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bakt > genetik > Flashcards

genetik Flashcards

1
Q

bakteriengenom besteht aus

A
  1. plasmid
  2. chromosomale DNA
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Q

bakterienchromosom

A
  • träger der gesamten essentiellen erbinformation
  • zirkulär
  • meist 1
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3
Q

plasmide

A
  • zirkulär, extrachromosomal, selbstreplizierend
  • tragen oft AB resistenzgene, virulenzgene
  • colicingene
  • konjugative plasmide selbstständig übertragbar
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4
Q

replikation allg

A
  • helikase aufspaltung
  • gyrase aufdrehung
  • DNA polymerase synthetisierung 5 zu 3
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5
Q

transkription

A
  • hauptregulation der expression von genen
  • DNA in mRNA umwandeln
  • auf ebene der Initiation reg. (promotoren, operatoren und regulatoren)
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6
Q

translation

A
  • mRNA zu Protein
  • in 70S Ribosom
  • aneinanderreihung von aminosäuren
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7
Q

arten von genetischer variabilität

A
  • intra-zelluläre variabilität
    • punktmutation
    • insertion/deletion
    • transposition
  • inter-zelluläre variabilität
    • konjugation
    • transformation
    • transduktion
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8
Q

insertionssequenzen und transposons

A
  • IS: mobile, im chromosom oder plasmiden enthaltene DNA struktoren
  • transposon: komplexe IS- sequenz
  • oft AB resi
  • intrezellulär: mutationen
  • horizontal: konjugative transpososns
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9
Q

aufbau transponierbare DNA-Elemente

A
  • flankiert durch inverted oder direct repeats
  • transposen komplexer
  • konjugative oft auf plasmide
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10
Q

konjugation

A
  • transfer von konjugativem plasmid
  • kontakt, kanal
  • übertragung
  • replikation
  • nicht alle bakt können das
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11
Q

transformation

A
  • natürliche kompetenz einiger Bakterien, DNA aus umgebung aufzunehmen “competence genes”
  • sequenzspezifisch, erkennung von brauchbarkeit
  • aufnahme von nahrung, nukleotiden, N und P
  • rekombinationa als nebeneffekt
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12
Q

bakteriophagen aufbau

A
  • kopf
  • DNA
  • schwanz
  • Schwanzfasern
  • grundplatte
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13
Q

arten von bakteriophagen

A
  • lytische phagen, führen direkt zu lyse, replikation und expression
  • lysogene phagen, integration ins genom, können durch induktion in den lytischen zyklus gelangen
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14
Q

transduktion

A
  • bakteriophagen können zu gentransfer führen
  • zb teil DNA übernehmen und in rezeptorzelle wird eingefügt
  • können auch ganze plasmide sein
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15
Q

immunsystem der Bakterien

A
  • restriktion und modifikation
  • CRISPR-cas system
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16
Q

restriktion von DNA

A
  • durch restriktionsenzyme schutz vor fremd-DNA
  • erkennen palindrome
17
Q

modifikation von DNA

A

schutz des wirts vor dem eigenen restriktionssystems durch methylierung der erkennungssequenz

18
Q

CRISPR-Cas

A
  • stücke von fremd-DNA werden in CRISPR region eingebaut
  • zukünftige vorlage um später zu erkennen und mit hilfe von cas proteinen zu zerstören
  • wird somit auch an nachkommen weitergegeben
19
Q

CRISPR-cas9

A
  • spezifische genschere
  • erlaubt spezifische gene zu schneiden und durch reperaturmechanismen zu editieren
20
Q

hauptmechanismen der bakteriellen evolution

A
  • reduktion durch deletion oder inaktivierung
  • horizontaler gentransfer
  • rekombination, inversionen, duplikationen, mutationen
21
Q

pan und core-genom

A

pangenom: alle möglichen gene
coregenom: gene die ALLE haben

22
Q

pathogenitätsinseln

A
  • mobile, grössere DNA elemente mit mehreren virulenzgenen
  • oft von bakteriophagen und plasmiden
  • flankiert von direct repeat sequences
  • enthalten oft mobilitätsgene
  • unterschiedlicher GC gehalt als genom
23
Q

phylogenie

A
  • ## rekonstruktion stammesgeschichte, heutzutage auf gensequenzen beruhend (molekulare phylogenie)
24
Q

taxonomie

A

systematische erfassung und einteilung der lebewesen
klassifizierung, identifizierung etc auf mol. phylogenie

25
Q

vorteile DNA sequenzen gegenüber phänotypische merkmale

A
  • charaktereigenschaften eindeutig bewertbar
  • grosse datenmenden sammelbar
  • abweichung gut erkennbar
26
Q

anfoderungen an ein phylogenetisches gen

A
  • allen bakterien vorkommen
  • gemeinsamer ursprung haben
  • molekulare uhr: mutationen zufällig und gleichbleibender wahrscheinlichkeit
  • geringe mutationsrate für weite verwandschaft
27
Q

beispiele phylogenetische gene

A
  • ribosomale RNA 16S, bereits grosse datenbank vorhanden, handbare grösse (23S)
  • 7 housekeeping genes
  • RNA polymerasen
  • ATPase
28
Q

taxonomie von bakterien schwierigkeiten

A
  • asexuelle vermehrung
  • bakteriengenom ist extream flexibel
  • kein genetische kontinuum
  • populationen müssen betrachtet werden
  • neue kombinationen möglich
29
Q

mikrobiologisches spezieskonzept

A

als goldstandart gild ähnlichkeit von 70% DNA

30
Q

medizinische taxonomie grundsatz

A

wenige unterschiede in DNA können viel unterschied in klinischer relevanz machen, kann also auch den namen ändern obwohl theoretisch gleiche spezies wäre

bakt (4 decks)

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