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Environnement et biosphère examen final > Interactions biotiques > Flashcards

Interactions biotiques Flashcards

1
Q

Nommer les 3 types d’interactions biotiques vues en classe

A

Différenciation
Reconnaissance des pairs
Interactions inter-espèces

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Q

Nommer des types de différenciations chez les microrganismes (4)

A

Morphologiques
De fonction
Biochimique
De métabolisme

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Q

À quoi sert la différenciation morphologique des microorganismes?

A

Produire des spores : propagation ou résistance/dormance

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4
Q

Quel est le rôle d’un endospore pour la bactérie?

A

Protection

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5
Q

Quels sont les rôles des exospores pour la bactérie?

A

Dormance et propagation

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6
Q

Nommer des types de spores autre que les endo et exospores qui sont utiles aux microorganismes

A

Myxospores
Akinètes (cyanobactéries)
Kystes

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7
Q

Qu’est-ce qui peut activer la formation d’endospores?

A

Début de manque en nutriment et quorum sensing

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8
Q

Décrire les étapes de la formation d’un endospore jusqu’à sa libération

A 
Division cellulaire
Formation du filament axial, puis du septum (division inégale en taille) - 3 membranes
Enkystement du préspore
Formation du cortex, puis de la tunique
Lyse de la cellule pour libérer le spore
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9
Q

Nommer les 4 parties formant la protection d’un endospore et indiquer le rôle de chaque partie

A

Core (centre) : déshydraté, riche en acide dipicolinique et ions calcium - empêche la dénaturation de l’ADN. Présence de SASP (small acid-soluble proteins) - protège des UV et de la chaleur
Cortex : Peptidoglycans branchés - protège contre les chocs osmotiques
Coat (tunique) : Couches de protéines spécifiques aux spores - empêche les produits chimiques d’entrer dans le spore
Croûte ou Exosporium : Couverture externe de protéines - résiste à la dessication

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10
Q

À quoi peuvent résister les endospores? (4)

A

Chaleur
Stress chimiques
UV et autres rayonnements
Temps

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11
Q

Nommer les 2 facteurs pouvant mener à la germination des endospores

A 
Germinants nutritifs (acides aminés, sucres...)
Germinants non-nutritifs (peptidoglycanes, acide dipocolinique...)
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12
Q

Que représentent les germinants non-nutritifs?

A

D’autres cellules autour germent aussi

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13
Q

Donner des exemples d’endospores utiles

A

Marqueurs pour l’efficacité de l’autoclave

Biofertilisants avec bactéries qui seront viables à l’achat

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14
Q

Donner un exemple d’endospores nuisible

A

Utilisation de Bacillus anthracis comme bioterrorisme

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15
Q

Quel est le signal de sporulation pour les exospores?

A

Manque de nutriments

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16
Q

Quelle est l’apparence d’un organisme qui fait un exospore?

A

Longue chaîne de spores

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17
Q

Quel signal mène à la formation de kyste

A

Manque de nutriments

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18
Q

Décrire la formation de kystes

A

Formation de granules de PHB (nutriments)
Division en 2-14 cellules (exine) recouvert d’une paroi = kyste
Arrivée des nutriments : kyste s’ouvre, cellules germent

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19
Q

Vrai ou faux : les kystes sont résistants à la chaleur

A

Faux

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20
Q

Vrai ou faux : les kystes sont résistants à la sécheresse

A

Vrai

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21
Q

Nommer les différents types de spores chez les mycètes (4)

A

Arthrospores
Sporangiospores
Conidiospores
Blastospores

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22
Q

Décrire l’apparence des arthrospores

A

Hyphes qui se fragmentent, cellules individuelles propagées dans la nature.

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23
Q

Décrire l’apparence des sporangiospores

A

Sporange avec spores au bout d’un hyphe. Libération par fragmentation du sac

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24
Q

Décrire l’apparence des conidiospores

A

Longues chaînes de spores au bout de l’hyphe, sans sac

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25
Q

Décrire l’apparence des blastiospores

A

Bourgeonnement des cellules mère partout sur l’hyphe

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26
Q

Qu’est-ce qu’une différenciation de fonction?

A

Diverses individus avec des rôles différents au sein d’une même population

27
Q

Donner l’exemple de Caulobacter crescentus (bactéries qui colonise les roches dans l’eau) pour une différenciation de fonction

A

Lac avec peu de nutriments : cellules mobiles. Au bon lieu : perte du flagelle - pédoncule avec un hold fast (ventouse).
S’installe sur une roche et peut se diviser : cellules filles ont un flagelle qui permet de trouver un nouveau lieu où s’installer.

