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PTL604 > Champignons phytopathogènes/facteurs de virulence > Flashcards

Champignons phytopathogènes/facteurs de virulence Flashcards

1
Q

Comment s’appel l’appareil végétatif des champignons phytopathogènes?

A

le thalle

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Q

Quels structures du thalle sont nécessaire pour la virulence du champignon?

A

L’appressorium et les sucoirs

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3
Q

Dans quelles conditions peut on observer des stromes?

A

dans des conditions stressantes pour le champignon. les stromes sont des structures de conservation.

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4
Q

comment l’appressorium entre-t-il dans la cellule végétale?

A

il peut pénetrer au travers des ouvertures naturelles comme les stomates
Certains champignons possèdent des enzymes pour dégrader la paroi de la cellule et entrer ainsi.

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5
Q

qu’est ce que les sclérotes?

A

des organes de conservation.

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6
Q

Certaines plantes ont des métabolites secondaires comme les saponines qui agissent sur les stérols des champignons.
Quel est le mécanisme d’action de ces protéines sur les champignons

A

ils vont causer l’agrégation des stérols de la membrane du champignon, cela créer des pores dans la membrane et éventuellement l’éclatement de celle-ci

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7
Q

Dans le contexte de la coévolution, comment les champignons peuvent ils se protéger des saponines?

A

En synthétisant des enzymes qui neutralisent l’activité antimicrobienne des saponines
OU en réduisant la quantité de stérols dans sa membrane

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8
Q

quelle est la différence entre les parois des vrais champignons et des oomycètes?

A

la paroi des champoignons est composé de chitine,
Les zygomycètes sont composé de chitosan
Les oomycètes sont composés de cellulose

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9
Q

les champignons n’utilisent pas le même type de reproduction selon leur besoin,
Quel type de reproduction favorise la conservation ou la dispersion du champignon

A

Sexuée favorise la conservation

Asexuée favorise la dispersion

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10
Q

qu’Est ce qu’un zygospore

A

le produit d’un zygomycete, il résulte de l’union de deux gamétange identiques

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11
Q

qu’est ce qu’un ascospore

A

Un endospore haploide produit pas un ascomycète. Ils viennent généralement en paquets de 8 dans un asque

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12
Q

quelle forme le périthèce, quel est son role dans un champignon

A

il a une forme de coupe. Il porte les ascospores au sommet de la coupe

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13
Q

Quelle for prend l’apothécie et quel est son role dans le champignon

A

Un espèce de ballon qui contient les ascospores à l’intérieur de lui-même

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14
Q

on sont formé les basidiospores? Chez quel type d’organisme fongiforme retrouve-t-on ces spores

A

dans les basides, une structure qui se retrouve chez les basidiomycètes

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15
Q

quels sont les trois types de classifications qu’on utilise chez les champignons

A

Phénétique/phénotypique
Cladistique/phylogénétique
Fonctionnelle

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16
Q

Quel est le piège derrière la classification phénétique

A

Il peut regrouper des espèces qui font du mimétisme ou qui ont eu des évolutions convergeantes même si elles ne sont pas apparentées

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17
Q

sur quoi est basée la classification phylogénétique? Comment peut on comparer deux espèce par classification phylogénétique

A

sur l’ADN ribosomal du pathogène. On utilise des amorces universelles pour séquencer les différentes sous-unités ribosomales du pathogène

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18
Q

quels sont les critères utilisé pour la classification morphologique

A

Morphologie du thalle
Type/morphologie de l’organe de reproduction sexuée
Type/morphologie de l’organe de reproduction asexuée

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19
Q

qu’est ce qu’un patovar?

A

une variété d’un pathogène spécifique à une espèce végétale seulement

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20
Q

quel champignon cause la pourriture grise?

A

Botrytis Cinerea

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21
Q

Si la feuille d’une plante infectée sèche et répand des spores dans un champ, risque-t-il d’y avoir de la transmission horizontale ou verticale

A

Horizontale

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22
Q

Quelles étapes permettent d’identifier par la classification phylogénétique un microorganisme?

A 
Observation du type de pathogène
Purification du pathogène
Extraction de l'ADN du pathogène
PCR avec les amorces universelles
Analyse de l'ADN ribosomal
construction d'un arbre phylogénétique ou comparaison avec un arbre préexistant
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23
Q

quels moyens utilisent les pathogènes pour attaquer les plantes?

A

1: régulation des hormones de croissances de la plante
2: les forces mécaniques
3: enzymes de dégradation de la paroi
4: toxines
5: utilisation des ouvertures naturelles de la plante

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24
Q

quelle méthode d’attaque est utilisée par agrobacterium tumefaciens

A

Elle régule les hormones de croissance de la plante pour créer des tumeurs.

