Examen intra powerpoint 2 Flashcards
Comment appelle-t’on un polypeptide à plus de 50 aa?
protéine
V ou F: Le dernier aa d’une protéine est modifier pour la protéger?
Vrai, pour s’assurer qu’aucun aa ne s’y rajoute
Donner deux classes de protéines.
1- Holoprotéines
2- Hétéroprotéines
Qu’est-ce qu’une holoprotéine?
C’est une protéine qui est seulement composée d’aa
Qu’est-ce qu’une hétéroprotéines?
C’est une protéine qui est composée d’aa et d’autres molécules fixées de façon covalente
Comment appelle-t’on les composés des protéines qui ne sont pas les aa?
groupements prosthétiques
Quels sont les classes d’hétéroprotéines?
1- Phosphoprotéines
2- Lipoprotéines
3- Flavoprotéines (FAD)
4- Métalloprotéines
5- Ribonucléoprotéines
6- Glycoprotéines
Donner les deux types de protéines.
1- protéines fibreuses
2- protéines globulaires
Quelles sont les propriétés des protéines fibreuses?
- fonction statique de structure
- Insoluble dans l’eau
- Ont des répétitions de motifs simples
Quelles sont les propriétés des protéines globulaires?
- fonction dynamique
- soluble dans l’eau
Comment la cystéine s’attache-t-elle aux autres aa?
elle forme des ponts disulfures
Définir la structure primaire d’une protéine?
chaîne de aa
Définir la structure secondaire d’une protéine?
structure spaciale adopté par des aa adjacents
Définir la structure tertiaire d’une protéine?
structure créée par les interaction entre les chaînes latérales des aa éloignées
Définir la structure quaternaire d’une protéine?
structure contenant plus d’une chaîne polypeptidique (assemblage des protéines entre elles)
Quelles sont les forces qui agissent sur la structure secondaire et tertiaire de la protéine?
- structure du lien peptidique (plan et polaire / encombrement stérique favorise la config. trans)
- pont disulfure
- liaison hydrogène
- liaison ioniques
- liaisons hydrophobes
V ou F: Il y a un nombre de conformations pour une protéine donnée.
Vrai
Avec quoi se fait la liaison peptidique entre 2 aa?
entre le groupement carbonyle et le groupement amine de manière à former une molécule d’H2O (réaction de déshydratation ou condensation)
V ou F: La liaison peptidique est plane et rigide avec un caractère de double liaison partielle.
Vrai, ceci empêche la rotation autour du lien peptidique
Comment appelle-t-on le diagramme qui permet de visualiser les angles des aa dans la structure d’une protéine?
diagramme de Ramachandran
Comment se forme les ponts disulfures?
le soufre de deux molécules de cystéines s’associent pour former une liaison qu’on appelle pont disulfure. Un groupement de deux cystéine se nomme cystine.
Entre quelles molécules se font les liaisons non-covalente?
entre les C=O et les N-H des liaisons peptidiques et entre les groupements latérales de certains aa
Qu’est-ce qu’une liaison ionique?
liaison non-covalente électrovalentielle entre un radical chargé positivement et un radical chargé négativement (groupement acide et groupement amine)
Qu’est-ce qu’une interaction de type force de Van der Waals?
lorsque les aa d’une chaîne latérale hydrophobe non-polaire se rapproche puisqu’ils sont repoussés comme ils ne forment pas de liaisons avec l’eau
Les protéines fibreuses alpha sont des protéines _____
élastiques
Les protéines fibreuses bêta sont des protéines _____
inextensibles
Quel aa a tendence à briser les hélices alpha?
la proline (à cause de son pentose)
Décrivez une hélice alpha.
-stabilisée par des liaisons hydrogènes
-chaînes latérales tournées vers l’extérieur (moins encombrement stérique)
V ou F: La conformation hélice gauche est plus fréquente et l’hélice plus longue.
Faux, c’est la droite; la conformation gauche est plus courte (4 aa) et est plus rarement rencontrée
Quels sont les 2 types de feuillets?
parallèles et anti-parallèles
Décrivez un feuillet plissé bêta.
- liaisons peptidiques sont parallèles dans un même plan
-groupements R sont perpendiculaires au plan du feuillet
-le feuillet est stabilisé par des liaisons H appartenants aux C et N de la liaison peptidique
Décrire l’hélice du collagène
3 hélices gauches s’enroulent pour former une hélice triple droite (crée une résistance à l’étirement)
Quel est l’effet du scorbut sur la vitamine C?
carence grave en vitamine C, mauvaise synthèse du collagène puisque l’enzyme prolyl-hydroxylase fonctionne modérément ou peu
Qu’est-ce qu’un coude bêta?
C’est une séquence de 4 aa qui permet à une chaîne de changer de direction (glycine ou proline)
Qu’est-ce qu’une pelote statistique (random coil)?
C’est une structure non-ordonnée, qui n’a pas de forme géométrique régulière dans l’espace mais qui peut être très importante dans l’activité d’une protéine. ATTENTION, ce n’est tout de même pas n’importe quoi.
Que font les chaperons moléculaires?
jouent un rôle dans l’assemblage ou le repliement des protéines sans en faire partie, empêche le repliement prématuré et peut accéléré le repliement
Qu’est-ce qui peut amener la dénaturation d’une protéine?
variation de pH
augmentation de la température
agents chaotrophes
détergents
agents réducteurs
la simple dilution ou agitation
Qu’est-ce qu’une protéine allostérique?
c’est une protéine dont L’activité est modulée par la fixation d’une petite molécule appelée modulateur allostérique (peut être effecteur ou inhibiteur)
Qu’est-ce qu’une protéine monomérique?
C’est une protéine qui n’a pas de structure quaternaire
Pourquoi est-ce que l’hémoglobine foetale va chercher plus d’oxygène?
c’est une question d’affinité, comme son affinité est élevée elle permet d’extraire l’O2 du sang placentaire, or elle est si importante qu’elle n’arrive pas à s’en détâcher pour la livrer aux tissus après la naissance. c’est pourquoi une autre hémoglobine vient dominer (myoglobine)
Qu’est-ce que l’effet Bohr?
L’effet Bohr est la diminution de l’affinité de l’hémoglobine pour l’oxygène lors d’une augmentation de la pression partielle en CO2 ou d’une diminution de pH.
le CO2 se lie à l’extrémité des 4 chaînes de globines
H+ se lie à l’histidine 146 de la bêta-globine
le CO2 est facilement libéré par simple compétition avec l’Oxygène
Qu’est-ce que le BPG?
c’est un modulateur allostérique qui stabilise la forme désoxyhémoglobine et qui est accru lors d’un manque d’oxygène dans les tissus
Qu’est-ce qu’une drépanocytose?
La drépanocytose, aussi appelée anémie falciforme, est une maladie génétique héréditaire touchant les globules rouges (ou hématies). Elle est caractérisée par une anomalie de l’hémoglobine, principale protéine du globule rouge. (mutation d’un acide glutamique en valine ce qui forme une pièce adhésive).
Qu’est-ce qu’un prion?
C’est une protéine dont la conformation est anormale qui transmet sa conformation anormale
Quelles maladies chez l’homme découlent de prions?
maladie de kuru
maladie de Creutzfeldt-Jakob
maladie de Gertsmann-Straussler-Scheinder