Estrutura e função de Proteínas

Question 1

Angstrom Å:

Answer 1

10^(-10)m 1nm=10Å

Question 1

Classes de Proteínas

Answer 1

• Estrutura
  Função
  Localização

Question 2

• Estrutura

Answer 2

→ Globulares

→ Fibrilares

Question 3

Função

Answer 3

→ Enzimas

→ Estruturais

→ Transporte

Question 4

Localização

Answer 4

Afeta a estrutura
→ Membranas - ambiente hidrofóbico

→ solúveis - grupos polares, hidrofílicas

Question 5

Aminoácidos estrutura geral

Answer 5

Grupo α-amino Grupo R Grupo α-carboxilo α-carbono (centro chiral)

Question 6

Enantiómeros

Answer 6

• Devido ao carbono chiral existem estruturas (19/20) espelhadas
• Os aminoacidos naturais são os L- (esquerda)
• Têm propriedades óticas diferentes e têm tendência a enrolar α-Hélice

Question 7

Quantos aminoácidos

Answer 7

20 aminoácidos - só a (G) - Glicina que tem dois substituintes iguais no centro chiral H-C-H é que as estruturas conseguem-se sobrepor

Question 8

Aminoácidos alifáticos apolares:

Answer 8

G - Glicina
A - Alanina
F - Fenilalanina
W - Triptofano
P - Prolina
M - Metionina
V - Valina
I - Isoleucina
L - Leucina

Question 9

prolina

Answer 9

→ Prolina (P) - anel na estrutura ligante → não podem torcer muito: desfazem a α-Helix

Question 10

Aminoácidos polares neutros:

Answer 10

N - Asparagina
Q - Glutamina
S - Serina
T - Teronina
Y - Tirosina
C - Cisteina

Question 11

C - Cisteina

Answer 11

o enxofre na lateral pode formar uma ligação covalente com outra cisteina → conferem estabilidade na estrutura

Question 12

Pontes de hidrogénio

Answer 12

→ aminas, grupos hidroxil: superfície das proteinas solúveis

Question 13

Polares carregados negativamente molécula:

Answer 13

→ $COO^- → interagem muito com polares carregados positivamente

Question 14

Polares carregados negativamente:

Answer 14

D - Ácido Aspártico
E - Ácido Glutámico

Question 15

Polares carregados positivamente: H+ na amina

Answer 15

K - Lisina
R - Arginina
H - Histidina

Question 16

Aminoácidos polares carregados notas:

Answer 16

formam a superfície das proteinas solúveis → os não polares situam-se no interior das solúveis
- Superfície eletroestática:

Question 17

Cadeias laterais

Answer 17

Algumas cadeias podem ser ionizadas e estar em estados diferentes de protonação:

Question 18

Proteinas como polímeros

Answer 18

Uma proteína é um polímero linear formado por condensação com ligações peptídicas

Question 19

Como se lê

Answer 19

É lida do N-terminal ($H_3N^+$) para o C-terminal ($COO^-$)

Question 20

Residuo

Answer 20

quase o aminoácido completo

Question 21

Níveis de estrutura:

Answer 21

Primária
Secundária
Terciária
Quaternária

Question 22

Primária

Answer 22

Sequência de aminoácidos numa proteina

Question 23

Secundária

Answer 23

Pontes de hidrogénio
Podemos dizer em % o conteúdo do arranjo em folhas ß e a-Hélices

Question 24

Terciária

Answer 24

Hélice dobra-se ficando com uma forma enovelada Cadeias polipéptidicas

Question 25

Quaternária

Answer 25

Como é que as cadeias se organizam quando temos a estrutura

Question 26

Interações responsáveis pela estabilidade:

Answer 26

Covalentes: pontes de dissulfureto (Cistina) Interações iónicas:Entre aminoácidos que têm cargas positivas/negativas nas ramificações Pontes de hidrogénio: Forças de Van der Walls→ dipolos momentâneos entre moléculas apolares:

Question 27

Estruturas secundárias principais:

Answer 27

α-Hélice: Folhas ß:

Question 28

α-Hélice estrutura

Answer 28

- Cadeias laterais apontam para fora da hélice → escondem os grupos polares da cadeia principal da membrana - Todos os carbonilos e as amidas da cadeia principal formam pontes de hidrogénio → garante uma estrutura estável

Question 29

α-Hélice voltas

Answer 29

- 5,4Å para dar uma volta ≈ 3.6 resíduos - O óxigénio do carbonilo do resíduo “i” forma uma ponte de hidrogénio com amida do resíduo “i+4” 100→104 101→105

Question 30

α-Hélice notas

Answer 30

- A piolina (anel) não gosta muito de estar em α-Hélice devido à sua flexibilidade - Glicina: Muito flexível e muda a estrutura da hélice Rotação com a mão direita devido à isomeria ótica.

Question 31

Folhas ß estrutura

Answer 31

- Não são constituídas por uma cadeia contínua - Carbonilos e amidas fazem pontes de hidrogénio - Cadeias laterais vão alterando de orientação

Question 32

Antiparalelas

Answer 32

- Pontes de hidrogénio mais estáveis - ß-Turn → por exemplo prolina são voltas apertadas no fim das cadeias -> <- ->

Question 33

Paralelas

Answer 33

- Têm de dar voltas maiores - Têm de sair da folha - -> -> ->

Question 34

Proteinas de transporte exemplo

Answer 34

Hemoglobina/Mioglobina nos tecidos

Question 35

Hemoglobina uso

Answer 35

Transporte de oxigénio → metalo-proteína

Question 36

Hemoglobina estrutura

Answer 36

- 4 cadeias com um átomo de ferro cada → ligado a 4 azotos que formam um anel - O ferra liga-se ao oxigénio:

Question 37

cooperatividade

Answer 37

a ligação da primeira aumenta a afinaidade para a segunda para oxigénio daí a curva de dissociação

Question 38

Desoxihemoglobina vs oxihemoglobina

Answer 38

Desoxihemoglobina → sem oxigénio e a oxihemoglobina são diferentes na posicionalização do átomo de ferro- Muda ligeiramente a posição da alpha-hélice

Question 39

Efeito da carga

Answer 39

- Quanto maior for a carga → maior será a solubilidade - Os mamifros marítimos têm mioglobina de maior carga e mais ferro

Question 40

Proteinas de estrutura exemplo

Answer 40

Exemplo do colagénio: - Representa aproximadamenta 1/4 do total da proteína no nosso corpo - Presente nos tendões ossos e dentes (com HA

Question 41

Colagénio estrutura

Answer 41

- Forma de tripla hélice - Repetição: Glicina, Hidroxiprolina, prolina - necessária vitamina C para a formação de hidrpoxiprolina

Question 42

Proteinas de catálise exemplo

Answer 42

Catalase Produz água e oxigénio de peroxido de hidrogénio

Question 43

Passos da catalase

Answer 43

Passo 1: molécula de H2O2 liga-se e um O é extraído, permanecendo ligado ao ferro. Molécula de água libertada Passo 2: liga-se uma segunda molécula de H2O2 que também é partida. Liberta-se uma molécula de água e uma de O2