Examen intra 1 Flashcards
Quels sont les 4 qualités qui permettre de différencier un être vivant d’un être non-vivant (matière inorganique)
Croissance, Capacité de répondre aux stimuli (homéostasie), Métabolisme et Reproduction
La chaîne de carbone des acides gras sont hydrophiles ou hydrophobes?
Hydrophobes
Un nucléoside est formé d’un… et d’une…
D’un sucre et d’une base azotée
Je suis un regroupement entre une base azotée, un phosphate et un sucre
Nucléotide
Les purines sont:
Adénine et Guanine sont des purines. Ils ont 2 cycles.
Quels sont les bases d’acide nucléiques à trois liaisons hydrogène dans la double hélice d’ADN?
Cytosine et Guanine
Les Liaisons pi-pi sont entre quoi et quoi?
Entre une NH2 et un C=O d’une purine et d’une pyrimidine
Quels sont les différents types d’ADN et leur caractéristique?
ADN-A: forme favorisé in vitro. Forme majeure pour l’ARN
ADN-B: forme commune
ADN-Z: milieu a forte conc. saline
Les doigts de zinc se fixent dans le sillon majeur ou mineur?
Dans le sillon majeur
Je suis le type de cellule unicellulaire dépourvu d’organites et de noyau
Procaryotes
Comment appelle-t-on un eucaryote unicellulaire?
Un protiste
Quels sont les 2 types de procaryotes?
Les Archeobactéries et les Eubactéries
Comment appelle-t-on le processus d’évolution d’un procaryote vers un eucaryote?
Endosymbiose
Le suffixe «phytes» comme dans les termes protophytes et métaphytes veut dire quoi?
Relatif aux végétaux
Protophytes: végétaux unicellulaire
Metaphytes: végétaux pluricellulaires
Quelle est la différence entre le cytosol et le cytoplasme?
Le cytosol est le liquide où baigne les organites intracellulaires tandis que le cytoplasme est la partie interne de la cellule située entre le noyau et la membrane cellulaire
Quelle est la principale fonction des lysosomes?
Ils servent à digérer les déchets intracellulaires
Aussi appelé les éboueurs de la cellule
Quels sont les ancêtres de la mitochondrie et du chloroplaste selon la théorie endosymbiotique?
Mitochondrie: Bactérie respirante
Chloroplaste: Cyanobactéries
Quel est le lien entre les animaux et les champignons?
Ce sont tous les deux des eucaryotes multicellulaires.
Quel est le nom donné à l’évolution biologique des procaryotes vers les eucaryotes?
La théorie endosymbiotique
Quel est le rôle des nucléoporines?
Reconnaissance et guidage des molécules qui traversent le CPN.
Combien de nucléoles une cellule peut-elle compté?
1 à 5 nucléoles
Quels sont les éléments qui permettent d’appuyer la théorie endosymbiotique?
1- La taille des mitochondries et des chloroplastes est semblable à celle des bactéries.
2- Chacun de ces organites possède un matériel génétique (ADN) qui lui est propre.
3- Chacun de ces organites possède le matériel nécessaire pour la synthèse protéique (ARNt , ribosomes, polymérases…).
4- Chacun de ces organites peut se diviser par étranglement médian -division cellulaire- (après avoir dupliqué le matériel génétique)
Quelle structure permet aux procaryotes de se déplacer?
Flagelle rotatif
Quel est le rôle de la mitochondrie?
Fournir de l’ATP à la cellule par la dégradation du glucose.
Qu’est-ce que l’enveloppe nucléaire?
Double membrane séparant le noyau du cytoplasme
Quel élément intranucléaire permet de stabiliser les CPN?
La lamina constitués des filaments de lamine
Quelle est le nom de la structure permettant le maintien de l’enveloppe nucléaire et où se situe cette structure?
La lamina se situe sur la membrane intranucléaire dans le nucléoplasme.
