Catálise enzimática Flashcards

1
Q

Que modelos de cinética existem

A

Chave e fechadura e encaixe induzido

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2
Q

Modelo chave-e-fechadura caracteristicas

A

Complementaridade perfeita entre enzima e substrato
Pouco eficiente
Ficam muitos substratos em complexo

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3
Q

Modelo Encaixe induzido caracteristicas

A

Enzima no local de ligação tem afinidade para o estado transiente da reação → destabiliza o substrato e catalisa a reação

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4
Q

Como é que a redução da E.A. é compensada

A

pela energia de ligação resulta das interações entro o substrato e a enzima no
estado de transição

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5
Q

Para o que é que é necessária energia

A

Reduzir a entropia do sistema
Retirar águas de solvatação
Alinhar os resíduos do centro catalítico

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6
Q

O que acontece quando a energia aumenta

A

Menor será k

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7
Q

O que são grupos catalíticos

A

Mecanismos pelos quais os grupos catalíticos → assistem na formação quebra de ligações covalentes:

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8
Q

Quais são os grupos catalíticos

A

Catálise ácido-base, Catálise covalente, iões metálicos

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9
Q

Catálise ácido-base

A

Intermediários/Resíduos carregados podem ser estabilizados pela transferência de protões

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10
Q

Catálise covalente

A

Uma ligação covalente transiente é formada entre a enzima e o substrato.

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11
Q

Resíduos envolvidos

A

Os resíduos normalmente envolvidos são Lys, His, Cys, Asp, Glu, e Ser.

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12
Q

Iões metálicos com função catalítica função e factos

A

→ Ajudam a orientar a ligação do substrato para promover a reação

→ Mediação de reações oxidação-redução (estado de oxidação do ião metálico reversível)

→ Cerca de 1/3 das enzimas
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13
Q

Que fator impacta a velocidade de reação

A
  • Velocidade afetada por [S]
  • [S] varia durante a reação
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14
Q

Quando é que se mede a velocidade incial

A
  • Mede-se a velocidade inicial quando [S]»[E]
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15
Q

O que postula o modelo de Michaelis Menten

A

→ A velocidade da reação é proporcional ao passo lento → [ES]

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16
Q

Equação de Michaelis-Menten

A

v0=(vmax[S]/Km+[S])

17
Q

Enzimática não representadas pela equação de Michaelis-Mentem:

A

não dependem de um mecanismo com 2 passos.

18
Q

Parametros para a Comparação de Eficiências Catalíticas:

A

k (cat) em 1/s é equivalente à constante de reação do passo limitante e Km que descreve a afinidade entre uma enzima e o substrato

19
Q

Qual é o valor máximo de eficiêcias catalíticas

A

→ Valor máximo/Teto: 10^8/10^9 1/Ms pois a partir deste valor a velocidade máxima é controlada pela difusão do substrato e produto (a que não podemos alterar a velocidade)

20
Q

Mecanismos de Inibição Enzimática reversível

A

Inibição competitiva
Inibição anti competitiva
Inibição mista
Inibição não competitiva

21
Q

Inibição Competitiva:

A

Inibidor liga-se no centro catalítico da enzima; $K_I$ é a constante de equilíbrio para a ligação do inibidor à Enzima.

22
Q

Inibição Anti-Competitiva:

A

Inibidor liga-se fora do centro catalítico, e apenas quando se forma o complexo ES; $K’_I$ é a constante de equilíbrio para a ligação do inibidor ao ES.

23
Q

Inibição Mista

A

Inibidor liga-se fora do centro catalítico mas pode
ligar-se à E ou a ES.

24
Q

Inibição não competitiva

25
Regulação da atividade enzimática em reações metabólicas (2 opções)
1. Variando a concentração da enzima 2. Regulando a atividade das enzimas presentes (normalmente este)
26
Reguladores da atividade das enzimas presentes
Regulação Alostérica (allo-outro; steric-forma) Regulação Covalente Inibição Feedback
27
Regulação Alostérica (allo-outro; steric-forma) definição
→ Enzimas com outro local de ligação, além do centro catalítico, onde se ligam os moduladores da atividade.
28
Regulação Alostérica (allo-outro; steric-forma) - funções
→ Os moduladores alteram a conformação da enzima e podem tanto aumentar como diminuir a atividade da enzima. → As enzimas podem ser afetadas por mais que um modulador e mesmo ter mais que um local de ligação de moduladores
29
Regulação Covalente
→ A atividade de uma enzima pode ser alterada pela ligação covalente de um grupo químico à enzima → São necessárias outras enzimas para catalisar a formação e o corte dessa ligação covalente
30
Exemplo de covalente
→ Exemplo: a fosforilação e desfosforilação de enzimas Cinase-catalisa a adição de um grupo fosfato Fofatase-catalisa a remoção de um grupo fosfato
31
Inibição Feedback
→Reações ocorrem em série Produto → Substrato da seguinte → O produto de uma reação regula a atividade de uma enzima de uma reação anterior
32
Regulação feedforward
um substrato regular uma reação a jusante: Por exemplo B modulador alostérico de E3