Genetik Del1 Flashcards
1
Q
Vad är komplett dominans?
A
Att även om en organism ex. har två olika alleler för ett karaktärsdrag är det endast egenskapen av en av dessa aller som observeras i fenotypen. Alltså heterozygoten har fenotypen av en av homozygoterna.
2
Q
Vad är inkomplett dominans?
A
Det är när heterozygoten har fenotypen som är mellan de båda homozygoterna.
3
Q
Vad sker med genotypfrekvensen och fenotypfrekvensen i inkomplett dominans?
A
De är densamma eftersom det finns 3 olika fenotyper kommer den överensstämma med de tre möjliga genotyperna. Alltså 1:2:1
4
Q
Vad är kodominans?
A
När fenotypen av båda homozygoterna uttrycks samtidigt.
5
Q
Vad kan hända med dominsansen beroende på vilken nivå man tittar på?
A
Den kan bli olika ex. om man tittar molekylärt kan dominansen vara codominant då båda allelerna uttrycks men om man kollar på en fysiologisk nivå kan den antas vara recessiv.
6
Q
Vad är karaktärsdragen av dominans?
A
Det är interaktionen mellan gener på samma locus, det är interaktioner mellan alleler. Den har inte ansvar för hur gener ärvs utan influerar bara hur fenotypen uttrycks. Slutligen typen av dominans som finns beror på vilken nivå som fenotypen undersöks.
7
Q
Vad är penetrans?
A
Penetrans är procenten av att en individuell organism som har en viss genotyp har fenotypen som förväntas uttryckas.
8
Q
Vad är uttrycksförmåga?
A
Det är graden av vad en egenskap uttrycks
9
Q
Vad kan skapa inkomplett pentrans och uttrycksförmåga?
A
Andra gener och miljöfaktorer
10
Q
Vad är en dödsalleler?
A
De skapar död vid ett tidigt stadie av utveckling
11
Q
Vad är ressesiva dödsgener?
A
Det är gener som tar död på homozygoter och skapar ration 2:1
12
Q
Vad är dominanta dödsgener?
A
Det är gener som tar död på båda heterozygoter och homozygoter för den allelen. De är inte lika vanliga i naturen
13
Q
Vad händer om ett locus har flera alleler?
A
Det ärvs fortfarande endast två men variationen inom organismerna är större eftersom det finns fler aller att “välja på”
14
Q
Vad är Epistas?
A
När en gen maskerar en annan gen vid ett annat locus
15
Q
Vad kallas den gen som maskeras och den gen som blir maskerad?
A
Epistas gen och hypostas gen
16
Q
Vad är “Sex-influenced characteristics”?
A
De kommer från autosomala gener och är nedärvda enligt mendels principer men uttrycks olika i hanar och honor. Finns mer av hos olika kön
17
Q
Vad är “Sex-limited characteristics”
A
Bestäms av autosomala gener men uttrycks endast i ett kön och har noll pentetrans hos det andra könet.
18
Q
Vad är cytoplasmatisk nedärvning?
A
Det är nedärvningen av genomet som finns i cytoplasman så som mitokondriens DNA
19
Q
Hur många nukleotider och generfinns det i mitokondriens DNA?
A
Det finns runt 16.569 stycken nukleotider och ungefär 37 gener
20
Q
Hur många nukleotider och gener innehåller DNA:t i kärnan?
A
Det innehåller 3 billioner nukleotider och ca 20.000 gener
21
Q
Hur nedärvs cytoplasmatiskt DNA?
A
Den ärvs endast från en förälder och det är oftast från ägget.
22
Q
Vad blir skillnaden i frekvensen av uttrycken hos cytoplasmatiska gener?
A
De fördelas inte genom mitos eller meios som hos kärn DNA:t utan kommer slumpmässigt. Vilket gör att det kan vara större fenotypisk skillnad mellan individer med ex. samma föräldrar.
23
Q
Vad är maternell effekt?
A
Generna ärvs av båda föräldrarna men “barnets” fenotyp bestäms inte av sin egen genotyp utan mammans.
24
Q
Vad är genetisk prägling?
A
När uttrycket av en autosomal gen påverkas av vilken förälder den ärvs ifrån.
25
Hur ser den sexuella cykeln ut i de flesta eukaryoter?
Det består av en diploid och en haploid fas där den haploida fasen består av meiosen och den diploida av att zygoten blir befruktad.
26
Vad är monoecy och dioecy?
Det är när en organism har ett kön eller två kön på olika individer
27
Hur ser X och Y fördelningen ut hos spermier?
Halva av spermierna får en X kromosom och andra halvan får en Y kromosom
28
Hur ser X fördelningen ut hos äggcellen?
Den har alltid endast en X kromosom
29
Vad kallas X och Y kromosomerna av ett gemensamt namn?
De kallas könskromosomer
30
Vad kallas de kromosomer som är samma för både hannar och honor?
De kallas autosomala kromosomer
31
Vad innefattar i XX-XO könsbestämmning?
Det betyder att könet bestäms av spermien, halva av spermierna har en X kromosom och den andra halvan har ingen könskromosom. Om ägget blir befruktat med den med X blir det en hona om den befruktas med en som inte har en könskromosom blir det en hanne.
Hanen är heterogametisk och honan är homogametisk
32
Vad är ett exempel på något djur som har XX-XO systemet
Gräshoppor
33
Vad är XX-XY könsbestämmning?
Det är när hanen och honan har lika många kromosomer men där hanen har en mindre y kromosom. Hanen är heterogametisk och honan är homogametisk
34
Ge exempel på någon organism som har XX-XY könsbestämmning
Människor, däggdjur
35
Ge exempel på kvantitativa karaktärsdrag
Det kan vara höjd, vikt, mjölkproduktion hos kor
36
Vad är två egenskaper hos ett kvantitativt karaktärsdrag?
De är polygena, alltså influerade av flera gener på olika loci, miljöfaktorer påverkar fenotypen.
37
Vad är definitionen av ett kontinuerligt karaktärsdrag?
Att det teoretiskt kan ha vilket värde som helst mellan två extremer, fenotypen är alltså endast begränsad av hur bra man kan mäta den.
38
Vad är meristiska karakärsdrag?
De har en begränsad antal fenotyper ex. djurkull men faktorn till dessa egenskaper bestäms av många olika fakoter.
39
Vad är tröskel karaktärsdrag?
Det är karaktärsdrag som antingen finns eller inte finns, men bestäms av flera olika faktorer både genetiskt och miljömässigt
40
Vad är ZZ-ZW könsbestämmning?
Det är när honan är heterogametisk medan hanen är homogametisk. Alltså bestäms könet av vilket ägg som blir befruktat. Det är finns bland annat hos fåglar och fjärilar
41
Vad är Genic sex determination?
Det är när det inte finns en uppenbarlig skillnad mellan autosomala kromosomerna och de som bestämmer kön, det finns alltså inga könskromosomer. Det här finns hos fiskar, svamp
42
Vad är miljöstyrd könsbestämmning?
Det är när miljön bestämmer könet hos en organism ex. toffelsnäckor där larven som sätter sig på en bottenyta blir till en hona och sedan attraherar en larv som sätter sig på honan och blir en hane pga detta. Eller ex. olika temperaturer när fostret utvecklas.
43
Vad är det som avgör om det blir en hane?
SRY på Y kromosomen
44
Varför är Y kromosomen mindre än X?
Därför att den inte har överkorsning och kan muteras har det genetiska materialet "försvunnit" från den. Därför är de flesta nedärvda köns länkade karaktärsdragen ärvda från X kromosomen
45
Vad beskrivs Män som istället för Heterozygot, homozygot och varför?