Quels sont les nucléotides faisant 2 liaisons hydrogène?
La thymine, l’adénine et l’uracile. Note: L’ ARN peut se replier sur lui-même ADN-A. Donc, il peut se former 2 liaisons H entre Adénine et Uracile
Quels sont les 2 types de procaryotes?
Les archéobactéries et les eubactéries
Combien de protéines constituent les nucléoporines?
Environ 50 protéines
Où se trouve le matériel génétique chez les bactéries?
Le nucléoide puisque les bactéries sont des procaryotes
Quel est le rôle du REL?
Lieu de synthèse des membranes
lipidiques de la cellule et assure le
renouvellement des membranes de tous
les organites.
Quelles sont les 2 grandes étapes de la synthèse des protéines?
1- Transcription
2- Traduction
Quelle est la différence dans la synthèse des protéines chez les procaryotes et les eucaryotes?
Il y a maturation de l’ARN prémessager en ARNm dans le noyau des eucaryotes.
Quelles sont les différences majeures de la cellule végétale par rapport à la cellule animale?
- Vacuole
- Chloroplaste
- Amyloplaste
L’ARN est plus long que l’ADN?
Faux, l’ADN est plus long puisqu’il contient tout le matériel génétique de l’organisme. L’ARN code seulement pour une protéine.
Quel est le nom donné aux protéines mobiles qui interagissent avec les nucléoporines?
Karyophérines
Où se retrouve les speckles?
Dans le noyau où il y a peu ou pas d’ADN.
Qu’est-ce que les speckles?
Compartiments contenant les facteurs d’épissage.
V ou F ?
Les paraspeckles servent dans l’épissage des ARN prémessager?
Faux, ils ne contiennent pas de facteurs d’épissage. Leurs rôles sont encore inconnus.
Qu’est-ce qui se retrouvent dans les Cajal Bodies?
- 3 ARN polymérases eucaryotes
- Facteurs, protéines et ARNs impliqués dans la transcription et la maturation
- Types d’ARNs
Quels seraient les rôles des Cajal Bodies (CB)?
Lieu de pré-assemblage et stockage de complexes prêts à être délivrer pour accomplir leur tâche dans la transcription
La respiration cellulaire (dans la mitochondrie) fournit-elle 100% de l’ATP?
Non. 95% de l’ATP
L’ADN de la mitochondrie contient des introns et de l’histone?
Faux, elle n’en contient pas.
Où se situent les pigments dans une cellule végétale?
Dans les thylakoïdes.
Qu’est-ce qu’un granum?
Un empilement de thylakoïdes
Quels sont les pigments solubles dans l’eau? Dans les graisses?
Eau: Pigments jaunes et rouges
Graisses: Chlorophylle a et b (verts), caroténoides (oranges) et xantophylles (jaunes).
Vrai ou Faux: La couleur d’un pigment est due à son absorption d’un spectre de la lumière?
Faux. La couleur est due à la réflexion de la lumière sur le pigment.
Où est stocké l’amidon de manière plus durable?
Dans les amyloplastes
Quel est le rôle du RER?
Lieu de synthèse des protéines
Où se situent les ribosomes?
Dans le cytoplasme ou sur le RER
Quel est le rôle de l’appareil de Golgi?
Lieu de maturation des protéines et formation des vésicules de sécrétion.
Comment s’appellent les faces où l’appareil de Golgi reçoit et envoie les vésicules?
Reçoit: Face cis
Envoie: Face trans
Le lysosome a un milieu interne neutre, basique ou acide?
Acide. pH entre 4,5 et 5,5.
Quels sont les rôles du peroxysome?
- Synthèse de la bile et du cholestérol.
- Détoxification des radicaux libres.
- Rôle dans la bêta-oxydation.
Quels sont les 3 classes de lipides membranaires?
1- phospholipides
2- glycolipides
3- stérols (dérivés du cholestérol)
Quels sont les fonctions des protéines membranaires?
