Génétique bactérienne Flashcards

1
Q

Quelles sont les principaux acteurs du vivants qui nécessitent une structure particulière pour être fonctionnels?

A

Les protéines

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Q

Quels sont les mécanismes de résistane aux antibiotiques?

A
  • Altération de la perméabilité/séquestration
  • Modification ou destruction de l’antibio
  • Modification ou remplacement de la cible
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Q

Vrai ou faux - Habituellement, les plasmides codent pour des fonctions essentielles à la cellule.

A

Faux, mais peuvent porter de l’information pouvant procurer un avantage unique à la bactérie.

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4
Q

Quelle est la conséquence d’avoir un petit génome?

A

Bactérie a des capacités limitées qui l’oblige à dépendre plus des facteurs d’un hôte pour sa survie.

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5
Q

Qu’est-ce que le génome accessoire?

A

Gènes retrouvés dans certaines souches mais absents dans d’autres souches

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6
Q

Qu’est-ce que le pangénome?

A

Ensemble de gènes qui peuvent se retrouver dans au moins une souche d’une espèce bactérienne (Génome de base + accessoire = pangénome)

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7
Q

Le pangénome est un réservoir potentiel de quels gènes?

A
  • Résistance
  • Virulence
  • Antigènes de surface
  • Métabolismes divers
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8
Q

Combien de temps dure environ la fission binaire (mode de reproduction) chez une bactérie?

A

20 minutes

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9
Q

Vrai ou faux - Lors de la fission binaire, il y a répartition égale des copies du chromosome entre les cellules filles, mais pas toujours équitable pour le ou les plasmides.

A

Vrai

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10
Q

Que fait la bactérie pour minimiser ses dépenses énergétiques?

A

Elle n’active un système que si elle en a besoin (régulation de l’expression des gènes)

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11
Q

Quel est le mécanisme de régulation de l’expression des gènes le plus utilisé par les bactéries?

A

La régulation transcriptionnelle qui permet de changer le nombre de transcrits grâce à des activateurs et des répresseurs.

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12
Q

Quel est le nom de la séquence qui est reconnue par l’ARN polymérase et qui permet la transcription du gène?

A

Promoteur

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13
Q

Qu’est-ce qu’un opérateur?

A

Séquence d’ADN adjacente à un gène qui est reconnue par une protéine régulatrice (répresseur ou activateur) et permet ainsi de contrôler la transcription du gène.

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14
Q

Pendant quelle phase de croissance la régulation est plus rapide? Pourquoi?

A

Durant la phase de croissance exponentielle car la régulation est un processus actif qui exige que la cellule soit dans un état métabolique actif.

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15
Q

Qu’est-ce que la régulation par un régulon?

A

Une seule protéine régulatrice (répresseur/activateur) pour contrôler plusieurs gènes situés à différents endroits.

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16
Q

Qu’est-ce que la régulation par un stimulon?

A

Le contrôle de plusieurs gènes non contigus par un même stimulus.

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17
Q

Quel type de mutation survient plus fréquemment? Spontanée ou induite?

A

Induite

18
Q

Quels sont les mécanismes de réparation de l’ADN?

A
  • Réparation directe de l’ADN
  • Réparation par excision
  • Réparation par recombinaison
  • Réponse SOS
  • Réparation sujette à erreur
19
Q

Vrai ou faux - L’action de certains antibiotiques peut activer les systèmes de réparation de l’ADN.

A

Vrai, la réponse SOS qui peut stimuler le transfert horizontal de gènes, puis la réparation sujette à erreur qui peut entraîner des mutations.

20
Q

Quels sont les 3 mécanismes d’échange d’information génétique (transfert horizontal)?

A
  1. Transformation
  2. Conjugaison
  3. Transduction
21
Q

Qu’est-ce que la transformation?

A

Lorsque des résidus d’ADN de bactéries mortes entrent à l’intérieur d’une bactérie vivante.

