La fermentation Flashcards

Les 2 parties sont comprises

1
Q

Comment Pasteur définit-il la fermentation ?

A

“La vie sans l’air”
c’est-à-dire une fermentation anaérobique. La
première fermentation est la fermentation alcoolique

Réaction biochimique de conversion de l’énergie chimique contenue dans une source de carbone (ex :
glucose) en une autre forme d’énergie sans oxygène.
C6H12O6 + 2ADP + 2Pi → 2C2H5OH + 2CO2 + 2ATP
La fermentation est la production de composés d’intérêt par culture en masse de microorganismes

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Quelles sont les caractéristiques nécessaires des microorganismes pour être fabriqués en masse ?

A
  • Facile à manipuler
  • Faible exigence
  • Croissance en culture rapide
  • Milieu liquide (pour utiliser des fermenteurs)
  • Amélioration des souches
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Les métabolites primaires sont spécialisés, vrai ou faux ?

A

C’est faux, ce sont les secondaires.

Les primaires sont indispensables aux fonctions biologiques, à la vie.

Les secondaires ne sont pas indispensables à la vie, mais nécessaire à la survie, et spécialisés

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Qu’est-ce que la trophophase ?

A

C’est la période de croissance logarithmique. La première croissance lors de la culture cellulaire et celle qui produit les métabolites primaires.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Qu’est-ce que l’idiophase ?

A

C’est la seconde phase de croissance, qui correspond à l’arrivée des métabolites secondaires.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Nous avons 4 phases :
- Phase de latence
- Phase exponentielle
- Phase stationnaire
- Phase de mort cellulaire.

Quand sont produits les métabolites primaires et secondaires ?

A

Métabolites primaires : phase exponentielle

Métabolites secondaires : phase stationnaire

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Quelles sont les 4 étapes de la fermentation ?

A
  • Inoculum
  • Ensemencement
  • Fermentation
  • Séparation/purification
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Qu’est-ce que l’inoculum ?

A

C’est déjà la première phase de fermentation et c’est aussi le microorganisme que l’on v a mettre en culture.
Soit à partir de :
- Cultures en boîte de prétri
soit :
- microorganismes congelés à -80°C
On va les agiter et ensuite on passe à l’ensemencement.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Décrire l’ensemencement.

A

On ensemence l’inoculum dans différents fermenteurs, on augmente les volumes de culture petit à petit. D’abord un pré-ensemencement puis l’ensemencement.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Décrire la fermentation.

A

La durée de fermentation est différente selon le produit.
Quand la culture est terminée on arrête la fermentation et on récolte le milieu de culture en séparant le surnageant et les cellules (biomasse)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Décrire la filtration.

A

On élimine les cellules et on récupère les surnageants débarrassés de ces cellules, par filtres rotatifs ou centrifugation.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Décrire la purification.

A

Ce sont des extractions additionnelles, lavages… On récupère les solvants et on traite/élimine les effluents.
Une fois que c’est bien avancée on pourra faire des purifications chromatographiques et on récupère le produit pur. Concentré pour élminer les solvants, on sèche sur le cylindre ou sous vide.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Quels sont les 2 types de techniques de fermentation ?

A
  • Fermentation en surface (croissance des microorganismes à la surface du milieu)
  • Fermentation par submersion (croissance dans le milieu de culture, ex : pénicilline) -> agitation importante
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Pour la fermentation par submersion on a 2 types de cultures, lesquels ?

A
  • Culture en mode discontinu ++++ (on prépare la culture, on ajoute l’inoculum et on arrête la culture)
  • Culture en mode continu (on ajoute le substrat et on récupère le produit sans arrêter la culture) -> très rare
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Il y a 2 lots en mode discontinu, lesquels ?

A
  • En lot “batch” +++ : nutritifs et inoculum ajouté dans le fermenteur stérilisé préalablement, add. éventuelle d’agents anti-mousse (développements pas trop trop important), récupération du contenu et extraction du produit désiré
  • En lot “Fed bach” (procédé en lot, ajout supp, de milieu sur le lot ou addition contrôlée de nutriments pendant la fermentation, glucose (limite la croissance), concentration en produit qu’on souhaite obtenir plus élevé par rapport au “batch”)
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

La production d’antibiotiques se fait en mode anaérobie, vrai ou faux ?

A

C’est faux, c’est en mode aérobie.
- Addition d’air stérile
- Sous agitation ou en mode mélange (ajout O2)
- Production d’ATB, enzymes, vitamines
- utilisée +++ pour les mdts

Alors qu’anaérobie, pas d’aération et s’est juste pour la production d’alcool (vin), d’acide lactique…

17
Q

Faire la description d’un bioréacteur/fermentateur industriel.