- Échanges de biomolécules
- Adhésion à la matrice extracellulaire
- Réception des signaux extracellulaires
- Transduction du signal
- Activités enzymatiques
Quel est le rôle du cytosquelette?
1- Contrôle la forme et les mouvements cellulaires
2- Permet le transport des organites et des molécules
3- Ancrage aux membranes des cellules voisines
Quels sont les 3 types de filaments qui constituent le cytosquelette?
1- Microfilaments
2- Filaments intermédiaires
3- Microtubules
Quels sont les critères exigés afin de choisir un animal pour faire une expérience en laboratoire?
- Bien vivre en laboratoire
- Se reproduit rapidement
- Peut être bien modifié par le génie génétique
- Expérience fait au préalable autre que du génie génétique
Une cellule peut se lier à seulement un anticorps?
Faux. Une cellule possède plusieurs épitopes qui lui permet d’être lier avec différents anticorps.
Je suis le plus petit type de filaments:
Les microfilaments (7nm de diamètre) (filaments d’actine)
Pourquoi ne peut-on pas regarder des échantillons de moins de 200nm avec un microscope photonique?
Car elle utilise les rayons de la lumière qui ont une longueur d’onde de 400nm à 700nm. La limite est donc la moitié de la plus petite longueur focale. Limite de la diffraction de la lumière.
Les Rhodamines et ses dérivés vont émettre du (couleur de fluorescence) sur (protéines cibles).
Émettre du rouge sur les kinétochores aux pôles du fuseau
À quoi sert le DAPI?
Il est utilisé comme fluorochrome pour donner de la fluorescence bleu de l’ADN dans les noyaux en interphase et dans les chromosomes en anaphase.
Quelle sorte de microscopie permet de réduire le floue d’une image provenant du microscope à épifluorescence? Quel type de source lumineuse est utilisée? À partir de quelles substances?
Un microscope confocal car l’échantillon sera vu uniquement dans un plan focal puisque les rayons sont concentrés en un point grâce au pinhole et à la source lumineuse très petite (laser). Laser à l’hélium, argon ou krypton
Quelle est la fonction d’un pinhole lors de la microscopie confocal?
Il agit comme diaphragme qui ne laisse passer qu’un seul point lumineux. Donc, il permet d’éliminer tous les signaux fluorescents situés en dehors du plan focal
Quels sont les critères pour dire qu’une transgénèse est réussie?
- Pénétration du transgène dans les cellules cibles
- Intégration dans le génome
- Expression dans les cellules (synthèse de protéines)
- Possibilité d’avoir une régénération d’individus entiers à partir des cellules génétiquement modifiée
Quel traitement devrait-on effectuer si une culture cellulaire atteint la confluence?
On utilise la trypsine pour séparer les cellules sans les tuer et les transférer dans un autre milieu de culture.
Quels sont les étapes en ordre de préparation d’un échantillon pour la microscopie?
1- Fixation
2- Inclusion (durcissement)
3- Microtomie (Coupe)
4- Coloration
Quel est le nom du colorant le plus utilisé pour colorer le matériel génétique? Il donne quelle couleur?
Le Giemsa donne une couleur violacée à l’ADN.
Quelle est l’utilisation initiale de la transgène par un gène rapporteur?
Identifier et caractériser les séquences régulatrices d’un gène donné.
Quelle technique pourrait-on utiliser pour identifier une séquence du génôme de la maladie de Crohn? EXEMPLE FICTIF
L’hybridation in situ (FISH) - Sondes à séquence unique. Une sonde qui code pour la séquence spécifique de la maladie de Crohn détecterait facilement sa séquence correspondante sur un chromosome.
Quels sont les 3 contraintes de la microscopie électronique?
- Il doit régner un vide poussé pour ne pas que les électrons se heurtent à des molécules d’eau par exemple.
