Fasel Flashcards
Comment est composée une membrane ?
Une bicouche lipidique amphiphile (une partie hydrophobe qui pointe vers l’intérieur et une partie hydrophile qui pointe vers l’extérieur).
Comment sont formés les composés polymériques ?
Par des liaisons covalentes entre des unités monomériques (acide aminés, acide nucléiques, sucres, etc.)
Comment sont formés les composés supramoléculaires ?
Ils sont formés par des liaisons non-covalentes entre des composés polymériques.
Quelle est la différence de conformation lorsqu’un carbone est lié à 4 atomes ou à 3 atomes ?
Un carbone lié à quatre atomes est au centre d’un tétraèdre, et il y a rotation libre d’atomes le long des liaisons simples ; tandis qu’un carbone lié à 3 atomes a des liaisons qui se trouvent dans le même plan, et aucune rotation n’est possible autour de la double liaison.
Quand est ce qu’on considère qu’une liaison covalente est polaire ?
Lorsqu’il y a une différence d’électronégativité entre les deux atomes. Un atome sera chargé un peu + négativement et l’autre un peu + positivement.
Quand y’a-t-il une interaction électrostatique ?
Lorsqu’une molécule chargée positivement interagit avec une molécule chargée négativement (2 ions).
Comment se présentent les ions en solution aqueuse ?
Ils sont hydratés, c’est-à-dire qu’ils ne sont pas libres mais sont entourés par une cage de molécules d’eau.
Quand y’a-t-il une liaison hydrogène ?
Si un hydrogène partiellement chargé interagit avec le doublet non-liant venant d’un autre atome.
Pour quelles types de particule est ce que les interactions de Van der Waals sont importantes ?
Pour des atomes de même électronégativité ou des molécules non-polaires comme les hydrocarbures.
Quand y’a-t-il des interactions hydrophobes ?
Lors de l’accumulation de molécules hydrophobes dans un milieu aqueux.
Quels sont les 3 types principaux de macromolécules présents dans les cellules ?
Les polysaccharides, les acides nucléiques et les protéines.
Quel type de réaction a lieu pour former des liaisons covalentes à partir d’unités monomériques ?
Une réaction de déshydratation = départ d’une molécule H2O.
Quel est le point commun de tous les monosaccharides ?
Ils contiennent tous au moins un groupement –OH et un groupe carbonylé (aldéhyde ou cétone).
Comment se forme une liaison glycosidique ?
Le groupement –OH en position 1 d’un sucre (en configuration alpha ou beta) se lie par déshydratation au groupement –OH en une autre position sur un autre sucre
Quelle est l’unité monomérique des acides nucléiques ?
Le nucléotide
De quoi est composé un nucléotide ?
Il est composé d’une base azotée, d’un groupement phosphate et d’un pentose.
Comment sont liés les nucléotides entre eux pour former des polymères ?
Ils sont liés par des liaisons phosphodiesters.
Qu’est ce qu’une liaison peptidique ?
C’est une liaison covalente entre le la fonction carboxyle d’un acide aminé et la fonction amine d’un autre.
Quelle est la principale différence entre un procaryote et un eucaryote ?
Les cellules procaryotes n’ont pas un noyau défini par une membrane et présentent une organisation intracellulaire relativement simple. Les eucaryotes ont une organisation cellulaire (organelles délimités par une membrane) complexes et un noyau bien défini.
Qu’est ce que le nucléoide ?
Une localisation intracellulaire précise des cellules procaryotes qui contient le matériel génétique mais n’est pas entouré par une membrane.
Quelle est organelle est en continu avec la membrane externe du noyau ? Quelle est sa fonction ?
Le réticulum endoplasmique rugueux. Il est chargé d’assembler les protéines.
Comment fonctionne un virus ?
Il est dépendant de la machinerie cellulaire de la cellule hôte et ne possède pas son propre métabolisme.
Quelle est la grosse différence entre les cellules procaryotes et eucaryotes dans la synthèse de protéines ?
Dans les procaryotes, il y a un couplage transcription/traduction, alors que les cellules eucaryotes ont des compartiments → noyau (transcription + maturation) et cytoplasme (traduction)
Dans les cellules eucaryotes, quel processus a lieu a l’extérieur du noyau (dans le cytoplasme) ?
