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PTL604 > immunité des plantes > Flashcards

immunité des plantes Flashcards

1
Q

qu’Est ce qu’une relation compatible pour une plante

A

une relation ou le pathogène a un avantage sur la plante

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2
Q

dans quelle situtino y a t’il incompatibilité entre la plante et le pathogène

A

1: aucune pénétration du pathogène dans les cellules
2: début de pénétration mais arrêt immédiat
3: pénétration et infection de quelques cellules avant l’arret de l’infection

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3
Q

quelle est la différence entre la défense constitutive et les barrières physique chez la plnte

A

Les barrière sont par exemple le trichome/paroi cellulaire

La défense constitutive est formé de métabolites qu’on retrouve toujours dans la cellule comme les saponines

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4
Q

qu’est ce que la tomatine? que fait elle

A

une saponine présente chez la tomate qui agrège les stérols des pathogènes pour former des pores dans leur membrane

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5
Q

quels sont les deux segments des saponines?

A

la partie alcaloïde

La partie saccharidique

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6
Q

quel segment des saponines est attaqué par les enzymes pathogènes?

A

la partie saccaridique

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7
Q

comment les trichome empêchent ils les pathogènes d’Accéder a l’épiderme?

A

les trichomes sont très denses sur la paroi. ils forment donc une barrière physique qui empêche les pathogènes d’acceder à la paroi
Ils sécretent aussi des molécules collantes qui agrègent les pathogènes sur les trichomes

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8
Q

donner trois types de résistane basale de la plante

A

La reconaissance de PAMPs

L’extinction génique (ARNi) divisé en extinction génique post transcriptionnelle et transcriptionnelle

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9
Q

Qu’est ce que la résistance ETI. est elle spécifique ou générale?

A

effector-induced immunity

cette résistance est spécifique à une molécule ou un type de molécule

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10
Q

qu’est ce que la résistance PTI

A

l’immunité induite par les PAMPs

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11
Q

qu’est ce qu’un système pathogène de sécretion de type 3?

A

le pathogènes utilise une sorte de seringue pour injecter des effecteurs pour inhiber la réponse immunitaire de la plante

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12
Q

ou retrouve-t-on les protéines de résistance aux effecteurs dans la cellule végétale?

A

membrane
Cytoplasme
noyau

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13
Q

quelle est la fonction des protéines de résistance chez la plante?

A

reconnaitre la présence des effecteurs et mettre en place la réponse spécifique ETI dans la plante

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14
Q

qu’est ce que les DAMPs et les MAMPs

A

Damage associated molecular pattern
Microbe associated molecular pattern
Les MAMPs ne sont pas nécessairement associé à des pathogènes, ils incluent les microbes symbiotiques

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15
Q

donner un synonyme de protéine d’avirulence

A

un effecteur

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16
Q

corriger la phrase: un effecteur peut être de nature protéine/lipidique ou saccharidique

A

les PAMPs peuvent être de ces natures. Les effecteurs sont seulement protéiques

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17
Q

Dans quelles catégories peut on classer les PAMPs

Donner des exemples de chaque types

A

Les oligo/polysaccharides (Oligogalacturonides, laminarine, oligofucanes oligochitines)
Les peptides et glycoprotéines (flagelline/inf1/mégaspermine/cryptogéine/systémine/harpine)
lipides (sphingolipides/ergostéroles)

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18
Q

quels sont les domaines structuraux principaux des gènes de résistance

A 
Le domaine LRR (leucine rich repeats)
Le domaine sérine/thréonine kinase
Le domaine NBS (nucleotide binding site)
le domaine LZ (leucine zipper)
Le domaine TIR (toll interleukin receptor^)
le domaine CC (superhélice)
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19
Q

quelle est la fonction du domaine LRR ou leucine rich repeats

A

Spécificité d’intéraction éliciteur/récepteur

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20
Q

Quelle est la fonction du domaine Ser/thr kinase

A

Réaction de phosphorylation associée à la transduction du signal

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21
Q

Quelle est la fonction du domaine NBS

A

site de fixation et d’hydrolise des nucléotides triphosphates ATP et GTP

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22
Q

quelle est la fonction du domaine LZ

A

jouer un role dans l’homo ou hétérodimérisation de protéines

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23
Q

quelle est la fonction du domaine TIR

A

impliqué dans la signalisation cellulaire

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24
Q

Quelle est la fonction du domaine CC

A

important pour l’oligomérisation et la réponse de la protéine

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25
Q

à quelles deux familles peuvent appartenir les protéines de résistance
Quel est le modèle de leurs domaines structuraux