De har bara en allel från X kromosomen och saknar en på Y kromosomen därför blir de hemizygoter
46
Vilket mönster finns det på Y länkade karaktärsdrag när det kommer till nedärvning?
De är ärvda av pappan och ärvs endast till sönerna och alla kommer ha dessa karaktärsdragen
47
Varför är människor svårt att göra genetiska studier på?
1. Ett man kan inte kontrollera parningen, eftersp, kärlek finns.
2. De har lång generationstid tillskillnad från bakterier som har 20 min.
3. Familjestorlek är små vilket gör att man inte kan uppfatta statistiska mönster.
48
Vad används för att förstå nedärvning hos människor?
Pedigree analys
49
Vad är en pedigree analys?
Det är en illustrerad representation av familje historia som ett familje träd som visar ärftligheten av ett karaktärsdrag
50
Vilka symboler har kvinnor och män i pedigree?
Kvinnor är cirklar och män är fyrkantiga
51
Vad betyder ifyllda symboler i pedigree?
Att de har karaktärsdraget som man tittar på
52
Vad är karaktärsdragen för Autosomal recessiva egenskaper?
Lika stor frekvens i båda könen, uppkommer bara när någon ärver båda allelerna för egenskapen. Det kan se ut som den skippar en generation om båda föräldrarna är heterozygota
53
Vad är karaktärsdragen för Autosomal dominanta egenskaper?
De finns hos båda könen i lika stor frekvens, de hoppar inte över någon generation
54
X länkade ressesiva
Finns oftare hos män än hos kvinnor eftersom män endast behöver en medan kvinnor båda. Den ärvs inte från far tilll son
55
X länkade dominanta
De finns både hos kvinnor och män, kan vara mer hps kvinnor. Varje sjuk person måste ha en sjuk förälder, den hoppar inte över en generation. Män som är sjuka skickar det till sina döttrar men ingen av deras söner.
56
Y-länkade
Inga av döttrarna blir påverkade, alla sjuka mäns söner blir det.
57
Vilka är de tre stora grupperna organismer?
Arkéer, prokaryoter och eukaryoter
58
Vad är skillnaderna mellan eukaryoter och prokaryoter?
Eukaryoter har en cellkärna där det mesta av genetiska materialet finns, medan i prokaryoter flyter det fritt i cytosolen. DNA i eukaryoter är också tätt packade runt histoner som bildar kromosomer som tillsammans kallas kromatin. Bakterier har inte histoner utan är oftast en enda cirkulär molekyl av DNA
59
Vad består virus av ?
En yttre protein kapsel med en nukleinsyra innuti (RNA eller DNA)och de kan bara reproducera i en värdcell
60
Vilka är de tre fundamentala händelserna som måste hända för framgångsrik förökning?
1. Genetisk information måste bli kopierad
2. Kopiorna måste bli sepererade från varandra
3. Cellen måste dela på sig
61
Vad är binär fission?
Prokaryota cellers sätt att föröka sig på
62
Hur går Binär fission kortfattat till?
Replikationen utgår från oriC (origin of replication) och sedan rör sig dessa kromosomer från varandra på motsatta sidor av cellen. SMC cirkulerar kromosomerna så att de inte fastnar i varandra. En cellvägg skapas med två likadana kopior av kromosomen i varandra.
63
Hur många kromosomer har människor?
46
64
Vad heter de kromosomer som står för alleler för samma sak?
Ett homolohy par
65
Vad heter celler som har samma genetiska information 2 gånger?
Diploid
66
Vad heter celler som endast har en uppsättning av genetisk information?
Haploid
67
Vad kallas de som har mer än 2 uppsättningar av genetisk information?
Polyploid
68
Vilken form har eukaryoters DNA?
Den är linjär
69
Hur kan DNA få plats i cellkärnan hos eukaryoter?
De är hårt packade runt histoner (proteiner)
70
Vad är tre element av en kromosom?
Centromer, origin of replication och telomer
71
Vad är centromeren och dess funktion på en kromosom?
Det är en sammandragen region på kromosomen som fungerar som en fästpunkt för spindlen gjord av mikrotubili
72
Hur fäster spindlen fast i centromeren på en kromosom?
Ett multiprotein komplex kallat kinetochorer sitter på centromeren och mikrotubli fäster på denna.
73
Vilka är de olika formerna av kromosomer kopplat till centromeren?
Submetacentrisk, metacentrisk, telocentrisk och acrocentrisk
74
Vad är telomerer och vad är deras funktion i anslutning till kromosomer?
De är ändar på kromosomerna och stabiliserar dem, som ett plastlock på ett skosnöre. De gör så att DNA som kodar för någonting inte bryts ner under kopieringen och förhindrar att det inte påverkar viktiga funktioner.
75
Vad är Origin of replication?
Det är där DNA syntetiseringen börjar
76
Vad heter kromosomerna när de kopierat sig själv inför celldelning?
Syster kromatider
77
Vilka två faser består cellcykeln av?
Interfas och Mfasen
78
Vad är interfas?
Fasen mellan celldivisioner, det är då cellen utvecklas, växer och utför sin funktion
79
Vad är Mfasen?
Det är då celldivisionen sker, detta inkluderar mitos och cytokines
80
Vad är mitos?
Själva kärndelningen
81
Vad är cytokines?
Det är delning av cytoplasman
82
Vilka faser består interfas av?
G1, G2 och S
83
Vad händer under G1 fasen?
Det är då cellen gör alla proteiner som utför celldivisionen, cellen är i den här fasen tills den kan dela sig.
84
Vad är G0 fasen?
Om cellen förberett sig för att celldelas och är i G1 kan den gå tillbaka pga regulatoriska signaler gå tillbaka till G0 som är en stabilfas där cellen inte växer osv. Den kan gå in i G1 igen eller stanna
85
Vilken fas kommer efter G1
S fasen
86
Vad innebär S fasen?
Kromosomerna duplikeras efter denna fasen är varje kromosom två systerkromatider
87
Vad är G2 fasen?
DNA:t kontrolleras så att det är perfekt kopierat så att det kan gå in i Mfasen.
88
Hur ser kromosomerna ut i interfas?
De är inte kondonserade men inte heller upprullad. Individuella kromosomer kan inte synas
89
Vilka faser är Mfasen uppdelad i?
Profas, prometafas, metafas, anafas och telofas (inkl. cytokines)
90
Vad pågår i profas?
Kromosomerna är kondenserade och syns i ljusmikroskop, detta pga en grupp protein kallade condensin. Den mitotiska spindlen skapas från centrosomerer som vandrar till två olika poler av cellen.
91
Vad innehåller centromeren?
Centrioler
92
Vad händer under prometafas?
Kärnmembranet löses upp, mitotiska spindlen fäster vid kinetochorerna från två olika poler
93
Vad händer under metafasen?
Kromosomerna ställs upp längs metafasplanet
94
Vad händer under anafasen?
Systerkromatiderna separeras och är början av anafasen. De rör sig mot motsatta spindelpoler
95
Vad händer under telofasen?
Den börjar när kromosomerna träffar spindelpolerna. Kärnmembranet formas igen runt kromosomerna och de dekondenseras. Division av cytoplasman.
96
Hur många celler skapas av en celldivision?
två identiskt lika celler. Varje celldivision ser till så att varje cell har samma uppsättning av systerkromatiderna. Men det görs inte samma med cytoplasman vilket gör att inte varje cell har samma uppsättning av cytoplasman
97
Var hittar man bakterier?
Överallt i på alla tänkbara ställen
98
Vad är en prokaryot?
