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MMD1045 > Génétique 2 > Flashcards

Génétique 2 Flashcards

1
Q

C’est quoi un caryotype

A

Classement des chromosomes selon un ordre établi par entente internationale

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2
Q

Que permet le caryotype

A

D’analyser les structures des chromosomes
De comparer les 2 homologues

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Q

Étapes pour établir le caryotype

A

1- Compter le nombre de chromosomes
2- Analyse des chromosomes

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Q

Sur quoi se base l’analyse des chromosomes

A
  • Taille: Classés du plus grand au plus petit (1à22)
  • Forme
  • MArquage particulier à chacun des chromosomes
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5
Q

Comment est déterminée la morphologie des chromosomes

A

Par la position des centromères
Cette forme est constante pour une paire de chromosome donnée mais elle varie d’une paire à l’autre

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6
Q

Chromosomes métacentriques

A

Position du centromère au centre entraine 2 bras symétriques

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7
Q

Chromosomes submétacentriques

A

Position du centromère entraine 2 bras asymétriques

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8
Q

Chromosomes acrocentriques

A

Position du centromère à une extrémité entraine un très petit bras

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9
Q

Décrit le marquage chromosomique

A
  • Constant pour une paire donnée et permet de la distinguer d’une autre paire
  • Varie d’une paire à l’autre
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10
Q

Décrit le marquage en bandes GTG ou bandes G

A
  • Obtenu après traitement à la trypsine et coloration au Giemsa
  • Marquage utilisé en routine dans les labos de cytogénétique
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11
Q

Quels sont les pré-requis pour l’obtention des chromosomes

A

Cellules qui se divisent car étudiées en métaphase de la mitose
- Spontanément : fibroblastes de la peau ou du fascia, amniocytes, cellules tumorales (hémopathies ou tumeurs solides)
- Par stimulation: lymphocytes T sanguins peuvent se diviser suite à la stimulation par la PHA (phytohématoglutinine)

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12
Q

Que nécessite l’obtention des chromosomes

A
  • Culture cellulaire
  • Arrêt du cycle cellulaire en métaphase en ajoutant un inhibiteur du fuseau mitotique (Colcemid)
  • Récolte des chromosomes après un traitement hypotonique de la cellule
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13
Q

C’est quoi la formule chromosomique

A

Composition en chromosomes de la cellule
Constituée de:
- Nombre total des chromosomes par cellule
- Gonosomes (XX ou XY)
- Indication de l’anomalie chromosomique, si existante
- Si pas d’anomalie: 46, XX ou 46, XY
- Exemple d’anomalie: 47, XX, +13=trisomie 13

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14
Q

C’est quoi la composition chromosomique

A

Composition en chromosomes de l’ensemble des cellules d’un individu. Peut être normale ou anormale
Pour déterminer la constitution chromosomique d’un individu, on doit analyser un minimum de 10 cellules différentes

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15
Q

Décrit la constitution chromosomique homogène

A

Lorsque toutes les cellules analysées sont normales ou anormales
Toutes les cellules ont donc la même formule chromosomique
Il s’agit de la majorité des cas

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16
Q

Décrit la constitution chromosomique non homogène ou mosaïque

A

Lorsqu’on retrouve 2 types ou plus de cellules chez le même individu
On parle de mosaïcisme pour une anomalie chromosomique lorsque les types cellulaires proviennent d’un même zygote
On parle de lignées cellulaires
Due à des anomalies dans la ségrégation mitotique des chromosomes

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17
Q

Décrit les anomalies chromosomiques

A

Modifications de l’euchromatine des chromosomes
LEs anomalies chromosomiques sont habituellement visibles au microscope et donc touchent plusieurs gènes (plus de plusieurs dizaines)

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18
Q

Une anomalie chromosomique modifiant la quantité d’euchromatine dans le génome entraine…

A

un effet sur le phénotype

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19
Q

SI l’anomalie ne touche que l’hétérochromatine, on parle de variant chromosomique et est

