LABORATORIO 1 (pdf) Flashcards

Aprender las reacciones y experimentos del 1er lab.

1
Q

Describir proteínas

A

Son moléculas de gran tamaño (macromoléculas). se trata de péptidos de largas cadenas formadas por aminoácidos.

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2
Q

Describir Aminoácidos; Qué son, por qué están compuestos, Que presentan (3 cosas), qué pasa cuando son muchos.

A

Los aminoácidos son compuestos orgánicos con un grupo ácido (carboxilo -COOH)
y un grupo básico (amina -NH2), unido al carbono α (carbono inmediato al carboxilo), es decir son α
- aminoácidos. Presentan actividad óptica (excepto la glicina) y la configuración “L” es la de mayor
interés bioquímico.
Los aminoácidos pueden establecer enlaces covalentes entre el grupo carboxilo de uno y el grupo
amina de otro, denominados “uniones peptídicas”, de tipo amida y que se producen con pérdida de
agua. Los polímeros formados por hasta diez aminoácidos unidos por uniones peptídicas se llaman
péptidos, los que poseen más de 10 residuos de aminoácidos pero menos de 50 se denominan
polipéptidos y los que superan ese número se denominan proteínas.
Las proteínas son macromoléculas formadas por un gran número de aminoácidos. Poseen una
estructura muy compleja,

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3
Q

Estructura de los aminoácidos (4)

A

Estructura Primaria: se refiere al número e identidad de los aminoácidos que componen la
molécula y al ordenamiento de estas unidades en la cadena polimérica (secuencia de aminoácidos).
Las cadenas son lineales, no poseen ramificaciones por la naturaleza de la unión peptídica.
- Estructura Secundaria: es la disposición espacial regular y repetitiva que adopta la cadena
polimérica. Puede ser α -hélice, β -lámina o lámina plegada, o bien disponer la cadena en una
estructura irregular, en tal caso se habla de una disposición al azar. Estas estructuras se mantienen
unidas por puentes de hidrógeno.
- Estructura Terciaria: se refiere a la arquitectura tridimensional completa de una cadena de
residuos de aminoácidos. De acuerdo con la forma final se clasifican en globulares y fibrosas. Estas
conformaciones se mantienen unidas por fuerzas de atracción o repulsión electrostática, enlaces de
hidrógeno, presencia de cadenas hidrofóbicas e hidrofílicas y puentes disulfuro según el tipo de
aminoácidos que constituyen la molécula.
- Estructura Cuaternaria: es la disposición espacial de las subunidades polipeptídicas
constituyentes de las proteínas formadas por más de una cadena polipeptídica o monómero (proteínas
oligoméricas, mero: parte). Las fuerzas responsables de mantener en posición a las diferentes
subunidades son las mismas que en el caso anterior.

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4
Q

Describir de qué trata el proceso de desnaturalización de las proteínas

A

La secuencia de aminoácidos de una proteína es el principal determinante.
Alteraciones en ese ordenamiento o sustituciones de aminoácidos pueden afectar la
capacidad funcional.
Las proteínas
desnaturalizadas (ej. la clara de huevo calentada) son menos solubles y precipitan, pierden su
capacidad de cristalizar, tienen mayor reactividad química y son más fácilmente atacadas por
enzimas.

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5
Q

Reacción de Biurer: Utilidad

A

Esta reacción es muy utilizada para poner en evidencia la presencia de polímeros de
aminoácidos e incluso cuantificarlos en fluidos biológicos (orina, sangre, líquido cefalorraquídeo,
etc). La cuantificación se basa en el hecho que los complejos coloreados absorben energía, de modo
que a mayor cantidad de complejo coloreado formado, mayor será la cantidad de energía absorbida.
Esta energía, de una longitud de onda específica (540nm) para cada compuesto, se puede determinar
utilizando un equipo de laboratorio.