- Les échantillons doivent résister à des températures élevées.
- La minceur des échantillons (max 0.1 micromètre) puisque les électrons doivent être capable de traverser
Quels sont les types de cellules pouvant croître indéfiniment dans des conditions optimales?
Les cellules tumorales, les cellules souches et les cellules provenant des lignées cellulaires.
Quels sont les techniques utilisés pour augmenter le contraste sur des échantillons de petite taille dans le MET?
- Coloration négative
- Ombrage métallique
- Cryofracture
- Cryodécapage
Quelle est la différence dans la préparation des échantillons entre la coloration négative et l’ombrage métallique?
Dans la coloration négative, on plonge l’échantillon dans une solution de métaux lourds alors que dans l’ombrage métallique, on le vaporise OBLIQUEMENT sous vide avec des vapeurs métalliques.
À quoi ressemble un échantillon traité en coloration négative?
Le fond est sombre et les structures apparaissent clair (blanche).
Quel est la différence entre l’ombrage métallique et la coloration négative au niveau du recouvrement des échantillons par des métaux lourds?
Dans l’ombrage métallique, les métaux lourds recouvrent le côté des échantillons seulement (métaux lourds vaporisés obliquement). Dans la coloration négative, c’est tout l’échantillon qui est vaporisé (trempé directement dans la solution).
Quel est le principe de base de la cryofracture et du cryodécapage?
On congèle l’échantillon pour ensuite le fracturer ce qui a pour effet de créer une surface irrégulière qui est décaper pour augmenter le relief des échantillons à observer.
Qu’est-ce qui est détecté et permet de classer les protéines dans la résonance magnétique nucléaire? Quel aspect les molécules doivent respecter?
Le retour à l’état initial des spins nucléaires suite à leur excitation. Ils doivent être placer en solution.
Quels sont les 3 types de chromatographie? Expliquez leur mode de fonctionnement et qu’est-ce qu’on fait pour retirer les substances liés au gel?
- Chromatographie avec affinité anticorps (les molécules d’intérêt se fixe aux anticorps spécifiques). On baisse le pH (acide) pour briser les liaisons antigène-anticorps.
- Chromatographie avec gel de filtration (Les petites molécules se heurtent au gel tandis que les grosses descendent direct). Les petites molécules sortent d’eux-mêmes.
- Chromatographie avec échangeurs d’ions (Les substances + ou - sont attirés par le gel de charge opposée). On met du NaCl pour faire compétition au liaison gel-ion.
Quels sont les 4 composantes communes des techniques d’analyse des acides nucléiques et des protéines?
- Cible
- Sonde
- Secondaire
- Enzyme, fluorochrome
Quels sont les 2 principes du Western Blot?
1- Séparation des protéines selon leur poids moléculaire
2- Immunodétection de la protéine d’intérêt.
Pourquoi transfert-on souvent les échantillons à analyser sur une membrane? Pourquoi est-ce qu’on hybride la membrane?
Les anticorps fonctionnent mieux lorsqu’on les met en contact avec une membrane. Ils ont tendance à s’y coller donc on hybride la membrane (on met des protéines de lait autour de l’échantillon) afin que les anticorps se fixe sur l’échantillon et non sur la membrane.
Qu’est-ce qui produit la fluorescence dans les techniques d’analyse?
- Un fluorochrome
- Une enzyme qui produit de la lumière ou dégrade un substrat.
- Fluorescence naturelle: Chlorophylles, GFP
Quelles sont les différences entre un Western Blot et un test ELISA?
Le test ELISA utilise une gamme étalon qui permet de doser alors que le Western Blot n’en utilise pas. Aussi, le Western Blot se fait sur un support solide (membrane) alors que le test ELISA se fait sur un support liquide
Quelle est la différence entre l’immunohistochimie (IHC) et l’immunofluorescence (IFC)?
L’IHC utilise des enzymes ou un colorant pour produire la coloration alors que l’IFC utilise un fluorochrome.