A
  • Cuve en inox avec un moteur qui agite les pales d’agitation (pour
    permettre l’aérobie)
  • Volume : 1L - 500m3 (80% de remplissage sinon sous pression, dans 1L
    on met 800ml)
  • Capacité : 100 kg poids sec/m3
  • Quantité de produit : 10 mg/L - 200 g/L (selon le produit)
    → 200 g/L : faciliter d’extraire le produit
    → 10 mg/L (=très dilué) : méthodes de purification importantes et + fines.
  • Conditions contrôlées (mélangeur, aérations, pH, apparition de mousse
    et de croissance mycélienne ou biofilms)
  • Stérilisation par vapeur du milieu de culture (par autoclave).
  • Aération (fermentation aérobie) par des bulles d’air.
  • Agitation, contrôlée par un rotor.
  • Système de refroidissement (air, eau) ou système de chauffage à
    l’extérieur de l’enveloppe.
  • pH contrôlé (=7) par une électrode (ajout de base ou d’acide)
  • Système classique
18
Q

Les macronutriments correspondent à des composés importantes comme : traces d’éléments minéraux (K, Ca, Mg, Fe, S, P et/ou
des oligo-éléments / métaux, vitamines, vrai ou faux ?

A

C’est faux, c’est la définition de micronutriments.

Macronutriments = sources de C, H, N, eau, sucres, lipides, AA…

19
Q

Les nitrites, alcalnilisant, analogues de base (antimétabolite), l’orange acridine, etc, sont des agents mutagènes biologiques, vrai ou faux ?

A

C’est faux, ce sont des agents mutagènes chimiques.

Agents mutagènes biologiques :
- transposons : permettent d’insérer un morceau d’ADN dans le chromosome et provoquent une
modification de la lignée.

20
Q

L’inoculum peut subir des mutations, des radiations X, UV, être attaqués par des agents mutagènes, vrai ou faux?

A

C’est vrai.

21
Q

La purification/bioséparation (traitement en aval ou “downstream processing”) se fait sur le milieu de culture, vrai ou faux ?

A

C’est vrai, si le produit est excrété des cellules pendant la culture il se trouve dans le milieu de culture.

Mais ça peut être aussi le bouillon de culture, si le produit est intracellulaire, on lyse les cellules et on récupère ce bouillon de culture.

22
Q

Le produit ne doit pas être trop dilué dans le milieu de culture, vrai ou faux ?

A

C’est faux, il doit être bien dilué dans le liquide du milieu de culture.

23
Q

La solubilité est importante pour l’extraction par solvant, précipitation et cristallisation, vrai ou faux ?

A

C’est vrai.
Si le composé est assez soluble avec le milieu de culture en phase organique, on fait une extraction
liquide/liquide et on récupère le composé dans la phase organique.

24
Q

La qualité de produits pote sur leur :
- …
- …
- …

A

○ Activité (toujours présente)
○ Pureté (doit être maximale)
○ Présence de contaminants (il ne faut pas en avoir)

25
Q

Quelles sont les étapes de cette purification ?

A
  • Séparation/clarification (centrifugation ++)
  • Homogénéisation (lyse cellulaire)
  • Concentration (objectif : réduire le volume pour concentrer le composé - > précipitation, ultra-filtration, ultra-centrifugation)
  • Purification (objetif : isolement du produit d’intérêt -> colonne d’adsorption, chromatographie d’élution, etc)
26
Q

Qu’est-ce que la chromatographie ?

A

purifier un composé en utilisant une
phase stationnaire. La séparation se fait en fonction de l’affinité
du composé pour le solvant d’élution.

27
Q

Quels sont les 3 types de chromatographie ?

A
  • chr. échangeuse d’ions (cf. TP biochimie)
  • chr. par gel-filtration
  • chr. d’affinité
28
Q

Le contrôle de qualité est basé sur les bonnes pratiques de fabrication (industrielle), vrai ou faux ?

A

C’est vrai.
Elles sont soumises aux mêmes normes que la fabrication des molécules de synthèses :
- Protocoles d’opération normalisés
- Validation des procédés
- Documentation bien définie

29
Q

Quelle est l’exemple de fermentation le plus connu ?

A

La pénicilline G

30
Q

La pénicilline est un produit métabolite secondaire, vrai ou faux ?

A

C’est vrai.

Cinétique de production de pénicilline, étant donné que c’est un produit
métabolique dit spécialisé ou secondaire :
- Production de pénicilline pendant la phase stationnaire
- Ajout continuel des nutriments pour maintenir la production de
pénicilline (= en fed-batch pour une production optimale).