Generalidades y secuenciación de genes

Question 1

Si bien el genotipo predispone, también el ambiente y factores externos influirán en la expresión de ciertos fenotipos

Answer 1

(info)

Question 2

El inventario del genoma humano contiene

Answer 2

• Regiones que codifican proteínas (2-3% genes)
• Distribución no igualitaria
• Repetición en secciones codificantes, ya sean iguales o divergentes
• DNA que codifica RNA –> síntesis de proteínas
• Sitios de unión para ligandos responsables de la transcripción
• Elementos repetitivos no codificantes o función desconocida (LINES y SINES/minisatélites y microsatélites)

Question 3

Cuantos genes codificadores de proteínas hay?

Answer 3

Alrededor de 23,000 genes

Question 4

Regiones pobres en codificación de prot.

Answer 4

Regiones subteloméricas en el cromosoma 18 y X

Question 5

Qué es lo que causa la variabilidad del tamaño de un gen?

Answer 5

El tamaño de los intrones a la hora de la transcripción

Question 6

Tipos de reguladores de transcripción y diferencias:

Answer 6

• CIS: cerca del sitio, corriente arriba o abajo
• Trans: provienen de otro sitio del genoma

Question 7

Porque existen sitios con genes altamente relacionados?

Answer 7

• Se debe al fenomeno evolutivo de duplicación y divergencia (splicing)

Question 8

Variaciones en la organización del material genético:

Answer 8

• Cromosomas, organelos y plásmidos
• Más importante, Forma y organización del material genético

Question 9

Qué es el proyecto del genoma humano? Cuando inició y cuando terminó?

Answer 9

• Se propuso secuecniar todo el ADN humano y de otros organismos modelo con la finalidad de entender su funcionamiento
• Inició en 1990 y terminó en 2003

Question 10

Qué hizo Frederick Sanger?

Answer 10

• Prueba de secuenciación por medio de alargamiento de cadenas complementarias (di-desoxirribonucleótidos) - PCR
• Secuenciación de Sanger (1era generación)

Question 11

Secuenciación por Seq Ilumina

Answer 11

• Amplificación de templados por PCR a través de adaptadores unidos a chips
• Anclado en un lado y libre en otro para formar bucles
• Terminadores (nucleótidos con fluorocromo)
• Segunda generación

Question 12

Secuenciación por Roche 454:

Answer 12

• Segunda generación
• Pirosecuenciado: detecta los pirofosfatos que se liberan tras la adición de un nucleótido
• Permite observar el orden mediante luminiscencia

Question 13

Secuenciación por Ion torrent:

Answer 13

• Segunda generación
• La incorporación de átomos de hidrogeno al formarse el ADN cambia el pH el cual es detectado como cambios de voltaje
• Cuentas microscópicas

Question 14

Secuenciación de ABI/Solid:

Answer 14

• Segunda gen
• Se realiza una PCR para multiplicar la secuencia deseada, después se utilizan nucleótidos marcados los cuales son captados

Question 15

Secuenciación SMRT o de una sola molécula de DNA:

Answer 15

• Tercera gen
• Se utilizan nucleótidos fluorescentes lo cuales son añadidos por una DNA polimerasa en cada posito
• Se utiliza un detector optico en tiempo real que detecta cada nucleótido
• Muchos errores

Question 16

Secuenciación de nanoporos:

Answer 16

• Tercera gen
• Dispositivo MinION
• El DNA deseado pasa por un nanoporo, el cual produce cambios iónicos dependiendo el nucleótido y se registra
• Secuencias ultralargas (1mb) y puede leer hasta 100 nucleótidos por segundo, aunque tiene muchos errores