Import/Export des protéines Flashcards
Qu’est-ce qu’il arrive lorsque l’ARN message est incomplet ?
- L’ARN SsrA assure le sauvetage des ribosomes qui traduisent les ARNm brisé
- Lorsqu’un ribosome est bloqué à l’extrémité 3’ d’un ARNm, le complexe SsrA-EF-Tu-GTP se lie au site A du ribosome et participe à la réaction peptidyl-trasférase, comme tout autre ARNt
- Se résulte en une protéine marquée (plein d’acide aminés Alanine)
- Cette protéine est ensuite dégradée par des protéases cellulaires
(Voir diapo 2)
Qu’est-ce qu’il arrive lorsqu’un ARNm contient une mutation supprimant le codant stop ?
- Le ribosome est bloqué sur l’ARNm
- L’ARN messager et le peptide sont dégradés
(Voir diapo 3)
Quels sont les 2 types de protéines qui dégradent l’ARNm et le peptide lors d’une mutation supprimant le codon stop ? Expliquez.
- Protéase : Dégrade le peptide
2. Exonucléase : Dégrade l’ARNm
Où se dirigent les protéines dans la cellule ?
- Mitochondrie
- Vesicule
- Cytosol
- Membrane plasmique
- Complexe de Golgi
- Noyau
Vrai ou faux.
Dans une illustration fidèle à la réalité, la membrane du noyau n’est pas fusionnée à la membrane du réticulum endoplasmique.
Faux, les membranes sont fusionnées, voir diapo 4
Où se produit l’initiation de la traduction pour les ribosomes ?
Cytosol
Quels sont les types de ribosomes ?
- Ribosome libre
- Ceux sur le réticulum endoplasmique rugueux
Vrai ou faux.
Les ribosomes sont situés à deux endroits
Vrai
Quel est le rôle général des 2 types de ribosomes ?
Chacun est responsable de la synthèse de certaines protéines
Vers quels endroits se dirigent les protéines qui sont synthétisées sur les ribosome du réticulum endroplasmique rugueux ?
- Réticulum endoplasmique
- Golgi
- Membranes plasmiques
- Lysosomes
- Vésicules
Vers quels endroits se dirigent les protéines qui sont synthétisées sur les ribosomes cytosoliques ?
- Noyau
- Mitochondrie
- Chloroplaste
- Peroxisomes
Comment différencie-ton les 2 grandes familles de protéines ?
Par l’endroit où elles se dirigent
Vrai ou faux; Pour l’intégration à la membrane, il y a une séquence de amplification du transfert.
Faux, il a une séquence STOP transfert.
Comment est-il possible de reconnaître un peptide signal sur une séquence?
Par l’utilisation d’un logiciel appelé SignalP4.0.
Sur le logiciel SignalP4.0, comment on peut retrouver le site de clivage?
On le voit sur le graphique, à l’endroit ou la pente descend abruptement.
Pourquoi, quand on utilise le logiciel, la pente du graphique descend abruptement lorsqu’il a site de clivage?
Parce qu’il va reconnaître la séquence hydrophobe (le reste est non-hydrophobe).
À quel endroit se trouve la séquence signal?
Elle se trouve au début de la séquence (acides aminés hydrophobes).
Quels sont les 8 acides aminés hydrophobes?
- Alanine
- Valine
- Leucine
- Isoleucine
- Proline
- Méthionine
- Phénylalanine
- Tryptophane
Vrai ou faux; Le transport des protéines vers la mitochondrie est la plus complexe car il y a deux membranes à traverser.
Faux; elle est complexe, mais le transport dans les chloroplastes est plus complexe (allant jusqu’à trois membranes).
Comment les protéines font pour passer entre les deux couches mitochondriales?
À l’aide d’un transporteur membranaire (canal).
Sur quels ribosomes sont traduites les protéines mitochondriales?
Sur les ribosomes libres.
Combien a-t-il de membranes à traverser pour le transport mitochondrial?
2 membranes.
Pourquoi les protéines mitochondriales sont traduites sur les ribosomes libres?
Parce qu’elles ne passent pas par le réticulum endoplasmique.
Comment se nomme l’intérieur de la mitochondrie?
Le stroma.
Est-ce que toutes les protéines traversent les membranes mitochondriales?
La majorité oui, mais certaines restent prises entre les deux membranes.
Comment se nomme le signal mitochondrial?
La pré-séquence.
À quel endroit se trouve le signal mitochondrial et combien possèdent-ils d’acides aminés?
Il se trouve au début de la séquence et fait de 20 à 35 acides aminés.
Vrai ou Faux: Il n’y a qu’un seul type d’importine (protéine qui régule l’import vers le noyau).
Faux: Il y en a deux types
- Alpha : Trouve le NLS
- Bêta : Entrer à l’intérieur du noyau
Comment l’insertion de la protéine se fait au sein de la mitochondrie (3 étapes)?
1- Le peptide lie un récepteur transmembranaire TOM
2- Le peptide traverse la membrane interne avec TIM
3- La pré-séquence est clivé
Que veut dire TOM?
Transport outer mitochondria
Que veut dire TIM?