A

CNL CC-NBS-LRR

TNL Tir-NBS-LRR

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26
Q

Donner un exemple de gène de résistance et son effecteur/agent pathogène

A

Rx de la pomme de terre reconnait le gène d’avirulence CP du virus X de la pomme de terre
N du tabac reconnait la réplicase du virus de la mosaique du tabac

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27
Q

Le gène AvrXa21 est il un gène de résistance ou d’avirulence? pourquoi

A

Avr dans un gène peut dire que c’est un gène d’avirulence. Xa21 est le gène de résistance qui reconnait cet effecteur

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28
Q

à quoi sert la réaction hypersensible?

A

à confiner le pathogène à la zone d’infection

29
Q

Comment prouve-t-on une intéraction gène pour gène dans une intéraction par effecteur

A

on isole chaque gène du pathogène et on l’insère dans une autre souche recombinante jusqu’à ce qu’un gène particulier du pathogène dans la souche recombinante cause la réaction hypersensible
On peut aussi causer une mutation inactivante dans le gène de résistance et vérifier si le pathogène qui possède le gène d’avirulence cause toujours une réaction hypersensible

30
Q

quelles sont les trois étapes de l’intéraction éliciteur/gène de résistance

A

1: reconnaissance d’éliciteur
2: transduction des signaux +production de messagers chimiques secondaires
3: réponses de défense

31
Q

comment a-t-on découvert que le récepteur Fls2 avait besoin du co-récepteur BAK1 pour reconnaitre la flageline22

A

En faisant des mutants qui n’ont pas le gène fls2 ou bak1 et en comparant leur réponse à la flageline22 à celle d’une plante WT. Les deux mutants ne mettaient pas en marche de mécanismes de défense puisqu’ils ne reconaissent pas ce PAMPs sans les deux récepteurs

32
Q

quelle est la différence entre une intéraction directe et indirecte entre un gène de résistance et d’avirulence?

A

L’intéraction se fait entre les deux protéines dans l’intéraction directe
Dans l’intéraction indirecte, la protéine de résistance intéragit avec un métabolite produit par le gène d’Avirulence (ex: machinerie cell endommagée)

33
Q

quel type d’expérience peut on réaliser pour vérifier s’il y a une intéraction directe entre deux protéines?

A

par Y2H (yeast 2 hybrid)

34
Q

pourquoi l’expérience Y2H n’a pas de signification biologique toute seule, comment peut on prouver la signification biologique de nos résultats de Y2H

A

parceque les 2 protéines testées pourraient ne pas se rencontrer in vivo (ex: 1 protéine racinaire et l’autre dans les feuilles)
Pour compenser, on ajoute une expérience de co-immunoprécipitation

35
Q

expliquer comment se fait une expérience de co-immunoprécipitation dans une plante

A

on créer nos protéines fusion par génie génétique pour ajouter des tag puis on injecte ces protéines dans la plante.
Après quelques jours, on fait un extrait natif de la plante, on isole une des protéines avec son tag et on fait migrer l’extrait isolé ainsi que la portion non-retenue dans un western dénaturé pour vérifier si les deux protéines se trouvent dans la portion retenue par l’anticorps anti-tag

36
Q

quel résultat permet de confirmer qu’une expérience coIP a un résultat positif

A

L’anticorps qui vise le tag de la première protéine a été capable de ramasser les deux protéines lors de l’extraction du

37
Q

Comment le ETI peut se mettre en place par une intéraction indirecte

A

Le pathogène va cliver/phosphoryler des protéines reliée à la réponse PTI. ces bouts de molécules clivées ou phosphorylés vont être détectées par les protéines de résistances ETI qui vont mettre en place une réponse secondaire plus importante

38
Q

quels sont les messagers secondaires qui sont activés lors dela réponse ETI

A

peroxyde d’hydrogène, Acide jasmonique, acide salycilique

39
Q

quelles molécules font partie des ROS

A

anion superoxyde O2-
Radical hydroxyl OH-
Peroxyde d’hydrogène H2O2

40
Q

qu’est ce que le burst oxydatif?

