HC 7 - NGS Flashcards

1
Q

Waar wordt NGS voor gebruikt?

A

Detectie van
- Kleine mutaties
- Deleties en amplificaties
- Translocaties en fusiegenen

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Wat is de toepassing van NGS?

A
  • DD
  • Therapiekeuze
  • Oncogenetica
  • Weefselidentificatie
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Wat is complementariteit?

A
  • A-T is makkelijker te sequencen ivm 2 waterstofbruggen
  • C-G is lastiger te sequencen ivm 3 waterstofbruggen
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Hoe gaat een PCR reactie?

A
  • Een dubbelstreng DNA molecuul wordt uit elkaar gehaald
  • Er worden primers aan het mengsel toegevoegd die complementair zijn dan aan een stukje van het template DNA
  • Toevoegen basen
  • Toevoegen DNA-polymerase
  • 2x nieuwe DNA strengen
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Hoe gaat sequencen? Het herkennen van een bepaald stuk DNA?

A

Door inbouwen van dideoxynucleotiden (hier stopt de replicatie), deze wordt herkend door een elektroforese

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Wat is de coverage?

A

Hoe diep het DNA gesequenced is, hoe hoger hoe vaker

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly