Fiche 3- Peroxysome et Réticulum endoblastique Flashcards

1
Q

Le RE est un site majeur pour le métabolisme des médicaments.

A

Vrai.

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Q

Quelle est la différence entre un peroxysome et une mitochondrie?

A

Ils se distinguent des mitochondries par le fait qu’ils n’ont qu’une seule membrane et n’ont ni propre ADN, ni ribosomes (leurs protéines sont donc importées du cytosol ou du RE). On les retrouve dans toutes les cellules eucaryotes.

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3
Q

Quel est le rôle d’un peroxysome?

A

Ils constituent un site majeur de l’utilisation d’oxygène et contiennent des enzymes oxydatives telles que la catalase et l’urate oxydase. Ce sont des sites majeurs de l’utilisation d’oxygène. Production de H2O2

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4
Q

À quoi servent les enzymes des peroxysomes?

A

Leurs enzymes servent notamment à éliminer des atomes d’hydrogène de substrats organiques pour former du peroxyde : RH2 + O2 –> R + H2O2
La catalase utilise ensuite ce peroxyde pour oxyder à son tour des substrats :
H2O2 +RH2 -> R + 2 H2O
En cas d’excès de peroxyde, elle catalyse également : 2 H2O2 -> 2 H2O + O2

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5
Q

Quel est le rôle des peroxysomes dans la B-oxydation?

A

Les réactions oxydatives effectuées par les peroxysomes permettent aussi la dégradation des molécules d’acides gras. Cette B-oxydation consiste à raccourcir les chaînes d’acides gras de manière à former de l’Acétyl CoA. L’opération se déroule à la fois dans les mitochondries et dans les lysosomes. Cette activité constitue une cible pharmacologique pour certains médicaments.

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6
Q

Quel rôle joue le peroxysome dans la formation de plasmalogènes?

A

Les peroxysomes catalysent la première réaction de formation des plasmalogènes, la classe de phospholipides la plus abondante de la myéline. Les plasmalogènes sont très abondants dans les gaines de myéline qui isolent les axones des cellules nerveuses.

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7
Q

Comment fonctionne l’importation des protéines dans les peroxysomes?

A

Une séquence spécifique de trois acides aminés (Ser-Lys-Leu), localisée à l’extrémité C-terminale de beaucoup de protéines des peroxysomes, fonctionne comme un signal d’importation. D’autres protéines des peroxysomes contiennent une séquence signal proche de l’extrémité N-terminale. Le processus impliquerait des récepteurs protéiques solubles du cytosol et des protéines d’amarrage. Il existerait au moins 23 protéines, les peroxines, qui participent au processus d’importation entraîné par l’hydrolyse de l’AT¨P. Les protéines n’ont pas à être dépliée pour être importées dans les peroxysomes. Au moins un récepteur d’importation soluble, la peroxine Pex5, accompagne sa cargaison sur tout son trajet vers le peroxysomes, puis retourne au cytosol une fois sa cargaison libérée.

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8
Q

Qu’est-ce qu’une peroxine?

A

Protéine qui participe au processus d’importation entraîné par l’hydrolyse de l’AT¨P

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9
Q

Explique l’organisation générale du RE.

A

La membrane du RE représente plus de 50% de la membrane totale d’une cellule animale moyenne. Le RE est organisé en un labyrinthe réticulé de tubules qui se ramifient et de sacs aplatis. La membrane nucléaire externe est en continuité avec le RE. Le RE et les membranes nucléaires forment un feuillet continu enfermant un seul espace interne, la lumière du RE. Le RE rugueux forme des piles orientées de citernes aplaties et la membrane du RE lisse est reliées à ces piles et forme un fin réseau de tubules.

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10
Q

Quels sont les rôles du RE?

A

Il joue un rôle à la fois dans la biosynthèse des lipides et des protéines et sert au stockage de Ca2+. Sa membrane est le site de production de toutes les protéines et lipides transmembranaires de la plupart des organites. La production de lipides du RE sert également à garnir les membranes des mitochondries et des peroxysomes. Presque toutes les protéines sécrétées à l’extérieur de la cellule sortent de la lumière du RE.

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11
Q

Quel processus d’importation des protéines caractérise le RE?

A

Un processus co-traductionnel. S’effectue avant que la chaîne polypeptidique ne soit complètement synthétisée. Ainsi, les ribosomes sont attachés à la membrane pour permettre à la chaîne d’être complétée pendant qu’un des bouts est transloqué.

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12
Q

Qu’est-ce que le RE de transition?

A

Les aires qui se détachent du RE lisse pour former des vésicules se dirigeant vers l’AG font partie du RE de transition.

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13
Q

Quels sont les rôles du RE lisse?

A

Accueille les enzymes qui métabolisent les lipides (ex: cholestérol –> Hormone stéroïde)

Contient les enzymes catalysant des réactions afin d’éliminer des médicaments liposolubles, et autres composants dangereux.

Séquestrer le calcium hors du cytosol (B-bloquant). Utilie pour contraction et relaxation musculaire.

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14
Q

Comment fonctionne la pompe Ca2+?

A

Pour stocker le calcium, une pompe Ca2+ sur la membrane du RE transporte les ions Ca2+ du cytosol dans la lumière du RE. Par ailleurs, une forte concentration de protéines liant le Ca2+ dans le RE, facilite le stockage du Ca2+.

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15
Q

Qu’est ce qu’un microsome?

A

Fragmentation et ressoudure de la membrane du RE pour se reformer en petites vésicules fermées . Intérieur vésicule équivaut à la lumière du RE

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16
Q

Quels sont les 2 types de protéines capturées?

