Microbiote Flashcards

1
Q

Vrai ou faux : E. coli est la bactérie présente en majorité dans le microbiote

A

Faux : moins de 1% des bactéries du microbiote sont des gammaprotéobactéries

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Q

Quelles sont les techniques disponibles pour étudier les microbiotes? (3)

A

Approche microbiologie environnementale (descriptive)
Expériences fonctionnelles (tester des hypothèses)
Essais cliniques

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3
Q

À quoi sert l’approche de microbiologie environnementale dans l’étude des microbiotes?

A

Qui est là? - Séquençage de masse de l’ADN encodant le 16S

Que font-ils? - Séquençage de masse de type métagénomique

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4
Q

Quelles sont les expériences fonctionnelles possibles dans l’étude des microbiotes?

A

Souris gnotobiotiques, transgéniques ou non

Culturomique (On essaie de cultiver les mo difficiles à cultiver dans les intestins)

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5
Q

Connaître quelques endroits dans le corps où un débalancement du microbiote peut mener à des problèmes

A
Intestins
Peau
Bouche
Placenta
Vagin
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6
Q

Vrai ou faux : le placenta contient un microbiote

A

Faux

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7
Q

Le microbiote d’un bébé naissant est-il plus près de celui de sa mère, de son père ou un mélange des deux?

A

De sa mère

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8
Q

Nommer quelques circonstances autour de la naissance d’un enfant qui vont affecter le microbiote de l’enfant

A

Voie vaginale ou césarienne, traitement antibiotique en bas âge, naissance prématurée …

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9
Q

Quel est le 2e contact avec un microbiote qu’un enfant va avoir après sa naissance?

A

Lait maternel

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10
Q

Discuter de l’évolution du microbiote d’un bébé, de la naissance jusqu’à 2-3 ans

A

Nouveaux nés : anaérobes facultatifs (vont tout consommer l’O2)
1 semaine à 3 mois : anaérobies strictes
1 an (changement de diète) : ressemble au microbiote adulte
2-3 ans : microbiote stable

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11
Q

À partir de quel âge (stade de développement de la vie) le microbiote est à son maximum de richesse? Le reste-il tout le reste de la vie?

A

Adolescence et oui

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12
Q

À partir de quel âge (stade de développement de la vie) le microbiote est à son maximum de stabilité? Le reste-il tout le reste de la vie?

A

Âge adulte - rediminue chez les personnes âgées

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13
Q

Vrai ou faux : chez les adultes, le microbiote est très varié en terme de phylum (espèces)

A

Vrai

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14
Q

Vrai ou faux : chez les adultes, le microbiote est très varié en terme de fonctions

A

Faux

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15
Q

Quel est le rôle du mucus intestinal par rapport au microbiote?

A

Permet de diminuer la quantité de microorganismes sur les cellules épithéliales.

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16
Q

Qu’est-ce qui influence l’identité des microorganismes près de la paroi épithéliale de l’intestin? Près de la lumière intestinale?

A

Paroi : génotype de l’hôte

Lumière : diète

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17
Q

Nommer quelques facteurs connus qui influencent le microbiote

A
Médication
Paramètres sanguins
Santé 
Diète
Mesures (taille) et poids
Style de vie
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18
Q

Vrai ou faux : la majorité des facteurs influençant le microbiotes sont connus

A

Faux

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19
Q

Quels types d’études ont été faites sur des humains par rapport au microbiote? Quel était le résultat?

A

Étude sur de grandes cohortes et sur des jumeaux : aucun résultat clair

20
Q

Vrai ou faux : certains facteurs génétiques vont influencer le microbiote

A

Vrai : Certains cas : mutations qui vont avoir un impact sur le microbiote - inflammation

21
Q

Que sont les MAC? (indice : microbiote)

A

Microbiota-accessible carbohydrates - fibres

Source d’énergie pour les microorganismes que nous ne sommes pas capables de digérer

22
Q

Vrai ou faux : une diète riche en gras va provoquer un microbiote différent d’une richesse pauvre en gras

A

Vrai

23
Q

Quel type de microorganisme est beaucoup plus présent dans une diète nord-américaine qu’une diète axée sur la chasse, la cueillette et l’agriculture (non-transformée)?

A

Bactéroïdes

24
Q

Quel type de microorganisme est beaucoup moins présent dans une diète nord-américaine qu’une diète axée sur la chasse, la cueillette et l’agriculture (non-transformée)?

A

Prevotella

25
Q

Comparer une diète urbaine américaine d’une diète basée sur l’agriculture

A

Urbain : riche en gras saturés et en protéines animales, plus d’additifs alimentaires et moins de fibres
Agriculture : moins de gras saturés et de protéines animales, plus de fibres

26
Q

Décrire une expérience démontrant l’impact de la diète sur le microbiote

A

Souris gnotobiotiques avec le microbiote humain. 2 diètes :

  • Que des polysaccharides de plantes
  • Riche en gras et en sucre

Augmentation de la présence de certaines voies métaboliques
Augmentation du taux de gras (même après transplantation d’un microbiote américain à une souris qui se nourrit que de plantes!)

