HARPER: Sección II Enzimas, cinética, mecanismo, regulación y bioinformática Flashcards

1
Q

La respiración rápida y superficial puede llevar a hiperventilación, un estado en el cual se exhala dióxido de carbono desde los pulmones con una rapidez que supera la producción de dicho compuesto por los tejidos. Explique cómo la hiperventilación puede llevar a un incremento del pH de la sangre.

A

La anhidrasa carbónica cataliza la hidratación de dióxido de carbono para formar ácido carbónico. A su vez, una porción de este ácido débil se disocia para producir bicarbonato y un protón. A medida que la concentración de dióxido de carbono disminuye, el ácido carbónico es desintegrado y dióxido de carbono y agua. Para compensar la pérdida de ácido carbónico, el bicarbonato y los protones se recombinan para restablecer el equilibrio, lo cual lleva a una disminución neta del [H1] y un aumento del pH.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Un ingeniero de proteína desea alterar el sitio activo de la quimotripsina de modo que divida enlaces peptídicos para el lado C terminal de residuos de aspartilo y glutamilo. El ingeniero de proteína tendrá más probabilidades de tener éxito si reemplaza el aminoácido hidrofóbico en la parte inferior de la bolsa del sitio activo con:
A. Fenilalanina.
B. Treonina.
C. Glutamina.
D. Lisina.
E. Prolina.

A

D. Lisina.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

De las afirmaciones que siguen, seleccione la que es INCORRECTA:
A. Muchas proteínas mitocondriales son modificadas de manera covalente por la acetilación de los grupos e-amino de residuos de lisina.
B. La acetilación de proteína es un ejemplo de una modificación covalente que puede “revertirse” en condiciones fisiológicas.
C. La concentración aumentada de acetil-coa tiende a favorecer la acetilación de proteína.
D. La acetilación aumenta la masa estérica de las cadenas laterales de aminoácido que están sujetas a esta modificación.
E. La cadena lateral de un residuo de lisilo acetilado es una base más fuerte que la de un residuo de lisilo no modificado.

A

E. La cadena lateral de un residuo de lisilo acetilado es una base más fuerte que la de un residuo de lisilo no modificado.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

De las afirmaciones que siguen, seleccione la que es INCORRECTA:
A. La catálisis acidobásica es una característica prominente del mecanismo catalítico de la proteasa de HIV.
B. El modelo de cerradura y llave de Fischer explica el papel de la estabilización del estado de transición en la catálisis enzimática.
C. La hidrólisis de enlaces peptídicos por serina proteasas comprende la formación transitoria de una enzima modificada.
D. Muchas enzimas emplean iones metálicos como grupos prostéticos o cofactores.
E. En general, las enzimas se unen a análogos de estado de transición más estrechamente que a análogos de sustrato.

A

B. El modelo de cerradura y llave de Fischer explica el papel de la estabilización del estado de transición en la catálisis enzimática.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

De las afirmaciones que siguen, seleccione la que es INCORRECTA:
A. Para calcular la Keq, la constante de equilibrio para una reacción, se divide la tasa inicial de reacción hacia adelante (tasa1) por la velocidad inicial de la reacción reversa (tasa21).
B. La presencia de una enzima no tiene efectos sobre la Keq.
C. Para una reacción conducida a temperatura constante, la fracción de las moléculas de reactante potenciales que poseen suficiente energía cinética para exceder la energía de activación de la reacción es una constante.
D. Las enzimas y otros catalíticos disminuyen la energía de activación de reacciones.
E. El signo algebraico de DG, el cambio de energía libre de Gibbs para una reacción, indica la dirección en la cual procederá una reacción.

A

A. Para calcular la Keq, la constante de equilibrio para una reacción, se divide la tasa inicial de reacción hacia adelante (tasa1) por la velocidad inicial de la reacción reversa (tasa21).

