Champignons phytopathogènes/facteurs de virulence Flashcards
Comment s’appel l’appareil végétatif des champignons phytopathogènes?
le thalle
Quels structures du thalle sont nécessaire pour la virulence du champignon?
L’appressorium et les sucoirs
Dans quelles conditions peut on observer des stromes?
dans des conditions stressantes pour le champignon. les stromes sont des structures de conservation.
comment l’appressorium entre-t-il dans la cellule végétale?
il peut pénetrer au travers des ouvertures naturelles comme les stomates
Certains champignons possèdent des enzymes pour dégrader la paroi de la cellule et entrer ainsi.
qu’est ce que les sclérotes?
des organes de conservation.
Certaines plantes ont des métabolites secondaires comme les saponines qui agissent sur les stérols des champignons.
Quel est le mécanisme d’action de ces protéines sur les champignons
ils vont causer l’agrégation des stérols de la membrane du champignon, cela créer des pores dans la membrane et éventuellement l’éclatement de celle-ci
Dans le contexte de la coévolution, comment les champignons peuvent ils se protéger des saponines?
En synthétisant des enzymes qui neutralisent l’activité antimicrobienne des saponines
OU en réduisant la quantité de stérols dans sa membrane
quelle est la différence entre les parois des vrais champignons et des oomycètes?
la paroi des champoignons est composé de chitine,
Les zygomycètes sont composé de chitosan
Les oomycètes sont composés de cellulose
les champignons n’utilisent pas le même type de reproduction selon leur besoin,
Quel type de reproduction favorise la conservation ou la dispersion du champignon
Sexuée favorise la conservation
Asexuée favorise la dispersion
qu’Est ce qu’un zygospore
le produit d’un zygomycete, il résulte de l’union de deux gamétange identiques
qu’est ce qu’un ascospore
Un endospore haploide produit pas un ascomycète. Ils viennent généralement en paquets de 8 dans un asque
quelle forme le périthèce, quel est son role dans un champignon
il a une forme de coupe. Il porte les ascospores au sommet de la coupe
Quelle for prend l’apothécie et quel est son role dans le champignon
Un espèce de ballon qui contient les ascospores à l’intérieur de lui-même
on sont formé les basidiospores? Chez quel type d’organisme fongiforme retrouve-t-on ces spores
dans les basides, une structure qui se retrouve chez les basidiomycètes
quels sont les trois types de classifications qu’on utilise chez les champignons
Phénétique/phénotypique
Cladistique/phylogénétique
Fonctionnelle
Quel est le piège derrière la classification phénétique
Il peut regrouper des espèces qui font du mimétisme ou qui ont eu des évolutions convergeantes même si elles ne sont pas apparentées
sur quoi est basée la classification phylogénétique? Comment peut on comparer deux espèce par classification phylogénétique
sur l’ADN ribosomal du pathogène. On utilise des amorces universelles pour séquencer les différentes sous-unités ribosomales du pathogène
quels sont les critères utilisé pour la classification morphologique
Morphologie du thalle
Type/morphologie de l’organe de reproduction sexuée
Type/morphologie de l’organe de reproduction asexuée
qu’est ce qu’un patovar?
une variété d’un pathogène spécifique à une espèce végétale seulement
quel champignon cause la pourriture grise?
Botrytis Cinerea
Si la feuille d’une plante infectée sèche et répand des spores dans un champ, risque-t-il d’y avoir de la transmission horizontale ou verticale
Horizontale
Quelles étapes permettent d’identifier par la classification phylogénétique un microorganisme?
Observation du type de pathogène Purification du pathogène Extraction de l'ADN du pathogène PCR avec les amorces universelles Analyse de l'ADN ribosomal construction d'un arbre phylogénétique ou comparaison avec un arbre préexistant
quels moyens utilisent les pathogènes pour attaquer les plantes?
1: régulation des hormones de croissances de la plante
2: les forces mécaniques
3: enzymes de dégradation de la paroi
4: toxines
5: utilisation des ouvertures naturelles de la plante
quelle méthode d’attaque est utilisée par agrobacterium tumefaciens
Elle régule les hormones de croissance de la plante pour créer des tumeurs.
quel est l’usage de l’acétosyringone
La plante produit ce métabolite après une blessure.
Comment A. tumefasciens se sert elle de l’acétosyringone
Ce métabolite permet de phosphoryler la protéine virale A par autophosphorylation.
Vir A phorphoryle ensuite Vir G. Une fois Vir G phosphorylé, cette protéine vient agir comme facteur de transcription pour les protéines Vir restantes.
à quoi sert Vir D dans A.tumefasciens?
à retirer l’ADN de transfert du plasmide puis à le transférer vers la cellule végétale avec un pont crée par les protéines Vir B
quelles sont les étapes de la mise en place de la galle du collet
1: blessure de la plante, synthèse d’acétosyringone
2: autophosphorylation de Vir A
3: phosphorylation de Vir G
4: activation par Vir G des autres protéines Vir
5: Vir D excise l’ADN de transfert
6: Vir E transporte l’ADN de transfert
7: Vir E traverse le pont entre la bactérie et la plante avec le pont Vir B
8: intégration de l’ADN dans le génome de la plante avec des récepteurs dans le cytoplasme
quel type d’acteur essentiel des pathogènes les plantes peuvent ils être capable de repérer et induire une immunité?
La flagelline des bactéries
quels sont les types de promoteurs que l’on retrouve chez les plantes
1: promoteur constitutif
2: promoteur inductible
3: promoteur tissus spécifique
comment se nomme un tissu végétal non différencié?
un Cal
pourquoi faut il faire plusieurs lignée transgénique lorsqu’on utilise A tumefasciens pour créer des plantes transgénique
puisque l’ADN de transfert s’insère à un endroit aléatoire dans la plante. On peut donc maximiser les chances que l’ADN s’insère à un bon endroit en faisant plusieurs lignées
à quel type de promoteur appartiennent les promoteurs 35S et ESTR
35s est un promoteur constitutif
ESTR est un promoteur inductible qui requiert l’estradiol, un métabolite absent chez les végétaux
quel avantage confère l’expression transitoire?
la plante transformée de cette manière n’a pas besoin d’être dédifférencié.
pourquoi l’expression transitoire n’est elle pas stable?
parce que la plante transformée n’est pas dédifférencié. Seules certaines cellules sont transformées et elles ne transmettent pas ces gènes à leur déscendance
comment fonctionne la co-localisation de certaines protéines dans des cellules
la protéines est fusionnée par génie génétique avec une protéine fluorescente. On peut ensuite observer au microscope confocal les couleurs respectives des protéines fluorescentes
Dans une expression transitoire, a-t-on besoin d’un gène antibiotique dans l’ADN de transfert?
non, puisqu’on transforme une plante adulte et on a pas à isoler les cellules transformées
pourquoi doit on retirer le codon STOP sur le tag qu’on ajoute à la séquence de la protéine dans l’ADN de transfert
puisqu’un Codon stop après le tag s’ajouterais au codon stop de la protéine d’interêt et ces deux-ci ne seraient pas liés.
Comment peut on vérifier si deux protéines dans la plante intéragissent avec des vecteurs d’ADN de transfert et deux tag protéiques différents
Combiner les deux protéines d’interêt dans des vecteurs différents avec un tag différent.
L’extrait de l plante peut ensuite être élué dans des billes couvertes d’anticorps contre un des deux tag.
Si les protéines intéragissent, un western blot sur les protéines retenu par les AC devrait présenter deux bandes
en quoi consiste le mécanisme de virulence physique retrouvé chez le spore de M.grisea
La spore envoit du glycérol dans l’apresaureum jusqu’à ce qu’il y ait une hypertonicité, cela créer un appel d’eau qui gonfle l’apresaureum gràce à la synthèse de mélanine qui empêche l’eau de sortir de cette structure.
Le gonflement de l’apresaureum permet de percer la surface de la feuille
Comment se sert-on de l’ADN ribosomal des pathogènes?
ils peuvent être séquencés gràce à des amorces de PCR universelle puis leur séquencage permet de classifier les pathogènes puisqu’ils ont tous des séquences ribosomales différentes
Comment fonctionne un promoteur inductible?