En encellig organism som inte är kärnmembran eller membranförsedda organeller.
99
Vad innehåller media som bakterier växer i när man studerar dem i lab?
De innehåller oftast en kolkälla, essentiella näringsämnen som kväve och fosfor, vitaminer och andra joner och näringsämnen.
100
Vad är prototrofiska bakterier?
Vildtypsbakterier som kan använda sig av näringsämnena i ett minimalt medium för att syntetisera de ämnen som behövs för tillväxt och reproduktion
101
Vad är auxotrofiska bakterier?
De är mutanter som inte har en eller flera enzymer som är nödvändiga för att syntetisera essentiella föreningar och måste ha dessa supplementerade i sitt tillväxt medium
102
Vad kallas det medium som även auxotrofiska bakterier kan växa på?
Ett komplett medium
103
Hur odlar man bakterier i labb?
Antingen i ett teströr eller på en agarplatta, med buljong där de växer och utför binär fission tills näringen tar slut eller de restprodukterna från bakterierna når en koncentration som är giftig för dem
104
Hur använder man en agarplatta?
Man sprider ut en lösning med bakterier på den och när bakterierna växer och dividera sig uppstår det klumpar med genetisk identiska bakterier.
105
Hur vet man om man odlar en auxotrof bakterie sträng?
Man pläterar bakterierna i distinkta kolonier på en agarplatta med komplett medium. När de sedan har växt för man över kolonierna till både en platta med komplett medium och ett minimalt medium. Genom att jämföra kolonierna på båda och se vilka som saknas på det minimala mediumet vet man vilken som är auxotrof
106
Hur många baspar har ett generellt bakterie genom?
Ca 4.6 millioner baspar
107
Vad är det vanligaste som bakterie gener kodar för?
Proteiner
108
Vad är en plasmid?
Det är en liten cirkulär DNA molekyl som skiljer sig från bakteriens kromosom. De bär oftast på gener som inte är essentiella för bakteriens funktion men som kan tillföra fördelar under levnadstiden ex. antibiotika resistens
109
Vad innehåller plasmiden?
En origin of replication vilket gör att den kan kopiera sig oberoende av bakterie kromosomen.
110
Vad är en episome?
Det är plasmider som kan replikeras fritt och integreras in i bakterie kromosomen. F faktorn av E.choli bakterien är en episom
111
Vilka är de tre olika mekanismerna med vilket bakterier utbyter genetiskt material?
Konjugation, transformation och transduktion
112
Vad är konjugation kortfattat?
Är när generna utbytes mellan bakterier direkt
113
Vad är transformation kortfattat?
När bakterier tar upp DNA från sin omgivning
114
Vad är transduktion kortfattat?
När bakteriofager bär DNA från en bakterie till en annan
115
Vad är skillnaden mellan genetiskt utbyte hos bakterier och diploid eukaryotisk sexuell reproduktion?
DNA utbyte och reproduktion hänger inte ihop utan bakterier kan genomgå binär fission utan att få DNA från enn annan. DNA som inte rekombineras i värdcellen blir degraderat
116
Vad heter E.coli's plasmid?
F faktorn
117
Vad heter celler som har F faktorn?
F+ celler
118
Vad heter celler som inte har F faktorn?
De heter F- celler
119
Vad innehåller f faktorn?
Gener som gör det möjligt för konjugation och ett origin of replication. Vissa gener kodar för sexpilin
120
Vad är sex pili?
Det är ett cellmembran utskott som produceras av F faktorn och vilken gör kontakt med en receptor på en F- cell och drar cellerna mot varandra.
121
Vad händer efter att sex pillin har dragit cellerna mot varandra?
En cytoplasmatisk brygga skapas och DNA blir utbytt från F+ cellen till F- cellen.
122
Hur transporteras F faktorn över till F- cellen?
Det blir ett hack i f faktorn på origin of transfer (oriT) och förs över till F- cellen. F faktorn replikeras i donatorn och ersätter strängen som förs över. Eftersom det alltid blir ett jack i oriT är det denna som först kommer in i mottagaren. Strängen replikeras i mottagaren och den blir en F+ cell
123
Vad är Hfr celler?
Det är celler där F faktorn har integrerats i bakteriens kromosom
124
Vad är likheterna mellan F+ och Hfr celler?
De kan båda skicka ut sex pili och utföra konjugation med F- celler
125
Vad är skillnaden mellan Hfr och F+ konjugation
Eftersom F faktorn är integrerad med bakteriens kromosom följer en bit av denna med under konjugationen. Hur mycket beror på hur lång tid cellerna sitter ihop. Väl innuti cellen sker det en överkorsning med F-cellens kromosom. Det är endast de rekombinerade DNA:t som är kvar resten blir degenererat.
126
Varför blir inte en F- cell, Hfr eller F+ cell när det sker en konjugation från en Hfr cell?
Det kan va så att den inte får med sig hela F faktorn i utbytet då jacket är i mitten. För att bli en Hfr eller F+ cell måste hela bakteriens kromosom föras över vilket nästan aldrig händer eftersom de inte sitter ihop tillräckligt länge
127
Vad är F´celler?
När F faktorn blir utskuren ur bakteriens kromosom kan det hända att det följer med lite av gener från bakterie kromosomen. Dessa bärs sedan av F plasmiden. Dessa kallas F´celler
128
Kan F´utföra konjugation med F- celler?
Ja eftersom de har en hel F faktor som har allt DNA möjligt för att göra detta.
129
Vad sker med cellerna som motar en F plasmid från en F´cell?
De blir delvis diploida eller merozygoter (celler med två kopior av vissa gener)
130
Vad behövs för att göra en lyckad transformation?
Upptagandet av DNA från omgivningen och inkorporeringen av DNA till bakteriens kromosom eller plasmid
131
Vad innebär det att en bakterie är komptetent?
Celler som kan ta upp DNA genom cellmebranet
132
Vad influerar kompetens?
Tillväxtstadiet, koncentrationen av DNA i omgivningen och miljöfaktorer
133
Vad händer under transformation?
En av DNA strängarna bryts ner och en av dem åker över membranet och överkorsas med genomet två gånger.
134
Vad kallas de celler som får DNA genom transformation?
Transformanter
135
Vad är olika sätt som kan göra att en cell mer kompetent?
Ex. behandling av kalcium klorid, värme, elektriskt fält
136
Vilka gener kotransformerar inte?
De som är långt i från varandra eftersom de inte finns på samma DNA fragment
137
Vad är horisontell genöverföring?
När genöverföringen sker mellan olika arter av individer.
138
Vad är vertikal genöverföring?
När det ärvs från ex. föräldrar
139
Vad är olika sätt som en bakterie kan skydda sig mot virus?
Utsöndring av polysaccharider, CRSPR-Cas, stänga av receptorer, ta död på sig själv.
140
Vad är bakteriofager?
Det är virus som infekterar bakterier
141
Vilka är de två livscyklerna av bakteriofager?
Lytiska cykeln och lysogeniska cykeln
142
Vad är den lytiska cykeln?
När ett virus injecerar sitt DNA in i cell, degraderar den värdcellens DNA och fagens DNA blir replikerat. Nya fagpartiklar skapas och producerar enzymer som gör att värdcellen öppnas och släpper ut fagerna
143
Vad är virulenta fager?
Det är fager som alltid förökar sig genom den lytiska cykeln och tar alltid död på sina värdceller
144
Vad är temperata fager?
De kan både genomgå lytisk och lysogenisk cyklerna
145
Vad är den lysogeniska cykeln?
