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Biologie moléculaire > Import/Export des protéines > Flashcards

Import/Export des protéines Flashcards

1
Q

Qu’est-ce qu’il arrive lorsque l’ARN message est incomplet ?

A
  • L’ARN SsrA assure le sauvetage des ribosomes qui traduisent les ARNm brisé
  • Lorsqu’un ribosome est bloqué à l’extrémité 3’ d’un ARNm, le complexe SsrA-EF-Tu-GTP se lie au site A du ribosome et participe à la réaction peptidyl-trasférase, comme tout autre ARNt
  • Se résulte en une protéine marquée (plein d’acide aminés Alanine)
  • Cette protéine est ensuite dégradée par des protéases cellulaires
    (Voir diapo 2)
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Q

Qu’est-ce qu’il arrive lorsqu’un ARNm contient une mutation supprimant le codant stop ?

A
  • Le ribosome est bloqué sur l’ARNm
  • L’ARN messager et le peptide sont dégradés
    (Voir diapo 3)
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3
Q

Quels sont les 2 types de protéines qui dégradent l’ARNm et le peptide lors d’une mutation supprimant le codon stop ? Expliquez.

A
  1. Protéase : Dégrade le peptide

2. Exonucléase : Dégrade l’ARNm

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4
Q

Où se dirigent les protéines dans la cellule ?

A
  • Mitochondrie
  • Vesicule
  • Cytosol
  • Membrane plasmique
  • Complexe de Golgi
  • Noyau
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Q

Vrai ou faux.
Dans une illustration fidèle à la réalité, la membrane du noyau n’est pas fusionnée à la membrane du réticulum endoplasmique.

A

Faux, les membranes sont fusionnées, voir diapo 4

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6
Q

Où se produit l’initiation de la traduction pour les ribosomes ?

A

Cytosol

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7
Q

Quels sont les types de ribosomes ?

A
  • Ribosome libre

- Ceux sur le réticulum endoplasmique rugueux

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8
Q

Vrai ou faux.

Les ribosomes sont situés à deux endroits

A

Vrai

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9
Q

Quel est le rôle général des 2 types de ribosomes ?

A

Chacun est responsable de la synthèse de certaines protéines

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10
Q

Vers quels endroits se dirigent les protéines qui sont synthétisées sur les ribosome du réticulum endroplasmique rugueux ?

A
  • Réticulum endoplasmique
  • Golgi
  • Membranes plasmiques
  • Lysosomes
  • Vésicules
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11
Q

Vers quels endroits se dirigent les protéines qui sont synthétisées sur les ribosomes cytosoliques ?

A
  • Noyau
  • Mitochondrie
  • Chloroplaste
  • Peroxisomes
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12
Q

Comment différencie-ton les 2 grandes familles de protéines ?

A

Par l’endroit où elles se dirigent

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13
Q

Vrai ou faux; Pour l’intégration à la membrane, il y a une séquence de amplification du transfert.

A

Faux, il a une séquence STOP transfert.

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14
Q

Comment est-il possible de reconnaître un peptide signal sur une séquence?

A

Par l’utilisation d’un logiciel appelé SignalP4.0.

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15
Q

Sur le logiciel SignalP4.0, comment on peut retrouver le site de clivage?

A

On le voit sur le graphique, à l’endroit ou la pente descend abruptement.

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16
Q

Pourquoi, quand on utilise le logiciel, la pente du graphique descend abruptement lorsqu’il a site de clivage?

A

Parce qu’il va reconnaître la séquence hydrophobe (le reste est non-hydrophobe).

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17
Q

À quel endroit se trouve la séquence signal?

A

Elle se trouve au début de la séquence (acides aminés hydrophobes).

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18
Q

Quels sont les 8 acides aminés hydrophobes?