A

sans effet sur le phénotype

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20
Q

QUels sont les anomalies de nombre

A

Polyploïdie
Aneuploïdie

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21
Q

Polyploïdie

A

Addition d’un ou plusieurscompléments haploïdes (n):
- Triploïdie : 69, XXX (3n)
- Tétraploïdie : 92, XXXX (4n)

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22
Q

Aneuploïdie

A

Touche une seule paire d’homologue dont le nombre est augmenté ou diminué
- Trisomie: 47, XY, +21
- Monosomie: 45, X

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23
Q

Décrit la triploïdie

A
  • 69, XXX ou 69 XXY (69, XYY plus rare)
  • Cause la plus fréquente: diandrie 84%
  • Dans les cas maternels: digynie; placenta hypertrophique, syndactylies 2-3, RCIU
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24
Q

Décrit la diandrie

A
  • Fécondation d’un ovule par 2 spermatozoïdes ou dispermie
  • Retard de croissance important (RCIU), kystes du placenta (changements molaires), peu viable
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25
Q

Décrit l’aneuploïdie

A
  • Anomalie du nombre d’une seule paire de chromosomes (+/-)
  • Résulte d’une erreur dans la répartition des chromosomes lors de la division cellulaire: en méiose pour homogène et non dysjonction en mitose entraine un mosaïcisme tissulaire
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26
Q

Décrit la non-dysjonction en méiose 1

A
  • Division réductionnelle: sert à la séparationn des 2 homologues
  • Non-dys en M1: 2 chromosomes homologues demeurent dans le même gamète
  • Type le plus fréquent
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27
Q

Décrit la non-dysjonction en méiose 2

A

-Division équationnelle: sert à séparer les chromatides soeurs
- Non-dys en MII: 2 chromatides soeurs dans le même gamète, donc 2 chromosomes identiques sauf pour les recombinaisons subies)

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28
Q

Causes des trisomies

A

+ de 90% origine de la méiose maternelle
Erreur en MI le plus souvent, sauf pour la trisomie 18 ou l’erreur est en M2 le plus fréquemment

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29
Q

Décrit l’absence de recombinaisons et les recombinaisons en positions télomériques

A

Sonr des facteurs de risque pour la non-dysjonction à tout âge
- Erreur de MI
- Le bivalent ségrégerait de façon plus ou moins indépendante

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30
Q

Décrit les recombinaisons péricentromériques

A
  • Facteur de risque chez la femme plus agée
  • Erreur en M2
  • Interférerait avec la cohésion normale des chromatides soeurs
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31
Q

Effet de l’âge maternel sur le fuseau mitotique

A

Avec l’âge avancé, probablement combinaison de facteurs
Patrons des recombinaisons
Vieillissement du fuseau mitotique

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32
Q

Décrit le syndrome de Turner

A

2 % des conceptions
90% résultent en avortements spontanés (phénotypes les plus sévères avec hydrops=oedème généralisé du foetus/embryon)
Majorité: non-disjonction dans les gamètes paternels
1/2000 nouveau-né féminins
À la naissance: phénotype variable, intelligence normale: le plus constant : courte taille proportionnée et dysgénésie gonadique

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33
Q

Décrit les manifestations du syndrome de Turner

A

Phénotype féminin avec corpuscule de Barr absent
Intelligence normale: difficultés spatio-temporelles, d’attention possibles
Courte taille proportionnée
Insuffisance ovarienne par dysgénésie gonadique: absence ou non complétion de la puberté spontannée, aménorrhée primaire, infertilité (possible avec nouvelles technologies reproductives)
Autres:
- Oreilles basses implantées
- Cou palmé (pterygium colli) résultant d’un hygroma kystique en grossesse
- THorax large et mammelons écartés
- Anomalie cardiaque (coartaction aortique ou autre)
- Anomalies rénales (reins fusionnés, ectopiques)
- Cubitus valgus
- Oedème du dorsum des mains et des pieds en néonatal
- Hydrops foetalis