La traduction.
Quelle base sont des pyrimidines et quelles bases sont des purines ?
Purines : Adénine et Guanine Pyrimidine : Cytosine, Thymine et Uracile
Quelle différence y’a-t-il entre les purines et les pyrimidines ?
Les purines possèdent un double anneau, tandis que les pyrimidines ont un seul anneau.
Quelle molécule obtient-on lors d’une méthylation de l’Uracile ?
La thymine
Comment peut-on passer d’une cytosine à une thymine ?
Par méthylation, suivie d’une déamination oxydative.
Quelle molécule est issue de la dégradation des purines ?
L’acide urique.
Quel carbone du pentose détermine s’il s’agit d’un ADN ou ARN ?
C2
Quel carbone se lie à la base ? Quel est le type de liaison ?
C1 : BN-9 pour purines et BN1 pour pyrimidine
Comment appelle-t-on une base liée à un sucre sans phosphate ? Quel carbone lie le phosphate ?
Un nucléoside, C5
Quel carbone permet de se lier à un autre nucléotide ?
C3
Sous quelle forme les nucléotides peuvent-ils exercer une fonction de messagers ?
cAMP, cGMP → forme cyclique (cycle formé par une liaison phosphate entre 3’ et 5’).
Quel type de liaison permet de lier 2 nucléotides ?
Liaison phosphodiester 3’-5’.
Quelle convention permet d’exprimer la polarité de la structure ADN ?
5’ à gauche et 3’ à droite.
Comment sont liées les deux chaînes polynucléotides de l’ADN ?
Elles sont liées entre bases complémentaires (A-T et G-C) par des liaisons hydrogènes.
Quelle différence y’a-t-il entre les liaisons A-T et G-C ?
A-T n’ont que 2 ponts hydrogène alors que G-C en a 3.
Quelle structure prend l’ADN ?
Structure en double hélice, avec des grands et petits sillons
Quels sont les 3 éléments qui assurent la stabilité de la double hélice ?
Liaisons hydrogènes, interactions hydrophobes entre les bases et hydratation des phosphates.
De quel type d’hélice est l’ADN double brin ?
Hélice B
Quels sont les 2 types de séquences répétées que l’on peut trouver dans le génome ? Et leurs sous-catégories ?
Tandem → Microsatellite, Mini-satellite et satellite. Dispersée → LINE et SINE
Comment sont générées les séquences répétées dispersées ?
Par transcriptase inverse.
Quelles sont les protéines autour desquelles s’entoure l’ADN ? Quelle est leur charge ? Quelle structure cela permet d’obtenir ?
Les histones des protéines basiques chargées +, la chromatine.
Quelles sont les 2 formes de chromatine et comment sont-elles organisées ?
Euchromatine → peu condensée donc accessible. Hétérochromatine → condensée.
Quand a lieu la réplication de DNA ? Quelles sont ses 2 caractéristiques ?
Avant la mitose. Elle est semi-conservative et bidirectionnelle.
Dans ce cas, combien de fois est répliquée chaque séquence ?
Chaque séquence doit être répliquée au moins une fois, mais pas plus d’une fois.
Quelle enzyme est chargée de synthétiser des bruns complémentaires ?
DNA polymérase.
Quelle différence y’a-t-il entre le génome des mammifères et celui des bactéries dans leur origine de réplication ?
Le génome des mammifères a plusieurs origines de réplications, alors que les bactéries ont un génome circulaire et une seule origine de réplication.
Quels sont les 3 éléments fondamentaux pour la réplication ?
Une matrice (séquence de base qui va être copiée), une amorce et un 3’OH.
Dans quel sens est l’amorce par rapport à la matrice ?
Antiparallèle
D’où vient l’énergie pour l’addition d’un nucléotide ?
Elle provient du nucléotide qui arrive dans le brin antiparallèle. Son phosphate alpha se lie au 3’OH de l’amorce et libère un pyrophosphate. Cette liaison est riche en énergie et permet donc le processus
Quel élément est nécessaire au fonctionnement d’une DNA polymérase ?
Une amorce ARN hybridée à une matrice.