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6
Q

Reacción de Biurer: Materiales y Reactivos (cantidades)

A

Materiales:
- Tubos de ensayos - Pipetas - Propipetas
- Baño termostático - Gradillas
Reactivos:
-EDTA/Cu: complejo EDTA/Cu 13 mmol/l en NaOH 875 mmol/l y alquil aril poliéter (AAP) (3,5ml x3)
- Agua destilada: (50microlitros)
- Muestra: suero (50 microlts.)

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7
Q

Reacción de Biurer: Procedimiento

A

Rotular tres tubos de ensayo: 1, 2 y 3 y proceder según el siguiente esquema de
trabajo:
- Tubo 1: 50 μl de agua destilada + 3,5 ml del reactivo EDTA/Cu. (control negativo)
- Tubo 2: 50 μl de suero + 3,5 ml del reactivo EDTA/Cu.
- Tubo 3: 50 μl de suero diluido al medio con solución fisiológica + 3,5 ml del reactivo EDTA/Cu.
Mezclar por agitación e incubar durante 15 minutos a 37°C en baño termostático. Observar los colores
generados en cada tubo y las intensidades.

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8
Q

Reacción de Biurer: Resultados

A

Tubo 1: coloración azul del reactivo EDTA/Cu.
- Tubo 2: coloración violeta intenso del complejo proteína – Cu.
- Tubo 3: coloración violeta pálido del complejo proteína – Cu.

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9
Q

Reacción de Biurer: Fundamentos

A

Los péptidos y proteínas forman complejos de coordinación con el ion cúprico (Cu++).
Cada ion Cu++ se liga a la cadena aminoacídica por 4 valencias de coordinación aportadas por pares
electrónicos libres de átomos de nitrógeno (figura 1). Los iones Cu++ reaccionan tanto con los N de
las uniones peptídicas (dando color rojo) como con los N de grupos amino libres (dando color azul)
lo que da por resultado un color violáceo.

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10
Q

¿Qué es la prueba de Heller?

A

Se trata de una prueba para la detección de proteínas en orina utilizando ácido nítrico como
reactivo. Los fluidos biológicos poseen una cantidad de proteínas que los caracterizan, por ejemplo,
en el plasma de un individuo normal (caninos, felinos, equinos, etc.) en ayunas hay 6-8g/dL, pero en
la orina no debería detectarse proteínas, ya que durante el proceso de formación de la misma se realiza
un filtrado de la sangre, siendo retenidas en el cuerpo evitando que se pierdan. Sin embargo, en
determinadas situaciones fisiológicas y patológicas las proteínas pueden aparecer en la orina y por
ello hay pruebas de laboratorio que permiten detectarlas.

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11
Q

Prueba de Heller: Materiales y reactivos (cantidades exactas)

A

Materiales:
- Tubos de ensayos - Pipetas -Propipetas
- Gradillas
Reactivos:
- Ácido Nítrico concentrado (1ml)
- Agua destilada (4ml)
- Muestra: Orina (4ml)

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12
Q

Prueba de Heller: Procedimiento y resultados

A

Procedimiento: Rotular tres tubos de ensayo con los números 1 (control negativo), 2 (control
positivo) y 3 (Muestra problema). Colocar en el tubo 1: 4 ml de agua destilada, en el tubo 2: 4 ml de
muestra control positivo y en el tubo 3: 4 ml de muestra problema. Inclinar los tubos a 45º sobre la
mesada y agregar a cada uno, lentamente por las paredes, 1 ml de ácido nítrico concentrado. Reservar
los tubos en una gradilla y observar el resultado.
Resultado: La visualización de un anillo insoluble blanquecino en la zona de separación de ambas
fases líquidas, pone en evidencia la presencia de proteínas desnaturalizadas indicando positividad de
la prueba.

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13
Q

Prueba de Heller: Fundamento

A

Es una prueba específica e importante por su facilidad de realización. Se fundamenta
en la acción desnaturalizante de un agente químico (Ácido Nítrico: HNO3) sobre las proteínas
presentes en una muestra, poniéndo en evidencia el resultado por la disminución de la estabilidad de
las mismas en disolución, lo cual provoca su precipitación.