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34
Q

Étiologie cytogénétique turner

A

45,X :
- 55%homogène
- 20% en mosaïque; donc origine post-zygotique/mitotique
Anomalie de structure d’un X dans 25% des cas homogènes ou en mosaïque: isochromosome Xq, délétion

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35
Q

Décrit le Triple X

A

Incidence 1/1000 filles
Phéotype féminin
Intelligence normale mais légèrement diminuée p/r fratrie: difficultés d’apprentissage fréquentes
Grande taille
Pas de malformation ou de dysmorphies
Fertilité normale

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36
Q

Syndrome 47, XXY

A

Klinefelter
Phéno masculin
Intelligence normale mais légèrement diminuée p/r fratrie: difficultés d’apprentissage fréquentes
Grande taille
Hypogonadisme: infertilité (possible avec nouvelles technologies reproductives), risque de gynécomastie, caractères sexuels secondaires peu développés

37
Q

Syndrome 47, XYY

A

1/900 gars
Phéno asculin normal
Intelligence normale mais légèrement diminuée p/r fratrie: difficultés d’apprentissage fréquentes, impulsivité possible

38
Q

Down syndrome (trisomie 21)

A

1/660
Première anomalie chromosomique décrite chez humain
Incidence augmentée avec l’âge maternel:
- 25=1/1250
- 30=1/840
- 35=1/356
- 40=1/94
- 45=1/24
95% causée par non-dysjonction méiotique lors de la méiose maternelle: formes plus rares (translocation 2,5%, mosaïcisme 2,5%)

39
Q

Manifestations down

A
  • Retard mental léger à modéré
  • Bon tempérament
  • Hypotonie
  • Traits physiques caractéristiques
  • Malformations cardiaques 40% (canal atrio-ventriculaire)
  • Malformations gastro-intestinales 12% (atrésie duodénale, de l’oesophage)
  • Risque leucémie -1%
40
Q

Traits physiques caractéristiques Down

A
  • Occiput plat
  • Visage rond
  • Orientation des fentes palpébrales vers le haut
  • Replis épicanthiques
  • Protrusion de la langue
  • Plis palmaires transverses
  • Clinodactylie 5e doigt
41
Q

Trisomie 13

A

Syndrome de Patau
1/5000
Retard mental sévère
Fente labio-palatine
Polydactylie
Malformation cérébrale sévère (holoprosencéphalie)
Malformations cardiaques, rénales et autres
Anomalies létales le plus souvent:
- Survie médiane 7j
- 91% meurent dans 1ere année
- Survie à long terme 5-10%

42
Q

Trisomie 18

A

Syndrome d’Edward
47, XX ou XY, +18
1/6000-1/8000
Retard mental sévère
Retard de croissance
Mains fermées : 2eme sur 3eme doigt, 5e sur 4e doigt
Pieds en piolets
Malformations cardiaques, digestives, rénales fréquentes
Anomalie létale le plus souvent:
- Survie médiane 14,5 j
- 5-10% survivent + que1 an

43
Q

Définition anomalies de structures

A
  • Modifications dans la forme des chromosomes
  • Presque toujours dues à des cassures
    Un chromosome peut être le site de une ou plusieurs cassures transversales
    Plus d’un chromosome peuvent subir des cassures en même temps
44
Q

Que se passe-t-‘il suite à une ou des cassures

A
  • Fragment peut se perdre
  • Se recoller exactement comme il était avant
  • Se recoller différemment, au même endroit ou ailleurs
45
Q

Décrit la délétion terminale

A

Le fragment qui ne contient pas de centromère et qui ne se recolle pas sera perdu lors des divisions cellulaires (fragment acentrique)
Les cellules filles conservent le chromosome cassé, cad le segment chromosomique qui contient le centromère

46
Q

Syndrome du Cri-du-Chat

A

Délétion terminale du bras court du chromosome 5
Retard de croissance
Cri caractéristique à la naissance
Retard mental

