Initiation à la génomique Flashcards
Qu’est ce que la génomique?
l’étude du génome entier
Quelle est la différence entre la génomique structurale et la génomique fonctionnelle?
structurale: caractérise la nature physique de génome entier
fonctionnelle: caractérise le mode d’expression des gènes
Quelle approche de séquençage proposée par Craig Venter permit le séquençage du génome humain en 2003?
shotgun
Quelles avancées technologiques ont consolidé l’approche shotgun?
nouveaux modèles de séquenceurs et la mise au point de nouveaux algorithmes bio-info et force de calcul.
Qu’est-ce qu’une banque d’ADN?
collection de fragment d’ADN provenant d’un individu, un échantillon ou d’une espèce.
Quelles sont les étapes requises pour l’approche de séquençage shotgun?
- ADN génomique
- fragmentation aléatoir en million de fragment
- création d’une banque
- séquencage des fragments
- assemblage par ordinateur et séquencage des trous
Qu’est-ce qu’un contig?
séquence de nucléotides qui représente une région continue de l’ADN
Comment détermine-t-on la séquence des « trous » entre les contigs laissés dans un séquençage génomique?
en assemblant des fragment qui se chevauche
Suite à l’obtention de la séquence brute du génome d’un organisme, comment procède-t-on pour identifier les gènes?
on fait des prédictions grace à la bio-info
Qu’est-ce que l’ADN complémentaire?
Comment l’obtient-on?
c’est une copie de ARNm et on l’obtient en alignant les séquences de l’ADNc avec le génome de référence.
La technologie des « puces à ADN » permet d’analyser quoi?
quantifier l’expression génétique pour une espèces ou un tissu.