Fag DNA:t integreras in i bakterie kromosomen och blir en inaktiv profag. Profagen replikeras med bakterie kromosomen till den nya generationen. Medan den är infekterad av en profag kan den inte bli infekterad av samma typ av fag. Stimuli kan få profagen att brytas loss från kromosomen och ingå i ett lytiskt tilltstånd.
146
Hur ser man lyserade celler på en agarplatta?
Genom plack vilket är en fag som har lyserat massa celler
147
Vad är generell transduktion?
Vilken gen som helst överförs
148
Vad är specialicerad transduktion?
Bara ett fåtal gener överförs
149
Vad händer under transduktion?
När fagen bryter ner bakterie kromosomen kan ibland en bit av denna inkorporeras i fagens hölje. När fagen infekterar en annan bakterie följer bakteriens DNA med och släpps ut. Vilket gör att de kan bli integrerade i värdcellens DNA.
150
Vad kallas fager som utför transduktion?
Transducerande fager
151
Vad kallas de bakterier som har genomgåt transduktion?
Transduktanter
152
Vilka tre hierarkiska nivåer kan DNA ses utifrån?
Primära är nukleotidsekvenserna, den sekundära är dubbelhelixen, den tredje är den packade versionen av DNA
153
Vad är supercoiling?
Det är hur DNAt är snurrat runt omkring sig själv.
154
Vad är det som får DNA:t att snurra sig?
topoisomeras
155
Varför är det mesta DNA:t negativt supercoiled?
det gör att seperationen av DNA strängarna inte kräver lika mycket energi.
156
Vad kallas klumpen som bakterierns DNA är samlat som?
Nukleoid
157
Vad kallas komplexet av histoner och DNA?
kromatin
158
Vad är eukromatin?
Det kromatinet som kopieras och är aktivt
159
Vad är heterokromatin?
Det är det kromatinet som alltid är mycket kondenserat i cellen
160
Vad är principen av segregation?
Varje diploid organism har två alleler på ett locus och dess separeras under meiosen och en allel hamnar i varje gamet
161
Vad är principen om oberoende sortiment?
att två alleler på ett locus separeras oberoende av alleler på andra loci
162
Vad kallas gener som sitter nära varandra på kromosomen?
Länkade gener och de formar länkade grupper
163
Vad händer med gener som sitter nära varandra på kromosomen?
De sorteras inte oberoende av varandra
164
Vad händer med gener under överkorsning?
De byter plats och kromosomen kan få nya kombination av gener
165
Vad är complete linkage?
de sitter så nära varandra att det aldrig sker överkorsning
166
Vad kallas de gameter som innehåller samma alller som föräldrarna?
icke rekombinanter gameter
167
Vad heter de som har andra alleler än föräldrarna?
rekombinanter
168
När sker överkorsning?
Det sker under profas 1 i meiosen
169
Vad gör ribozymer?
Det är RNA molekyler som kan klippa delar av sina egna sekvenser, koppla ihop RNA molekyler tillsammans, replikera och katalysera peptid bindningar mellan aminosyror.
170
Vad består RNA molekylen av som är gemensamt för DNA?
Det är en polymer som har nukleotider som består av ett socker, fosfatgrupp och kvävebas som sitter ihop med fosfordiester bindningar.
171
vILKET SOCKER FINNS I dna?
Deoxyribos
172
Vilket socker finns i RNA?
ribos
173
Vad gör att RNA snabbt degraderas under basiska förhållande?
Eftersom ribos har en fri hydroxylgrupp på 2´kolet
174
Vad är en skillnad mellan kvävebaserna när det kommer till DNA och RNA?
RNA har uracil istället för thymin som i DNA
175
Vad är skillnaden i strukturen hos RNA och DNA?
RNA är oftast endast en sträng och också därför inte lika stabil som DNA
176
Vad är en hair-pin struktur?
När RNA molekylen formar en sekundär struktur genom att binda till komplementära sektioner på molekylen.
177
Vad gör sekundära strukturer av RNA versitila?
Genom att deras struktur formas beroende på vilka basersekvenser som är sammankopplade. Strukturen ger funktionen vilket gör att den kan göra mkt.
178
Vad är tre klasser av RNA?
rRNA (ribosomal RNA), mRNA (messenger RNA), tRNA (transfer RNA)
179
Vad gör rRNA?
De skapar strukturen tillsammans med ribosomalt protein subenheter för ribosomen. Alltså där protein sätts ihop
180
Vad gör mRNA?
De bär på den kodinstruktionerna för polypeptidkedja från DNA till ribosomen. De specifierar sekvenserna av aminosyrorna och är därför mallen för ihopsättandet av aminosyrorna.
181
Har bakterier mRNA?
Nej, transkriptionen och translationen sker samtidigt
182
Vad gör tRNA?
Det är länken mellan den kodande skevensen av nukleotider i mRNA och aminosyra sekvensen av polypeptidkedjan. tRNA sätter fast sig i en specefik aminosyra och inkorporerar den till en polypeptidkedja
183
Hur skapas RNA?
Det syntetiseras genom transkription från DNA
184
Vad är en av skillnaderna mellan replikation och transkription?
Under replikation så kopieras hela DNA strängen medan det endast kopieras en liten bit under transkriptionen.
185
Varför är det endast en liten del som kopieras under transkriptionen?
Eftersom inte alla genprodukter behövs samtidigt i cellen, mycket DNA kodar inte för en specifik produktion
186
Vad är de tre sakerna som krävs för transkription?
1. DNA mall
2. råmaterial för att bygga RNA
3. transkriptions apparatus, med protein som är nödvändiga för att katalysera och syntetisera RNA
187
Vad är mallen för RNA?
en av strängarna av DNA
188
Vad heter strängarna av DNA som är med i transkriptionen?
Template strand och nontemplate strand
189
Hur ser RNA molekylen ut som syntetiseras jämfört med template stranden?
Den är komplementär och antiparallel och har inte T utan U istället
190
Vad är en transkriptions enhet?
Det är en bit av DNA som kodar för en RNA molekyl och vars sekvenser är nödvändiga för transkriptionen
191
Vilka är de tre regionerna som transkriptions enheten består av?
promotorn, den kodande regionen och terminatorn
192
Vad är promotorn?
Det är en DNA sekvens som transkriptions apparaturen känner igen och binder sig till. Den indikerar vilken av DNA strängarna som ska läsas som template och vilken riktning den ska ske i. Den transkriberas inte själv
193
Vad är den RNA kodande regionen?
det är den sekvens av DNA nukleotider som kopieras till RNA molekylen
194
Vad är terminatorn?
Det är en sekvens av nukleotider som signalerar när transkriptionen ska avslutas. transkriptionen avslutas endast när terminatorn har lästs av.
195
Vilken riktning rör sig transkriptions apparaturen?
Downstream
196
Hur skrivs the nontemplate strand?
Med 5´änden till vänster och 3´änden till höger
197
Hur märker man nukleotider i transkriptionen?
Den första nukleotiden som blir transkriberad märks +1. Nukleotider som går downstream från transkriptionens start punkt är märkta + och de upstreams är -
198
Hur sätts nukleotiderna ihop i RNA syntetiseringen?
De sätts på 3´änden av OH gruppen. De sätts alltid på 3´änden
199
Vilket enzym sköter transkriptionen?
RNA polymeras
200
Hur många enheter består bakteriers RNA polymeras av?
5
201
Vad heter de fem subenheter som RNA polymeras består av?
2 stycken alpha, beta, beta prime och omega.
202
Vad är speciellt med omega subenheten?
Den är inte nödvändig för transkriptionen men den används för att stabilisera enzymet
203
Vad är och gör sigma faktorn?
