HC 7 - NGS Flashcards
1
Q
Waar wordt NGS voor gebruikt?
A
Detectie van
- Kleine mutaties
- Deleties en amplificaties
- Translocaties en fusiegenen
2
Q
Wat is de toepassing van NGS?
A
- DD
- Therapiekeuze
- Oncogenetica
- Weefselidentificatie
3
Q
Wat is complementariteit?
A
- A-T is makkelijker te sequencen ivm 2 waterstofbruggen
- C-G is lastiger te sequencen ivm 3 waterstofbruggen
4
Q
Hoe gaat een PCR reactie?
A
- Een dubbelstreng DNA molecuul wordt uit elkaar gehaald
- Er worden primers aan het mengsel toegevoegd die complementair zijn dan aan een stukje van het template DNA
- Toevoegen basen
- Toevoegen DNA-polymerase
- 2x nieuwe DNA strengen
5
Q
Hoe gaat sequencen? Het herkennen van een bepaald stuk DNA?
A
Door inbouwen van dideoxynucleotiden (hier stopt de replicatie), deze wordt herkend door een elektroforese
6
Q
Wat is de coverage?
A
Hoe diep het DNA gesequenced is, hoe hoger hoe vaker