Le promoteur exprime le gène lorsqu’il est mis en contact avec un métabolite spécifique
On va généralement prendre des inducteurs qui ne sont pas natifs chez les plantes comme métabolites inducteurs
qu’est ce qu’on peut conclure si plusieurs lignées de plantes transformées réagissent de la même facon à l’insertion d’un gène?
(indice: penser à la location de l’insertion)
On peut conclure que c’est le gène ajouté qui provoque ce changement plutot que le lieu d’insertion modifié qui cause une mutation dans un gène natif
à quoi sert un test de complémentation
à prouver l’utilité d’une certaine protéines dans un mécanisme comme la virulence d’un pathogène
Il sert aussi à vérifier que les mutants qu’on teste ne manquent que le gène d’interêt
en quoi consiste un test de complémentarité
Prendre un mutant qui n’a pas le gène en question qui réintroduire ce gène par génie génétique pour voir si le mutant va retourner à sa forme sauvage
Quels sont les principales armes chimiques des phytopathogènes?
Les enzymes de dégradation de la paroi
quels enzymes sont utilisés par les pathogènes pour dégrader la paroi de la plante?
la cutinase
Les enzymes pectinolytiques
les cellulases
quelle réaction est catalysée par les polygalacturonases (pectinases)
Ils clivent la les liaisons alpha-1,4 entres acides galacturoniques et relache une molécule d’eau
à quoi servent les monomères libérés par les polygalacturonases
Ils servent de source de carbone au pathogène
Quelle classe de pathogène bénéfit à causer des nécroses à l’aide d’attaques enzymatiques comme les polygalacturonase et les pectines lyase.
expliquer aussi pourquoi
Les pathogènes nécrotrophes. Ils peuvent utiliser ces nécroses pour se nourrir.
Comment inactive-t-on un gène viral dans un pathogène par génie génétique?
on ajoute une cassette de résistance à l’antibiotique dans le milieu du gène viral du pathogène et on sélectionne les souches transformées qui survivent à l’antibiotique.
Comment la polygalacturonase entraine-t-elle une réponse immunitaire de la plante?
La plante peut reconnaitre les oligomères qui sont produits lors de la dégradation de la pectine avec des récepteurs membranaires.
Comment la plante se défend-t-elle contre un pathogène qui utilise la polygalacturonase pour se nourrir sur la pectine de la plante?
La plante détecte les oligomères et produit une enzyme qui inhibe la dégradation des oligomère en monomères. il y a donc une amplification de la réponse immunitaire et asphyxie du pathogène
à quoi sert particulièrement les cellulases chez des pathogènes?
à infecter les arbres, qui sont très riches en cellulase
Quelle est la terminologie utilisée pour toxines utilisées par des pathogènes?
En quoi consistes ces molécules
Phytotoxines: molécules toxiques pour la plantes produites pas les MO
Vivotoxines: molécules spécéfiquement produites par un parasite au contact d’une plante infectée
Quel pathogène utilise la coronatine?
Pseudomonas syringae, plus spécifiquement le pathovar tomato
quelle toxine est produite par Streptomyces scabei. (indice: c’est un projet de recherche de la doyenne de science)
La thaxtomine
La coronatine mimique la structure moléculaire des jasmonates, en quoi est ce que cela confère un avantage à P syringae
Les jasmonates défend la plante contre les nécrotrophes et une grande quantité de jasmonates inhibe la voie de l’acide salicylique.
Puisque le pathogène est biotrophe/hémibiotrophe, l’inhibition de la voie de l’Acide salicylique lui est bénéfique
quelles sont les ouvertures naturelles de la plantes qui peuvent être exploitées par les pathogènes?
les stomates
Les lenticelles
les hydathodes
Comment on réuni les conditions du triangle de la maladie dans un laboratoire pour infecter une plante synthétiquement?
Le choix du pathogène/plante est fait adéquate et un papier mouillé est placé dans le pétri pour causer une hausse de l’humidité à la température d’incubation
à quoi sert le gène FOW
il permet au pathogène de se rendre dans les vaisseaux conducteurs et provoquer une infection systémique
Les pathotoxines sont elles des molécules produites par des pathogènes?
oui. elle peut aussi être produite in vitro
Quelle symptomes peuvent causer une pathotoxine?
Les pathotoxines induisent tout les symptomes d’une maladie chez la plante sensible