A

Protéines transmembranaires (pour le RE ou pour ailleurs) & Protéines hydrosolubles (qui seront sécrétées ou maintenues dans la lumière).

17
Q

Qu’est-ce qui initie la translocation des protéines?

A

Une séquence signal dirigerait la protéine vers la membrane du RE (un translocateur) et serait coupée par une signal peptidase de la membrane en libérant la protéine de la lumière. Le translocateur se refermerait ensuite jusqu’à une nouvelle importation.

18
Q

Qu’est-ce qui coupe la séquence signal?

A

Une signal peptidase.

19
Q

Quelles sont les deux composantes de l’importation des protéines?

A

Particule de reconnaissant du signal (SRP): s’enroule autour de la grande sous-unité du ribosome et se lie à la séquence signal (pause de traduction + temps aux ribosomes de se fixer à la membrane)

Récepteur SRP: se lie au complexe ribosome-SRP et le dirige vers un translocateur.

Le récepteur et le SRP sont ensuite libérés, laissant le ribosome lié au translocateur.

Translocateur insère la protéine dans la membrane et la transfère à travers la bicouche lipidique. Il se referme ensuite pour demeurer imperméable.

20
Q

Qu’est-ce qu’un polyribosome?

A

plusieurs ribosomes liés à l’ARNm. Il est attaché à la membrane du RE.

21
Q

Quelle est la structure du complexe sec61, et à quoi sert-il?

A
  • c’est le centre du translocateur
  • composé de 3 s-u
  • hélices alpha entourent un pore central qui permet à la chaine polypeptidique de traverser la membrane

Pore fermé par une courte hélice et se déplace de côté pour laisser passer la protéine. Quand le ribosome se fixe au translocateur, pas de fuite car étanche.

22
Q

Quelle est la caractéristique du processus post-traductionnel?

A

Besoin de protéines accessoires pour faire pénétrer la chaine.

Requiert l’hydrolyse de l’ATP.

Protéine BiP

23
Q

Que fait la protéine BiP?

A

Elle se fixe sur la chaine polypeptidique et elle va tirer celle-ci vers le bas pour la faire transloquée. Processus POST-traductionnel.

24
Q

Quels sont les 2 modes d’insertion de protéines membranaire?

A
  • Séquence en N-terminale qui initie la translocation, segment hydrophobe qui met fin au processus et ancre la protéines (signal d’arrêt)
  • Séquence signale interne qui imite le transfert. Après sa libération du translocateur, la séquence reste dans la bicouche sous forme d’hélice à un seul passage.
25
Q

Quel est le mode d’insertion des protéines ayant plusieurs domaines membranaires?

A

-Séquence signal interne (signal de début de translocation) qui se poursuit jusqu’à une séquence signal de fin.

Pour + de 2 domaines: une 2e séquence de début de transfert et de fin, une 3e , etc.

26
Q

Qu’est-ce que la glycolysation?

A

Addition covalente de sucres(oligosaccharides) sur les protéines.

Les protéines glycolysées deviennent des glycoprotéines. Liés par liaisons N-glycosidiques.

27
Q

Définis la calnexine et la calréticuline.

A

Se sont des protéines chaperonnes du RE. Elles nécessitent du Ca2+. Elles sur les oligosaccharides des protéines du RE pas repliée complètement pour les maintenir dans le RE. Elles les empêchent de s’agréger. Elles se fixent sur les protéines seulement quand 2 des 3 glucoses ont été enlevés par une glucosidase du RE.

80% des protéines n’atteindront jamais la perfection –> Dégradées.

28
Q

Que fait la glycosyltransférase?

A

Ajoute continuellement un sucre sur les protéines mal repliées pour les empêcher de perdre leur dernier sucre

29
Q

Explique le mécanisme de rétention membranaire impliquant le GPI.

A

Les enzymes du RE fixent de façon covalente une ancre de GPI à l’extrémité C-terminale de certaines protéines membranaires destinées à la membrane plasmique. Ces protéines ne sont alors ancrées à la membrane que par cette ancre et le reste de la protéine est dans la lumière. La protéine est liée par l’intermédiaire d’un lien oligosaccharide à l’ancre au cours de ses déplacements à travers le réticulum endoplasmique.

30
Q

Quel est le principal phospholipide produit?

A

Phosphatidylcholine (lécithine)

formé à parti de choline, 2 a.g et de glycérolphosphate.

31
Q

Comment est synthétisée la Phosphatidylcholine?

A

Catalysée par des enzyme du RE, dont le site actif fait face au cytosol (métabolites)–> feuillet cytosolique de la membrane du RE.

Protéine de liaison cytosolique des a.g.

Dans le RE et après l’activation par le CoA, des acyltransférases mettent 2 a.g. au glycérophosphate pour former l’acide phosphatique.

32
Q

Nommer les 3 principaux phospholipides de la membrane du RE.

A

Phosphatidylsérine

Phosphatidylinositol.

33
Q

Qu’est-ce qui équilibre les phospholipies entre les 2 feuillets de la bicouche?

A

La scramblase.

34
Q

Qu’est-ce que la B-oxydation?

A

Réaction qui réduit la longueur des chaines des a.g.

35
Q

Action cellulaire déclenchée par une accumulation de protéines repliées dans le RE..

A

Réponse à un repliement protéique incorrect.

36
Q

Qu’est-ce qu’une glycoprotéine?

A

Protéine avec une ou plusieurs chaînes d’oligosaccharides liées par covalence à des chaînes latérales d’a.a

37
Q

Dans quel compartiement est le cytochromeP450?

A

RE lisse.

38
Q

Qu’est-ce que le Réticulum sarcoplasmique?

A

Une forme spécialisée de RE lisse des cellules musculaires.