INTÉRÊT DU SÉQUENÇAGE DE NOUVELLE GÉNÉRATION NGS Flashcards
Que permet le NGS
séquencer de grandes qté d’ADN
analyser en parallèle des cibles multiples
technique NGS
compartimentalisation de l’échantillon de départ
séquençage individuel de chaque fragment de départ
pour quoi utilise t on des panels dits ADN?
pour la recherche des mutations et amplification de gènes
pour quoi utilise t on des panels ARN?
pour la recherche de transcrits de fusion après reverse transcription des ARNm en ADNc
pour quel type d’analyse le NGS est il intéressant ?
pour la caractérisation moléculaire des tumeurs
la couverture définition
correspond a la quantité de séquence linéaire analysée
profondeur du séquençage définition
correspond au nombre de fois où le même fragment est analysé –> conditionne la sensibilité
quel type d’analyse obtient on à l’issue du séquençage
une analyse bioinformatique des données permet de générer un tableau de variants
quel type d’analyse obtient on à l’issue du séquençage
une analyse bioinformatique des données permet de générer un tableau de variants