28
Q

Nommer les 4 fonctions possibles au sein du même colonie de Bacillus subtilis

A

Mobilité
Biofilm
Compétence
Sporulation

29
Q

Que veut-on dire par la différenciation biochimique?

A

Production de métabolites primaires et secondaires

30
Q

La production de pigments est possible après quel type de différenciation?

A

Biochimique

31
Q

Vrai ou faux : les antibiotiques peuvent être utilisé pour le quorum sensing

A

Vrai : seulement à faible concentration

32
Q

Discuter de l’endotoxine CRY

A

Spécifique à B. thuringensis. Toxine = cristal attaché à un spore. Insectes mangent les bactéries des plantes = digestion des cristaux qui libère la toxine et qui perfore la paroi, libérant des nutriments qui font germer les spores. Utilisation en biopesticides, mais résistance augmente. Aussi chez les OGM (maïs)

33
Q

Décrire l’exemple de différenciation de fonction et biochimique d’une actinobactérie

A

Différenciation de fonction : hyphes aériens, et exospores

Biochimique : production d’antibiotiques (mort cellulaire programmée qui mène à la formation d’hyphes aériens)

34
Q

Décrire les cellules persistantes

A

État de dormance partielle (croissance très lente / arrêtée), et de contrôle restrictif du stress oxydatif.

35
Q

Quels sont les 2 facteurs qui peuvent mener à la différenciation en cellules persistantes?

A
  • Environnement (stress, présence de biofilm, endocytose par macrophages)
  • Facteur stochastique
36
Q

Nommer un rôle important des persisters pour les bactéries Gram - et Gram +

A

Bactéries Gram-négative : Rôle important des systèmes toxine-antitoxine
Bactéries Gram-positive: Possible rôle des systèmes toxine-antitoxine…

37
Q

Quel est le résultat d’un système toxine-antitoxine?

A

Induit la dormance, ce qui confère un état de protection contre les stress extérieurs aux cellules persistantes

38
Q

Pourquoi les bactéries persistantes sont-elles résistantes aux antibiotiques?

A

Antibiotique fonctionne en bloquant le processus actif. Si pas de cellule active, pas d’effet!

39
Q

Nommer 3 stratégies pour contourner le problème des cellules persistantes

A
  • Antibiotiques dont la cible ne doit pas nécessairement être métaboliquement active (ex. membranes).
  • Forcer les persisters à re-croître pour augmenter l’efficacité des traitements antibiotiques.
  • Modification chimique d’antibiotiques connus (ex. anticorps-antibiotique) pour maximiser l’effet.
40
Q

Nommer des avantages pour les microorganismes unicellulaires d’avoir un mode de vie ‘‘multicelluaire’’. (4)

A

Résistance aux stress (température, pH, pression osmotique, …)
Meilleure utilisation de nutriments
Protection contre les prédateurs
Division des tâches possible

41
Q

Nommer des désavantages pour les microorganismes unicellulaires d’avoir un mode de vie ‘‘multicelluaire’’. (3)

A

Coût énergétique de synthèse des adhésines et molécules de communication
Limitation de mouvement
Gestion des tricheurs

42
Q

Nommer les 4 types de multicellularité des microorganismes unicellulaires

A

Swarms
Multicellular magnetotactic procaryotes (MMP)
Agrégats
Filaments

43
Q

Qu’est-ce qu’est le mode multicellulaire ‘‘swarm’’?

A

Colonie de cellules unicellulaires envahit une autre colonie et utilise ses nutriments.

44
Q

Nommer un exemple d’organisme vivant en filament et en expliquer l’avantage

A

Bon transfert de nutriments. Ex : hétérocystes des cyanobactéries (fixation de l’azote) et cellules photosynthétiques.

45
Q

Discuter des MMPs (Multicellular magnetotactic procaryotes)

A

Obligatoirement multicellulaires, 20-60 cellules, sphère qui va se diviser (pas les cellules individuellement). Magnétosomes (Fe3S4) qui nagent vers les pôles magnétiques

46
Q

Discuter du phénomène de multicellularité des amibes

A

Se nourrit de bactéries, une sécrète de l’AMPc (waves) = rassemblement géant et ‘‘pseudopodes’’ (plus de déplacement en peu de temps). But : trouver un endroit où s’installer.

Fructifications (voir prochaine diapo) : s’installer le plus haut possible pour le transport par le vent et les animaux. Seulement 80% se reproduisent et 10% font la tige et la base.