La cytométrie de flux nous renseigne sur quel paramètre de la cellule?
La morphologie et la structure cellulaire.
Quels sont les abréviations données aux petits angles et aux grands angles dans la cytométrie de flux?
FSC: Petits angles
SSC: Grands angles
Quel est l’avantage et le désavantage majeur de la cytométrie de flux?
Avantage: Pureté de 99% des cellules isolées
Désavantage: Très lent faire le tri des cellules.
Quels sont les 2 grandes contraintes de la microscopie photonique?
Épaisseur: de 2 à 5 micromètre
Contraste
Les membranes constituent 2 barrières entre 3 choses, lesquels?
Barrière entre l’extérieur de la cellule et son intérieur ainsi que l’espace à l’intérieur des organites
Quels sont les fonctions de la membrane?
- Barrière à perméabilité sélective
- Transduction d’énergie (ATP, photosynthèse)
- Transport des molécules
- Support des activités métaboliques (Import-Export)
- Réponse aux signaux extérieurs
- Interaction entre les cellules
- Création de gradients d’ions
- Mouvement et expansion cellulaire
Quels sont les 5 éléments constituants le système endomembranaire?
- Vésicules de sécrétion
- Lysosome
- RE
- Appareil de Golgi
- Endosome
Quels sont les fonctions du système endomembranaire?
- Régulation du calcium
- Dégradation de diverses substances
- Production, stockage et exportation des protéines
Quels sont les 2 types de transport dans le système endomembranaire?
1-Adressage des protéines basé sur une séquence signal (Entrée dans le système endomembranaire)
2- Transport vésiculaire (Entre les organites)
Quels sont les 3 membranes présentes dans un cellule?
Membrane plasmique
Membrane nucléaire
Membrane des organites
Quelles sont les fonctions principales des membranes intracellulaires?
Compartimentation et barrière sélective entre l’organite et le cytoplasme
Quels sont les 2 constituants de tous les membranes?
Lipides et protéines
Quels sont les 3 types de lipides? Où sont situés ces lipides dans la BCL?
1-Phospholipides (Face interne et externe)
2-Glycolipides (Face externe)
3-Cholestérol (Centre)
Comment appelle-t-on une molécule comme le cholestérol ayant un groupement -OH et une partie hydrocarbonée C-H?
Une molécule amphipatique
Les phospholipides se divisent en 2 sous-groupes. Lesquels sont-ils? Quels sont leurs constituants moléculaires?
1- Phosphoglycérolipides (Phosphate, Glycérol et acide gras + Acide aminé ou alcool) Exemple: Phosphatidylcholines
2- Sphingophospholipides (Phosphate, Acide gras et sphingosine + Acide aminé ou alcool)
Quels sont les lipides les plus abondants de la membrane cellulaire? Soyez le plus précis possible
Phosphatidylcholines
Qu’est-ce qu’un sphingosine?
Un alcool aminé synthétisé à partir du palmitoyl-CoA et de la sérine.
Quels sont les 2 types de glycolipides?
-Glycéroglycolipides
-Sphingoglycolipides
ATTENTION PAS DE PHOSPHATE ICI
À quoi ressemble la structure des carbones du cholestérol?
3 cycles carbonés à 6C et 1 cycle carboné à 5C. snake
Quelle modification faite au cholestérol lui enlèverait son caractère amphipatique.
Une estérification (retrait de OH pour un COO-R) augmente le nombre de C donc le cholestérol devient entièrement non-polaire.
2 principes expliquent le positionnement de la BCL. Lesquels? Quels types de liaisons se fait-il entre les molécules de chaque région respective?
La tête hydrophile des lipides est exposé vers l’eau (ponts H et interactions électrostatiques). Tandis que les queues hydrophobes fuient l’eau et se rassemblent au centre (effet hydrophobe).