47
Q

Délétion interstitielle

A

Deux cassures dans un même bras chromosomique
Perte du matériel entre les 2 points de cassure (fragment acentrique)
Fusion aux 2 points de cassure

48
Q

Inversion paracentrique

A

Si les cassures affectent le même bras chromosomique (le bras court p ou le bras long q)
Le segment chromosomique peut se recoller à l’envers ce qui entrainera une inversion paracentrique
Si les cassures affectent chacun des bras chromosomiques et est donc de part et d’autre du centromère
Le segment chromosomique peut se recoller à l’envers ce qui entrainera une inversion péricentrique. Ce type change la position du centromère

49
Q

La translocation

A

2 cassures qui se produisent sur deux chromosomes différents
Qu’il y a échange de matériel chromosomique
Recollage de segments
Ceci produit une translocation
On distingue 2 sortes de translocation

50
Q

Sortes de translocation

A
  • Réciproque: t(9,22)
  • Robertsonienne: rob(13;15) ou der(13;15)
    Peuvent être équilibrées ou déséquilibrées
51
Q

Décrit la translocation réciproque équilibrée

A

Cassure en a sur le 11
Cassure en b sur le 22
échange de fragments
Formation de 2 nouveaux chromosomes transloqués (der ou dérivés)
Elles se font entre des chromosomes non-homologues et le long des bras chromosomiques
Ne fait pas varier le nombre de chromosomes (46)
Ne s’accompagne d’aucune perte de matériel chromosomique, donc:
Pas d’effet sur le phénotype
Présente un risque de ségrégation non-équilibrée lors des divisions de la méiose et par conséquent un risque accru de phénotype anormal chez les descendants, de fausse couche, d’infertilité

52
Q

Translocations réciproques équilibrées et méiose, ses gamètes peuvent contenir

A
  • 2 chromosomes normaux
  • 2 chromosomes transloqués mais équilibrés (comme le parent porteur)
  • 1 chromosome transloqué et un normal
    Cette 3e ombinaison appelée ségrégation nonéquilibrée, produira des zygotes anormaux avec une monosomie et une trisomie partielle combinées, et donc porteurs d’une translocation non-équilibrée. L’enfant, si viable, sera de phénotype anormal
53
Q

Que sont les translocations robertsoniennes

A

Survient après cassures et recollement au niveau des centromères des chromosomes acrocentriques (13,14,15,21,22)
Il y a alors fusion centrique des 2 chromosomes
Fait varier le nombre de chromosomes (45)
S’accompagne d’une petite perte de matériel (le spetits bras courts des 2 chromosomes acrocentriques) qu sont constitués d’hétérochromatine et par conséquent n’entraine pas d’effet sur le phénotype chez les porteurs
Risque de ségrégation non-équilibrée et une possibilité accrue de malségrégation lors de la méiose etpar conséquent hausse le risque de phénotypes anormaux chez leurs enfants, de fausses couches et d’infertilité

54
Q

Formation d’une translocation robertsonnienne

A

Après cassures au centromère du chromosome 14 et au centromère du chromosome 21, il y a fusion des longs bras des deux chromosomes acrocentriques et formation d’un chromosome transloqué (14;21)
Un porteur de la translocation équilibrée a 45 chromosomes

55
Q

Cause de trisomie 21 par translocation robertsonnienne

A

2,5% des cas de trisomie 21
Caryotype de l’enfant détermine le risque de récidive pour les parents:
- Aneuploïdie ou triso libre: 1%
- Translocation robert… non-équilibrée: selon le statut de porteur des parents: de novo -1%
-Un parent porteur a un risque de récurrence de triso 21: 15% pour une femme et 1% pour un homme
Le caryotype des parents ne sera pas nécessaire si aneuploïdie mais primordial su translocation

56
Q

Autres anomalies de structures

A

Duplication
Insertion
Chromosome dicentrique
Chromosome en anneau
Isochromosome
etc