22
Q

Quel est le mécanisme prédominant de transfert d’ADN entre les bactéries?

A

La conjugaison

23
Q

Qu’est-ce que la compétence?

A

Capacité qu’ont certaines bactéries d’être transformées par de l’ADN externe. La compétence peut être acquise par exposition à des agents chimiques ou physiques ou être naturelle.

24
Q

Vrai ou faux - La transformation de bactérie est plus efficace entre bactéries d’espèces différentes.

A

Faux, plus efficace entre bactéries d’une même espèce

25
Q

Comment les antibio peuvent-ils favoriser la transformation?

A
  • Imposant pression sélective
  • Agissant comme stimulus externe induisant la compétence
  • Favorisant la lyse de cellules, libérant l’ADN
26
Q

Par quoi sont codés les gènes nécessaires à la conjugaison?

A

Gros plasmides appelés plasmides conjugatifs (plasmide F)

27
Q

Vrai ou faux - Certains plasmides non conjugatifs peuvent aussi être transférés en même temps que le plasmide conjugatif.

A

Vrai, par le mécanisme de mobilisation

28
Q

Quels sont les types de cycles de vie des bactériophages?

A
  • Lytiques
  • Lysogéniques
  • Chroniques
29
Q

Que se produit-il lors de la lysogénation par un phage?

A

Le matériel génétique du phage s’intègre dans le chromosome de la bactérie et y est répliqué en même temps que le chromosome sans affecter l’hôte.

30
Q

Qu’est-ce que la transduction spécialisée?

A

Formation de phage avec son génome et celui de l’hôte (rare mais peut se propager)

31
Q

Qu’est-ce que la transduction généralisée?

A

Formation de phage seulement avec le génome de l’hôte (fréquent mais ne peut pas se propager)

32
Q

Qu’est-ce que la transposition?

A

Mouvement de segments d’ADN à l’intérieur d’une même cellule

33
Q

Comment se nomment les éléments génétiques qui recrutent des gènes de résistance et les intègrent les uns à la suite des autres devant des promoteurs forts assurant l’expression de multiples gènes simultanément?

A

Intégrons

34
Q

Pour quelle raison les transposons complexes ont une importante médicale considérable?

A

Ils peuvent encoder à l’intérieur de leur région centrale des gènes de toxines ou de résistance aux antibiotiques.

35
Q

Qu’est-ce que le microbiote?

A

Ensemble des microbes, bactéries, archées, etc, vivant dans un environnement spécifique (ex: chez l’humain)

36
Q

Qu’est-ce que le microbiome?

A

Ensemble des génomes microbiens colonisant un environnement + composition en microbes et théâtre d’activité de ces MO dans leur écosystème particulier.

37
Q

Qu’est-ce que la pharmacoécologie?

A

Effet des médicaments ciblant l’humain sur les bactéries du microbiote

38
Q

Qu’est-ce que la pharmacomicrobiomique?

A

Effet des bactéries du microbiote sur les médicaments ciblant l’humain

39
Q

Quels sont les 2 systèmes de restrictions des échanges (pour éviter invasion d’ADN étranger)?

A
  1. Système de restriction-modification
  2. Système CRISPR/Cas
40
Q

Comment fonctionne le système de restriction-modification?

A

Une enzyme de modification ajoute un groupement méthyle aux séquences palindromique pour éviter coupure par enzyme de restriction qui va détruire génomes envahissants

41
Q

Comment fonctionne le système CRISPR/Cas?

A

Incorporation d’espaceurs lors d’une infection dans les régions CASPR qui sont transcrites. Cet ARN permet de guider la protéine Cas vers une séquence cible pour la couper

42
Q

Nommer des exemples de produits pharmaceutiques synthétisés par des bactéries et d’autres types de cellules.

A
  • Hormone de croissance humaine
  • Insuline humaine
  • EPO
  • Vaccin contre hépatite B
  • Etc.