Instuderingsuppgifter Flashcards
Frågor från föreläsningar.
Hur är HIV-1/retroviruspartikeln uppbyggd?
Yttre lipidmembran
- lipidmembran + virala glykoproteiner
Matrix
- omsluter en kapsid med retrovirus-RNA (ss +RNA)
Kapsid
- 2 virala RNA-kopior + virusproteiner
- integras, reverst transkriptas

Vad är reverse transcriptase och hur fungerar det?
Det är ett enzym som syntetiserar komplementärt ssDNA från RNA. Det tar alltså retrovirus-RNA och gör provirus-DNA av det.
(+)ssRNA → (-)ssDNA → (+)ssDNA
(-)ssDNA + (+)ssDNA ⇒ dsDNA (provirus)
Vad är gag, pol och env?
Gener som finns hos alla retrovirus.
-
Gag kodar för strukturella proteiner
- MA: matrix
- CA: kapsid
- NC: nukleokapsid
-
Pol kodar för tre viktiga enzymer
- PRO: proteas
- RT: reverst transkriptas
- IN: integras
-
Env kodar för ytproteiner
- SU: surface envelope protein
- TM: transmembrane envelope protein

Varför enkoderar HIV-1 proteas?
Det behövs för att klyva Gag-molekylerna till individuella funktionella proteiner så det mogna viruset kan infektera andra celler.
PRO är enkoderat inuti Gag-Pol polyproteinet. Gag och Gag-Pol polyproteinerna klyvs via PRO som alltså klyver ut sig själv.
Proteasinhibitorer förhindrar att HIV-proteinerna processas.
Hur mognar HIV-1?
När viruset har knoppat av från cellen måste proteaset klyva Gag-prekursorn till mogna Gag-proteiner MA, CA, NC och p6. Denna klyvning är nödvändig för virusproteinets morfologiska rearrangemang.
Vilka receptorer (huvudreceptor + co-receptorer) använder HIV-1 för att infektera celler?
Receptor: CD4
Co-receptorer: CCR5/CXCR4
De binder till gp120 (ytprotein) och gp41 (transmembranprotein) på HIV-1, som genomgår konformationsändring och fuserar membranen.

Vad är CCR5 delta32?
En mutation i CCR5 som förhindrar ytuttryck av CCR5-receptorn (co-receptor för CD4), finns hos nordeuropeer och medför HIV-resistens.
Vad är skillnaden mellan HTLV-1 och HIV-1?
HTLV-1
- Human T-cell leukemia virus type 1
- Deltaretrovirus
- Orsakar tumörer
HIV-1
- Human immunodeficiency virus type 1
- Lentivirus
- Orsakar långsamt progredierande, nedbrytande sjukdomar
Hur framkallar HIV sjukdom?
Vilka kliniska faser ses vid HIV-1-infektioner?
Vilka är de vanligaste antiretrovirala behandlingsprinciperna (4 steg)?
-
Binding inhibitor
- gp120 och CCR5-antagonist
- Maraviroc binder till CCR5 co-receptorn på makrofager och förhindrar interaktion med HIV-1 ytproteinet.
-
Fusion inhibitor
- gp41 inhibitor
- Enfuvirtide binder till HIV-1 Env transmembranprotein så den inte kan fusera med cellmembran.
-
RT-inhibitorer
-
NRTIs - Nucleoside Reverse Transcriptase Inhibitors
- Blockerar RT genom att tävla med naturliga nukleotider om en plats i det nybildade HIV-DNA:t. Blockerar alltså kedjan så den inte blir färdig, RT kan inte fortsätta bygga.
- Exempel: AZT
-
NNRTIs - Non-Nucleoside Reverse Transcriptase Inhibitors
- Nonkompetitiva hämmare av RT-enzymet
-
NRTIs - Nucleoside Reverse Transcriptase Inhibitors
-
Proteas-inhibitorer
- Förhindrar processning av HIV-proteiner
-
Integras-inhibitorer
- Förhindrar att HIV-genom sätts in i humant DNA
Alltså: Man kan
- hindra viruset från att fästa
- hindra viruset från att transkriberas
- hindra viruset från att integrera sitt genom
- hindra viruset från att processa sina proteiner