Mécanisme de reconnaissance des pairs pour reconnaitre les tricheurs (profiteurs)

47
Q

Qu’est-ce qu’est un bien public?

A

Petites molécules extracellulaires partagées entre toutes les cellules.

48
Q

Nommer des exemples de molécules du bien public

A

Acquisition de nutriments (sidérophores, molécules de dégradation des polysaccharides…)
Molécules de quorum sensing
Antibiotiques (synthèse et dégradation)
Biosurfactants

49
Q

Que doit-il y avoir pour avoir une division du travail dans une colonie microbienne? (2)

A
  • Des types cellulaires clairement définis et mutuellement exclusifs
  • Présence de tâches qui se complémentent
50
Q

À quoi sert la division du travail?

A

Effectuer en même temps deux activités/tâches métaboliquement coûteuses, et donne ainsi un meilleur fitness à la population globale.

51
Q

Que sont les tricheurs en microbiologie?

A

Cellules génétiquement différentes qui profitent des autres, notamment en se reproduisant plus et en ne participant pas aux activités métaboliquement demandantes

52
Q

Comment peut-on limiter le problème des tricheurs au sein d’une même espèce?

A

Proximité physique

Reconnaissance des pairs (kin recognition): Sélection du soi ou Élimination des autres

53
Q

Donner des exemples de la reconnaissance des pairs par la sélection du soi

A

Système clé-serrure, contact direct et protéines extracellulaires. Ex : amibes

54
Q

Comment peut-on visuellement observer une reconnaissance des pairs par élimination des autres?

A

Délimitation claire, zone de non-croissance entre 2 colonies

55
Q

Expliquer le processus de reconnaissance des autres via élimination par inhibition de contact

A

Opéron qui utilise des toxines. CdIB : promoteur (ou toxine) qui ancre à la surface. CdiI : inhibiteur, intracellulaire
Phénomène clé-serrure. Chaque opéron très spécifique

56
Q

Quels sont les 3 scénarios possibles pour l’élimination des autres par inhibition de contact?

A

1) Inhibition de croissance : La toxine cause des dommages cellulaires, tel la dégradation de l’ARNt (pas la même espèce)
2) Pas d’effet : Le CdiI correspondant inactive la toxine CdiA, conférant l’immunité
3) Inhibition de croissance : Le CdiI ne correspond pas, et la toxine cause des dommages cellulaires

57
Q

Comment se font les interactions inter-espèces pour la reconnaissance des autres et élimination de l’autre?

A

Via contact direct
Via des molécules (signaux chimiques)
- Communication
- Manipulation de l’environnement

58
Q

Expliquer l’interaction entre Pseudomonas aeruginosa et Vibrio en terme d’élimination de l’autre à l’aide des sécrétions de type 6

A

Lorsque Vibrio attaque : Pseudomonas assemble son type 6 et contre-attaque - tue Vibrio.
Si Vibrio fait rien, pas d’attaque de la part de Pseudomonas

59
Q

Nommer des molécules médiant le signal dans la communication inter-espèces

A 
Molécules de quorum sensing
Antibiotiques
Peptidoglycanes
Surfactants
Sidérophores
60
Q

Nommer des réponses possibles à la communication interespèce

A 
Inhibition/stimulation de croissance
Inhibition/stimulation du biofilm
Induction de la synthèse de métabolites
secondaires (différenciation)
Altération de la virulence
61
Q

Décrire un exemple de coopération inter-espèces pour l’approvisionnement en sources de carbone

A

Streptococcus gordonii utilise le glucose et le transforme en acide lactique
Aggregatibacter actinomycetemcomitans préfère acide lactique comme source de C : ne prend pas le glucose qui sert à streptococcus en diminuant la quantité d’acide lactique du milieu, ce qui pousse à l’utilisation de plus de glucose

62
Q

Nommer un exemple de compétition entre 2 espèces

A

Compétition du fer avec les sidérophores

63
Q

Discuter de la bataille des pathogènes entre Candida albicans et Pseudomonas aeruginosa.

A

Candida en hyphe. Pseudomonas colonise et l’hyphe meurt : pas de forme levure!
Pour Candida, si quorum sensing, diminution de la différenciation en hyphe et moins de pycocyanone (toxine) produite par Pseudomonas.

64
Q

Étudier le système toxine-antitoxine peu importe c’est dans quel powerpoint parce que j’me suis fourrée dans les questions

A

Oui chef

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