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

De las afirmaciones que siguen, seleccione la que es INCORRECTA:
A. Como se usa en bioquímica, la concentración de estado estándar para productos y reactantes que no son protones es 1 molar.
B. DG es una función del logaritmo de Keq.
C. Como se usa en cinética de reacción, el término “espontaneidad” se refiere al hecho de si la reacción como está escrita es favorecida para que proceda de izquierda a derecha.
D. DGo denota un cambio de la energía libre que acompaña la transición desde el estado estándar hacia el equilibrio.
E. En el momento en que se alcanza equilibrio, las tasas de la reacción hacia adelante y reversa disminuyen a cero.

A

E. En el momento en que se alcanza equilibrio, las tasas de la reacción hacia adelante y reversa disminuyen a cero.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

De las afirmaciones que siguen, seleccione la que es INCORRECTA:
A. Las enzimas disminuyen la energía de activación para una reacción.
B. Otro medio mediante el cual las enzimas disminuyen la energía de activación es al desestabilizar intermediarios de estado de transición.
C. Los residuos histidilo de sitio activo a menudo ayudan a la catálisis al actuar como donadores de protones o como aceptores de los mismos.
D. Algunas enzimas emplean catálisis covalente para proporcionar una vía de reacción única.
**E. **La presencia de una enzima no tiene efectos sobre el DGo.

A

B. Otro medio mediante el cual las enzimas disminuyen la energía de activación es al desestabilizar intermediarios de estado de transición.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

De las afirmaciones que siguen, seleccione la que es INCORRECTA:
A. Para casi todas las enzimas, la relación de [S] y la tasa de reacción inicial, vi, da una curva hiperbólica.
B.Cuando [S] es mucho más bajo que Km, el término Km1 [S] en la ecuación de Michaelis-Menten se aproxima mucho a Km. En estas condiciones, la tasa de catálisis es una función lineal de [S].
C. Las concentraciones molares de sustrato y productos son iguales cuando la tasa de una reacción catalizada por enzima alcanza la mitad de su máximo potencial (Vmáx/2).
D. Se dice que una enzima ha quedado saturada con sustrato cuando el aumento sucesivo de [S] no produce un incremento importante de vi.
E. Cuando se hacen mediciones de tasa de estado estable, la concentración de sustratos debe exceder mucho la del catalítico enzimático.

A

C. Las concentraciones molares de sustrato y productos son iguales cuando la tasa de una reacción catalizada por enzima alcanza la mitad de su máximo potencial (Vmáx/2).

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

De las afirmaciones que siguen, seleccione la que es INCORRECTA:
A. Ciertas enzimas monoméricas muestran cinética de tasa inicial sigmoidea.
B. La ecuación de Hill se usa para realizar análisis cuantitativo de conducta cooperativa de enzimas o proteínas de transporte, como hemoglobina o calmodulina.
C. Para una enzima que muestra unión cooperativa de sustrato, se dice que un valor de n (el coeficiente de Hill) de más de la unidad muestra cooperatividad positiva.
D. Se dice que una enzima que cataliza una reacción entre dos o más sustratos opera mediante un mecanismo secuencial si los sustratos deben unirse en un orden fijo.
E. Los grupos prostéticos permiten a las enzimas añadir capacidades más allá de las proporcionadas por cadenas laterales de aminoácidos.

A

A. Ciertas enzimas monoméricas muestran cinética de tasa inicial sigmoidea.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

De las afirmaciones que siguen, seleccione la que es INCORRECTA:
A. IC50 es un término operacional sencillo para expresar la potencia de un inhibidor.
B. En los gráficos de Lineweaver-Burk y de Dixon se emplean versiones reordenadas de la ecuación de Michaelis-Menten para generar representaciones lineales de conducta e inhibición cinéticas.
C. Un gráfico de 1/vi en contraposición con 1/[S] puede usarse para evaluar el tipo de un inhibidor y la magnitud del mismo.
D. Los inhibidores simples no competitivos disminuyen la Kmaparente para un sustrato.
E. Los inhibidores no competitivos típicamente tienen poca o ninguna semejanza estructural con el o los sustratos de una reacción catalizada por enzima.

