Genome structure and DNA replication

Question 1

Vad är “the central dogma”?

Answer 1

Core i molekylärbiologi, protein syntes - hur proteiner är gjorda och regulerade

Question 2

Vilka är komponenterna i en DNA molekyl?

Answer 2

Nukleotider (socker, fosfat) associerade med en bas:
Guanin, Adenin, Cytosin, Tymin

Dessa utgör en DNA-sträng. DNA-molekylen är uppbyggd av två DNA-strängar (två nukleotider)

Question 3

Hur många väten binder Guanin till Cytosin?

Answer 3

Tre väten

Question 4

Hur många väten binder Adenin till Tymin?

Answer 4

Genom två väten

Question 5

DNA agerar som en mall för att kopiera sig själv. Vad kopieras ett DNA till?

Answer 5

Två daughter strands som ska bli exakt som the parental DNA strand

Question 6

Vad är basen för DNA replikation?

Answer 6

DNA är en lång strand av baser som delas upp i kromosomer. Vad genen vill beskriva beror på ordern.

Question 7

Vad kodar exoner för?

Answer 7

De kodar för protein

Question 8

Vad kodar introner för?

Answer 8

Inte för proteiner, men för RNA molekyler som cellen behöver

Question 9

Vad innehåller ett GENOME?

Answer 9

gener + icke-kodande DNA

Question 10

Vad innehåller ett chromatin?

Answer 10

DNA + speciellt protein

Question 11

Var finns allt DNA?

Answer 11

I cellkärnan

Question 12

Var sker syntes av ribosomer?

Answer 12

I cellkärnan

Question 13

Vad bygger upp kromosomerna?

Answer 13

Chromatin fibers

Question 14

Hur är gener uppbyggda?

Answer 14

Av exoner och introner.

5’ av det första exonet finns det en regulatorisk DNA-sekvens - där olika proteiner binder för att tala om för cellen att just denna gen kommer att transkriberas. När det transkriberas till RNA, först ett omoget RNA (med introner, exoner etc.), sedan bearbetas RNA:t till ett omoget RNA där intronerna har skurits ut, översatts till ett protein och sedan vikts till ett funktionellt protein. Detta är organisationen av gener i det mänskliga genomet.

Question 15

Varför är strukturen av chromatin dynamisk?

Answer 15

DNA:t måste vara tillgängligt för replikation, transkription och reperation

Question 16

Vad betyder Epigenetics?

Answer 16

De olika typerna av modifikationer av kromosomerna som inte är med i DNA sekvenserna.

Question 17

Hur kan histone proteins modifieras?

Answer 17

Genom acetylation eller methylation i DNA

Question 18

Vad karaktäriserar Heterochromatin?

Answer 18

Kromatinet är tätt/kondenserat packat; med få tysta gener som inte ska transkriberas. DNA metyleras ofta

Question 19

Vad karaktäriserar Euchromatin?

Answer 19

Kromatinet är mer löst packat/mindre kondenserat och fler gener kan transkriberas

Question 20

Vad menas med att lysin acetylation och serie fosforylering är reversible?

Answer 20

Att det kan deacetyleras och sedan gå tillbaka till lysin igen. Och de kan bestämma vilka proteiner som kan binda till histonproteinet och reglera kromatinets struktur.

Question 21

Nämn andra typer av modifikation av lysin

Answer 21

Monomethyl lysine - one methyl group is added
Dimethyl lysine - two methyl groups are added
Trimethyl lysine - three methyl groups are added

Question 22

Vad sker i histone tails?

Answer 22

Modifikationer

Question 23

Vad händer under S-fasen i DNA replikationen?

Answer 23

• Alla kromosomer/allt DNA kopieras

- DNA:t snurras upp i histoner

Question 24

Hur går DNA syntes i strandsen?

Answer 24

ALLTID från 5’ till 3 ‘. 3’ änden av parental strand blir 5’ änden i den nya stranden

Question 25

Vad binder till 3' änden?

Answer 25

En deoxyribonucleotide

Question 26

Vilket är det viktigaste enzymet i DNA replikation?

Answer 26

DNA-polymeras, eftersom den adderar nya nukleotider till det nya DNA strandet

Question 27

Vad menas med att DNA realisationen är semi-conservative?

Answer 27

Varje ny DNA molekyl innehåller en gammal och en ny DNA strand

Question 28

Vad sker i replication fork?

Answer 28

Det är där där replikationen sker

Question 29

Vad gör DNA-primase?

Answer 29

En kort RNA primer som kan bilda starten för ett Okazakifragment

Question 30

Utöver att DNA-polymeras tillsätter nukleotider till den nya växande DNA-strängen. Vad har den mer för funktion?

Answer 30

En korrektfunktion/proofreading function

Question 31

Vad gör DNA helicase?

Answer 31

Enzymet separerar DNA-strandsen i DNA-molekylen som kommer att replikeras

Question 32

Vad gör single-strand DNA-binding protein monomers?

Answer 32

Dessa binder till enkelsträngat DNA bara för att undvika denna framställning av hairpinstructure eller andra strukturer som inte är gynnsamma för replikationsprocessen.

Question 33

Vad gör DNA-ligase?

Answer 33

Sätter ihop de korta okazakifragmenten

Question 34

Vad gör Topoisomerases?

Answer 34

De är enzymer som kan fixa supercoiling av DNA (när DNA:t blir för spänt)

Question 35

Vilken Topisomerase cuts a single strand break?

Answer 35

Topoisomerases I cuts a single-strand break

Question 36

Vilken Topisomerase cuts a double strand break?

Answer 36

Topoisomerases II cuts a double-strand break

Question 37

Hur lång tid tar replikeringen av DNA?

Answer 37

ca 8 h

Question 38

Vart startar DNA replikationen?

Answer 38

Replication origin - en specifik DNA sekvens

Question 39

Vilken fas sker realisationen i?

Answer 39

S-fasen

Question 40

Nämn 5 st DNA-repair mekanismer:

Answer 40

1. DNA polymerase - Exonuclease activity 2. Mismatch repair 3. Nucleotide excision repair 4. Homologous recombination 5. Non-homologous recombination

Question 41

Vilka är de 6 stegen i genuttryck? Vilka sker i cellkärnan och vilka sker i cytosolen?

Answer 41

I cellkärnan: 1. Transkriptionskontroll 2. RNA processing kontroll I Cytosolen: 3. RNA transport och lokaliserings kontroll 4. Tranlsationskontroll 5. mRNA degraderings kontroll 6. Protein aktivitets kontroll