Pourquoi la bicouche lipidique se referme en une structure sphérique hydrophile en son centre?
On ne veut exposer aucun lipide à l’eau. Sans cette conformation sphérique, la BCL serait plane et les lipides des extrémités ferait face à l’eau. La structure fermée est la plus stable.
Quels sont les 2 déplacements possibles des lipides de la BCL?
1- Flip-flop (basculement d’une monocouche à une autre)
2- Diffusion latérale, flexion, rotation sur une même monocouche
La fluidité de la membrane des végétaux dépend de quoi?
-Longueur des acides gras
-Degré d’insaturation
(Le cholestérol présent seulement chez les animaux)
Quel molécule raffermit la membrane? De quelle manière?
Le cholestérol se glisse dans les espaces vacants dans la BCL dû au degré d’insaturation et à la longueur des AG.
Donnez un exemple révélant l’importance de la fluidité de la membrane?
Fusion des vésicules avec la membrane ou déplacement des protéines pour transmission d’un signal.
Est-ce que les membranes comporte les mêmes composantes sur leur face interne et externe?
Non, les membranes sont asymétriques.
Comment la membrane fait-elle pour garder sa forme ronde malgré le fait que lors de la croissance, les lipides fusionnent à la membrane côté cytoplasmique seulement?
Les lipides doivent faire un flip-flop pour passer sur la couche externe.
Comment appelle-t-on l’enzyme faisant passer les lipides d’un côté de la BCL à un autre?
Une flippase.
Vrai ou Faux? Les membranes des vésicules sont constitués uniquement de phosphatidylcholines.
Faux. Les vésicules respectent l’asymétrie des membranes. Donc, elles sont constituées de toutes sortes de lipides.
Où a lieu la synthèse des lipides? Soyez précis
Dans le RE, sur sa face cytosolique.
Qu’est-ce que des rafts? Que contiennent-ils?
Ce sont des zones de la membrane regroupant des protéines fonctionnant ensemble. Ces zones sont enrichis en sphingolipides, cholestérol et protéines.
Quels sont les rôles des rafts?
Ils permettent d’accommoder les protéines ayant de longs domaines membranaires.
Vrai ou Faux? Les protéines représentent 70 % de la masse totale des membranes?
Faux, ils représentent 50 % de la masse totale des membranes.
Quels sont les 4 principales fonctions des protéines membranaires?
- Transport
- Catalyser des réactions (enzyme)
- Capter les signaux
- Ancrage de la cellule
Quels sont les 3 façons dont les protéines peuvent se lier à la membrane?
- Intégrales (domaine dans la membrane)
- Ancrage lipidique (attaché un lipide membranaire)
- Périphériques (attaché sur une protéine membranaire)
Quelle est la forme adopté par la protéine lorsqu’elle traverse la membrane? Pourquoi adopte-elle cette forme?
La protéine est en forme d’hélice alpha ou de tonneau de feuillet bêta qui seront faits d’acides aminés hydrophobes majoritairement. Elle adopte cette forme de plusieurs hélices pour créer un pore aqueux laissant passer les molécules hydrosolubles.
Où se retrouvent principalement les tonneaux beta?
Dans les chloroplastes, les mitochondries et les bactéries.
Sur quels acides aminés les sucres s’ajoutent-ils?
Asn-X-Thr
Quels sont les déplacements possibles pour les protéines membranaires?
Diffusion latérale
Comment appelle-on la technique servant à mesurer le déplacement latéral des protéines?
Le FRAP (Fluorescence Recovery After Photobleaching).
Qu’est-ce que le FRAP? Quels sont les étapes de réalisation?
Une technique servant à mesurer la mobilité membranaire. C’est-à-dire qu’on attache un marqueur fluorescent (fluorochrome) aux éléments d’intérêt d’une membrane. Ensuite, avec un laser, on éteint une région de la membrane (fluorochrome n’émet plus de lumière). Après un certain, si la région éteinte plus tôt se rallume, on sait qu’il y a mouvement dans la membrane.
