Instabilité Du Génome Flashcards
Qu’est-ce qu’un locus génétique?
Localisation d’un gène sur un chromosome
Qu’est-ce qu’un allèle?
Un ou plusieurs variants d’un même gène
Qu’est-ce qu’un variant?
Il s’agit d’une séquence nucléotidique trouvée dans l’ADN génomique qui diffère de la séquence de référence
Qu’est-ce qu’un génotype?
Information génétiques complète d’un individu pour un gène donné
Qu’est-ce qu’un phénotype?
Caractéristiques observables chez un organisme. Il sont déterminés par le génotype d’un individu, par des facteurs environnementaux et par des mutations
Par quoi sont causées les mutations?
• Des erreurs lors de la réplication ou la réparation de l’ADN.
• Des dommages à l’ADN lors de la mitose ou la méïose.
• Des dommages à l’ADN causés par des agents mutagènes.
• Les mutations peuvent aussi être causées par des insertions ou délétions d’éléments d’ADN mobiles dans le génome.
Qu’est-ce qu’une mutation ponctuelle?
Implique la modification d’un seul nucléotide
Quelles sont les différentes conséquence d’une mutations sur la protéine?
• Affecte la fonction de la protéine.
• Affecte la localisation de la protéine.
• Affecte la stabilité (durée de vie) de la protéine.
• Affecte son interactome (interaction avec d’autres
protéines).
• Affecte la transcription de l’ADN en ARNm.
• Affecte la stabilité de l’ARNm.
• Affecte l’épissage de l’ARNm.
• Etc…
Qu’est-ce qu’une mutation silencieuse?
Mutation qui ne change pas la nature de l’acide aminé encodé, mais l’acide nucléique muter peut affecter : la transcription de l’ADN, l’épissage de l’ARNm, la traduction de l’ARNm et la liaison d’autre ARN à l’ARNm mutant
Qu’est-ce qu’une mutation faux-sens et quelles sont les conséquences?
Mutation qui change un acide aminé. Cela peut affecter la fonction d’une protéine, sa localisation ou encore la durée de vie de la protéine
Qu’est-ce que les mutations sensibles à la température?
Les mutations sensibles à la température sont des mutations faux-sens, dites conditionnelles, qui affectent le repliement des protéines à certaines températures.
Vrai ou faux : les mutations faux-sens sont toujours nocives?
Faux, peuvent être bénéfique (voir exemple malaria/anémie falciforme)
Qu’est-ce qu’une mutation non-sens et quelles sont les conséquences?
Les mutations non-sens induisent la formation d’un codon stop prématuré, menant à plusieurs conséquences:
• Donne une protéine tronquée : avec ou sans préservation partielle de sa fonction, avec un changement de fonction (peut agir comme dominant négatif ou avoir un gain-de-fonction par exemple)
• L’impact sur la fonction dépend de l’endroit où se trouve la mutation (i.e. au début, millieu, fin de la protéine)
Qu’est-ce que les mutations venant d’un changement du cadre de lecture?
Les mutations venant d’un changement du cadre de lecture sont des insertions et/ou délétions dans l’ADN d’une ou plusieurs bases.
Qu’elles sont les conséquences d’une mutation causée par un changement du cadre de lecture?
Un changement de fonctions et une troncation de la protéine
Quel est le mécanismes des mutations par insertion ou délétion?
Les triplets peuvent être vocalisés par une erreur de glissement de brin lors de la réplication de l’ADN.
Erreur sur le brin matrice = délétions
Erreur sur le brin fille = additions
Qu’est-ce qu’un polymorphisme?
Présence de différents allèles pour un même gène donné d’une population d’une même espèce
Quels sont les différents types de polymorphisme?
- SNP
- SNV
- SSLP
Qu’est-ce que les SNP?
Un seul changement de base entre les individus, présent dans la lignée germinale. Le variant doit être présent dans plus de 1% de la population
Qu’est-ce que les SNV?
Variation d’un seul nucléonique dans une population génomique, dans les cellules somatiques ou germinales
Qu’est-ce que les SSLP?
Une région d’ADN consistant en rÉpétitions en tandem et qui varie en longueur d’un individu à l’autre
Qu’on permis les polymorphisme?
• Établissement de la carte génomique humaine
• Vérification de la monoclonalité d’une maladie
• Génétique des populations
• Études de l’empreinte parentale
• Études du métabolisme des médicaments chez
différentes population d’individus
• Importants pour la pharmacothérapie personnalisée
D’où proviennent les aberrations chromosomiques?
D’un réarrangement dans la structure des chromosomes. Ils sont la conséquence d’erreurs de réplication de l’ADN pendant la mitose ou la méiose
Quelles sont les différents mécanismes possibles des aberrations chromosomiques?
Inversion, translocation et duplication
Qu’elle est la conséquence d’un chromosome de Philadelphie (réarrangement entre le chromosome 9 et 22)?
Création de la protéine de fusion BCR-ABL1, une tyrosine kinase constitutivement active
Qu’est-ce qu’un gène essentiel?
Gène indispensable pour que l’organisme puisse croître et se reproduire
Qu’est-ce qu’une mutation dominante négative?
Une mutation dont la protéine mutée aura un effet négatif sur la protéine sauvage produite dans la cellule.
Qu’est-ce qu’une mutation gain de fonction?
Une mutation dont la protéine aura une nouvelle fonction dans la cellule, qui est différente de la fonction habituelle de la protéine en question.
Qu’est-ce qu’une mutation germinale?
Les mutations germinales sont présentes dans les gamètes parentaux et seront transmises à la progéniture (l’organisme entier sera porteur de la mutation (i.e. cellules somatiques ET germinales), et 1⁄2 gamète de la progéniture affectée portera la mutation.
Qu’est-ce qu’une mutations somatiques?
Les mutations somatiques se produisent pendant l’embryogenèse et n’affecteront que les cellules somatiques, et les gamètes de la progéniture affectée ne portent pas la mutation.