F16: DNA og kromosomer Flashcards
Hvad er nukleosider, nukleotider og nukleobasser?
Nukleobaser er N-holdige ringstrukturer
Nukleobaser bundet til (deoxy)ribose gennem N-glykosidbinding kaldes nukleosider
Nukleosider bundet til en eller flere P-grupper er nuleotider.
Redegør for DNA struktur og funktion
Struktur: Opbygget af to komplementære antiparallelle strenge af nukleotider, der er bundet sammen med hydrogenbindinger. Fra 5’enden sidder P-gruppe på 5’-C-atomet i sukkerstoffet, herefter følger sukkerstof med base og næste nukleotids P-gruppe på 3’C i sukkerstoffet. Baseparring mellem AT og CG (hhv. 2 og 3 H-bindinger), så der dannes dobbelthelix med 10,4 nukleotider/turn. Den ene streng løber 5’3’, den anden modsat.
Funktion: Langtidslager af DNA, der giver mulighed for interaktion med proteiner.
Redegør for kromatinstruktur herunder histoner og nukleosomer
DNA og de associerede proteiner (histoner og non-histone kromosomale proteiner) kaldes kromatin. Kromatin danner kromosomer.
Histoner gør det muligt at pakke DNA i nukleosomer, hvor histonkomplekser sidder som perler på en snor med DNA vundet omkring. Der er 147 nukleotidpar vundet 1,7 gange om hvert histonkompleks (nukleosome core particle), der består af 2*(H2A+H2B+H3+H4). Mellem nukleosomerne er linker-DNA. Teknisk set er det ene linker-DNA en del af nukleosomet, der er cirka 200 nukleotider langt. DNA bindes til histonerne gennem nonkovalente bindinger. Der er mange K og R i histoner til at matche negative P-grupper.
Hvilke funktioner har nukleotider?
Kodende i DNA og RNA
Energienhed
Coenzymdel
signalering (cAMP og cGMP)
Redegør for histonmodifikationer og deres biologiske funktion
Histonernes N-terminale hale kan modificeres, hvilket påvirker kromosomstruktur- og funktion. Acetylering og methylering, ubiqitylering og fosforylering. Methylering giver heterokromatindannelse mens M+A og A+P kan give genudtrykkelse. Acetylering løsner op ved at fjerne positiv ladning på K. Cytosinmethylelring lukker også for udtrykkelsen. Histonkoden læses af code readers, der undersøger behov for reparation, genudtrykkelse, DNA-syntese m.v.
Biologisk funktion: Påvirker gener i nærheden og inaktiverer det ene x-kromosom.
Histonvarianter indsat i interfase (og ikke S) kan også give fx transkriptionel aktivering, DNA-reparation m.v.
Redegøre for begreberne eukromatin og heterokromatin
Eukromatin er tilgængeligt for proteiner og derved for transkription, mens heterokromatin er kraftigt kondenseret og oftest er genekspressionen er “lukket ned”. Heterokromatin findes i centromerer og telomerer og andre steder.
Beskrive telomerer og centromerer
Kromosomer indeholder 1 centromer og 2 telomerer samt replikationsorigins. Replikationsorigins er nukleotidsekvenser, hvor duplikation af DNA påbegyndes
Centromer: Den region af kromosomet, der holder søsterkromatiderne sammen og hvor kinetchore mitrotubuli hæfter under mitosen. Består formentlig af lange repeats af nukleinsyre-proteinkomplekser, der nedarves.
Telomerer er enderne på kromosomet, der består af repetitive sekvenser. De forhindrer at DNA bliver kortere gennem hver replikation, hvad der ellers ville have været tilfældet pga. 5’-3’-synteseretningen. De beskytter ligeledes mod nedbrydning via exonukleaser
Redegøre for begrebet genom
Den totale mængde af genetisk information, der findes i kromosomerne i en celle. Nogle gange henviser det også til det DNA, der indeholder denne information.
Redegøre for begreberne gen og kromosom
Vi har 23/24 forskellige kromosomer (homologe og kønskromosomer) i hver celle, der sammen med mtDNA giver vores arvemateriale. Hvert kromosom består af kromatin. I hvert kromosom er ét langt DNA-molekyle, der er vundet op.
Et gen er en DNA-sekvens, der transkriberes som én enhed, der koder for en eller flere beslægtede molekyler - RNA eller protein - og som er arveligt.
Beskrive et eukaryot gen
Enhancer/silencer-sites kan være langt fra genet.
Promoter sequencer: Kontrollerer genekspression opstrøms for genet og inkluderer TATA-boksen, der findes 30-80 nukleotider før transkriptionssitets start. Funktionen er at facilitere RNA-pol.-binding. Herefter kommer stedet for initiering af transkription og herefter sted for start af translation med startcodon
Så kommer ORF med exons og introns (transkriberes, men translateres ikke). 5’ og 3’ UTR ligger i første og sidste exon.
Terminator sequences med stopcodon for translation og 3’UTR, herefter transkriptionsstop.
Hvordan farves kromosomerne?
Med hybridisering, ofte når DNA er kondenseret.
Hvad er funktionen af DNA, der ikke koder?
Noget har betydning for kontrol af genudtrykkelse, men meget af den kender vi ikke funktionen af
Hvad er funktionen af DNA, der ikke koder?
Noget har betydning for kontrol af genudtrykkelse, men meget af den kender vi ikke funktionen af.
Hvad er gennemsnitlig genstørrelse?
27.000 nukleotidpar
Hvonår dekondenserer interfasekromosomer?
Ved replikation, reparation og transkription
