La transcription Flashcards

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1
Q
Quels-sont les éléments de l'ARN?
A) Ribose
B) Désoxyribose
C) Phosphate
D) Base (ATGC)
E) Base (AUGC)
A

Quels-sont les éléments de l’ARN?
A) Ribose
C) Phosphate
E) Base (AUGC)

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Q

Quelles-sont les différences entre l’ADN et l’ARN?
A) Seulement leur structure et rien d’autre
B) L’ARN est simple brin
C) Groupement OH en C’2 du désoxyribose
D) Groupement OH en C’2 du ribose
E) L’uracile au lieu de la thymine

A

Quelles-sont les différences entre l’ADN et l’ARN?
B) L’ARN est simple brin
D) Groupement OH en C’2 du ribose
E) L’uracile au lieu de la thymine

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3
Q

Vrai ou faux.L’ARN peut se replier par appariement de bases.

A

Vrai!

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4
Q

Lequel des énoncés suivants est faux:
A) La diversité des structures secondaires de l’ARN est similaire à la forme tertiaire des protéines
B) Les appariements non-strandards sont impossibles
C) Les structures secondaires et tertiaires de l’ADN augmentent la stabilité
D) Les structures secondaires et tertiaires de l’ADN permettent une activité enzymatique

A

Lequel des énoncés suivants est faux:
B) Les appariements non-strandards sont impossibles

Faux, les appariements standards sont possibles et permettent la diversité des structure secondaires.

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5
Q

Quelle-est la différence entre le ribose et de désoxyribose?

A

Le groupement OH (fonction alcool) en C’2 pour l’ARN au lien de seulement H pour l’ADN.

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6
Q

Quels-sont les deux impacts de cette différence entre le ribose et le désoxyribose pour l’ARN?

A

1) Fonction alcool rend l’ARN plus sensible à l’hydrolyse alcaline
2) Deux O aux C’2 et C’3 permettent un cyclisation du groupement phosphate.

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7
Q

Vrai ou faux.La cyclisation du groupement P sur le ribose entraine une courbure de la chaine sucre-phosphate.

A

Vrai!

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8
Q

Quelles-sont les 2 caractéristiques qui différencie la thymine de l’uracile?

A

1) H au lieu de CH3 sur le C’3

2) L’uracile est moins coûteuse à produire

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9
Q

Vrai ou faux.

L’uracile se transforme tranquillement en Guanine.

A

Faux, c’est en cytosine.

Cela peut cause un problème lors de la traduction.

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10
Q

Lequel des énoncés suivants est faux?
A) La synthèse de l’ARN se fait de 5’ vers 3’
B) La synthèse nécessite l’apport de rNTPs
C) La synthèse nécessite un groupement OH disponible sur le 5’ de la chaine naissante.
D) La synthèse se fait par l’ARN polymérase

A

Lequel des énoncés suivants est faux?
C) La synthèse nécessite un groupement OH disponible sur le 5’ de la chaine naissante.

Faux, c’est sur le 3’

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11
Q

Vrai ou faux.Le brin qui sert de modèle pour la synthèse sur l’ADN se nomme «brin codant».

A

Faux, le brin codant est le brin ayant la même séquence que l’ARN produit. C’est le brin matrice qui sert de modèle pour la synthèse de l’ARN.

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12
Q

Quelles-sont les différences entre la réplication et la transcription? (2)

A

1) La réplication recopie tout le génome et la transcription recopie une région précise
2) La réplication se fait une fois par cycle cellulaire alors que la transcription fait un nombre de copies, un nombre de fois variable.

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13
Q

Lequel des énoncés suivants est faux?
A) Le nombre de protéines produites à partir d’un ARNm est variable
B) La transcription implique de la régulation
C) La transcription se fait toujours en même temps que le la traduction

A

Lequel des énoncés suivants est faux?

C) La transcription se fait toujours en même temps que le la traduction

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14
Q

Que peut-on dire du site actif de l’ARN polymérase?
A) Constitué des régions des deux plus petites sous-unités
B) Le site catalytique est situé à la base de la pince
C) Utilise le mécanisme catalytique d’ajout de nucléotides avec l’intervention de 2 ions métalliques

A

Que peut-on dire du site actif de l’ARN polymérase?