Den kontrollerar bindningen av RNA polymeras till promotorn och behövs endast i början och släpper efter att några nukleotider har bundits ihop.
204
Vilka tre olika RNA polymeras finns det oftast hos eukaryota celler?
RNA polymeras 1 som transkriberar rRNA, RNA polymeras II transkriberas pre-mRNA osv. RNA polymeras III som transkriberar andra små RNA molekyler såsom tRNA
205
Hur stora är eukaryotas RNA polymeras?
De har oftast mer än ett dussin subenheter
206
Vilka är de tre faserna under transkription?
1. innitiering
2.Elongering
3.termination
207
Vad händer under initiationen kortfattat?
När transkriptions enheten monteras på promotorn och börjar syntetisera RNA
208
Vad händer under elongeringen kortfattat?
DNA rörs genom RNA polymeras och detta varvar upp DNA och adderar nukleotider en i taget till 3´änden av RNA strängen
209
Vad händer under terminationen kortfattat?
Erkännandet av änden av transkriptions enheten och seperationen av RNA molekylen från DNA mallen
210
Vilka steg behöver utföras under initiationen som gör det möjligt för RNA syntes?
1. Att promotorn känns igen
2. formation av transkriptions bubblan
3. skapandet av de första bindningarna av rNTPs
4. lossnandet av transkriptions enheten från promotorn
211
Vad är rNTP?
Det är var RNA består av, de innehåller en ribos och en bas med 3 fosfatgrupper satta till den.
212
Vad är gemensamt för promotorer?
De består ofta av korta sekvenser som är vanliga hos många och de sitter relativt till transkriptionens start ställe på samma plats som de flesta promotorer
213
Vad kallas de sekvenser som det är vanligast att stöta på hos promotorer?
konsensussekvenser
214
Vilken är den vanligaste konsessekvensen i bakteriepromotorer?
-10 konsensussekvensen
215
Vilka nukleotider innehåller den?
TATAAT
216
Vad är viktigt att komma ihåg med konsensussekvenserna?
Det är de vanligaste nukleotiderna som träffas på på dessa plaser.
217
Vad är en annan vanlig bakterie promotor sekvens?
TTGACA
218
Vart sitter TTGACA?
-35 upstream och kallas därför -35 konsensussekvensen
219
Vad är speciellt för nukleotiderna mellan -10 och -35 konsensussekvenserna?
De varierar extremt mellan promotor och promotor
220
Vad gör sigmafaktorn?
Den binder till kärnan av RNA polymeras och bildar ett holoenzym vilken sedan binder till -35 och -10 sekvenserna
221
Vad är den tredje konsensussekvensen som finns hos bakterier?
Upstream element A-T par vid -40 och -60
222
Vad gör RNA polymeras i början av transkriberingen?
Den är positionerad vid början av transkriptionens start plats +1 och har virat upp DNA för att få en template strand och sedan parar den rNTP med första basen på template stranden
223
Hur bedöms start platsen för transkriptionen?
Genom positionen av konsensussekvenserna
224
Behövs det en primer till transkriberingen?
Nej
225
Vad händer när rNTP binds till strängen?
två eller tre fosfatgrupper klipps bort medans den sätts på 3' änden av RNA molekylen.
226
Vad händer med RNA polymeras i början av elongeringen?
Den ändrar sin komformation och kan inte längre binda till konsesussekvenserna i promotorn
227
Varför "vill" RNA polymeras inte längre binda till promotorn?
För att fortsätta transkriptionen längs template strängen
228
Hur rör sig RNA polymeras längssträngen?
Den rör sig downstream på mallen och virar upp DNA på den ledande delen av transkriptions bubblan
229
Hur stor är transkriptions bubblan?
Den är 18 nukleotider lång
230
Vad händer i transkriptions bubblan?
RNA syntetiseras kontinuerligt
231
Varför pausar RNA polymeras?
Ec. sekundära strukturer, nukleosomer eller backtracking
232
Vad är backtracking?
När RNA polymeraset backar längs DNA templat strängen, 3' OH gruppen av RNA molekylen kopplar av och stoppar temporärt RNA syntetiseringen
233
Vad stoppar backtracking i just bakterieceller?
Transkription och translation är tätt sammankopplade och därför stoppar närvaron av mRNA som är bakom RNA polymeras
234
Varför finns backtracking?
Det är en form av korrekturläsning
235
Vad händer när RNA polymeras inkorporerar fel nukleotid?
Den backtrackar och klyver de sista två nukleotiderna
236
När stoppar RNA polymeras att lägga till nukleotider till 3´änden av RNA molekylen?
När den har transkriberat terminatorn
237
Vilka event händer i slutet av transkriptionen?
Stopp av syntetisering av RNA, RNA måste släppa från RNA polymeras, Släppas från DNA, RNA polymeras måste släppa från mallen
238
Vad är rhofaktorn?
Protein som styr terminationen av transkriptionen
239
Hur ser rho-oberoende terminatorer ut?
De har omvända repetioner, och de har 7-9 adenin nukleotider efter de inverterade upprepningarna
240
Vad är en inverterad upprepning?
Det är sekvenser av nukleotider på samma sträng som är omvända och komplementära
241
Vad gör inverterade upprepningar (inverted repeats=
De skapar hårnålstrukturer
242
Varför har terminatorerna flera adenin nukleotider efter varandra?
De skapar fler uracil i RNA strängen vilket gör att RNA syntetitas pausar och hårnålstrukturen som skapas av inverterade upprepningar hinner skapas.
243
Varför skapas en hårnålstruktur?
Den destabiliserar DNA-RNA parningen och får dem att separera från varandra.
244
Vad är skillnaderna mellan Eukaryota cellers transkription och prokaryota?
Eukaryota celler har tre olika RNA polymeras som transkriberar tre olika promotorer.
245
Vad är exempel på att underlätta uppvarvningen av DNA?
Acetyltransferas som adderar acetyl grupper på aminosyrerna som finns på histonproteinet vilket destabiliserar nukleosomstrukturen
246
Vad är det som känner igen promotorn i Eukaryota cellers transkription?
proteiner som binder till promotorn och sedan rekryterar specifika RNA polymeras
247
Vad är transkriptions faktorer?
De påverkar vilken nivå transkriptionen sker på.
248
Hur skapas den basala transkription apparaten?
Genom att generella transkriptions faktorer kombinerat med RNA polymeras
249
Vad finns det vanligtvis i en promotor för RNA polymeras II
core promotern, regulatoriska promotorn
250
Vad är core promotor?
Den ligger uppströms nästan intill transkriptions startpunkt och är den plats den basala transkriptions apparaten binder
251
Vad är TATA box?
Det är en core promotor hos eukaryota celler och är en av den vanligaste. Den har konensussekvensen TATAAA och är lokaliserad -25 -30 bp uppströms
252
Vad är regalotory promotor?
Ligger precis bredvid core promotor uppströms, Här binder transkriptions faktorer och påverkar vilken frekvens transkriptionen sker.
253
Vad händer under initiationen av transkriptionen hos eukaryoter?
Regulatoriska protein binder till DNA nära promotorn och modifierar kromatin strukturen så att transkriptionen kan ske.
254
Vad består den basala transkription apparaten av?
Den består av RNA polymeras II, generella transkriptionsfaktorer, komplex av protein som kallas mediatorer
255
Exempel på generella transkriptions faktorer?
TFIIA, TFIIB
256
Vad är preinitation komplexet?
Det är kombination av RNA polymeras II, generella transkription faktorer när de har bundit vid promotorsekvensenV
257
Vad motsvarar sigma faktorn i Eukaryota?