Qu’est-ce que le RE (réticulum endoplasmique)?
C’est un réseau de tubules interconnectés parcourant le cytoplasme.
Quels sont les 2 types de RE? Quels sont leurs rôles?
- Réticulum endoplasmique lisse. Rôle dans la synthèse des lipides, du cholestérol, des hormones stéroïdiennes, absorption et transport des lipides, détoxification
- Réticulum endoplasmique rugueux. Rôle dans la synthèse, glycosylation et contrôle de la qualité des protéines, début de la voie sécrétoire
Qu’est-ce qui détermine si une protéine optera pour la voie sécrétrice ou pas?
Si la protéine présente une séquence signal du propre du RE, la protéine empruntera la voie sécrétrice.
Vrai ou Faux? Une protéine empruntant la voie sécrétrice sera traduit par un ribosome libre.
Faux, une protéine empruntant la voie sécrétrice sera traduit par un ribosome du RE.
Qu’est-ce que la voie sécrétoire et la voie non sécrétoire?
La voie sécrétoire emprunte le système endomembranaire tandis que la voie non sécrétoire représente les protéines qui intègrent directement un organite (noyau, mitochondrie, lysosome…) ou qui reste dans le cytoplasme
Qu’est-ce qui se lie au complexe ribosome-protéine afin de traduire la protéine dans le RE?
La protéine de reconnaissance signal (SRP)
Comment fonctionne la SRP?
Elle se lie au complexe ribosome-protéine (séquence signal) et bloque la synthèse de la protéine tant que le complexe n’a pas rejoint le récepteur du RE.
La SRP est constituée de quels acides aminés majoritairement?
Méthionine
Par où la protéine synthétisée passe pour intégrer la lumière du RE? Comment ce canal est-il ouvert?
La protéine passe par le translocon. Celui-ci est ouvert grâce à l’hydrolyse du GTP.
Qu’est-ce que la translocation co-traductionnelle?
C’est le fait de traduire une protéine directement à l’intérieur du RE grâce à la SRP, son récepteur et le translocon.
Qu’est-ce qui cause l’ouverture du translocon?
Le peptide signal retrouvé au début de la protéine avec l’hydrolyse de GTP
Comment s’appelle le translocon? Quels sont ces composantes? Laquelle est la plus importante et de quoi est-elle composée?
Le translocon est appelé Sec61. Il comporte des sous-unités alpha, beta, gamma. La plus importante est la sous-unité alpha faite de 10 hélices alpha.
Est-ce que la séquence signal demeure accroché avec le peptide synthétisé?
Non, la séquence signal est clivé dans le type 1
Par quoi la séquence signal est clivé dans la translocation co-traductionnelle?
Par une enzyme peptidase.
Quel forme prenne les domaines transmembranaires des protéines?
Des hélices alpha.
Combien de domaines maximum une protéine transmembranaire peut avoir?
Maximum de 7 domaines.
Avec quel lipide une protéine peut-elle se lier? Du côté cytosolique ou dans la lumière du RE?
La protéine peut se lier avec le glycophosphatidylinositol (GPI) dans la face interne du RE.
Qu’arrive-t-il aux protéines mal repliées dans le RE?
Elles sont retournées dans le cytosol pour être dégradées.
Quels sont les 3 étapes faites dans le RE pour rendre une protéine fonctionnelle?
1- Glycosylation
2- Formation de ponts disulfures
3- Repliement de la chaîne peptidique et assemblage en plusieurs unités.
Vrai ou Faux? La formation de l’oligosaccharide préformé pour la glycosylation se fait uniquement du côté cytosolique.
Faux, il y a un flip dans la membrane vers la fin pour ajouter 4 mannoses.
L’oligosaccharide se lie à quoi? À l’aide de quoi?