B) Le site catalytique est situé à la base de la pince
C) Utilise le mécanisme catalytique d’ajout de nucléotides avec l’intervention de 2 ions métalliques

–> Constitué des régions des deux plus grosses sous-unités

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15
Q

Compléter la phrase:On retrouve plus de similitude au niveau du __________qui s’occupe de la transcription alors que la __________ est très variable, et reflète les interactions avec les protéines régulatrices propres à chaque espèce.

A

On retrouve plus de similitude au niveau du SITE CATALYTIQUE qui s’occupe de la transcription alors que la PÉRIPHÉRIE est très variable, et reflète les interactions avec les protéines régulatrices propres à chaque espèce.

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16
Q

Quels-sont les 3 différentes ARN polymérases chez les eucaryotes et leur spécificités?

A

ARN Pol I: transcrit les séquences les différents autres ARN (pas protéines)

ARN Pol II: Transcrit les séquences codant les protéines

ARN Pol III: transcrit les séquences les différents autres ARN (pas protéines)

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17
Q

Quelle affirmation est fausse?
A) Les eucaryotes ont 3 ARN Pol composées de 10 sous-unités chacune.
B) Les procaryotes ont 1 ARN Pol composées de 5 sous-unités.
C) Les procaryotes ont 3 ARN Pol composés de 5 sous-unités.

A

Quelle affirmation est fausse?

C) Les procaryotes ont 3 ARN Pol composés de 5 sous-unités.

Une seule ARN Pol

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18
Q

Laquelle des affirmations suivantes est fausse?
A) L’ARN Pol n’a pas besoin d’amorce
B) La forme de l’ARN Pol peut stabiliser une purine (A) efficacement à l’initiation de la transcription.
C) L’ajout du 2ème nucléotide de façon stable sur le 3’OH du premier demande des liaisons non-spécifiques.
D) Chez les procaryotes, le facteur sigma aide à cette étape.

A

Laquelle des affirmations suivantes est fausse?

C) L’ajout du 2ème nucléotide de façon stable sur le 3’OH du premier demande des liaisons non-spécifiques.

Faux, cela demande des liaisons très spécifiques!

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19
Q

L’initiation de la transcription implique… (3)

A

1) La reconnaissance du promoteur (complexe fermé)
2) Passage en complexe ouvert (isomérisation)
3) Complexe de transcription initial

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20
Q

Quelle affirmation est fausse?
A) le promoteur est une protéine se plaçant en amont du gène à transcrire
B) Le promoteur détermine l’orientation du gène
C) Un seul des deux brins peut être transcrit, chacun des deux brins peut être matrice.
D) La force du promoteur est déterminée par le nombre de transcrits qu’il initie dans un laps de temps donné

A

Quelle affirmation est fausse?
A) le promoteur est une protéine se plaçant en amont du gène à transcrire

–> Faux, il s’agit d’une séquence d’ADN en amont du gène à transcrire.

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21
Q

Quels-sont les 3 facteurs qui influencent la force du promoteur?

A

1) Capacité à lier l’ARN Pol: plus ou moins de points de contacts (+ = + fort)
2) Isomérisation efficace: passage du complexe fermé au complexe ouvert. La bulle de transcription apparait rapidement avec un promoteur fort.
3) La facilité de l’ARN Pol à se dissocier du promoteur: passage du complexe de transcription initial au complexe ternaire stable. (10 nucléotides)

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22
Q

Chez les procaryote, quelle sous-unité de l’ARN Pol restreint l’initiation de la transcription aux promoteurs?

A

La sous-unité sigma.

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23
Q

Quelle affirmation est fausse?
A) La sous-unité sigma reconnait les promoteurs formés de 2 régions de 6 nucléotides (-35 et -10)
B) Plusieurs possibilité de sous-unité sigma selon l’espèce et même dans la même espèce
C) Le promoteur sigma 70 est composé de 2 sections non-spécifiques et un section centrale conservée.

A

Quelle affirmation est fausse?

C) Composée de 2 sections non-spécifiques et un section centrale conservée.

–> Faux. Composée de 2 sections conservées et une section centrale non-spécifique

24
Q

Qu’est-ce qui représente une séquence optimale pour la sous-unité sigma?

A

La séquence consensus. Plus un promoteur sigma s’en rapproche plus il est fort.