27
Q

Nommer quelques voies métaboliques qui augmentent en quantité avec une diète riche en plantes

A

Synthèse de sucres complexes
Dégradation de sucres complexes
Synthèse d’acides aminés et autres facteurs de croissance accessoires

28
Q

Qu’est-ce qui peut influencer le microbiote dans le style de vie? (4)

A

1) Eau propre : Diminution des transmissions fécales
2) Taille réduite des familles : Diminution des transmissions en bas âge
3) Augmentation de l’hygiène (bains, douches, savons antibactériens)) : Sélection favorisant un changement dans la composition
4) Exercice : Variation de la composition

29
Q

Qu’arrive-t-il à la composition du microbiote lors de l’utilisation d’antibiotiques?

A

Moins de bactéroïdes

Plus de protéobactéries (qui arrivent en cas de problèmes)

30
Q

Qu’arrive-t-il au niveau des molécules produites (4) lors de l’utilisation d’antibiotiques?

A

Augmentation d’acides biliaires primaire et ê d’acides biliaires secondaires
Augmentation de certains sucres-alcools (mannitol, sorbitol)
Diminution d’acides gras libres
Augmentation d’acides aminés

31
Q

Vrai ou faux : le microbiote adulte peut facilement changer

A

Faux : après une perturbation, il revient souvent à l’état normal

32
Q

Donner des caractéristiques des cellules épithéliales de l’intestin en présence de microbiote

A

Mucus plus épais
Villi plus courts et mieux irrigués
Cryptes plus profondes
Le système immunitaire associé est mature
Stimulation de la fonction « barrière » de l’épithélium du lumen

33
Q

Quel est l’impact du premier microbiote du nouveau-né sur le système immunitaire?

A

Apprentissage pour tolérer les bactéries bénéfiques et ne pas déclencher une réaction immunitaire pour rien

34
Q

Quels sont les conséquences d’une perturbation du microbiote tôt dans la vie?

A

Perturbation apprentissage du système immunitaire. Donc, maladies du système immunitaire plus tard dans l’enfance (asthme…)

35
Q

Donner des exemples de mécanismes de reconnaissances spécifiques induits par le microbiote intestinal en lien avec le système immunitaire

A

1) Bifidobacterium : inhibe cellules B du système immunitaire avec exopolysaccharides
2) Clostridum : acides gras à chaîne courte qui stimulent les T régulateurs
3) B. fragilis : active les cellules dendritiques qui activent les T régulateurs
4) SFB : Bactéries filamenteuses mystérieuses. Stimule Th17 qui aide pour l’adhérence.

36
Q

Qu’est-ce qui caractérise les maladies inflammatoires gastro-intestinales?

A

Caractérisées par une réponse immunitaire incontrôlée au niveau du système gastro-intestinal, dirigée en partie contre les microorganismes qui y résident

37
Q

Quelles sont les 2 causes pouvant mener à des maladies inflammatoires gastro-intestinales?

A

Prédisposition génétique

Dysbiose du microbiote intestinal

38
Q

Quelles sont les 3 utilisations de la transplantation fécale?

A

Infections persistantes à Clostridium difficile
Maladies inflammatoires gastro-intestinales telles que colite ulcéreuse, maladie de Crohn (en essai clinique)
Syndrôme du colon irritable (recherche préliminaire)

39
Q

Vrai ou faux : la transplantation fécale est un processus simple

A

Faux

40
Q

Vrai ou faux : la transplantation fécale convient à tout le monde

A

Selon un épisode de South Park, non

41
Q

Quels serait l’impact d’un stress ou d’une maladie sur le microbiote et au niveau de la santé mentale? (3)

A

Cognitions, comportement, émotions altérées
Niveau altéré des cellules inflammatoires
Dysbiose intestinale

42
Q

Nommer des molécules neuromotrices qui pourraient être impliqués avec le microbiote et leur lien

A

1) Acides gras à chaine courte (SCFAs) : Affectent le comportement ou émotions.
2) Facteur neutrotrophique dérivé du cerveau (BDNF) : système digestif affecte la quantité de cette protéine dans le cerveau
3) GABA et sérotonine : neurotransmetteurs produits dans l’intestin
4) Cytokines (et système immunitaire en général) : lien moins important
5) Nerf vague : Péristaltisme, système immunitaire, faim/pu faim (satiété)…

43
Q

Quels seraient les rôles du microbiote sur le développement du cerveau?

A

Rôle dans la formation des circuits neuraux impliquées dans l’anxiété, le contrôle moteur et la mémoire.

44
Q

Quels seraient les impacts du microbiote sur la douleur?

A

Diminution de la sensation de douleur due au stress et au syndrome du colon irritable en présence de Lactobacilli et de Bificobacteria

45
Q

Quels seraient les liens possibles entre le désordre du système nerveux central et le microbiote?

A

Lien possible entre désordre du microbiote et anxiété, dépression ou trouble de l’humeur.

Note : pas de lien cause-effet, mais corrélation

46
Q

Quel serait l’impact du microbiote sur les troubles du spectre de l’autisme?

A

Flore intestinale altérée au niveau des bactéries produisant des acides gras à chaîne courte

47
Q

Comment pourrait-on manipuler le microbiote pour soigner des maladies?

A

1) Probiotiques : bactéries vivantes qui remplacent, MAIS ne colonisent pas! (pas évident).
2) Prébiotiques - substances nutritives qui servent pour le métabolisme des bonnes bactéries.
3) Antibiotiques-drogues qui agissent sur les pathogènes