Q

Cos’è il paradosso C?

A

non esiste alcuna correlazione tra la
quantità di DNA di un organismo e la sua complessità
Es.
-Il DNA degli Archea contiene tra circa 500.000 di basi a circa 5 milioni di basi;
-Il DNA batterico contiene da 10^5 coppie di nucleotidi a 10^7 coppie di nucleotidi
-Gli Eucarioti hanno una quantità di DNA molto variabile:
* i Protozoi vanno da circa 10^6 a circa 10^12 geni
*i Funghi vanno da circa 10^7 a circa 10^9 geni
*le piante vanno da circa 10^8 a circa 10^11 geni
*I mammiferi (tra cui gli umani) circa 10^10 geni

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19
Q

Cos’è il paradosso G?

A

numero di geni che codificano per una proteina non è correlato alla dimensione del
DNA (es. una salamandra ha circa 10 volte più DNA di un umano ma ha il suo stesso
numero di proteine)

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20
Q

Dimmi le 3 fasi del ciclo cellulare batterico

A

1) FASE B—-> fase di crescita cellulare (la cellula si prepara alla duplicazione)
2)FASE C—->fase di duplicazione del cromosoma (La replicazione del DNA ha inizio da un punto detto origine di replicazione (oriC), da
questo punto ha inizio la duplicazione del cromosoma alla fine della duplicazione si vengono a formare delle strutture dette “theta” che sono ancora agganciate tra loro. In seguito le strutture theta vengono districate e così si
ottengono due cromosomi (la FASE C può essere una fase piuttosto lunga)
3) A questo punto la cellula originale (che ha una forma allungata) viene divisa in due
ottenendo due cellule figlie (FASE D)

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21
Q

Come si chioma la divisione cellulare nei batteri?

A

Ripartizione o amitosi

22
Q

Dimmi 2 motivi per cui i batteri crescono abbastanza lentamente

A

-hanno limitazioni nelle
quantità di nutrienti a disposizione
-di solito il tempo impiegato a dividere la cellula è leggermente superiore a quello impiegato per duplicare il cromosoma.

23
Q

Come fa il batterio a crescere più velocemente?

A

il tempo di divisione cellulare diventa più piccolo di quello della duplicazione del DNA. In particolare le due fasi vengono accavallate:prima ancora di dividere la cellula possono iniziare a replicare nuovamente DNA (in questo modo le
distanze tra gli inizi di replicazione sono diventano di 20 minuti e quindi la duplicazione
della cellula avviene in un tempo inferiore alla duplicazione del cromosoma).
Es. E Coli

24
Q

Quando la fase B del ciclo cellulare batterico si allunga?

A

Quando i batteri devono fermare la crescita e magari sviluppare delle forme cellulari adatte all’ambiente (flagelli lunghi,
peduncoli etc….), per questo la fase di non divisione B può allungarsi e il ciclo di
duplicazione diventa molto più lungo