Il se lie sur une asparigine d’une protéine grâce à l’enzyme: Oligosaccharyl transferase.
Qu’est-ce que des chaperonnes? C’est quoi leur rôle?
Ce sont des aides dans le repliement des protéines. Elles permettent de rendre les protéines fonctionnelles si leur structure n’est pas conforme à l’habitude.
Quelle type de molécule sur les protéines est visé spécifiquement par la majorité des chaperonnes?
Les glucides
Vrai ou Faux? Les protéines solubles mal repliées doivent entrer dans le RE pour ensuite resortir et finalement être dégrader par un protéasome.
Vrai. Les protéines solubles doivent rentrer dans le RE pour être marqué par les ubiquitines à leur sortie.
Qu’est-ce que le protéasome reconnait pour dégrader une protéine mal repliée?
Le protéasome reconnaît l’ubiquitine. Il doit y avoir au moins 3 ubiquitines pour que le protéasome dégrade la protéine.
Combien d’enzymes sont nécessaires au processus d’ubiquitination? Quels sont leurs rôles?
3 enzymes:
- E1: Ligase qui fixe l’ubiquitine
- E2 et E3 changent la conformation et permettent à 1 ubiquitine de s’accrocher sur la protéine mal repliée.
Où a lieu le processus d’ubiquitination?
Dans la membrane du RE.
Pourquoi le calcium est si important pour le RE?
Il est nécessaire à l’activité des chaperonnes du RE.
Qu’est-ce qui explique la faible concentration cytosolique du calcium?
Le calcium est enfermé dans le réticulum sarcoplasmique et dans le milieu extracellulaire.
Comment le calcium rentre dans le RE?
Grâce à une pompe à calcium.
Quels sont les 2 chaperonnes principales dont nous parlons? De quoi ont-ils besoin pour fonctionner?
-Calréticuline
-Calnexine
Ils ont besoin de calcium pour bien fonctionner.
Quels sont les signaux possibles engendrant une entrée de calcium dans le cytosol?
- Signaux chimiques (IP3)
- Signaux électriques (dépolarisation - muscle, neurone)
Par où sort le calcium du RE? Comment sont activés ces voies?
Le calcium sort par un canal ligand-dépendants à 2 substances: Les récepteurs de l’IP3 et les récepteurs de la ryanodine
Qu’est-ce que l’IP3?
Une molécule de glucose phosphorylée (Inositol 1,4,5-triphosphate) qui sert de ligand pour le canal à calcium du RE.
Quel est le rôle du RE dans la synthèse des lipides? Quel est le réactif initial du cholestérol?
Le RE synthétise le cholestérol grâce à des enzymes qu’il possède. Il synthétise le cholestérol à partir de l’Acétyl-CoA.
Par où passe les structures dans l’Appareil de Golgi du début jusqu’à la fin?
Ils entrent par la face cis, traverse les citernes et subissent des modifications puis ils sortent par la face trans.
Quels sont les 2 types de transport dans la voie sécrétoire?
- Transport rétrograde (vers le Golgi) appelé COPI
- Transport antérograde (vers les lysosomes, la membrane plasmique (constitutif ou régulé) appelé COPII.
Quels sont les rôles de l’AG?
- Site de glycosylation, tri des protéines de la voie sécrétoire
- Protéolyse pour maturation/activation des protéines, retrait de la séquence signal
Qu’est-ce qui permet de distinguer si une protéine sera synthétisé dans le cytosol ou dans le RE?
Sa séquence d’adressage.
Quels sont les destinées possible pour une protéine selon sa séquence d’adressage?
- Reste dans le cytoplasme
- Voie sécrétoire (Entre par le RE)
- Dans un organite.
Vrai ou Faux? Une protéine destinée à un organite est synthétisé dans l’organite comme elle le ferait dans la voie sécrétoire.
Faux. La protéine est synthétisée dans le cytoplasme et importée dans l’organite par la suite.
