ARN d'interférence Flashcards
Quel est l’acteur qui initie la réponse par ARNi
l’ARN double brin
Tout les virus passent par une étape d’ARN double brin. expliquer le chemin pour se rendre à l’ARNdb chez les virus à ARN et ADN
les virus à ARN utilisent leur répliquase qui s’appelle l’ARN répliquase dépendante de l’ARN. Celle-ci réplique le brin d’ARN simple et fait un deuxième brin
Les virus à ADN utilisent une répliquase de la plante qui va répliquer l’ADN du virus en ARNdb
quelles protéines font partie de la voie des ARNi et leur fonction
Dicer qui clive l’ARNdb
Argonaute qui permet de charger l’ARNi dans RISC et dégrader l’ARN homologue au petit ARNi
un seul brin de l’ARNdb est utilisé comme ARNi, à quoi sert le deuxième brin?
il est utilisé comme amorce pour amplifier la séquence d’ARNdb et permettre le recrutement de plusieurs complexes RISC avec le même ARN simple brin
quelle est la fonction des RDRP
générer des ARN doubles brins
comment le complexe RISC peut il servir à méthyler l’ADN de la plante?
la plante se sert de ses enzymes RDRP pour synthétiser des ARNdb à partir de son propre ADN, cet ARNdb est découpé par des protéines Dicer et chargé dans des RISC spécifiques qui ne servent pas à dégrader l’ARNm homologue à son ARNi mais plutot de diriger la machinerie cellulaire à méthyler un gène particulier
Comment les miARN sont ils formée à partir du génome?
la séquence dans le génome a un motif
Région Foward - région tige-boucle - Région Complémentaire inverse à la région foward
Cela créer un ARN qui se repli sur lui même sous forme de tige-boucle.
Cet ARN ressemble à de l’ARNdb pour la cellule et est clivé par DCL pour former un miARN mature qui va être incorporé à RISC
à quoi sert la phytoène désaturase?
nécessaire à la synthèse de la chlorophyle
Comment a-t-on utilisé A.tumefasciens pour démontrer l’action de l’ARNi dans le silencing de la phytoène désaturase?
on a inséré dans la partie infectieuse d’A.tumefasciens le génome du virus X de la pomme de terre avec le gène de la phytoène désaturase (PDS). ce génome contient l’information pour produire l’ARNdb, il va donc se répliquer avec le gène PDS et produire un ARNdb qui est reconnu par DLC
La portion de l’ARNdb qui correspond à PDS est ensuite chargé dans RISC et la synthèse de la chlorophylle était inhibé dans ces plantes
l’ARNi est il une méthode knock down ou knock-out?
knock down
comment fait on un knock-out dans une plante?
en faisant une plante transgénique, un processus plus long que l’utilisation de l’ARNi
à quoi correspond l’acronyme VIGS?
virus-induced gene silencing
quel est l’avantage d’utiliser VIGS au lieu de créer des plantes transgéniques?
l’inhibition de gènes par VIGS prend 2-3 semaines plutot que des années pour créer une plante transgénique
Les VIGS permettent aussi de cibler plusieurs gènes en même temps
Les VIGS sont plus cheap à produire
est ce que les mécanismes d’ARNi servent seulement à se défendre contre les pathogènes?
non, la plante utilise des miARN pour réguler l’Expression de gènes et on peut utiliser ces mécanismes pour induire des knock down dans les plantes
quel controle négatif devrait on utiliser pour faire une expérience de knock-down par ARNi avec A.tumefasciens
Un vecteur ou il n’y a pas d’ADNc dans le multiple cloning site. Cela permet de vérifier que ce n’est pas l’infection par A.tumefasciens qui cause le phénotype mais bien l’ADNc qui se trouve dans le vecteur