Generella transkriptions faktorer
258
Vad är första steget för initiationen?
Att TFIID binder till TATA boxen i promotorn
259
Vad gör TFIID?
Den böjer DNA och öppnar upp det
260
Vad händer med DNA och polymeraset när RNA polymeras II och de generella transkriptions faktorerna binder till promotorn?
Det sker komformations förändring och DNA:t öppnas upp så att mallen blir tillgänglig
261
Vad händer efter att det öppna komplexet formas?
fosfatgrupper från rNTPs klyvs bort och nukleotider sätts ihop för att forma RNA molekylen
262
När börjar RNA polymeras röra på sig från promotorn?
Efter ca 30 bp har blivit syntetiserade
263
Vad händer med de generella transkriptions faktorerna när RNA polymeras rör sig från promotorn?
De stannar oftast kvar för att effiktevisera att en ny transkription kan påbörjas.
264
Vad är exoner?
Exonen är den del av nukleotidsekvensen i en gen som kodar för det slutliga proteinet
265
Vad händer med introner och exoner under den initiala transkriptionen?
De båda transkriberas in i RNA:t
266
Vad händer med intronerna under transkriptionen eller efter den?
De tas bort och exonerna sätts i hop för att skapa ett moget RNA
267
Är introner vanliga i bakterie celler?
Nej
268
Hur ser skillnaden mellan längd och antal när det kommer till introner och exoner?
Introner är oftast längre och fler i gener
269
Vilka fyra variationer finns det av introner?
Grupp 1, grupp 2, kärn pre-mRNA, transfer RNA
270
Hur skiljs grupperna åt?
Beroende på hur de tas bort från RNA
271
Berätta kort om grupp 1 av introner
De finns i några gener av bakterier, bakteriofager och eukaryoter, de kan splitsa sig själva; de kan katalysera sin egen borttagning
272
Berätta kort om grupp 2 introner
De finns i mitokondria, kloroplaster, arkeer, och bakterier, de splitsar också sig själva, men det finns skillnad i hur de gör det från grupp 1
273
Berätta kort om nukleära pre-mRNA introner
De inkluderar introner som är lokaliserade i de gener som kodar för proteiner hos eukaryoter, splitsningen liknar grupp II men är inte själv splitsande utan kräver en spliceosom som innehåller små kärnRNA
274
Berätta kort om transfer RNA introner
De finns i tRNA gener i bakterier, arkéer, och eukaryoter och använder sig av enzymer för att klippa och föra ihop RNA
275
Vad är två generella regler med introner och splitsning processen?
1. all splitsning av pre-mRNA introner sker i kärnan 2. ordningen på exonerna i DNA är ofta den ordningen som hålls kvar i splitsat RNA
276
Vart sker proteinsyntesen?
I cytoplasman
277
Vad är mRNA?
De är de som är mallen för proteinsyntesen, den bär genetiskt material från DNA till ribosomen och hjälper till att sätta ihop aminosyror
278
Vad är skillnaden mellan bakterier och eukaryotas mRNA?
I bakterier transkriberas mRNA direkt från DNA molekylen men i eukaryota går den först genom pre-mRNA stadiet för att sedan bli mRNA
279
Vad är ett kodon?
tre nukleotider som kodar för en aminosyra
280
Vilka tre regioner finns det på mRNA i eukaryota celler?
5´otranslaterade regionen (5´UTR), proteinkodande regionen, 3´otranslaterade regionen (3´UTR)
281
Vad består 5'UTR av?
Det är en sekvens av nukleotider på änden av mRNA som inte kodar för någon aminosyra av ett protein.
282
Vad består bakteriers mRNA 5'UTR av?
En konsensussekvens kallad Shine-dalgarno sekvensen (AGGAGG) som binder till ribosomens bindningsplats under translationen
283
Vad består den proteinkodande regionen av?
Det är de kodon som specifierar aminosyra sekvensen av ett protein. Det börjar med ett start kodon och avslutas med ett stopp kodon
284
Vad är 3'UTR?
Transleras inte till en aminosyra utan fungerar för stabilitet av mRNA
285
Vart sker translationen och var sker transkriptionen?
Translationen sker i cellkärnan medan transkriptionen sker i cytoplasman
286
Vad ger att translationen och transkriptionen är delade i tid och plats för eukaryota celler?
En möjlighet att att modifiera RNA:t innan det transleras
287
Vad är 5'cap?
det är när en exta guanin sätts in på 5' änden av mRNA och metyl grupper på den extra basen. MEtylgrupper sätts ibland också på sockret först och andr aplats efter 7-methylguanosine
288
Vad gör 5'cap?
Proteiner känner igen och rör sig nedströms längs mRNA tills startkodonet och translation börjar. Den ger också stabilitet
289
Vad är Poly(A)svansen?
En modifiering av mRNA där flera (50-250) adenin nukleotider sätts på 3' änden. Den ger stabilitet vilket ökar längden som mRNA kan vara kvar och transleras.
290
Vad kallas de två ändena av introner och vad innehåller de?
5' splice site, 3' splice site, de innehåller små korta konsensussekvenser
291
Vad är branch point?
Det är en adenin nukleotid mellan 18-40 baspar uppströms från 3' splice site
292
Vad är det som sköter splitsning?
Spliceosomen
293
Hur sitter introner?
Mellan en uppström exon och en nedström exon
294
Vad är stegen för splitsning?
Först splitsas pre-mRNA vid 5'splice site vilket friar exonen uppströms, guanin nukleotiden i konsensussekvensen vid 5' splicesite binder till adenin nukleotiden i branch point och bildar lariat, sedan splitsas 3'UTR och exon 1sätts fast på 5' änden av exon 2. Intronen släpps som en lariat
295
Vad skapar det för struktur när guanin och adenin binder till varandra i splitsningen?
Lariat
296
Vad händer efter splitsningen av exon 1 och 2?
Enzym bryter kopplingen vid branch point och en linjär intron skapas och degraderas snabbt
297
Vad händer med mRNA efter splitsningen av exon 1 och 2
mRNA som endast består av exoner splitsade tillsammans exporteras till cytoplasman.
298
Vad är en vanlig orsak till genetiska sjukdomar?
mutationer i pre-mRNA splitsning
299
Hur aggerar splitsning som en kontroll?
RNA måste vara splitsat innan det åker ut ur cellkärnan, felaktigt splitsat RNA kan stanna i kärnan tills det degraderas.
300
Vad är det som får mRNA att röra sig ut ur cytoplasman?
Exon-junction complex (EJC)
301
Vad gör tRNA?
tRNA är länken mellan den genetiska koden i mRNA och aminosyrorna som skapar protein. Varje tRNA binder till en specifik aminosyra och sätter den till polypeptidkedjan på positionen som mRNA specificerar
302
Vilken struktur har tRNA?
De har en klöver struktur med fyra armar
303
Vilka är de fyra armarna av ett tRNA?
acceptor armen, TWC armen, antikodon armen och DHUarmen
304
Vilken form har DHU, TWC och antikodon armen?
De har en hårnålstruktur
305
Vad gör acceptor armen?
Den har en 5' och 3' ände och har en sekvens som alla tRNA har på 3´änden, ACC
306
Vad gör antikodon armen och hur ser den ut?
Den sitter längst ner på tRNA:t och längst ner på denna armen finns antikodon som paras med kodonet på mRNA:t för att se till att aminosyrorna länkas i rätt ordning
307
Hur många ribosomer kan en bakteriecell ha?
ca 20.000
308
Vilka enheter består en ribosom av?
