Génetique Flashcards

1
Q

quelle est la définition des plasmide

A

C’est des molécules extra chromosomique d’ADN double brin circulaire
capable de la réplication autonome et de transmission naturelle entière ou partielle d’une cellule à une autre le transfert se fait verticalement ou horizontalement=conjugatif

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Q

Quelle est la caractéristique des plasmide transférable

A

Les plasmide transférable porte des gènes permettant leur mobilité et la formation du pili sexuel = le facteur F

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3
Q

Quels sont les deux mécanismes d’évolution d’une bactérie

A

La mutation et le transfert génétique

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4
Q

Quels sont les éléments génétiques mobiles

A

Les transposons et les intégrant

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5
Q

Qu’est-ce que les transposons

A

C’est des séquence d’ADN capable de changer de localisation dans le génome sont jamais apparaître à l’état libre
ils peuvent de répliquer de manière autonome et coder pour la détermination de la transposition et d’autres fonctions telle que la Résistance

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6
Q

Qu’est-ce que la transposition

A

C’est un mécanisme d’évolution rapide, qui est l’addition pure et simple de gènes de taille définie au sein du matériel génétique

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7
Q

Quelle est la définition des intégrons

A

c’est un système de capture et d’expression de gènes sous forme de cassette
incapable de s’auto répliquer

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8
Q

Qu’est-ce qu’une cassette

A

c’est un élément mobile capable d’être intégré ou excisé par un mécanisme de recombinaison spécifique de site médié par une intégrase

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9
Q

Quelles sont les formes des cassettes

A

forme linéaire au sein d’un intégrons forme circulaire à l’état libre

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10
Q

Quels sont les phénomènes du transfert génétique responsable de la diffusion de la Résistance aux antibiotiques

A

la conjugaison la transformation et la transduction

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11
Q

Comment se fait la transformation

A

Nat ou Physiologuque
Partiel=1-2% du génome
L’ADN est absorbé par une bactérie réceptrices puis suivi d’une recombinaison génétique avec acquisition de nouveau caractère génétique stable transmissible à la descendance appeler: recombinant ou transformant
Elle est limitée à quelques espèces

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12
Q

Comment se passe la transduction

A

Par l’intermédiaire d’un vecteur, le Bactériophage(virus batctérien), dont le rôle est passif, lors de la phase d’encapsidation il incorpore l’ADN bactérien fragmentée (=pariel)

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13
Q

Quelle est la condition de la transduction

A

La présence de récepteur spécifique qui permettent ce transfert = la sensibilité de la bactérie à un bactériophage = Lysotypie

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14
Q

qu’est-ce que la conjugaison

A

C’est la transmission d’ADN d’une bactérie donneuse porteuse de plasmide F+ à une bactérie réceptrice F-

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15
Q

Comment se fait la conjugaison

A

Reconnaissance entre donneur F+ et accepteur F- grâce au pilus= pont cytoplasmique
Transfert d’un des deux bras du plasmide
La ‏synthese du brin complémentaire chez le receveur et l’a recirculation

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16
Q

Comment se fait la transduction

A

L’attachement du virus sur la bactérie
L’infection de la bactérie
Destruction de l’ADN de l’hôte et la synthèse de l’ADN viral
La synthèse de la capside virale (structure qui entoure le génome)
Lyse cellulaire
L’infection d’un nouvelle hote portant l’ADN
Recombinaison

17
Q

Quels sont les principaux support de la résistance aux antibiotiques

A

les plasmides les transposons et les intégrant

18
Q

Quels sont les bienfaits de tirer de la biologie moléculaire

A

L’étude des bactéries non cultivable hautement contagieuse et très exigeante
Le suivi thérapeutique
La détermination des génotypes des gènes de résistance aux antibiotiques, des genes de facteurs de virulence
L’infection décapité par antibiothérapie
La classification phylogénique L’épidémie détection des clones circulants et des nouvelles espèces

19
Q

Quelles sont les différentes techniques utilisées de la biologie moléculaire

A

La technique d’hybridation
PCR
Les techniques utilisant des enzymes de restriction
Le séquençage en utilisant une SNP: nucléotides polymorphes simple

20
Q

Les techniques de biologie moléculaire se font à partir de…

A

Du prélèvement ou de la culture pure

21
Q

À quoi consiste la technique d’hybridation moléculaire

A

à la détection de l’ADN cible en utilisant une sonde nucléique spécifique contenu dans une vingtaine de base complémentaire à l’ADN cible

22
Q

Par quoi sont marqué les sondes

A

Par incorporation des éléments radioactifs: sonde chaudes

par des méthodes non radioactifs: sonde froide

23
Q

Quelle est la définition de la peau de l’amplification génétique PCR

A

C’est l’amplification d’une séquence d’ADN spécifique délimité par deux amorces grâce à une polymérase
Allez automatisable est très sensible

24
Q

À quel facteur est lié la spécificité de la PCR

A

Au choix d’amorce et à l’absence de contamination

25
Q

Quelles sont les règles à respecter pour éviter la contamination

A

Des locaux près de la PCR et poste PCR
* la zone de preamplification: préparation des réactifs
*la zone de préamplification: extraction de l’ADN
*la zone de poste amplification: amplification et détection
Utilisation des contrôles internes positifs et négatifs

26
Q

Quels sont les types du PCR

A

Simple
multiplex
niché
en temps réel

27
Q

Dans des exemples de la détection de pathogène spécifique par PCR

A

PCR 2: recherche de Mycobacterium tuberculosis sur prélèvement
PCR 3: recherche de Nigeria meningitidis dans le LCR à partir de la culture et du génogroupage

28
Q

Décris les étapes de la technique par enzyme de restriction

A

1-enzyme + ADN double brin
2-enzyme se lie à la séquence spécifique sur l’ADN
3-coupure au niveau des 2 brins de l’ADN
4-la libération de l’enzyme
5-ADN fragmenté
6-les échantillons sont chargés sur un gel d’agarose
7-un champ électrique fait migrer et séparer les les 2 fragments
8-le gel d’agarose est disposé sur une lumière bleue et un filtre orange permet de visualiser les fragments et la photographié

29
Q

Comment se fait la détection de pathogène par séquençage

A

Isolement de l’ADN bactérien à partir d’une culture ou d’un prélèvement
Amplification de l’ADN ribosome l 16S par des amorces universelles
Séquençage du gène
analyse critique
et comparaison avec les banques de données
elle prend au minimum 3 jours

30
Q

Quand s’applique la technique de séquençage

A

Identification et taxonomie bactérienne:
*lorsque les technique classique d’identification insuffisante
* la bactérie des cultures et lente ou difficile
Diagnostic: recherche de bactéries dans des sites normalement stérile

31
Q

Quelles sont les limites de la biologie moléculaire

A

L’absence de standardisation de contrôle qualité
Appareillage particulier et le personnel qualifié
La validation clinique est nécessaire
Présence d’un gene =/ bact vivante
La présence d’un gène ne donne pas d’indication sur son expression

32
Q

À quoi sont dues les faux négatif

A

problème d’extraction
présence d’inhibiteurs de la polymérase dans certains tissus
soif théorique de détection = sensibilité
choix du fragment de biopsie à traiter

33
Q

À quoi sont dues les faux positif

A

problème d’interprétation à partir des prélèvements

Non adapté pour les infections pluri microbienne

34
Q

Par quel gène et coder la toxine diphtérique

A

Le gène TOX

35
Q

Quelles sont les espèces bactériennes concerné par la transformation

A

Streptococcus
pneumoniae
Neisseria
Haemophilus