Vilken fördel har bakterier av att vara små?
Hur påverkas genuttryck av att bakterier saknar cellkärna?
Hur ser principen för operon ut? Vilka fördelar ger det för genuttryck i bakterier?
Vilka karaktäristika används för att klassificera bakterier?
Vilka olika syrekrav kan bakterier ha?
Hur skiljer sig Gramnegativa och Grampositiva bakterier med avseende på cellvägg och membran?
Vilka är byggstenarna i peptidoglykan och hur byggs cellväggen upp så den blir stark?
Vad är LPS, vad har den för roll på bakterien resp. immunförsvaret?
Vad reagerar Toll-like receptors på?
Vad anvädner bakterier pili, fimbrier, flageller och sekretionssystem till?
Vad har bakteriekapseln för funktioner?
Hur bildas sporer, vad har de för roll för bakteriens överlevnad och vilken roll kan de spela kliniskt?
Hur definieras och används SIR-systemet?
Vilka tre saker bidrar främst till utveckling av antibiotikaresistens? Hur kan vi påverka dessa för att minska resistensutvecklingen?
Varför utvecklas så få nya antibiotika?
Vilka generella mekanismer har bakterier för att bli motståndskraftiga mot antibiotika? Ge exempel på antibiotikaklasser där resistensmekanismerna förekommer.
Vilken roll spelar sjukhusen i resistensutveckling resp. spridning av resistens?
Vilken roll spelar resande för resistensproblematiken?
Vilken roll spelar horisontell gentransfer i resistensproblematiken?
Hur kan vi stoppa smittspridning och minska spridning av resistenta stammar på sjukhus?
Vilka positiva/negativa korrelationer kan det finnas mellan virulens och smittspridning?
Hur påverkas i allmänhet virulensen i ett långvarigt värd-parasitförhållande?
Hur påverkar indirekt/direkt smittväg möjligheten för en patogen att öka sin virulens?
Vilka smittvägar finns mellan djur och människor?
Hur påverkas risken för zoonoser och uppkomst av nya sjukdoar av människans utnyttjande av miljö/urbanisering/djurhållning?
Vad innebär konceptet One Health?
Hur skiljer sig bakteriostatiska och bakteriocida antibiotika i verkan?
Hur påverkar Gramnegativa cellers yttre cellmembran vår möjlighet att behandla med antibiotika? Hur tar sig antibiotika in i den Gramnegativa cellen?
Hur definieras MIC?
Vad innebär synergi/antagonism vid antibiotikabehandling och hur kan det påverka behandlingen?
Vilka olika antibiotikaklasser har vi och vilka mål har olika antibiotikaklasser?
Hur påverkas normalfloran av antibiotikabehandling och vad ger det för risker?
Vilka skyddsbarriärer/system har vi vid epitellagret för att motverka bakterieinfektioner?
Hur skyddar sig bakterier mot sIgA?
Hur skyddar sig bakterier mot antimikrobiella peptider?
Hur kan bakterier variera sina ytstrukturer för att undvika upptäckt av immunförsvaret?
Vilka exempel finns på att bakterier maskerar sig?
Vilken roll har bakteriekapseln för att undvika upptäckt av immunförsvaret?
Hur kan bakterier generellt undvika komplementsystemet?
Vilka mekanismer har bakterier för att undvika att dödas av fagocyterande celler?
Hur bildas bakteriella biofilmer?
Vilka egenskaper förändras när bakterier växer som biofilm?
Varför är biofilmer så kliniskt viktiga?
Varför fungerar antibiotika generellt sämre på bakterier i biofilm? Vilka preparat går bäst att använda?
Hur bekämpar man bäst biofilmsbildning?
Vad är principen för kvorumreglering (quorum sensing)?