A
  • Alanine
  • Valine
  • Leucine
  • Isoleucine
  • Proline
  • Méthionine
  • Phénylalanine
  • Tryptophane
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19
Q

Vrai ou faux; Le transport des protéines vers la mitochondrie est la plus complexe car il y a deux membranes à traverser.

A

Faux; elle est complexe, mais le transport dans les chloroplastes est plus complexe (allant jusqu’à trois membranes).

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20
Q

Comment les protéines font pour passer entre les deux couches mitochondriales?

A

À l’aide d’un transporteur membranaire (canal).

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21
Q

Sur quels ribosomes sont traduites les protéines mitochondriales?

A

Sur les ribosomes libres.

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22
Q

Combien a-t-il de membranes à traverser pour le transport mitochondrial?

A

2 membranes.

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23
Q

Pourquoi les protéines mitochondriales sont traduites sur les ribosomes libres?

A

Parce qu’elles ne passent pas par le réticulum endoplasmique.

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24
Q

Comment se nomme l’intérieur de la mitochondrie?

A

Le stroma.

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25
Q

Est-ce que toutes les protéines traversent les membranes mitochondriales?

A

La majorité oui, mais certaines restent prises entre les deux membranes.

26
Q

Comment se nomme le signal mitochondrial?

A

La pré-séquence.

27
Q

À quel endroit se trouve le signal mitochondrial et combien possèdent-ils d’acides aminés?

A

Il se trouve au début de la séquence et fait de 20 à 35 acides aminés.

28
Q

Vrai ou Faux: Il n’y a qu’un seul type d’importine (protéine qui régule l’import vers le noyau).

A

Faux: Il y en a deux types

  • Alpha : Trouve le NLS
  • Bêta : Entrer à l’intérieur du noyau
29
Q

Comment l’insertion de la protéine se fait au sein de la mitochondrie (3 étapes)?

A

1- Le peptide lie un récepteur transmembranaire TOM
2- Le peptide traverse la membrane interne avec TIM
3- La pré-séquence est clivé

30
Q

Que veut dire TOM?

A

Transport outer mitochondria

31
Q

Que veut dire TIM?

A

Transport inner mitochondria

32
Q

Vrai ou faux; TOM est un récepteur transmembranaire.

A

Vrai.

33
Q

Vrai ou faux; Le signal mitochondrial est reconnu par TIM.

A

Faux; Le signal est reconnu par TOM (avant l’entrée).

34
Q

Combien le chloroplaste peut avoir de membrane(s)?

A

2 ou 3 membranes.

35
Q

Sur quels ribosomes sont traduites les protéines du chloroplaste?

A

Sur les ribosomes libres.

36
Q

Pourquoi les protéines du chloroplaste sont traduites sur les ribosomes libres?

A

Parce qu’elles ne passent pas par le réticulum endoplasmique.

37
Q

Comment s’appelle le signal des protéines des chloroplastes et quelle est sa longueur?

A

Transit peptide et fait de 30 à 100 acides aminés.

38
Q

Comment l’insertion de la protéine se fait au sein du chloroplaste (3 étapes)?

A

1- Le peptide lie un récepteur transmembranaire TOC
2- Le peptide traverse la membrane interne avec TIC
3- Le transit peptide est clivé

39
Q

Quelle type de protéine doit absolument passer par le ribosome endoplasmique et pourquoi?

A

Les protéines qui auront des ponts disulfures puisque l’endroit le plus favorable à la formation de ces liaisons est l’intérieur du RE et elles seront ensuite dirigées vers la membrane plasmique ou les lysosomes via le transport vésiculaire (Golgi)

40
Q

Que veut dire TIC?

A

Transport inner chloroplast

41
Q

Vrai ou faux; TOM et TIM sont des récepteurs transmembranaires.

A

Faux, ce sont TOM et TOC.

42
Q

Vrai ou faux; Le peptide signal des chloroplastes peut être suivi d’une séquence hydrophobe seulement si la protéine doit ensuite traverser la membrane du thylakoïde (partie interne du chloroplaste).