25
Dimmi 3 esempi di differenziamento nei batteri
--i batteri in grado di fissare l’azoto (sono molto rari); - i batteri sporigeni: sono in grado di fare delle spore -i batteri con dei peduncoli (es. Caulobacter. Da origine a due cellule figlie con caratteristiche diverse: una avrà un peduncolo per stare fissa, l’altra avrà un flagello per muoversi. Questo avviene perchè il batterio fa la duplicazione del DNA e segrega i due cromosomi in parti diverse della cellula che possono avere due istanti diversi)
26
Cosa sono le spore?
strutture alternative del batterio, costituite da una parete molto spessa che è in grado di sopravvivere all’essiccamento rendendo il batterio matabolicamente inattivo per lunghissimo tempo. Quando poi il batterio ricade in una zona ricca di nutrienti e di acqua, la spora rigermina e il batterio ritorna ad essere metabolicamente attivo
27
Dimmi le 4 fasi del ciclo cellulare eucariotico
1. G1 (“G” sta per “gap”: “intervallo, pausa”): fase in cui la cellula decide se deve duplicarsi o meno, ciò dipende se ci sono i segnali per farlo (es.fattori di crescita, nutrienti necessari etc..). Può durare da pochi minuti ad anni (es. dopo che i neuroni si sono terminalmente differenziati si fermano in fase G1 e non proseguono il ciclo cellulare); 2. S (Synthesis): Duplicazione del DNA; 3. G2: la cellula ha un numero 4n di cromosomi (ossia ha duplicato il DNA ma è ancora una singola cellula) e resta in fase G2 per tutto il tempo necessario (in questa fase si duplicano anche gli altri organelli, il citoscheletro ed il citosol); 4. M (Mitosis): la cellula si divide in due
28
La durata delle varie fasi del ciclo cellulare è la stessa per tutti gli eucarioti?
La lunghezza relativa delle varie fasi del ciclo cellulare degli eucarioti è variabile da specie a specie: es. nel ciclo cellulare del lievito Schizosaccharomyces pombe (immagine 1) la fase più lunga è la G2; invece nel caso di un mammifero (immagine 2) le fasi più lunghe sono G1 ed S.
29
Quanto DNA hanno gli eucarioti nel nucleo di una cellula?
-gli eucarioti hanno 2m di DNA e 6 miliardi di basi nel nucleo (3 miliardi di paia di basi)
30
Cosa trovo nel nucleo di una cellula eucariote?
10% DNA e 90% liquido
31
Cosa sono i cromosomi omologhi?
I cromosomi materno e paterno di una coppia di cromosomi
32
Qual è la differenza tra cromosomi omologhi e cromatidi fratelli?
-I cromosomi omologhi sono due cromosomi che appartengono alla stessa coppia di cromosomi, uno proveniente dal padre e l’altro dalla madre. Ogni cromosoma omologo porta gli stessi geni (anche se le versioni di questi geni possono essere diverse, ossia varianti chiamate alleli). -sono due copie identiche di un singolo cromosoma, formate durante la replicazione del DNA, e rimangono connessi dal centromero fino alla divisione cellulare, quando si separano.
33
Qual è l’unica coppia di cromosomi non omologhi?
La coppia 23 (cromosomi sessuali)
34
Quanti cromosomi ha una cellula umana?
46 cromosomi: 22 coppie comuni a maschi e femmine, più due cosiddetti cromosomi sessuali (X e Y nei maschi, due X nelle femmine).
35
Cos’è un gene?
un segmento di DNA che contiene le istruzioni per produrre una particolare proteina
36
Cosa ottengo a partire da un gene?
Una proteina (Tuttavia ci sono anche molti “geni a RNA”, segmenti di DNA che generano come loro prodotto finale, invece di una proteina, una molecola di RNA)
37
Dimmi 3 sequenze nucleotidiche specializzate nel DNA utili per la replicazione del cromosoma
-origine di replicazione—-> la posizione in cui inizia la duplicazione del DNA ( I cromosomi eucariotici contengono molte origini di replicazione per assicurare che l’intero cromosoma possa essere replicato rapidamente) -Centromero—-> tiene uniti i cromatidi fratelli dopo la replicvazione del DNA e permette a una copia di ciascun cromosoma duplicato e condensato di essere tirata in ciascuna cellula figlia quando una cellula si divide (questo avviene grazie al cinetocore: si forma sul centromero e attacca i cromosomi duplicati al fuso mitotico, permettendone la separazione) -telomeri—->estremità del cromosoma. Svolgono 2 funzioni: *contengono sequenze nucleotidiche ripetute che permettono la replicazione efficiente delle estremità dei cromosomi * formano strutture che proteggono l’estre- mità del cromosoma dall’eventualità di essere riconosciuta dalla cellula come una molecola di DNA spezzato che ha bisogno di essere riparata