A

c’est la forte augmentation de la concentration de peroxyde d’hydrogène en réponse à un éliciteur

41
Q

comment détecte-t-on le burst oxydatif?

A

par luminol
DAB (diaminobenzydine)
Fluorescence avec microscopie confocal

42
Q

quelle réction permet de détecter le péroxyde avec le luminol?

A

le luminol en présence de péroxyde et d’une enzyme: la péroxydase du horseradish. produit de la lumière. on peut donc quantifier la quantité d’H2O2 selon la quantité de lumière produit par la réaction

43
Q

comment fonctionne la détection de péroxyde par le DAB

A

on récolte un disque de feuille traité avec une PAMPs, on ajoute le DAB puis on décolore le chlorophylle de la feuille avec de l’éthanol. Le peroxyde de la feuille devrait oxyder le DAB en présence des péroxydases endogène à la plante et donner une couleur marron/rouge foncée.
Cette couleur est correlé avec la quantité de H2O2 dans la feuille.

44
Q

Comment fonctionne la détection de péroxyde par microscopie confocale?

A

on ajoute des substrats qui produisent de la lumière en présence de H2O2 et le microscope permet de visualiser la lumière produite dans la plante.

45
Q

quelle enzyme(s) sont utilisées pour synthétiser les espèces réactives d’oxygène chez la plante?

A

majorité des cas: NADPH oxydase

Cas particulier: l’oxalate oxydase

46
Q

pourquoi le millieu extracellulaire subit il une alkalinisation lorsqu’un PAMP est détecté par des récepteurs transmembranaires d’une plante?

A

la détection de PAMPs entraine l’ouverture de canaux ioniques, ce qui fait entrer des ions H+ à l’intérieur de la cellule. Cette entrée d’ions déplete la réserve d’ions H+ dans le milieu extracellulaire, donc hausse du pH

47
Q

l’entrée d’ions H+ dans la cellule permet le cotransport d’ion calcium. à quoi servent ceux-ci dans la réponse PTI?

A

ils vont permettre l’Activation de MAPkinases qui vont activer la NADPH oxydase

48
Q

où se trouve le H2O2 produit par la NADPH oxydase?

A

la majorité est produite de facon extra-cellulaire mais une certaine quantité de H2O2 peut traverser la membrane plasmique et finir dans le cytoplasme pour agir comme messager secondaire

49
Q

quelles enzymes permettent de protéger la plante du H2O2 qu’elle produit?

A

la catalse
La glutathione peroxydase
La glutathion sulfotransférase

50
Q

quelle est la différence entre:
Des gènes de protection
Gène de résistance
Gène de défence

A

Gène de résistance permet l’activation de ETI/PTI
Gène de défense codent pour les protéines qui forment la réponse ETI
Gène de protection permet de protéger la plante contre la toxicité de la réponse ETI

51
Q

qu’est ce que l’acide salicylique et l’acétosyringone ont en commun?

A

ce sont des dérivés de la phénylalanine, ils font partie de la voie métabolique des phénylpropanoides (voie des phénols)

52
Q

quel gène permet aux pathogènes de résister à l’Action de l’acide salicylique? quel est l’effet de ce gène

A

Le NAHG, il dégrade l’acide salicylique

53
Q

comment se fait la signalisation cellulaire qui permet la synthèse de l’acide jasmonique?

A

une phospholipase membranaire reconnait une molécule et clive des phospholipides.
Cela relâche un acide gras membranaire, l’Acide linolénique dans le cytoplasme qui va entrainer la production d’acide jasmonique

54
Q

qu’est ce que la réaction hypersensible?