Transport inner mitochondria
Vrai ou faux; TOM est un récepteur transmembranaire.
Vrai.
Vrai ou faux; Le signal mitochondrial est reconnu par TIM.
Faux; Le signal est reconnu par TOM (avant l’entrée).
Combien le chloroplaste peut avoir de membrane(s)?
2 ou 3 membranes.
Sur quels ribosomes sont traduites les protéines du chloroplaste?
Sur les ribosomes libres.
Pourquoi les protéines du chloroplaste sont traduites sur les ribosomes libres?
Parce qu’elles ne passent pas par le réticulum endoplasmique.
Comment s’appelle le signal des protéines des chloroplastes et quelle est sa longueur?
Transit peptide et fait de 30 à 100 acides aminés.
Comment l’insertion de la protéine se fait au sein du chloroplaste (3 étapes)?
1- Le peptide lie un récepteur transmembranaire TOC
2- Le peptide traverse la membrane interne avec TIC
3- Le transit peptide est clivé
Quelle type de protéine doit absolument passer par le ribosome endoplasmique et pourquoi?
Les protéines qui auront des ponts disulfures puisque l’endroit le plus favorable à la formation de ces liaisons est l’intérieur du RE et elles seront ensuite dirigées vers la membrane plasmique ou les lysosomes via le transport vésiculaire (Golgi)
Que veut dire TIC?
Transport inner chloroplast
Vrai ou faux; TOM et TIM sont des récepteurs transmembranaires.
Faux, ce sont TOM et TOC.
Vrai ou faux; Le peptide signal des chloroplastes peut être suivi d’une séquence hydrophobe seulement si la protéine doit ensuite traverser la membrane du thylakoïde (partie interne du chloroplaste).
Vrai.
Quel est le mécanisme général d’import pour les protéines qui se dirigeront vers le réticulum endoplasmique, le Golgi, la membrane plasmique, les lysosomes ou les vésicules?
La protéine contient une séquence N-terminale (9-23 acides aminés) hydrophobe qui va l’ancrer dans les couches de phospholipides
Quel est le mécanisme général d’import pour les protéines qui se dirigeront vers le le noyau, la mitochondrie, le chloroplaste ou les peroxisomes?
La protéine contient un signal qui sera reconnu par un récepteur membranaire qui va procéder à son import
Comment s’effectue le transport de protéine vers le noyau?
Il s’agit d’un transport actif régulé par des protéines (Importines)
Vrai ou Faux: Il n’y a qu’un seul type d’importine (protéine qui régule l’import vers le noyau).
Faux: Il y en a deux types
- Alpha : Trouve le NLS
- Bêta : Entrer à l’intérieur du noyau
Les importines reconnaissent quel signal?
Le NLS (Nuclear Localization Signal)
Qu’est-ce que le NLS?
Un signal situé sur la protéine qui est une séquence linéaire ou patch (physiquement linéaire dans l’espace et non sur la chaîne du peptide) riche en Ariginine ou en Lysine (chargé +) qui fait entrer la protéine dans le noyau.
Que se produit-il lorsqu’il y a une mutation dans la séquence du NSL?
Il n’y a pas de transport au noyau
Comment s’effectue le transport de protéine hors du noyau?
Il s’agit d’un transport actif régulé par des protéines (Exportines)
Vrai ou Faux: Il n’y a qu’un seul type d’exportine (protéine qui régule l’export du noyau).
Vrai
Les exportines reconnaissent quel signal?
Le NES (Nuclear Export Signal)
Qu’est-ce que le NES?
Un signal situé sur la protéine qui est une séquence linéaire interrompue riche en acide aminés hydrophobes généralement la Leucine
Séquence exacte recherchée: LxxxLxxLxL
Où sont synthétisées la majorité des protéines qui vont dans le réticulum endoplasmique?
La majorité des protéines qui vont dans le RE sont synthétisées sur les ribosomes du réticulum endoplasmique rugeux
Pourquoi nomme-t-on le réticulum endoplasmique rugueux ainsi?
Puisqu’il y a des ribosomes sur la surface du RE qui le rende «rugueux»
Vrai ou Faux: Les ribosomes libres et ceux sur le RE sont identiques.
Vrai
Vrai ou Faux: C’est le ribosome endoplasmique qui attire la séquence du peptide vers lui pour faire la traduction.
Faux: Comme les ribosomes (libres ou sur le RE) sont identiques, c’est la séquence du peptide qui dirige le ribosome vers le RE
Quel séquence signal est présente chez les peptides qui vont dans le réticulum endoplasmique?
Une séquence continue appelée Peptide Signal qui fait ± 20 acides aminés qui sont généralement hydrophobes placé au début de la protéine
Vrai ou Faux: Le clivage du peptide signal se fait dans le RE à la fin de la traduction et de la maturation de la protéine.
Faux: Dès le début de la traduction, immédiatement après sont entrée dans le RE, ensuite la protéine peut maturer
Quel élément attire le ribosome au réticulum endoplasmique?
SRP (Signal Recognition Particle)
À quel endroit se fait le clivage du signal peptide?
Entre le dernier acide aminé hydrophobe et le premier acide aminé acide de la séquence.