Stora och lilla subenheten
309
Vad mäts ribosomer i?
Svedberg
310
Hur kan man se hur gener är länkade?
om man odlar bakterier med olika mutationer på olika medier, kan man se om man fortfarande får produkten man vill ha och därav se vilken ordning de är i.
311
Vad består protein av?
Aminosyror
312
Hur många aminosyror finns det som skapar vanliga protein?
20 st
313
Hur är aminosyror strukturerade?
De består av en kolatom bunden till en aminogrupp, en väteatom, en carboxylgrupp och en R grupp som är olika mellan aminosyror
314
Hur sitter aminosyror ihop i protein?
Genom peptidbindningar, ena änden har en fri aminogrupp och den andra en fri carboxyl grupp
315
Vilka strukturerna av proteiner?
Primär struktur: aminosyror
sekundär polypeptidkedja som viker sig,beta pleated sheet eller alpha helix
tredje strukturen är 3d formen av ett protein
316
Hur många olika kodon finns det?
4^3 =64 möjliga kodon, 3 är stopp kodon, 61 sense kodon
317
Vad heter de kodon som kodar för mer än en aminosyra?
synonyma kodon
318
Hur kommer det sig att ett antikodon kan paras ihop med olika kodon?
Genom flexibilitet i basparning på den trejde positionen av ett kodon. Den första basen av kodonen formar vätebindningar med den tredje basen av ett antikodon men eftersom den trejde basen paras svagt kan det skapas wobble i parningen
319
Vad är reading frame?
Olika sätt att läsa en sekvens med kodon och startar med start kodonet
320
Vilket är det vanligaste startkodonet?
AUG
321
Kodar start kodonet för något?
Ja
322
Hur går ribosomen över mRNA?
den fäster vid 5' änden och rör sig mot 3' och translerar kodonen medan den går
323
Vilka är de fyra stegen av proteinsyntesen?
1. tRNA laddning när tRNA binder till aminosyror
2. initiation när komponenterna samlas i ribosomen
3.elongation, när aminosyrorna sätts fast på polypeptid kedjan
4. termination, när proteinsyntesen slutar och translations komponenterna släpper från ribosomen
324
Hur tar tRNA upp aminosyror?
alla tRNA har CCA i 3' änden som binder till carboxyl gruppen på adeninet detta kräver energi i form av ATP
325
Vilka delar är det som måste behövas för proteinsyntesen?
1. mRNA
2. både det lilla och stora enheterna av ribosomen
3. 3 protein kallade initiations faktorer
4.initiator tRNA med N-formlmethionine och 5 GTP
326
Vilka är stegen i initiationen?`
1. mRNA binder till den lilla subenheten av ribosomen
2. initiator tRNA binder till mRNA genom basparning mellan initiator kodonet och antikodon
3. stora ribosom enheten joinar
327
Vilka subenheter består en bakteries ribosom av?
30 S och 50 S
328
Vad gör IF3?
Den gör så att det är omöjligt för den stora subenheten att binda in så att mRNA kan binda in. När proteinsyntesen är redo försvinner den så att den stora subenheten kan binda in
329
Vad gör ribonuclease?
Den degraderar allt mRNA förrutom det täckt av ribosomen
330
Vad glr poly(A) svansen under initiationen?
Den binder med proteiner som binder 5'cap och gör bindningen starkare mellan 5'cap:en och den lilla enheten av ribosomen och formar en stängd loop
331
Vilka är de tre platserna på ribosomen som kan ockuperas av tRNA?
A platsen, P platsen och E siten
332
Hur kommer tRNA in i ribosomen?
En laddad tRNA binder kommer in till A siten och där antikodonet binder till mRNA'ts kodon
333
Vad händer efter att tRNA:t kommit in till A siten?
En peptidbindning mellan aminosyrorna som är i P och A siten vilket händer i den stora ribosomenheten
334
Vad är translokation?
Det är rörelsen av ribosomen längs mRNA 5'->3' änden vilket gör att ribosomen positioneras över nästa kodon
335
Vad händer med tRNA som är i ribosomen när den rör sig?
De rör sig inte eftersom de sitter fast med antikodon-kodon bindning detta gör att tRNA:t som tidigare satt på A siten nu sitter på P siten istället och den som satt på P siten sitter nu på E siten. Denna släpper sedan och åker ut i cytoplasman
336
Hur avslutas proteinsyntesen?
Av att ribosomen translokeras till ett stopp kodon eftersom det inte finns någon aminosyra som kodar för dessa kommer det inte in något nytt tRNA
337
Vad händer istället för att en tRNA kommer in i ribosomen när ett termineringskodon avläses?
Frisättningsfaktorer (release factors) binder in. E.choli har tre RF-1, RF-2 och RF-3. Dessa främjar klyvning av tRNA:t i P siten och frisätter polypeptidkedjan
338
Vad är en polyribosom?
Det är ett mRNA med flera ribosomer kopplade på det.
339
Vad har virus för genom?
De kan både ha RNA, enkelsträngat DNA och dubbelt DNA
340
Vad heter de virus med dubbelsträngat DNA?
adenovirus
341
Ge exempel på adenovirus
herpesvirus
342
Ge ecempel på enkelsträngat virus
Parvoviruset
343
Vad är nästan alla virus som infekterar vertebrater och växter?
RNA virus ex. AIDS, influensaV
344
Vad heter de virus som kan integrera sitt genom in i värdens?
Retrovirus
345
Hur inkorporerar retrovirus sitt RNA in i värden?
Genom reverse transcriptas, som kopierar RNA:t till en enkelsträngad DNA sträng
346
Vad kallas ett virus genom som har blivit inkorporerat i värdens genom?
provirus
347
Hur funger HIV?
attackerar hjälpcellerna Tlymfocyter eller Thjälpar celler, HIV integreras i deras kromosom och sedan förstör de cellen och släpper ut nya virus
348
Vad är antigenrtic drift?
Det är den kontinuerliga förändring som uppstår pga mutationer vid kopieringen av virusets genom som sker väldigt ofta.
349
Vad är epigenetik?
Det är studien av mekanismerna som leder till förändring av genuttryck som kan bli nedärvd från cell till cell och är reversibel och involverar inte förändring av sekvenserna av DNA:t
350
Vad är några exempel på epigenetik?
metylisering av DNA, kromatin förändring, hison modifikation
351
Vad är genomisk prägling?
När en sekvens av DNA är markerad och den här markeringen känns igen genom livscykeln av organismen som ärver det markerade DNA:T. Exempelvis gener som gör olika saker beroende om det är en manlig eller honlig organism som ärver den.
352
Vad är DNA metylisering?
Det är när metylgrupper sätts fast på baser av DNA och kan påverka genuttrycket.
353
Hur påverkar DNA metylisering genuttrycket?
Det hämmar uttrycket av gener och initiation av transkription eller får kromatinet i en region att bli mer kompakt. Ex. förhindra bindning till promotorn.
354
Vad är C-value?`
Det är mängden DNA som finns per cell
355
Vad gäller generellt med mängden DNA i prokaryota och eukaryota?
Det finns mer oftast mer DNA i eukaryota celler
356
Vad kan C-vvalue inte förklara?
Komplexitet, det finns ingen motsvarighet mot desto mer komplex varelse desto mer DNA
357
Vad är denaturering?
Processen när dubbelsträngat DNA utsätts för värme och vätebindningarna blir svagare så sepereras strängarna från varandra
358
Vad kallas den temperatur som DNA denatureras i?
Smälttemperatur (Tm)
359
Vad avgör smälttemperaturen?