A

une mort cellulaire programmée qui sert à confiner la zone d’infection et empêcher que l’infection puisse se répandre dans la plante

55
Q

quels sont les mécanismes mis en marche lors de la réaction hypersensibles HR

A

il y a renforcement de la paroi cellulaire gràce à certaines métabolites:
Lignine
Protéines de paroi riche en glycine/proline/hydroxyproline
Subérine
Callose et formation des papilles

56
Q

à quoi sert le bleu d’aniline

A

à visualiser la callose sous UV

57
Q

à quoi sert la callose?

A

la callose bloque les plasmodesmes et empêche les pathogènes de traverser les cellules au travers de ceux-ci

58
Q

qu’est ce que les PR protéines? (pathogenesis related proteins)

A

des protéines de résistance qui confèrent une protection en dégradant certaines structures de pathogènes comme la chitine par la chitinase (PR3) ou glucane par la glucanse (PR2)

59
Q

à quoi sert la PR6, ou inhibiteurs d’endo-polygalaturonases (PGIP)

A

elle reconnait la dégradation de la paroi en oligopectine et inhibe la dégradation des oligopectine en monomères
Il y a donc accumulation d’oligopectine, ce qui va amplifier la réponse immunitaire et empêcher le pathogène de dégrader des oligopectine en monomères assimilables par la polygalacturonase

60
Q

qu’est ce que les phytoalexines? quelle est leur effet

A

des molécules antimicrobiennes d’origine végétales.

Ils ont un effet antibiotique ou inhibent la germination de pathogènes

61
Q

quelle expérience peut on faire pour vérifier l’installation d’une résistance systémique acquise?

A

on présente la flagelline ou de l’eau sur une feuille pour induire une réponse de résistance.
on infecte par la suite une feuille éloignée avec une bactérie chez la plante controle et celle exposée à la flagelline.
On compare le titre bactérien dans la feuille éloignée dans la plante test et controle

62
Q

L’acide azélaique (AzA) et le Glycérol 3 phosphate sont des acteurs importants de la résistance systémique acquise. Comment peuvent ils induire une résistance systémique dans la plante?

A

en se déplaceant par les plasmodesmes

63
Q

Comment est produit et utilisé l’acide pipecolique?

A

la lysine sert de précurseur et est modifié par les gènes ALD1, SARD4 et FMO1 pour synthétiser l’acide pipecolique, qui joue un dans la résistance systémique acquise.

64
Q

comment l’acide jasmonique permet-il l’expression de gènes de défense?

A

l’acide jasmonique active une protéine de type ubiquitine ligase qui va ubiquitinyler les répresseurs de gènes de défense dépendants de l’AJ. les represseurs sont donc dégradés ce qui permet la transcription des gènes de défense

65
Q

Comment est ce que l’acide salicylique mène à la transcription de gènes de résistance?

A

l’acide salicylique permet un changement rédox à la protéine NPR1, ce qui va permettre à celle-ci d’activer un facteur de transcription; TGA2 qui se lie au promoteur de gènes de résistances comme PR1

66
Q

Comment l’acide jasmonique inhibe-t-il la voie de l’acide salicylique et vice-versa?

A

l’ubiquitine ligase ctivée par l’acide jasmonique peut aussi marquer NPR1 dans la voie de l’Acide salicylique, ce qui inhibe la liaison de celui-ci à son facteur de transcription
L’acide salicylique active un facteur qui se lie à l’ADN sur la région promotrice de l’acide jasmonique et empêche son expression

67
Q

l’acide jasmonique et salicylique peuvent avoir un effet antagoniste ou synergétique. Dans quel contexte ces effets arrivent-ils?

A

synergie lorsque les deux métabolites sont à faibles concentration
Antagonisme lorsqu’un métabolite a une haute concentration

68
Q

quels métabolites sont utilisés pour induire la résistance systémique acquise?

A 
acide salicylique (AS)
Acide pipécolique 
Acide azélaique (AzA)
Glycérole 3 phophase (G3P)
Especes réactives de l'oxygène (ROS)

PTL604 (5 decks)

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