25
Q

Vrai ou faux.Le promoteur sigma 70 est le plus répandu chez les eucaryotes.

A

Faux! C’est chez E.Coli. La sous-unité sigma est présente chez les procaryotes seulement.

26
Q

Quels-sont les 3 ajouts supplémentaires possibles au promoteur sigma selon les caractéristiques suivantes?
A) Devant le -35, site de contact additionnel de l’ARN Pol
B) Après -10, stabilise l’enzyme sur le promoteur
C) Situé avant -10, remplace parfois le -35

A

A) Élément UP: Devant le -35, site de contact additionnel de l’ARN Pol
B) Stabilisateur: Après -10, stabilise l’enzyme sur le promoteur
C) Extension -10: situé avant -10, remplace parfois le -35

27
Q

À quelle région de la sous-unité sigma peut-on associer le motif hélice-coude-hélice?
A) sigma 2
B) Alpha
C) Sigma 4

A

À quelle région de la sous-unité sigma peut-on associer le motif hélice-coude-hélice?

C) Sigma 4

28
Q

Vrai ou faux.
Sigma 4 interagit avec l’ADN à l’aide de 2 hélices, une première se glisse dans le sillon majeur et lie une séquence spécifique et une deuxième s’attache à la charpente sucre-phosphate. Les hélices sont reliées par un coude d’acide aminés.

A

Vrai!

Je savais pas comment formuler une question avec ça autrement :P

29
Q

Quel rôle appartient à la région sigma 2 et de la sous-unité alpha du coeur de l’enzyme?
A) Lier l’élément UP
B) Reconnaitre l’élément -10 et stabiliser le brin codant

A

A) Lier l’élément UP: sous-unité alpha

B) Reconnaitre l’élément -10 et stabiliser le brin codant: sigma 2

30
Q

En quoi ne consiste pas l’isomérisation durant l’initiation de la transcription?
A) Les pinces BB’ se resserrent sur l’ADN devant l’enzyme
B) La région 2 de sigma est expulsée du site actif
C) Le site actif peut accommoder le brin matrice
D) La région 1 de sigma est chargée négativement et imite l’ADN

A

En quoi ne consiste pas l’isomérisation durant l’initiation de la transcription?

B) La région 2 de sigma est expulsée du site actif

–> Faux! C’est la région sigma 1 qui est expulsée du sire actif.

31
Q

Associez les région de la sous-unité sigma au bon rôle:
A) Reconnait l’élément -35 via un motif hélice-coude-hélice
B) Reconnait l’élément -10 et stabilise le brin codant (style SSB)
C) Reconnait le stabilisateur et est expulsée pour que l’holoenzyme passe en mode ouvert

A

Associez les région de la sous-unité sigma au bon rôle:

A) Sous-unité Sigma 4
B) Sous-unité Sigma 2
C) Sous-unité Sigma 1

32
Q

À l’étape de l’isomérisation dans l’initiation, qu’est-ce qui ne concorde pas?
A) Changement spontané de conformation énergiquement favorable
B) Ouverture de l’ADN entre -11 et +3
C) Irréversible
D) 50% de chance de se détacher ou de passer en complexe ouvert.
E) Liaison au promoteur

A

À l’étape de l’isomérisation dans l’initiation, qu’est-ce qui ne concorde pas?

E) Liaison au promoteur

Non, c’est l’étape 1, passage en complexe fermé.

33
Q

À l’étape de l’isomérisation dans l’initiation, qu’est-ce qui est vrai?
A) Changement spontané de conformation énergiquement défavorable
B) Les pinces BB’ se resserrent sur l’ADNsb devant l’enzyme
C) La région 1 est expulsée du site actif
D) Réversible

A

À l’étape de l’isomérisation dans l’initiation, qu’est-ce qui est vrai?

C) La région 1 est expulsée du site actif

–> le site actif peut alors accommoder le brin matrice
La région 1 est chargée négativement.

34
Q

Quels-sont les deux canaux du complexe de transcription initiale et quel brins s’y insèrent?

A

Canal NT (non template strand) où le brin codant s’insère.

Le canal T (template strand), dans lequel le brin matrice entre.

35
Q

Dans la phase du complexe de transcription initiale, où se referme l’ADNdb?