57
Q

C quoi la cyto mol

A

Permet d’étudier le génome humain d’une façon plus fine que le caryotype standard
2 techniques:
Hydridation in situ en fluorescence (FISH)
Hybridation génomique comparative sur micropuce

58
Q

Décrit FISH

A

Appariement d’une séquence d’ADN connue d’acides nucléiques (la sonde) et marquée avec une mol fluorescente à une ou des séquences complémentaires qu’on veut étudier
Se fait sur des chromosomes en métaphase , des noyaux interphasiques de cellules fixées, de frottis, empreinte, ou sur une section de tissu

59
Q

Principes de base de l’hybridation

A

Se base sur la structure de l’ADN
- Chaque chromosome a une double hélice d’ADN hautement repliée et condensée
- Chacun des brins est composé d’un polymère de désoxyribose phosphate lié à une base (purine ou pyr)
- Chacune des bases est reliée par une liaison H à un ebase complémentaire
Dénaturation et renaturation
- L’hybridation se fait grâce à une alternance des processus de dénat et renat de l’ADN.
Un fragemtn d’ADN simple-brin à séquence connue (nommée la sonde) sous des conditions spécifiques d’hybridation, se lie à l’ADN simple-brin complémentaire que l’on veut étudier

60
Q

Dénaturation

A

Ponts-H sont rompus entre bases des 2 brins complémentaires de l’ADN, le rendant simple brin

61
Q

Renaturation

A

Segments d’ADN simple brin complémentaires vont s’apparier, il y a formation de laisons H entre bases complémentaires

62
Q

Étapes de FISH

A

1- Dénat de la sonde ET de l’ADN génomique à étudier
2- Hybridation des 2 ADN simple brin et renat
3- Visualisation au microscope à fluorescence

63
Q

Que permet FISH

A

Détection d’anomalies chromosomiques inframicroscopiques (non visibles au caryotype)
Caryo standard: 10 Mb
caryo haute résolution: 2-5 Mb
FISH:sonde 100-150 Kb

64
Q

Types de sondes

A

Peinture chromosomique
Sondes à séquence répétitive
- SOndes centromériques
- Sondes télomériques
Sondes à séquence unique: séquence d’une région spécifique du génome, ADN non répétitif

65
Q

Sonde à séquence uniuqe

A

Sonde qui utilise une séquence d’une région spécifique du génome ou l’ADN n’est pas répétitif
Pour dx des syndromes de microdélétion, microduplication

66
Q

Application de FISH

A

Dx cytogénétique
- Préciser une anomalie vue en cytogénétique classique et qui n’a pu être identifiée précisement en raison de sa complexité
- Dx de micro-remaniements chromosomiques, non-visibles aucaryotype
- FISH interphasique pour dx rapide
Choix de la sonde grâce aux infos cliniques

67
Q

Micro-remaniements

A

Syndromes associées à une microdélétion ou mucroduplication chromosomique récurrente ou à remaniements cryptiques d’autres régions

68
Q

Syndrome de DiGeorge

A

Syn vélocardiofacial
Délétion interstitielle de la région 22q11.2
1/4000
Phénotype très variable même dans une même famille

69
Q

Phéno clinique DiGeorge

A

Majeurs:
- Dysmorphie
- Cardiopathie conotroncale (qui atteint les voies de chasse du coeur comme tétralogie de Fallot)
- Anomalie du palais (fente ouverte à insuffisance vélo-palatine)
- ypoparathyroidie
- Hypoplasie du thymus
- Retard psychomoteur (déficience intellectuelle rare; difficultés d’apprentissage fréquentes)
- Retard de croissance
Autres signes
- Surdité
- An rénales
- An endo
- An squelettiques
- An oculaires
- Psychose (30%)
- An laryngées

70
Q

Mécanisme microdélétions récurrentes

A

Séquences répétées similaires à l’extérieur de la région fréquemment délétée
Recombinaison homologue non allélique durant la méiose
- Délétion de la région entre les répétitions
- Duplication de la région entre les répétitions
Explique
- Fréquence des remaniements
- Haut taux de survenue de novo
- Points de cassure identique