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14
Q

¿ Qué es la Reacción de reconocimiento y desnaturalización de catalasa?

A

Poner en evidencia la presencia de
catalasa en tejido animal y
para destacar la importancia de la estructura tridimensional de las enzimas para mantener su
funcionalidad. La existencia de catalasa en los tejidos animales, se aprovecha para utilizar el
agua oxigenada como desinfectante cuando se aplica sobre una herida. Como muchas de las
bacterias patógenas son anaerobias, mueren con el
desprendimiento de oxígeno que se produce cuando la catalasa de los tejidos actúa sobre el
agua oxigenada.

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15
Q

Reacción de reconocimiento y desnaturalización de catalasa: Materiales y reactivos

A

Materiales:
- Tubos de ensayos - Pipetas - Pinza
- Propipetas - Gradillas
Reactivos:
- Peróxido de Hidrógeno (5ml en c/tubo)
- Muestra: Tejido hepático de ave fresco y hervido previamente

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16
Q

Reacción de reconocimiento y desnaturalización de catalasa: Procedimiento y resultados

A

Procedimiento: Rotular dos tubos de
ensayo: 1 y 2. Introducir en el tubo 1
trocitos de hígado fresco y en el tubo 2
trocitos del mismo tejido hervido
previamente en agua. Añadir a cada tubo
5ml de agua oxigenada.

Resultados: la observación de burbujas se
corresponde con la presencia de oxígeno, uno de
los subproductos de la reacción. Dicha
observación se correlaciona con la presencia de
la enzima funcional. La ausencia de burbujeo
puede asociarse con pérdida de funcionalidad
enzimática por desnaturalización térmica de la
catalasa.

17
Q

Reacción de reconocimiento y desnaturalización de catalasa: FUNDAMENTO

A

La catalasa es una enzima que se
encuentra en las células de los tejidos animales y
vegetales que posee la función de catalizar la
hidrólisis de un producto tóxico que se genera
durante el metabolismo celular, el peróxido de
hidrógeno (H2O2) generando agua y oxígeno
según la siguiente reacción. Pertenece a la
categoría de las oxidorreductasas

18
Q

¿Cuáles podrían ser los causantes de la desnaturalización de las proteínas?

A

Agentes físicos como calor, agitación mecánica,
radiaciones, etc.,
Agentes químicos como ácidos o álcalis fuertes, detergentes iónicos, agentes
caotrópicos (urea, guanidina), solventes orgánicos, metales pesados, etc.,

19
Q

¿Las proteínas desnaturalizadas son afectadas en toda su estructura? ¿Qué ocurre con ellas?

A

Se pierden las estructuras cuaternaria, terciaria
y secundaria de la proteína, de modo irreversible en la mayoría de los casos. La estructura primaria
no se ve afectada ya que los agentes desnaturalizantes no atacan la unión peptídica. Sin embargo,
experimentalmente se comprobó que la desnaturalización proteica en algunos casos puede ser
reversible cuando los tratamientos desnaturalizantes no son tan drásticos.

20
Q

¿Qué son los ÁCIDOS NUCLÉICOS?

A

Son sustancias del más alto rango biológico, a ellos se atribuyen importantes
funciones tales como ser reservorio de la información genética y responsables de su
transmisión de una célula a otra célula hija o de un individuo a otro. Poseen un rol fundamental
en el proceso de síntesis proteica ya que dirigen el ensamblaje correcto de aminoácidos.

21
Q

¿Qué es el ADN?

A

Molécula del interior de las células que contiene la información genética responsable del desarrollo y el funcionamiento de un organismo. Estas moléculas son el medio de transmisión de la información genética de una generación a la siguiente. La estructura del ADN es una hélice bicatenaria unida por enlaces de hidrógeno débiles entre los pares de bases nucleotídicas purínicas y pirimidínicas: la adenina (A) se une con la timina (T) y la guanina (G) se une con la citosina (C). También se llama ácido desoxirribonucleico y DNA.
Es el monómero constituyente recibe el nombre de
desoxirribonucleótido

22
Q

¿Qué es el ARN?