38
Cos’è la cromatina?
È il complesso costituito da DNA+istoni + aòcune proteine non istoniche
39
Cos’è il nucleo soma?
L’elemento strutturale di base della cromatina
40
Dimmi 2 cose sulla struttura del nucleo soma
-comprende un nucleo proteico costituito da 8 molecole di istoni + 1 DNA linker (da 100 a 200basi) -attorno ad esso è avvolto il DNA 1,7 volte (giri) con andamento sinistrorso
41
Cos’è un cromosoma?
Una molecola di DNA
42
Quante coppi di nucleotidi ha il genoma umano?
3,2 X 10^9 (miliardi)
43
Qual è lo spessore di una fibra di cromatina?
30 nm
44
Nei batteri e negli archea ci sono gli istoni che permettono la compartimentazione del dna?
-negli archea c’è un precedente degli istoni. Però qui i nucleosomi sono impilati in modo diverso: qui è garantita più protezione ma non si usa la struttura come piattaforma di riconoscimento. -nei batteri non ci sono istoni
45
Dimmi 3 cose sui complessi di rimodellamento della cromatina dipendenti da ATP?
-servono per rendere il dna accessibile alla cellula -comprendono una subunità ATPasica (sfruttano l’idrolisi di ATP per far scorrere il core del nucleosoma sul DNA, così da renderlo accessibile). -Possono collaborare con i chaperoni degli istoni per rimuovere in tutto o in parte il core del nucleosoma (o invertendo gli istoni 2A e 2B o rimuovendo totalmente l’ottamero dal DNA
46
In cosa si divide la cromatina?
-eucromatina—-> ,meno condensata e accessibile -eterocromatina—->più condensata e non accessibile
47
Dimmi le 3 componenti dei virus
-acidi nucleici (DNA o RNA) -capside proteico -pericapside lipidico (opzionale)
48
Come escono i virus dalla cellula?
L’ RNA o DNA VIRALE si fa coprire da un capside che va in contatto con la membrana ospite dall’interno, in seguito quest’ultima assorbe le proteine del virus ed esce come un nuovo virus.
49
Cosa sono i farmaci antivirali?
sono farmaci che uccidono il virus, ossia bloccano il ciclo replicativo oppure l’ingresso del virus nella cellula (sono molto rari perché a differenza dei batteri che sono cellule diverse dalle nostre, i virus entrano all’interno delle nostre cellule e quindi il farmaco le andrebbe a danneggiare)
50
Quali sono i 4 m4ccanismi con cui i virus infettano le cellule?
Sono 3 meccanismi di endocitosi e uno di fusione diretta 1)uncoating—-> Se il virus ha un involucro (es.HIV), la sua membrana si fonde con la membrana della cellula ospite. Questo processo è mediato dalle proteine presenti sulla membrana del virus e della cellula. Una volta che le due membrane si fondono, il capside entra nella cellula, e il materiale genetico del virus viene rilasciato all’interno della cellula attraverso un processo chiamato “uncoating” (spoliazione). IMMAGINE B 2) formazione di un poro—->Se il virus non ha un involucro (come i virus a capsula nuda, es. i virus della famiglia picornavirus), la cellula lo ingloba comunque attraverso l’endocitosi. Una volta che la vescicola contenente il virus si forma all’interno della cellula, il capside del virus crea un poro all’interno della vescicola per rilasciare il materiale genetico virale nel citoplasma della cellula. IMMAGINE C 3)il virus viene inglobato nella cellula per endocitosi. Se la vescicola endocitica non riesce a creare un poro per rilasciare il materiale genetico, potrebbe essere degradata (cioè, la cellula distrugge la vescicola), ma in questo caso il materiale genetico virale viene comunque iniettato direttamente nel nucleo della cellula, attraverso il poro nucleare. IMMAGINE D 4) Fusione diretta—>Il virus si fonde direttamente con la membrana della cellula senza passare attraverso l’endocitosi. IMMAGINE A