A

En position -11 dans l’holoenzyme.

36
Q

Comment peut-on passer de l’étape de la transcription initiale à l’élongation?

A

L’holoenzyme doit s’échapper du promoteur.

37
Q

Quelle est la première étape de l’élongation?

A

Transition vers le complexe ternaire stable

38
Q

Vrai ou faux.

La sous-unités sigma est aussi responsable des difficultés de l’ARN Pol à entrer en phase d’élongation.

A

Vrai!

39
Q

Quelle région de la sous-unité sigma est impliquée dans l’étape 4 (première étape de l’élongation)? Quel est son rôle?

A

La région sigma 3.2

Expulsée après quelques tentatives, permet le passage de l’ARN naissant, ce qui est nécéssaire pour pour produire des ARN de plus de 10 nt.

40
Q

Qu’est-ce qui aide la polymérase à se dissocier du promoteur?

A

Le changement induit par la région sigma 3.2 affaibli le lien sigma-polymérase et celui-ci se dissocie.

41
Q

Quelle est la deuxième étape de l’élongation? (étape 5 de la transcription?)

A

Le complexe ternaire stable.

42
Q

Laquelle de ces affirmations est fausse concernant le Le complexe ternaire stable?
A) 8-9 nt restent appariés en tout temps au brin matrice alors que le reste sort de l’enzyme au fur et à mesure.
B) La dimension de la bulle de transcription varie
C) Lorsqu’une paire de bases est est déroulée à l’avant, une paire de base est reformée en arrière.
D) L’ARN Pol a recours à deux moyens d’autocorrection

A

Laquelle de ces affirmations est fausse concernant le Le complexe ternaire stable?

B) La dimension de la bulle de transcription varie

–> Faux, elle reste toujours stable

43
Q

Quelles-sont les deux activités de l’ARN Pol pour avoir des transcrits plus fidèles?

A

1) Correction pyrophospholytique: le dernier nt ajouté est retiré en lui remettant son PPi perdu
2) Correction hydrolytique: retour en arrière et excision d’une séquence de quelques nucléotides.

44
Q

Quels-sont les deux types de terminaison possibles?

A

Intrinsèque et Rho dépendante

45
Q

Qui suis-je: 2 régions riches en GC complémentaires entre elles et une région Poly-A (sur l’ADN), induit un pli dans l’ARN qui forme une tige-boucle suivi d’une série de U.

A

Terminateur intrinsèque

46
Q

Pourquoi la tige-boucle se forme alors que l’ARN est encore apparié à l’ADN?

A

Les liaisons ARN-ARN sont plus favorables car stables.

47
Q

Qui suis-je?
Hexamère liant l’ARNsb sur une séquence brut se déplaçant en hydrolysant de l’ATP cause la dissociation du complexe de transcription quand il rencontre la polymérase.

A

Rho responsable de la terminaison Rho-dépendante

48
Q

Qu’est-ce qu’un séquence brut?

A

40nt sans structure secondaire, après les site de terminaison de la traduction, libre de ribosomes.

49
Q

Les gènes sont-ils mono ou polycistroniques chez les eucaryotes?

A

Monocistroniques

50
Q

Combien de sous-unités en périphérie pour l’ARN Pol II?

A

12

51
Q

Quelle est la répétition en tandem sur la queue CTD de l’ARN Pol chez les eucaryotes?

A

Ser-Pro-Thr-Ser-Pro-Ser (heptamère)

52
Q

Quelle partie de la Pol II a ces fonctions?

  1. contrôlée par phosphorylation, responsable du passe du complexe d’initiation au complexe d’élongation
  2. Recrutement des facteur d’élongation
  3. Recrutement des facteurs de maturation des préARNm
A

Queue CTD

53
Q

Qu’est-ce qui joue le rôle du facteur sigma chez les eucaryotes?

A

3 FT généraux: TFIIB, TFIID, TBP

54
Q

Quelles-sont les séquences pouvant composer un promoteur (2,3, ou 4)

A

BRE, TATA, Inr, DPE

55
Q

Vrai ou faux.

La formation du complexe préinitiation se fait à la séquence Inr.

A

Faux, elle se fait à TATA quand elle est là. Inr est le plus fréquent chez tous les promoteurs.