A

D. Los inhibidores simples no competitivos disminuyen la Kmaparente para un sustrato.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

De las afirmaciones que siguen, seleccione la que es INCORRECTA:
A. Para una enzima dada, las concentraciones intracelulares de sus sustratos tienden a estar cerca de sus valores de Km.
B. El secuestro de ciertas vías dentro de orgánulos intracelulares facilita la tarea de la regulación metabólica.
C. El paso más temprano en una vía bioquímica en la cual puede ejercerse con eficiencia control regulador es el primer paso comprometido.
D. Regulación por retroacción se refiere al control alostérico de un paso temprano en una vía bioquímica por el o los productos finales de esa vía.
E. El control metabólico es más eficaz cuando uno de los pasos rápidos en una vía es establecido como objetivo para regulación.

A

E. El control metabólico es más eficaz cuando uno de los pasos rápidos en una vía es establecido como objetivo para regulación.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

De las afirmaciones que siguen, seleccione la que es INCORRECTA:
A. El efecto Bohr se refiere a la liberación de protones que ocurre cuando el oxígeno se une a la desoxihemoglobina.
B. Poco después del nacimiento de un lactante humano, hay inducción rápida de la síntesis de la cadena a hasta que comprende 50% del tetrámero de hemoglobina.
C. La cadena b de hemoglobina fetal está presente durante toda la gestación.
D. El término talasemia se refiere a cualquier defecto genético que da por resultado falta total o parcial de las cadenas a o bde la hemoglobina.
E. La conformación tensa de la hemoglobina es estabilizada por varios puentes de sal que se forman entre las subunidades.

A

B. Poco después del nacimiento de un lactante humano, hay inducción rápida de la síntesis de la cadena a hasta que comprende 50% del tetrámero de hemoglobina.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

De las afirmaciones que siguen, seleccione la que es INCORRECTA:
A. El obstáculo estérico por la histidina E7 desempeña un papel crucial en la debilitación de la afinidad de la hemoglobina por el monóxido de carbono (CO).
B.La anhidrasa carbónica desempeña un papel crucial en la respiración en virtud de su capacidad para desintegrar 2,3-difosfoglicerato en los pulmones.
C. La hemoglobina S se distingue por una mutación genética que sustituye Glu6 en la subunidad b por Val, lo cual crea un parche pegajoso sobre su superficie.
D. La oxidación del hierro hem del estado 12 al estado 13 suprime la capacidad de la hemoglobina para unirse al oxígeno.
E. Las diferencias funcionales entre la hemoglobina y la mioglobina reflejan, en un alto grado, diferencias de su estructura cuaternaria.

A

B. La anhidrasa carbónica desempeña un papel crucial en la respiración en virtud de su capacidad para desintegrar 2,3-difosfoglicerato en los pulmones.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

De las afirmaciones que siguen, seleccione la que es INCORRECTA:
**A. **La red de transmisión de carga de la tripsina hace que el sitio activo de la serina sea un nucleófilo más potente.
**B. **La constante de Michaelis es la concentración de sustrato a la cual la tasa de la reacción es de la mitad del máximo.
C. Durante reacciones de transaminación, ambos sustratos están unidos a la enzima antes de que se libere cualquier producto.
D. Los residuos de histidina actúan como ácidos y como bases durante la catálisis por una aspartato proteasa.+
E. Muchas coenzimas y cofactores se derivan de vitaminas.

