Epigenetica Flashcards
Waardoor wordt genetische status geregeld?
Ligt vast in volgorde DNA
Wat regelt epigenetische status?
Biochemische eigenschappen van DNA en de daarmee geassocieerde eiwitten, variabel tussen verschillende celtypes
Epigenetische status
Combi van histonmodificaties en DNA-methylering
Hoeveel baseparen zijn rond een octameer gewonden?
147
Hoe zijn histonbolletjes verbonden?
Via linker DNA
Herhalingseenheid
Een nucleosoom (inclusief linker DNA en lengte is 200bp)
N-terminale staarten
Staarten van histonen die uitsteken van centrale globulaire domein, ze zijn betrokken bij vorming van 30 nm draad. Ze kunnen biochemische modificaties ondergaan die hun biofysische eigenschappen beïnvloeden
Heterochromatine
Gesloten ontoegankelijke chromatine
Genen inactief
Zorgen voor uitlezing door represserende eiwitcomplexen
Euchromatine
Open toegankelijke chromatine
Genen actief
Zorgen voor uitlezing activerende eiwitcomplexen
Transcriptiefactoren kunnen
- Weefselspecifiek tot expressie komen
- Geactiveerd worden door binding van ligand
- Via signaal-transductie relocaliseren van cytoplasma naar kern
- Rekrutering van enzymen die betrokken zijn bij aanbrengen en verwijderen van histonmodificaties
DNA-methyltransferases (DNMTs)
Enzymen die met behulp van cofactor s-adenosylmehthionine als methyldonor cytosine basen kunnen methyleren
2 klassen van DNMTs
De novo
Maintenance
De novo DNMTs
Kunnen ongemethyleerde CG volgordes methyleren
Rol in epigenetische status: nieuwe methyleringspatronenen neerzetten
Maintenance DNMTs
Kunnen alleen hemi-gemethyleerde CG volgordes methyleren
Rol: zorgen dat na celdeling de cytosine in beide strengen weer wordt gemethyleerd zodat eenmaal vastgelegd methyleringspatroon behouden blijft
Wat gebeurt bij binding van MBD (methyl bindend domein) eiwitten?
Chromatine van open en toegankelijk gaat naar gesloten en ontoegankelijk