71
Q

Qu’explique la recombinaison méiotique non homologue

A

TT autres syndromes de microdélétion/microduplication récurrents

72
Q

Sydrome de Williams

A

Retard mental
Retard de croissance
Lèvres proéminentes
Iris en étoile
Sténose aortique supravalvulaire, sténose pulmonaire
Hypoplasie de l’émail

1/7500
Habituellement de novo
50% des risques de transmission pour les atteints
del(7)(q11.23q11.23)

73
Q

Syndrome de PraderWilli

A

Hypotonie néonatale
Difficultés alimentaires dans la première année de vie (gavage)
Hyperphaie et prise de poids rapide à partir de 1à6 ans. Obésité morbide
Retard de dév et mental
Phénotype: teint pale, yeux en amande, petits mains et pieds
Hypogonadisme
Complications: diabète, apnée obstructive
Tx: GH, restriction calorique, exercices, réadaptation

15q11q13
- 70%: délétion allèle parental
- 25%: disomie maternelle
- 2%: empreinte anormale
Gène SNRPN exprimé sur la copie paternelle
Dx cyto par FISH permet de poser un dx seulement s’il s’agit d’une délétion
1/10 000-30 000

74
Q

Syndrome d’Angelmann

A

Région 15q11-13
Gène UBE3A exprimé à partir de l’allèle maternel
70% del allèle maternel (dx par FISH)
2-5% disomie paternelle
5% aN empreinte
20% mutation itragénique
Retard mental important, ataxie, rires inappropriés
1/12 000-24 000

75
Q

Syndrome de microduplication

A

Les réciproques des syndromes de microdélétion sont décrits
- Dup(22)(q11.2q11.2)
- Dup(7)(q11.23q11.23)
- Dup(15)(q11q13)
En comparaison avec les délétions de ces mêmes régions:
phénotypes peu distinctifs, moins typés
phénotypes moins sévères
plus difficiles à suspecter cliniquement a priori

76
Q

Dup(15)(q11q13)

A

Peu de malformations
Retard mental et autisme
Convulsions
Dx sur noyaux interphasiques, difficile sur métaphase

77
Q

À quoi est indispensable le FISH interphasique

A

Détection d’anomalies de nombre ou d’anomalie de structure dans les cas ou:
- L’index mitotique est peu élevé (c néoplasiques)
- Un résultat rapide est nécessaire (dx prénatal)
- Pour un dx d’une mosaïque/clone faible pour une aneuploïdie ou pour une anomalie clonale précise
Le choix des sondes repose sur les données cliniques

78
Q

Caractéristiques de FISH interphasique

A

TT type de sonde peut être utilisé (sauf les peintures et sondes télomériques)
Pas besoin de mitoses donc pas nécessaire d’avoir des cellules en division (pas de culture); l’échantillon peut être traité immédiatement
Un grand nombre de cellules peuvent donc être analysées rapidement

79
Q

Principes de l’hybridation génomique comparative

A

Comparaison de l’ADN d’un patient avec un ADN controle
Cette comparaison s’effectue grâce à l’hybridation des ces ADN marqués en fluorescence sur un support d’ADN
- Préparation chromosomique contrôle (lâme cytogénétique)
- Fragments de l’ADN génomique que l’on veut étudier (micropuce)
Se base sur les mêmes principes d’hybridation que FISH
Intensité de la fluorescence hybridée sur un segment donné contrôle vs patient évaluée par un ordinateur

80
Q

Hyridation génomique comparative sur micropuce

A

Hybridation sur des séquences d’ADN fractionnées(sondes) qui représentent tout le génome
Permet de comparer l’ADN d’un patient à un ADN de référence et de déceler des:
- Surplus de séquences p/r à cet ADN de référence : duplication de la séquence pour le patient
- Pertes de séquences p/r à cet ADN de référence: délétion pour le patient

