Control of gene expression

Question 1

Cellen måste reglera genuttryck, vad är det cellen reglerar?

Answer 1

I vilken utsträckning olika gener kommer att uttryckas, dvs HUR mycket protein som kommer att produceras och NÄR, vid vilken tidpunkt som en viss gen uttrycks.

Question 2

Vad menas med housekeeping genes?

Answer 2

Gener som ALLTID uttrycks, då vi inte överlever utan dem. Kan vara t ex. gener som kodar för protein som är involverade i metabolismen.

Question 3

Vilket är det vanligaste sättet att kontrollera genuttryck?

Answer 3

Genom transcriptionskontroll av gen uttryck

Question 4

Vilken typ av protein kontrollerar transkriptionen av gener och binder direkt till DNA?

Answer 4

DNA-bindande proteiner (transkriptions regulatorer)

Question 5

Vart binder transkriptions regulatorerna på DNA?

Answer 5

De binder till specifika sekvenser av DNA som är lokaliserade innan 5` (prime) eller upstream av genen vilket sker i början av transkriptionen.

Question 6

Vad händer vid TATA box?

Answer 6

RNA polymeras binder samman regular transkriptionsfaktorer

Question 7

Vad händer vid upstreamdelen av en gen?

Answer 7

Det är där promotorn är/the regulatory part

Question 8

Vad bildar CAAT box tillsammans med GC box?

Answer 8

De är the proximal control elements, där specifika regulatorer kan binda och hjälpa att kontrollera transkriptionen

Question 9

Nämn 6 vanliga strukturer av transkriptionsregulatorer

Answer 9

1. Helix-turn-helix
2. Homeodomain structure
3. Leucine zipper
4. B-sheet
5. Zink finger
6. Helix-loop-helix

Question 10

På vilket sätt påverkar nucleosomerna bindingen av transkriptions regulatorer?

Answer 10

Om bindningssekvensen inte är helt intill nukleosomen/histonproteinet så är det lättare för transkriptionsregulatorn att binda. Jämfört med om sekvensen är den för tät mot nukleosomen.
Om en transkriptionsregulator binder, är det lättare även för nästa att binda.

Question 11

Vad händer när transkriptionen startar?

Answer 11

Mediatorkomplexet binder till polymeras och de allmänna transkriptionsfaktorerna och genom att vika DNA:t kan de regulatoriska proteinerna binda till mediatorkomplexet. Antingen ges aktiverande signaler så att transkription startar eller tvärt om förhindras transkriptionen att starta.

Question 12

Vad menas med Transcription Synergy?

Answer 12

Transkriptionsaktivatorproteiner verkar tillsammans för att öka transkriptionshastigheten

Question 13

Glukokortikoidreceptorn finns i cytosolen. Vad händer när kortisol frisätts från binjurebarken som utsöndras i samband med svält eller fysisk aktivitet?

Answer 13

Kortisolet kommer att binda till receptorn i cytosolen och komplexet kommer tillsammans att transporteras in i kärnan, binda och kontrollera transkriptionen av gener.

Question 14

Va menas med transcription attenuation- försvagning?

Answer 14

Transkriptionen stoppas innan den är klar eftersom det nya mRNA bildar strukturer som interagerar med RNA-polymeraset

Question 15

Ge tre exempel på en posttranscriptional kontroll av genuttryck/regulation av RNA processing

Answer 15

1. Alternative RNA splicing
2. Poly-A tillägg och klyvning av RNA vid slutet av transkriptionen
3. RNA editing deaminations adenin till inosin; cytosin till uracil - förändringar i RNA-sekvensen

Question 16

RNA bör spliceas för att kunna transporteras till cytosolen. RNA kan transporteras till olika lokaliseringar i cytosolen. Vad måste proteinet fästa för att nå cytosolen?

Answer 16

Alla proteiner måste fästa det mogna mRNA:t, eftersom det annars inte når kärnporen och det kan då inte exporteras till cytosolen

Question 17

Vad är det som styr att mRNA:t ska ut till ribosomerna nära ER?

Answer 17

Signalsekvensen i mRNA:t

Question 18

Vad kontrollerar translationen?

Answer 18

Ribosombindning (leaky scanning)

Question 19

Vad menas med leaky scanning?

Answer 19

Det förändrar proteinet genom att 40 s delen av ribosomen skannar mRNA

Question 20

Vad kontrolleras mRNA degradation av?

Answer 20

Av icke-kodande RNA molekyler (miRNA)

Question 21

Nämn tre funktioner för miRNA:

Answer 21

1. Ett miRNA kan kontrollera flera olika mRNA targets
2. Olika miRNA kan agera på samma mRNA target
3. Har en stor effekt på proteinsyntesen men tar en liten plats i genomet

Question 22

Vad står CRISPR för?

Answer 22

Clustered Regulatory Interspersed Short Palindromic Repeat

Question 23

Vad används CRISPR till?

Answer 23

Man kan använda systemet till att manipulera gener, i sjukdomar och är viktigt för genuttryck och forskning

Question 24

Hur används CRISPR/Cas9 för att studera en genfunktion?

Answer 24

Man kan ta bort en gen och se vad som händer med cellerna för att se vilken funktion genen har. Alternativt att man ändrar genen och ser vad som händer med proteinerna och ser vad som händer med cellen.

Question 25

Vad är post-translational modifikationer viktiga för?

Answer 25

För aktiviteterna av de nyproducerade proteinerna