exam 3 Flashcards
Éléments d’ADN mobiles
Vrai ou faux, l’insertion des transposons est complètement aléatoire
faux Ce n’est pas réellement aléatoire - Certains sites contiennent la séquence cible, mais qui ne sont pas
très utilises, voir jamais. Il y a donc des hotspot (sites préférentiels). Les repliements
de l’ADN peuvent aussi avoir un impact sur ces sites préférés
Propriétés communes des transposons
Quel est le site d’attachement Tn7 et Tn7-like
attTn7 : Site attachement transposon situé en 3’ d’un gène extrêmement
conservé chez les procaryotes (glmS)
Quel est l’effet du transposon sur les gènes adjacents ?
Les gènes en aval du site d’insertion ne seront plus
transcrits
Le transposon Tn (en rose) s’insère dans l’opéron à 4 gènes ci dessous. Quel sera son effet sur sa transcription ? Pourquoi ?
abcB : interrompu
abcC et D: non exprimés à cause de l’effet polaire :
terminateurs bidirectionnels portés par Tn
Par quel mécanisme un Tn pourrait mener à l’Activation de gènes cryptiques
si ils portent des promoteurs
permettant la transcription des gènes
adjacents
Qu’est ce qu’un opéron cryptique ?
Un operon cryptique
signifie gènes cachés.
On a soit aucune idée
de leur fonction ou ils
ne possèdent pas de
promoteur
Vrai ou faux :
La transposition est un événement très fréquent, car la
transposase a des activités peu régulées
Faux : La transposition est un événement rare sur des échelles de temps assez longs, car la
transposase a des **activités très régulées **
Décris la Régulation de la transcription du
gène codant pour la Tnpase pour Tn3
TnpR agit comme répresseur du transposon Tn3, bloquant la transcription de tnpA, codant pour la transposase (Tnpase permet au tn de se déplacer)
Décris la régulation de la transposition pour Tn10
L’ADN hémi-méthylé favorise la liaison de TnpA et son activité de clivage. Augmente aussi l’activité transcriptionnelle de Ptnp (le promoteur pour la transposase)
- assure que la transposition ne se produit pas de manière excessive
Décris la régulation de la transposition pour Tn5
Tnpase tronquée interagit avec Tnpase
et réduit la dimérisation des Tnpases
fonctionnelle ce qui va
inhiber la transposition
Quel type de gène (fonction) est fréquemment retrouvé dans les intégrons
Abior
VRAI OU FAUX
Les intégrons sont des éléments d’ADN mobile
Faux: Pas des éléments d’ADN mobile, mais qui vont
intégrer de façon privilégiée dans des transposons
Que fait la Présence d’une intégrase
permet la recombinaison
spécifique a une séquence bien précise :
reconnaît des séquences spécifiques sur l’ADN à intégrer
complétez la phrase : au sujet de l’intégron, le Promoteur constitutif (Pc) est orienté vers ______
attI: transcrit les gènes insérés
choisissez
Les cassettes les plus (proches / éloignées) de attI seront les plus exprimées
proches
Que peut il advenir des cassettes les plus distantes à attI ?
deviennent des réservoirs et être réinsérées plus proches de attI au besoin (ex. pour AbioR)
Sur un intégron normal, combien de cassettes consécutives peut on retrouver ?
8-10
Qu’est ce qu’un Superintégrons Xsomiques
Peuvent avoir jusqu’à 217
cassettes encadrées par les
séquences attC, ils sont Présents dans 17% des génomes procaryotes
Quelle est la particularité (l’erreur) que l’on peut retrouver au sujet de l’intégrase de Vibrio cholerae ?
Des fois il y a des erreurs et l’intégrase intègre la cassette a l’envers
Vrai ou faux
les Superintégrons Xsomiques sont des structures peu stables
FAUX : Stable car contient
systèmes toxines
antibiotiques toxines dont la cellule dépend donc s’ils ne sont plus là, ily aura mort de la cellule
Les Toxines- Antitoxines
Vrai ou faux : Il y en a dans TOUS les organismes bacteriens
vrai
Nommez 5 conditions pouvant induire l’activation des systèmes toxines-antitoxines
baisse de nutriments
antibiotique
choc thermique
dommage ADN
système SOS
combien de systèmes T/A possède Mycobacterium tuberculosis
80
Que veut dire cette phrase ?
le Mécanisme de mort cellulaire programmée peut etre consideré comme un sacrifice altruiste
certaines cellules qui vont se tuer, ce qui va libérer des nutriments que les autres cellules pourront utiliser