Vilken effekt har vaccinering för en person resp. en population? Hur skyddas de som inte kan vaccineras av att andra vaccineras?
Vad är principen bakom aktiv resp. passiv immunisering?
Vilka typer av bakteriella vacciner finns det?
Vad är ett toxoidvaccin?
Vad är ett konjugatvaccin? Varför ger konjugatvaccin en bättre effekt än ren polysackarid?
För vilka bakterier har vi vaccin mot kapseln?
Vilka risker/fördelar finns med att vaccinera med avdödade hela bakterier?
Vilka risker/fördelar finns med att vaccinera med attenuerade bakterier?
När vaccinerar man?
När ökar risken för infektion med normalflorans bakterier?
Vad innebär begreppet virulens? Vad är en virulensfaktor?
Vilka effekter ger vanligtvis symtomen vid infektion?
Varför skiljer sig symtombilden generellt mellan extracellulära och intracellulära infektioner?
Hur lyder Kochs postulat?
Vilka är de främsta virulensfaktorerna?
Var har olika typer av toxiner sina mål i vävnaden? Hur påverkar detta sjukdomssymtomen/förloppet?
Vad är ett endotoxin resp. exotoxin?
Hur fungerar superantigen?
Hur är ett AB-toxin uppbyggt och hur fungerar det generellt?
Vilka fördelar ger toxiner för bakterier?
Varför är det evolutionärt fördelaktigt för asexuellt reproducerande celler att kunna byta gener med varandra?
Vad är ett pan-genom? Vad innebär det potentiellt ur ett kliniskt perspektiv?
Vilka tre mekanismer för horisontell genöverföring finns hos bakterier? Hur går de till? Vad har de gemensamt?
Hur skiljer sig lytiska fager från lysogena fager?
Vilken positiv påverkan kan bakteriofager ha på bakterier?
Hur kan plasmider överföras mellan bakterier? Vilken är den vanligaste mekanismen?
Hur är en sammansatt transposon uppbyggd?
Varför samlas fördelaktiga gener tillsammans på mobila element?
Vilka delar av kroppen är främst koloniserade av bakterier?
Vilka positiva effekter har normalflorans bakterier på oss?
Vilka negativa effekter har normalflorans bakterier på oss?
Hur koloniseras vi med bakterier och hur varierar normalflorans sammansättning över livet?
Vilken påverkan har tarmens normalflora på vårt näringsupptag?
Vilka risker finns med rubbad normalflora i samband med t.ex. antibiotikabehandling?
Hur aktiveras interferoner i endosomer och cytoplasma vid virusinfektion?
Hur skyddar interferoner mot virusspridning?
Hur producerar RNA- och DNA-virus det dsRNA som aktiverar effektormolekylerna PKR och OAS?
Vilka är de viktigaste enzymerna som upprätthåller det antivirala tillståndet?
Hur kan virus blockera den antivirala aktiviteten av PKR? Ge exempel.
Hur kan virus inaktivera CTL-igenkänning av en virusinfekterad cell?
Hur kan virus inaktivera NK-cellslysering?
Hur fungerar neutraliserande antikroppar?
Hur kan virus undvika antikroppsförsvaret?
Vad är HAART?
Highly Active Anti-Retroviral Therapy
Standardbehandling med en kombination av minst tre olika läkemedel som påverkar HIV-1 replikation:
-
2 NRTIs +
- PI (proteasinhibitor) eller
- NNRTI (non-nucleoside RT-I) eller
- II (integrasinhibitor)

Hur undviker HIV-1 immunförsvaret?
-
Infekterar dendritiska celler, makrofager och CD4 TH-celler.
- förlust av aktivatorer och kontroller för immunsystemet
-
Antigenisk drift (mutation) av gp120
- undviker igenkänning av antikroppar
-
Kraftig glykosylering av gp120
- undviker igenkänning av antikroppar
-
Direkt cell-cell spridning och syncytieformation
- undviker igenkänning av antikroppar