A

El ARN contiene información copiada del ADN (el otro tipo de ácido nucleico).
Es un polímero lineal constituido por ribonucleótidos
Sus bases nitrogenadas son de A,C, C y U
Contienen regiones de doble cadena llamadas horquillas.
Su hebra es monocatenaria.
Es + inestable que el ADN.

23
Q

¿Cómo y por qué están constituidos los ácidos nucleicos?

A

químicamente están constituidos por un azúcar, una base nitrogenada (púrica o pirimídica) y
un grupo fosfato que al pH celular le confiere cargas negativas. Al azúcar se unen las bases
nitrogenadas por enlace N-glicosídicos y los grupos fostatos por enlaces de tipo fosfodiéster.
Luego cada nucleótido se une a otro mediante enlaces fosfodiéster establecidos entre el grupo
fosfato de un nucleótido con el oxhidrilo 3´de otro. Se genera de este modo una hebra
que se mantiene unida a otra cadena “Complementaria” por enlaces Puente de hidrógeno, en
el caso de ADN.

24
Q

¿Qué es la electroforesis de ADN?

A

es una técnica empleada para separar moléculas basándose en propiedades
como tamaño, conformación o carga eléctrica. Consiste en utilizar una matriz o soporte
semisólido con una estructura molecular porosa, a través de la cual pueden migrar moléculas
de diferentes tamaños cuando se aplica un campo eléctrico, en un medio conductor de la
corriente eléctrica (buffer de corrida). Las moléculas más pesadas migran más lentamente que
las más livianas o de menor tamaño. Por tener las moléculas de ADN y ARN cargas negativas,
estas moléculas se mueven hacia el polo positivo del soporte semisólido (agarosa en nuestro
caso).

25
Q

¿Cómo se realiza la electroforesis?

A

Las matrices que se utilizan son: GEL DE POLIACRIDAMIDAS o GEL DE AGAROSA

La más utilizada es la compuesta por agarosa (polisacárido obtenido
de algas)

1- Se disuelve la agarosa en un medio iónico a altas temperaturas.

2- A la agarosa
disuelta, en caliente, se le agrega un colorante que permita la visualización de las moléculas
separadas (tradicionalmente, Bromuro de etidio)

3-Se la vierte en una plataforma cuadrada
o rectangular que contiene un dispositivo similar a un peine.

4- Se retira el peine una vez pedra

5-Antes de la siembra, se mezcla la muestra
problema con un buffer de siembra que contiene entre otros componentes, un colorante (en
general azul de bromofenol)

6- Se traslada el
gel a la cuba de electroforesis que contiene el buffer de corrida y se siembran las
muestras.

7- Se procede luego a la etapa de revelado mediante luz UV, ya que el bromuro de etidio además de
intercalarse entre las bases de los ácidos nucleicos, emite una radiación fluorescente; observándose en caso positivo, bandas rojo- anaranjadas.

26
Q

Electroforesis de Ácido Desoxirribonucleico:

Preparación de Agarosa 1,5%

A

Pesar 1,5 g de agarosa y agregar buffer TBE (EDTA, ácido bórico, tris) 1.0X hasta alcanzar
un volumen final de 100 ml. Disolver la agarosa por calentamiento en microondas. Agregar
3µl de solución de Bromuro de etidio (10 mg/ml) y volcar sobre plataforma de acrílico con
peine. Dejar solidificar. Retirar el peine y disponer en cuba de electroforesis con buffer TBE
1.0x.

27
Q

Electroforesis de Ácido Desoxirribonucleico:

Siembra, Corrida y Revelado

A

Mezclar 2μl de buffer de siembra (azul de bromofenol, glicerol y agua) y 10μl de solución de
ADN. Homogeneizar con pipeta automática y sembrar en cada pocillo del gel preparado con
anterioridad. Correr a 100 voltios durante 25 minutos. Retirar el gel y observar el ADN por
transiluminación con luz UV.