A

C. Durante reacciones de transaminación, ambos sustratos están unidos a la enzima antes de que se libere cualquier producto.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

De las afirmaciones que siguen, seleccione la que es INCORRECTA:
A.
Las enzimas interconvertibles desempeñan funciones clave en redes reguladoras integradas.B.
**B. **La fosforilación de una enzima a menudo altera su eficiencia catalítica.
C. Los “segundos mensajeros” actúan como extensiones intracelulares o sustitutos para hormonas e impulsos nerviosos que inciden sobre receptores de superficie celular.
D. La capacidad de proteína cinasas para catalizar la reacción reversa que elimina el grupo fosforilo es clave para la versatilidad de este mecanismo regulador molecular.
E. La activación de zimógeno por proteólisis parcial es irreversible en condiciones fisiológicas.

A

D. La capacidad de proteína cinasas para catalizar la reacción reversa que elimina el grupo fosforilo es clave para la versatilidad de este mecanismo regulador molecular.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

De las afirmaciones que siguen, seleccione la que es INCORRECTA:
**A. **La HapMap Database se enfoca en la localización e identidad de polimorfismos de un solo nucleótido en seres humanos.
B. Genbank es un depósito de datos sobre los resultados fenotípicos de deleciones (knockout) de gen en seres humanos.
C. La Protein Database o PDB almacena las estructuras tridimensionales de proteínas según se determina mediante cristalografía de rayos X o espectroscopia por resonancia magnética nuclear (NMR).
**D. **El objetivo del proyecto ENCODE es identificar todos los elementos funcionales del genoma.
E. BLAST compara secuencias de proteína y de nucleótido para identificar áreas de similitud.

A

B. Genbank es un depósito de datos sobre los resultados fenotípicos de deleciones (knockout) de gen en seres humanos.

17
Q

De las afirmaciones que siguen, seleccione la que es INCORRECTA:
A. Un obstáculo importante en el diseño de fármacos auxiliado por computadora son las extraordinarias demandas de capacidad de cómputo requeridas para permitir a las proteínas y ligandos que tengan un grado realista de flexibilidad conformacional.
B. La flexibilidad conformacional se necesita para permitir que el ligando y la proteína influyan uno sobre el otro como se describe mediante modelos de cerradura y llave para la unión entre proteína y ligando.
C. La construcción de una célula virtual podría proporcionar un medio para detectar con rapidez y eficiencia muchos efectos indeseables de fármacos potenciales, sin la necesidad de pruebas de laboratorio costosas.
D. La biología de sistemas pone de relieve la manera en la cual las conexiones entre componentes enzimáticos u otros componentes en una célula afectan su desempeño.
E. Los biólogos de sistemas a menudo emplean la lógica simbólica de los programas de computadora y los circuitos electrónicos para describir las interacciones entre proteínas, genes y metabolitos.

A

B. La flexibilidad conformacional se necesita para permitir que el ligando y la proteína influyan uno sobre el otro como se describe mediante modelos de cerradura y llave para la unión entre proteína y ligando.

18
Q

De las afirmaciones que siguen, seleccione la que es INCORRECTA:
A. Las representaciones GRASP ponen de relieve áreas de la superficie de una proteína que poseen carácter positivo o negativo local.
B. Las simulaciones de dinámica molecular buscan reconstruir los tipos de movimiento y el rango de este último por los cuales pasan las proteínas flexibles desde el punto de vista conformacional.
C. Los investigadores usan programas de esfera giratoria para localizar indentaciones y hendeduras sobre la superficie de una proteína, porque éstas representan sitios probables para el ataque por proteasas.
D. Para adaptarse al poder de cómputo disponible, las simulaciones de acoplamiento molecular a menudo restringen la rotación libre a sólo un pequeño grupo de enlaces en un ligando.
E. Discernir las relaciones evolutivas entre proteínas constituye uno de los medios más eficaces de predecir las funciones probables de un polipéptido recién descubierto.

A

C. Los investigadores usan programas de esfera giratoria para localizar indentaciones y hendeduras sobre la superficie de una proteína, porque éstas representan sitios probables para el ataque por proteasas.