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25
Q

quel est l’usage de l’acétosyringone

A

La plante produit ce métabolite après une blessure.

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26
Q

Comment A. tumefasciens se sert elle de l’acétosyringone

A

Ce métabolite permet de phosphoryler la protéine virale A par autophosphorylation.
Vir A phorphoryle ensuite Vir G. Une fois Vir G phosphorylé, cette protéine vient agir comme facteur de transcription pour les protéines Vir restantes.

27
Q

à quoi sert Vir D dans A.tumefasciens?

A

à retirer l’ADN de transfert du plasmide puis à le transférer vers la cellule végétale avec un pont crée par les protéines Vir B

28
Q

quelles sont les étapes de la mise en place de la galle du collet

A

1: blessure de la plante, synthèse d’acétosyringone
2: autophosphorylation de Vir A
3: phosphorylation de Vir G
4: activation par Vir G des autres protéines Vir
5: Vir D excise l’ADN de transfert
6: Vir E transporte l’ADN de transfert
7: Vir E traverse le pont entre la bactérie et la plante avec le pont Vir B
8: intégration de l’ADN dans le génome de la plante avec des récepteurs dans le cytoplasme

29
Q

quel type d’acteur essentiel des pathogènes les plantes peuvent ils être capable de repérer et induire une immunité?

A

La flagelline des bactéries

30
Q

quels sont les types de promoteurs que l’on retrouve chez les plantes

A

1: promoteur constitutif
2: promoteur inductible
3: promoteur tissus spécifique

31
Q

comment se nomme un tissu végétal non différencié?

A

un Cal

32
Q

pourquoi faut il faire plusieurs lignée transgénique lorsqu’on utilise A tumefasciens pour créer des plantes transgénique

A

puisque l’ADN de transfert s’insère à un endroit aléatoire dans la plante. On peut donc maximiser les chances que l’ADN s’insère à un bon endroit en faisant plusieurs lignées

33
Q

à quel type de promoteur appartiennent les promoteurs 35S et ESTR

A

35s est un promoteur constitutif

ESTR est un promoteur inductible qui requiert l’estradiol, un métabolite absent chez les végétaux

34
Q

quel avantage confère l’expression transitoire?

A

la plante transformée de cette manière n’a pas besoin d’être dédifférencié.

35
Q

pourquoi l’expression transitoire n’est elle pas stable?

A

parce que la plante transformée n’est pas dédifférencié. Seules certaines cellules sont transformées et elles ne transmettent pas ces gènes à leur déscendance

36
Q

comment fonctionne la co-localisation de certaines protéines dans des cellules

A

la protéines est fusionnée par génie génétique avec une protéine fluorescente. On peut ensuite observer au microscope confocal les couleurs respectives des protéines fluorescentes

37
Q

Dans une expression transitoire, a-t-on besoin d’un gène antibiotique dans l’ADN de transfert?

A

non, puisqu’on transforme une plante adulte et on a pas à isoler les cellules transformées

38
Q

pourquoi doit on retirer le codon STOP sur le tag qu’on ajoute à la séquence de la protéine dans l’ADN de transfert

A

puisqu’un Codon stop après le tag s’ajouterais au codon stop de la protéine d’interêt et ces deux-ci ne seraient pas liés.

39
Q

Comment peut on vérifier si deux protéines dans la plante intéragissent avec des vecteurs d’ADN de transfert et deux tag protéiques différents

A

Combiner les deux protéines d’interêt dans des vecteurs différents avec un tag différent.
L’extrait de l plante peut ensuite être élué dans des billes couvertes d’anticorps contre un des deux tag.
Si les protéines intéragissent, un western blot sur les protéines retenu par les AC devrait présenter deux bandes

40
Q

en quoi consiste le mécanisme de virulence physique retrouvé chez le spore de M.grisea

A

La spore envoit du glycérol dans l’apresaureum jusqu’à ce qu’il y ait une hypertonicité, cela créer un appel d’eau qui gonfle l’apresaureum gràce à la synthèse de mélanine qui empêche l’eau de sortir de cette structure.
Le gonflement de l’apresaureum permet de percer la surface de la feuille

41
Q

Comment se sert-on de l’ADN ribosomal des pathogènes?

A

ils peuvent être séquencés gràce à des amorces de PCR universelle puis leur séquencage permet de classifier les pathogènes puisqu’ils ont tous des séquences ribosomales différentes

42
Q

Comment fonctionne un promoteur inductible?