Vilka typer av basparen som finns i lösningen med DNA, G-C har tre vätebindningar med A-T har två vilket gör att det krävs mer energi för att bryta upp G-C bindningarna
360
Är denatureringen av DNA reversibel?
Ja
361
Hur kan man renaturera DNA igen?
Genom att kyla ner lösning med singulära DNA strängar kommer de att kollidera och vätebindningar kommer bildas igen mellan komplementära baspar
362
Vad är hybridisation?
När man tar DNA från olika källor (ex. olika organismer) och reannealerar dem
363
Behöver DNA strängarna vara komplementära i alla sina baser för att renatureras?
Nej det behöver bara vara tillräckligt många.
364
Vilka tre klasser av sekvenser finns det i DNA?
unika sekvenser, lagom repetative och högst repetativa sekvenser av DNA
365
Vad är unika sekvenser?
Det är sekvenser som endast finns en eller några gånger i genomet, exempelvis sekvenser som kodar för protein
366
Vad är en genfamilj?
Det är unika DNA sekvenser som liknar varandra men inte är identiska
367
Ge exempel på en genfamilj?
Beta-globin gener
368
Vad är repetativa DNa sekvenser?
Det är sekvenser som finns i många kopier, nästan hälften av det mänskliga genomet är repetativt DNA
369
Vad är lagom repetativt DNA?
Det är ex.gener som kodar för rRNA, tRNA
370
Vilka två olika klasser finns det av "moderately repetative DNA"?
Tandem repeteringar, som händer eftervarandra och finns i kluster på kromosomer, strödda repeteringar som finns i runt i genomet
371
Vad är högst repetativt DNA?
Det är sekvenser repeterade i tandem och kluster i vissa regioner ex. vod centromererna och telomererna. De görs nästan aldrig om till RNA
372
Vad är sattelit DNA?
Det är högt repeterade DNA sekvenser som skiljer sig åt i proportioner av baserna och därför separeras som en sattelit fraktion när det centrifugeras.
373
Hur kommer det nya mitokondrier och kloroplaster?
Genom celldelning av redan existerande mitokondrier och kloroplaster, detta händer under hela cellcykeln och är fristående från meiosen och mitosen
374
Vad innehåller DNA i mitokondrien och kloroplasterna?
DNA som kodar för polypeptider som används av organellerna och rRNA's som finns i ribosomerna och tRNA som behövs vid translation av proteiner
375
Vad är endosymbiont teorin?
Att mitokondria och kloroplaster tidigare var prokaryoter som flyttade in i cellen, mitokondria och kloroplaster är lika stora som bakterier nuförtiden och har deras egna DNA som stämmer överens med bakteriers DNA
376
Hur ärvs mitkondrier och kloroplaster?
Oftast från en förälder, mtDNA ärvs ofta i djur av mamman.
377
Vad kan vara en förklaring att det oftast är från mamman man ärver mtDNA?
pga storleken på köncellerna, spermier är mycket mindre och har inte lika mkt mitokondria som äggcellen
378
Vad kallas det när det finns två olika variationer av DNA i cytoplasman av en cell?
Heteroplasmi
379
Vad heter det när det endast finns en variation av DNA i cytoplasman av en cell?
Homoplasmi
380
Vad är replicativ segregation?
När heteroplasmiska celler dividerar och de olika DNA ärvs slumpmässigt till avkomman, detta gör att olika typer av fenotyper i olika vävnader
381
Hur ser de flesta mitkondrie genomer ut i svamp och djur?
Det är oftast en cirkulär dubbelsträngad DNA liknande bakterier, har inte histonproteiner
382
Hur stor är mitokondrie DNA?
ca 15-65.000 bp
383
Vad är några fördelar med att studera mtDNA i koppling till evolution?
1. den lilla storleken och den stora mängden av den i en cell
2. Snabba evolutionen av mtDNA sekvenser i vissa organismer
3. att det ärvs från mamman och mtDNA har ingen rekombination
384
Hur stort är kloroplast genomet?
80-160.000 baspar
385
Vad är rekombination?
Det är utbytet av genetisk inrofmation mellan DNA molekyler
386
Vad är homolog rekombination?
Det är när rekombinationen sker mellan homologt DNA
387
Varför är rekombination en viktig process?
Ökar genetisk variation, förstå länkade relationer mellan gener, nödvändig för viss DNA reperation
388
Hur går homolog rekombination till?
En nukleotid sträng från en kromosom ställs upp precis med en nukleotid sträng av den homologa kromosomen. Brott skapas och de korresponderande regionerna av de två DNA molekylerna byter plats och sedan sätts bitarna ihop rätt igen.
389
Vad är är heteroduplex?
Det är när strängarna under rekombination sitter ihop med varandra
390
När sker homolog rekombination?
Under profas 1
391
Vad är holiday junction?
När det är ett ensam brott i varje av de två DNA molekylerna kallas den formation de skapas för detta. Det är under denna som en DNA från den ena rör sig till den andra
392
Klyvning kan ske på två sätt vilka är detta?
Horisontella planet eller i det vertikala
393
Vad händer när det klyvs i det horisontella planet?
Det skapas icke överkorsande rekombinanter där generna på de två ändarna av molekylen är identisk med de originella
394
Vad händer när det klyvs vertikala planet?
detta skapar överkorsnings rekombinanter där gener av ändarna av molekylerna är annorlunda från vad som var orginellt
395
Vad händer under dubbelsträngs brott?
Två heteroduplexet skapas och två holiday junctions
396
Vad är transposoner?
Det är DNA sekvenser som kan flytta sig i genomet
397
Vad sker när de rör sig?
De skapar ofta mutationer, antingen genom att sätta sig i en gen och ändra den eller att ändra kromosomerna
398
Hur är transposoner uppbyggda?
De är olika vissa är enkla och kodar endast för sin förflyttning, vissa är långa och kodar för andra funktioner som inte har med förflyttning att göra.
399
Vad har transposoner gemensamt?
De har korta repeterande sekvenser på båda ändarna av dem. De förflyttar sig inte med den, De här finns för att de uppkommer när transposonen sätter in sig i DNA. Inte alla men det finns terminala inverterade repeterade sekvenser som är inverterade och komplementära till varandra och känns igen av enzymer som katalyserar transposition
400
Vad är transposition?
Det är rörelsen av transposoner från en plats till en annan
401
Vad är stegen för transposition?
1. Hackigt brott gör i DNA och transposonen sätts fast i singlestranded ändarna av DNA
3. DNA replikeras på ensamma sträng brottens gap
402
Vilket enzym är det som klipper upp DNA för transposonerna?
transposas
403
Vilka två klasser av transposition finns det i DNA transposoner?
Replikativ transposition där en ny tansposon introduceras på den nya stället medan den gamla är kvar eller icke replikativ transposition där transposon elementet exciteras från det gamla stället och sätts på det nya
404
Vilka är sätt att slippa transpositioner?
Genom metylisering av DNA, eller små RNA piRNA
405
Vilka två grupper av DNA transposoner finns i bakterier?
1. enkla transposoner kallade IS (insertion sequens) som bara innehåller information som hör till förflyttning
2.och mer komplexa omflyttningsbart DNA som innehåller information som inte bara har information som hör till förflyttning
406
Vad är retrotransposer?
Omflyttningsbart RNA
407
Vad är SNP?
Det är när en sekvens av genomet där människor skiljer sig från varandra med en ända nukleotidbaspar
408
Hur ofta kan SNP hittas i genomet?
Ca varje 1000bp mellan två individer
409
Hur många SNP finns det i det mänskliga genomet?
Ca 84.7 millioner