81
Q

Types de micropuce

A

BACs
- Sondes de la taille d’une sonde de FISH
- Résolution de l’analyse moins grande
Oligonucléotides
- Meilleure résolution vs BACs
- Sondes oligonucléotides: fragments d’ADN d’env 60 pb
- Oligonucléotides avec ou sans marqueurs SNPs
- Résultat techniquement plus fiables et technique plus rapide

82
Q

Détection des variants du nombre de copies (CNV)

A

-1Kb ad quelques Mb
Déséquilibré: délétion, duplication, triplication,
Sont des variations fréquentes dans le génome normal:
- Seraient présents dans 5-13% du génome
- 11 700 cnvs décrits sur 1000 gènes
- La majorité sont rares
La plupart non pathogénique, à distinguer de ceux qui entraînent un phénotype (pathogéniques)
- Rôle dans la diversité biologique?, maladies complexes?, certains syndromes
But de l’analyse de micropuce: détection de CNV pathogénique expliquant le phénotype du patient

83
Q

Avantages de l’hybridation génomique sur micropuce

A

Raffiner l’analyse chromosomique à une résolution de quelques dizaines de kb et donc de poser un dx chez un plus grand nombre de sujets (env 25%)
Meilleure sensibilité pour la détection de duplication que la FISH
Allie la précision de FISH et l’approche d’évaluation globale du génome du caryotype
- Ne nécessite pas de savoir ou cibler dans le génome au préalable
Ne nécessite pas de cellules en division (extraction d’ADN)

84
Q

Investigation par micropuce pour sujets avec

A
  • Retard intellectuel ou de dév
  • Désordres du spectre de l’autisme
  • Malformations congénitales, dysmorphies
    Recherche d’un déséquilibre chromosomique chez ces patiens
85
Q

Symptomes syndrome de microdélétion 1p36

A
  • Retard mental modéré à sévère
  • Dysmorphies
  • Cardiopathie cardiomyopathie
  • Difficultés alimentaires
  • Convulsions
86
Q

Désavantages/limites hybridation génomique sur micropuce

A
  • Ne permet pas de détecter les remaniements équilibrés (translocations, inversions, etc)
  • Ne permet pas de “voir” l’organisation cytogénétique du remaniement détecté
  • Limite quant à la détection des mosaïques (anomalie env 20% et plus détectable)
  • Polymorphismes sans conséquence du génome fréquents et parfois n’ont jamais été vus encore dans le labo
    La plupart sont rares (chez -2%pop)
    Impact sur le phénotype clinique pas tjrs clair
  • Risque de trouver aN pathogénique non reliée (en gènes cancer, à révélation tardive, porteurs)
87
Q

Critères pour déterminer pathogénicité d’une del ou dup

A
  • Taille du remaniement
  • Survenu de novo, MAIS présence de remaniement de novo chez 1% des contrôles. Certains parents peuvent avoir un phéno plus léger ou non exprimé
  • Type de gènes impliqués et lien avec le phénotype (le plus fort)
  • Remaniement déjà décrit avec phénotype semblable dans la littérature ou les bases de données
  • vs région connue comme polymorphique
88
Q

Recommandations analyse de micropuce

A

Utilisation en première ligne de la CGH sur micropuce pour les patients avec
- Retard mental ou dév
- Autisme
- Malformations
Confirmation des remaniements par caryotype, FISH ou autres méthodes moléculaires
Conseil génétique pré-test et post-test nécessaire
Non indiqué pour rechercher des remaniements équilibrés car non détectables par cette méthode. Si phénotype clair d’anomalie chromosomique précise

89
Q

Indications de caryotype

A

Recherche de remaniements chromosomiques équilibrés:
- Couples avec avortements spontannés répétés
- Infertilité
- Histoire familiale d’un tel remaniement
Recherche de mosaïcisme
Phénotype clinique clair d’une anomalie chromosomique détectable par caryotype comme trisomie 21

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