Microbiote Flashcards
Vrai ou faux : E. coli est la bactérie présente en majorité dans le microbiote
Faux : moins de 1% des bactéries du microbiote sont des gammaprotéobactéries
Quelles sont les techniques disponibles pour étudier les microbiotes? (3)
Approche microbiologie environnementale (descriptive)
Expériences fonctionnelles (tester des hypothèses)
Essais cliniques
À quoi sert l’approche de microbiologie environnementale dans l’étude des microbiotes?
Qui est là? - Séquençage de masse de l’ADN encodant le 16S
Que font-ils? - Séquençage de masse de type métagénomique
Quelles sont les expériences fonctionnelles possibles dans l’étude des microbiotes?
Souris gnotobiotiques, transgéniques ou non
Culturomique (On essaie de cultiver les mo difficiles à cultiver dans les intestins)
Connaître quelques endroits dans le corps où un débalancement du microbiote peut mener à des problèmes
Intestins Peau Bouche Placenta Vagin
Vrai ou faux : le placenta contient un microbiote
Faux
Le microbiote d’un bébé naissant est-il plus près de celui de sa mère, de son père ou un mélange des deux?
De sa mère
Nommer quelques circonstances autour de la naissance d’un enfant qui vont affecter le microbiote de l’enfant
Voie vaginale ou césarienne, traitement antibiotique en bas âge, naissance prématurée …
Quel est le 2e contact avec un microbiote qu’un enfant va avoir après sa naissance?
Lait maternel
Discuter de l’évolution du microbiote d’un bébé, de la naissance jusqu’à 2-3 ans
Nouveaux nés : anaérobes facultatifs (vont tout consommer l’O2)
1 semaine à 3 mois : anaérobies strictes
1 an (changement de diète) : ressemble au microbiote adulte
2-3 ans : microbiote stable
À partir de quel âge (stade de développement de la vie) le microbiote est à son maximum de richesse? Le reste-il tout le reste de la vie?
Adolescence et oui
À partir de quel âge (stade de développement de la vie) le microbiote est à son maximum de stabilité? Le reste-il tout le reste de la vie?
Âge adulte - rediminue chez les personnes âgées
Vrai ou faux : chez les adultes, le microbiote est très varié en terme de phylum (espèces)
Vrai
Vrai ou faux : chez les adultes, le microbiote est très varié en terme de fonctions
Faux
Quel est le rôle du mucus intestinal par rapport au microbiote?
Permet de diminuer la quantité de microorganismes sur les cellules épithéliales.
Qu’est-ce qui influence l’identité des microorganismes près de la paroi épithéliale de l’intestin? Près de la lumière intestinale?
Paroi : génotype de l’hôte
Lumière : diète
Nommer quelques facteurs connus qui influencent le microbiote
Médication Paramètres sanguins Santé Diète Mesures (taille) et poids Style de vie
Vrai ou faux : la majorité des facteurs influençant le microbiotes sont connus
Faux
Quels types d’études ont été faites sur des humains par rapport au microbiote? Quel était le résultat?
Étude sur de grandes cohortes et sur des jumeaux : aucun résultat clair
Vrai ou faux : certains facteurs génétiques vont influencer le microbiote
Vrai : Certains cas : mutations qui vont avoir un impact sur le microbiote - inflammation
Que sont les MAC? (indice : microbiote)
Microbiota-accessible carbohydrates - fibres
Source d’énergie pour les microorganismes que nous ne sommes pas capables de digérer
Vrai ou faux : une diète riche en gras va provoquer un microbiote différent d’une richesse pauvre en gras
Vrai
Quel type de microorganisme est beaucoup plus présent dans une diète nord-américaine qu’une diète axée sur la chasse, la cueillette et l’agriculture (non-transformée)?
Bactéroïdes
Quel type de microorganisme est beaucoup moins présent dans une diète nord-américaine qu’une diète axée sur la chasse, la cueillette et l’agriculture (non-transformée)?
Prevotella
Comparer une diète urbaine américaine d’une diète basée sur l’agriculture
Urbain : riche en gras saturés et en protéines animales, plus d’additifs alimentaires et moins de fibres
Agriculture : moins de gras saturés et de protéines animales, plus de fibres
Décrire une expérience démontrant l’impact de la diète sur le microbiote
Souris gnotobiotiques avec le microbiote humain. 2 diètes :
- Que des polysaccharides de plantes
- Riche en gras et en sucre
Augmentation de la présence de certaines voies métaboliques
Augmentation du taux de gras (même après transplantation d’un microbiote américain à une souris qui se nourrit que de plantes!)