A

Vrai.

43
Q

Quel est le mécanisme général d’import pour les protéines qui se dirigeront vers le réticulum endoplasmique, le Golgi, la membrane plasmique, les lysosomes ou les vésicules?

A

La protéine contient une séquence N-terminale (9-23 acides aminés) hydrophobe qui va l’ancrer dans les couches de phospholipides

44
Q

Quel est le mécanisme général d’import pour les protéines qui se dirigeront vers le le noyau, la mitochondrie, le chloroplaste ou les peroxisomes?

A

La protéine contient un signal qui sera reconnu par un récepteur membranaire qui va procéder à son import

45
Q

Comment s’effectue le transport de protéine vers le noyau?

A

Il s’agit d’un transport actif régulé par des protéines (Importines)

46
Q

Vrai ou Faux: Il n’y a qu’un seul type d’importine (protéine qui régule l’import vers le noyau).

A

Faux: Il y en a deux types

  • Alpha : Trouve le NLS
  • Bêta : Entrer à l’intérieur du noyau
47
Q

Les importines reconnaissent quel signal?

A

Le NLS (Nuclear Localization Signal)

48
Q

Qu’est-ce que le NLS?

A

Un signal situé sur la protéine qui est une séquence linéaire ou patch (physiquement linéaire dans l’espace et non sur la chaîne du peptide) riche en Ariginine ou en Lysine (chargé +) qui fait entrer la protéine dans le noyau.

49
Q

Que se produit-il lorsqu’il y a une mutation dans la séquence du NSL?

A

Il n’y a pas de transport au noyau

50
Q

Comment s’effectue le transport de protéine hors du noyau?

A

Il s’agit d’un transport actif régulé par des protéines (Exportines)

51
Q

Vrai ou Faux: Il n’y a qu’un seul type d’exportine (protéine qui régule l’export du noyau).

A

Vrai

52
Q

Les exportines reconnaissent quel signal?

A

Le NES (Nuclear Export Signal)

53
Q

Qu’est-ce que le NES?

A

Un signal situé sur la protéine qui est une séquence linéaire interrompue riche en acide aminés hydrophobes généralement la Leucine
Séquence exacte recherchée: LxxxLxxLxL

54
Q

Où sont synthétisées la majorité des protéines qui vont dans le réticulum endoplasmique?

A

La majorité des protéines qui vont dans le RE sont synthétisées sur les ribosomes du réticulum endoplasmique rugeux

55
Q

Pourquoi nomme-t-on le réticulum endoplasmique rugueux ainsi?

A

Puisqu’il y a des ribosomes sur la surface du RE qui le rende «rugueux»

56
Q

Vrai ou Faux: Les ribosomes libres et ceux sur le RE sont identiques.

A

Vrai

57
Q

Vrai ou Faux: C’est le ribosome endoplasmique qui attire la séquence du peptide vers lui pour faire la traduction.

A

Faux: Comme les ribosomes (libres ou sur le RE) sont identiques, c’est la séquence du peptide qui dirige le ribosome vers le RE

58
Q

Quel séquence signal est présente chez les peptides qui vont dans le réticulum endoplasmique?

A

Une séquence continue appelée Peptide Signal qui fait ± 20 acides aminés qui sont généralement hydrophobes placé au début de la protéine

59
Q

Vrai ou Faux: Le clivage du peptide signal se fait dans le RE à la fin de la traduction et de la maturation de la protéine.

A

Faux: Dès le début de la traduction, immédiatement après sont entrée dans le RE, ensuite la protéine peut maturer

60
Q

Quel élément attire le ribosome au réticulum endoplasmique?

A

SRP (Signal Recognition Particle)

61
Q

À quel endroit se fait le clivage du signal peptide?

A

Entre le dernier acide aminé hydrophobe et le premier acide aminé acide de la séquence.

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