A

Le promoteur exprime le gène lorsqu’il est mis en contact avec un métabolite spécifique
On va généralement prendre des inducteurs qui ne sont pas natifs chez les plantes comme métabolites inducteurs

43
Q

qu’est ce qu’on peut conclure si plusieurs lignées de plantes transformées réagissent de la même facon à l’insertion d’un gène?
(indice: penser à la location de l’insertion)

A

On peut conclure que c’est le gène ajouté qui provoque ce changement plutot que le lieu d’insertion modifié qui cause une mutation dans un gène natif

44
Q

à quoi sert un test de complémentation

A

à prouver l’utilité d’une certaine protéines dans un mécanisme comme la virulence d’un pathogène
Il sert aussi à vérifier que les mutants qu’on teste ne manquent que le gène d’interêt

45
Q

en quoi consiste un test de complémentarité

A

Prendre un mutant qui n’a pas le gène en question qui réintroduire ce gène par génie génétique pour voir si le mutant va retourner à sa forme sauvage

46
Q

Quels sont les principales armes chimiques des phytopathogènes?

A

Les enzymes de dégradation de la paroi

47
Q

quels enzymes sont utilisés par les pathogènes pour dégrader la paroi de la plante?

A

la cutinase
Les enzymes pectinolytiques
les cellulases

48
Q

quelle réaction est catalysée par les polygalacturonases (pectinases)

A

Ils clivent la les liaisons alpha-1,4 entres acides galacturoniques et relache une molécule d’eau

49
Q

à quoi servent les monomères libérés par les polygalacturonases

A

Ils servent de source de carbone au pathogène

50
Q

Quelle classe de pathogène bénéfit à causer des nécroses à l’aide d’attaques enzymatiques comme les polygalacturonase et les pectines lyase.
expliquer aussi pourquoi

A

Les pathogènes nécrotrophes. Ils peuvent utiliser ces nécroses pour se nourrir.

51
Q

Comment inactive-t-on un gène viral dans un pathogène par génie génétique?

A

on ajoute une cassette de résistance à l’antibiotique dans le milieu du gène viral du pathogène et on sélectionne les souches transformées qui survivent à l’antibiotique.

52
Q

Comment la polygalacturonase entraine-t-elle une réponse immunitaire de la plante?

A

La plante peut reconnaitre les oligomères qui sont produits lors de la dégradation de la pectine avec des récepteurs membranaires.

53
Q

Comment la plante se défend-t-elle contre un pathogène qui utilise la polygalacturonase pour se nourrir sur la pectine de la plante?

A

La plante détecte les oligomères et produit une enzyme qui inhibe la dégradation des oligomère en monomères. il y a donc une amplification de la réponse immunitaire et asphyxie du pathogène

54
Q

à quoi sert particulièrement les cellulases chez des pathogènes?

A

à infecter les arbres, qui sont très riches en cellulase

55
Q

Quelle est la terminologie utilisée pour toxines utilisées par des pathogènes?
En quoi consistes ces molécules

A

Phytotoxines: molécules toxiques pour la plantes produites pas les MO
Vivotoxines: molécules spécéfiquement produites par un parasite au contact d’une plante infectée

56
Q

Quel pathogène utilise la coronatine?

A

Pseudomonas syringae, plus spécifiquement le pathovar tomato

57
Q

quelle toxine est produite par Streptomyces scabei. (indice: c’est un projet de recherche de la doyenne de science)

A

La thaxtomine

58
Q

La coronatine mimique la structure moléculaire des jasmonates, en quoi est ce que cela confère un avantage à P syringae

A

Les jasmonates défend la plante contre les nécrotrophes et une grande quantité de jasmonates inhibe la voie de l’acide salicylique.
Puisque le pathogène est biotrophe/hémibiotrophe, l’inhibition de la voie de l’Acide salicylique lui est bénéfique

59
Q

quelles sont les ouvertures naturelles de la plantes qui peuvent être exploitées par les pathogènes?

A

les stomates
Les lenticelles
les hydathodes

60
Q

Comment on réuni les conditions du triangle de la maladie dans un laboratoire pour infecter une plante synthétiquement?

A

Le choix du pathogène/plante est fait adéquate et un papier mouillé est placé dans le pétri pour causer une hausse de l’humidité à la température d’incubation

61
Q

à quoi sert le gène FOW

A

il permet au pathogène de se rendre dans les vaisseaux conducteurs et provoquer une infection systémique

62
Q

Les pathotoxines sont elles des molécules produites par des pathogènes?

A

oui. elle peut aussi être produite in vitro

63
Q

Quelle symptomes peuvent causer une pathotoxine?

A

Les pathotoxines induisent tout les symptomes d’une maladie chez la plante sensible

PTL604 (5 decks)

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