Nommer quelques voies métaboliques qui augmentent en quantité avec une diète riche en plantes
Synthèse de sucres complexes
Dégradation de sucres complexes
Synthèse d’acides aminés et autres facteurs de croissance accessoires
Qu’est-ce qui peut influencer le microbiote dans le style de vie? (4)
1) Eau propre : Diminution des transmissions fécales
2) Taille réduite des familles : Diminution des transmissions en bas âge
3) Augmentation de l’hygiène (bains, douches, savons antibactériens)) : Sélection favorisant un changement dans la composition
4) Exercice : Variation de la composition
Qu’arrive-t-il à la composition du microbiote lors de l’utilisation d’antibiotiques?
Moins de bactéroïdes
Plus de protéobactéries (qui arrivent en cas de problèmes)
Qu’arrive-t-il au niveau des molécules produites (4) lors de l’utilisation d’antibiotiques?
Augmentation d’acides biliaires primaire et ê d’acides biliaires secondaires
Augmentation de certains sucres-alcools (mannitol, sorbitol)
Diminution d’acides gras libres
Augmentation d’acides aminés
Vrai ou faux : le microbiote adulte peut facilement changer
Faux : après une perturbation, il revient souvent à l’état normal
Donner des caractéristiques des cellules épithéliales de l’intestin en présence de microbiote
Mucus plus épais
Villi plus courts et mieux irrigués
Cryptes plus profondes
Le système immunitaire associé est mature
Stimulation de la fonction « barrière » de l’épithélium du lumen
Quel est l’impact du premier microbiote du nouveau-né sur le système immunitaire?
Apprentissage pour tolérer les bactéries bénéfiques et ne pas déclencher une réaction immunitaire pour rien
Quels sont les conséquences d’une perturbation du microbiote tôt dans la vie?
Perturbation apprentissage du système immunitaire. Donc, maladies du système immunitaire plus tard dans l’enfance (asthme…)
Donner des exemples de mécanismes de reconnaissances spécifiques induits par le microbiote intestinal en lien avec le système immunitaire
1) Bifidobacterium : inhibe cellules B du système immunitaire avec exopolysaccharides
2) Clostridum : acides gras à chaîne courte qui stimulent les T régulateurs
3) B. fragilis : active les cellules dendritiques qui activent les T régulateurs
4) SFB : Bactéries filamenteuses mystérieuses. Stimule Th17 qui aide pour l’adhérence.
Qu’est-ce qui caractérise les maladies inflammatoires gastro-intestinales?
Caractérisées par une réponse immunitaire incontrôlée au niveau du système gastro-intestinal, dirigée en partie contre les microorganismes qui y résident
Quelles sont les 2 causes pouvant mener à des maladies inflammatoires gastro-intestinales?
Prédisposition génétique
Dysbiose du microbiote intestinal
Quelles sont les 3 utilisations de la transplantation fécale?
Infections persistantes à Clostridium difficile
Maladies inflammatoires gastro-intestinales telles que colite ulcéreuse, maladie de Crohn (en essai clinique)
Syndrôme du colon irritable (recherche préliminaire)
Vrai ou faux : la transplantation fécale est un processus simple
Faux
Vrai ou faux : la transplantation fécale convient à tout le monde
Selon un épisode de South Park, non
Quels serait l’impact d’un stress ou d’une maladie sur le microbiote et au niveau de la santé mentale? (3)
Cognitions, comportement, émotions altérées
Niveau altéré des cellules inflammatoires
Dysbiose intestinale
Nommer des molécules neuromotrices qui pourraient être impliqués avec le microbiote et leur lien
1) Acides gras à chaine courte (SCFAs) : Affectent le comportement ou émotions.
2) Facteur neutrotrophique dérivé du cerveau (BDNF) : système digestif affecte la quantité de cette protéine dans le cerveau
3) GABA et sérotonine : neurotransmetteurs produits dans l’intestin
4) Cytokines (et système immunitaire en général) : lien moins important
5) Nerf vague : Péristaltisme, système immunitaire, faim/pu faim (satiété)…
Quels seraient les rôles du microbiote sur le développement du cerveau?
Rôle dans la formation des circuits neuraux impliquées dans l’anxiété, le contrôle moteur et la mémoire.
Quels seraient les impacts du microbiote sur la douleur?
Diminution de la sensation de douleur due au stress et au syndrome du colon irritable en présence de Lactobacilli et de Bificobacteria
Quels seraient les liens possibles entre le désordre du système nerveux central et le microbiote?
Lien possible entre désordre du microbiote et anxiété, dépression ou trouble de l’humeur.
Note : pas de lien cause-effet, mais corrélation
Quel serait l’impact du microbiote sur les troubles du spectre de l’autisme?
Flore intestinale altérée au niveau des bactéries produisant des acides gras à chaîne courte
Comment pourrait-on manipuler le microbiote pour soigner des maladies?
1) Probiotiques : bactéries vivantes qui remplacent, MAIS ne colonisent pas! (pas évident).
2) Prébiotiques - substances nutritives qui servent pour le métabolisme des bonnes bactéries.
3) Antibiotiques-drogues qui agissent sur les pathogènes
