Génétique bactérienne Flashcards
Quelles sont les principaux acteurs du vivants qui nécessitent une structure particulière pour être fonctionnels?
Les protéines
Quels sont les mécanismes de résistane aux antibiotiques?
- Altération de la perméabilité/séquestration
- Modification ou destruction de l’antibio
- Modification ou remplacement de la cible
Vrai ou faux - Habituellement, les plasmides codent pour des fonctions essentielles à la cellule.
Faux, mais peuvent porter de l’information pouvant procurer un avantage unique à la bactérie.
Quelle est la conséquence d’avoir un petit génome?
Bactérie a des capacités limitées qui l’oblige à dépendre plus des facteurs d’un hôte pour sa survie.
Qu’est-ce que le génome accessoire?
Gènes retrouvés dans certaines souches mais absents dans d’autres souches
Qu’est-ce que le pangénome?
Ensemble de gènes qui peuvent se retrouver dans au moins une souche d’une espèce bactérienne (Génome de base + accessoire = pangénome)
Le pangénome est un réservoir potentiel de quels gènes?
- Résistance
- Virulence
- Antigènes de surface
- Métabolismes divers
Combien de temps dure environ la fission binaire (mode de reproduction) chez une bactérie?
20 minutes
Vrai ou faux - Lors de la fission binaire, il y a répartition égale des copies du chromosome entre les cellules filles, mais pas toujours équitable pour le ou les plasmides.
Vrai
Que fait la bactérie pour minimiser ses dépenses énergétiques?
Elle n’active un système que si elle en a besoin (régulation de l’expression des gènes)
Quel est le mécanisme de régulation de l’expression des gènes le plus utilisé par les bactéries?
La régulation transcriptionnelle qui permet de changer le nombre de transcrits grâce à des activateurs et des répresseurs.
Quel est le nom de la séquence qui est reconnue par l’ARN polymérase et qui permet la transcription du gène?
Promoteur
Qu’est-ce qu’un opérateur?
Séquence d’ADN adjacente à un gène qui est reconnue par une protéine régulatrice (répresseur ou activateur) et permet ainsi de contrôler la transcription du gène.
Pendant quelle phase de croissance la régulation est plus rapide? Pourquoi?
Durant la phase de croissance exponentielle car la régulation est un processus actif qui exige que la cellule soit dans un état métabolique actif.
Qu’est-ce que la régulation par un régulon?
Une seule protéine régulatrice (répresseur/activateur) pour contrôler plusieurs gènes situés à différents endroits.
Qu’est-ce que la régulation par un stimulon?
Le contrôle de plusieurs gènes non contigus par un même stimulus.
Quel type de mutation survient plus fréquemment? Spontanée ou induite?
Induite
Quels sont les mécanismes de réparation de l’ADN?
- Réparation directe de l’ADN
- Réparation par excision
- Réparation par recombinaison
- Réponse SOS
- Réparation sujette à erreur
Vrai ou faux - L’action de certains antibiotiques peut activer les systèmes de réparation de l’ADN.
Vrai, la réponse SOS qui peut stimuler le transfert horizontal de gènes, puis la réparation sujette à erreur qui peut entraîner des mutations.
Quels sont les 3 mécanismes d’échange d’information génétique (transfert horizontal)?
- Transformation
- Conjugaison
- Transduction
Qu’est-ce que la transformation?
Lorsque des résidus d’ADN de bactéries mortes entrent à l’intérieur d’une bactérie vivante.
Quel est le mécanisme prédominant de transfert d’ADN entre les bactéries?
La conjugaison
Qu’est-ce que la compétence?
Capacité qu’ont certaines bactéries d’être transformées par de l’ADN externe. La compétence peut être acquise par exposition à des agents chimiques ou physiques ou être naturelle.
Vrai ou faux - La transformation de bactérie est plus efficace entre bactéries d’espèces différentes.
Faux, plus efficace entre bactéries d’une même espèce
Comment les antibio peuvent-ils favoriser la transformation?
- Imposant pression sélective
- Agissant comme stimulus externe induisant la compétence
- Favorisant la lyse de cellules, libérant l’ADN
Par quoi sont codés les gènes nécessaires à la conjugaison?
Gros plasmides appelés plasmides conjugatifs (plasmide F)
Vrai ou faux - Certains plasmides non conjugatifs peuvent aussi être transférés en même temps que le plasmide conjugatif.
Vrai, par le mécanisme de mobilisation
Quels sont les types de cycles de vie des bactériophages?
- Lytiques
- Lysogéniques
- Chroniques
Que se produit-il lors de la lysogénation par un phage?
Le matériel génétique du phage s’intègre dans le chromosome de la bactérie et y est répliqué en même temps que le chromosome sans affecter l’hôte.
Qu’est-ce que la transduction spécialisée?
Formation de phage avec son génome et celui de l’hôte (rare mais peut se propager)
Qu’est-ce que la transduction généralisée?
Formation de phage seulement avec le génome de l’hôte (fréquent mais ne peut pas se propager)
Qu’est-ce que la transposition?
Mouvement de segments d’ADN à l’intérieur d’une même cellule
Comment se nomment les éléments génétiques qui recrutent des gènes de résistance et les intègrent les uns à la suite des autres devant des promoteurs forts assurant l’expression de multiples gènes simultanément?
Intégrons
Pour quelle raison les transposons complexes ont une importante médicale considérable?
Ils peuvent encoder à l’intérieur de leur région centrale des gènes de toxines ou de résistance aux antibiotiques.
Qu’est-ce que le microbiote?
Ensemble des microbes, bactéries, archées, etc, vivant dans un environnement spécifique (ex: chez l’humain)
Qu’est-ce que le microbiome?
Ensemble des génomes microbiens colonisant un environnement + composition en microbes et théâtre d’activité de ces MO dans leur écosystème particulier.
Qu’est-ce que la pharmacoécologie?
Effet des médicaments ciblant l’humain sur les bactéries du microbiote
Qu’est-ce que la pharmacomicrobiomique?
Effet des bactéries du microbiote sur les médicaments ciblant l’humain
Quels sont les 2 systèmes de restrictions des échanges (pour éviter invasion d’ADN étranger)?
- Système de restriction-modification
- Système CRISPR/Cas
Comment fonctionne le système de restriction-modification?
Une enzyme de modification ajoute un groupement méthyle aux séquences palindromique pour éviter coupure par enzyme de restriction qui va détruire génomes envahissants
Comment fonctionne le système CRISPR/Cas?
Incorporation d’espaceurs lors d’une infection dans les régions CASPR qui sont transcrites. Cet ARN permet de guider la protéine Cas vers une séquence cible pour la couper
Nommer des exemples de produits pharmaceutiques synthétisés par des bactéries et d’autres types de cellules.
- Hormone de croissance humaine
- Insuline humaine
- EPO
- Vaccin contre hépatite B
- Etc.
