Enzymy Flashcards

1
Q

W jaki sposób katalizator wpływa na przebieg reakcji?

A

Katalizor przyspiesza przebieg reakcji, ale nie jest niezbędny do jej zajścia lub zmiany jej mechanizmu.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Czym są biokatalizatory?

A

Biokatalizatory to katalizatory, które występują naturalnie w żywych organizmach i napędzają ich procesy.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Biokatalizatory to substancje z jakich grup?

A

Biokatalizatory to substancje z grup:
1. witamin
2. hormonów
3. enzymów

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Co spełniało funkcję enzymów we wczesnej fazie biogenezy?

A

We wczesnej fazie biogenezy funkcję enzymów spełniały cząsteczki RNA.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Co obecnie spełnia funkcję enzymów?

A

Obecnie funkcję enzymów spełniają białka.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Gdzie występują enzymy białkowe?

A

Enzymy białkowe występują we wszystkich komórkach, każdego żywego organizmu, a także w kapsydach wirusów.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Z czego składa się enzym?

A

Enzym składa się z:
1. Apoenzymu
2. Centrum aktywnego
3. Centrum allosterycznego

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Co to jest apoenzym?

A

Apoenzym jest właściwą częścią enzymu - jego ciałem zbudowanym z łańcuchów peptydowych.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Dzięki czemu apoenzym przybiera unikalny wyłącznie dla siebie kształt?

A

Apoenzym dzięki trzeciorzędowej strukturze białka przybiera unikalny dla siebie kształt.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Na czym polega specyfika enzymów?

A

Specyfika enzymów polega na tym, że każdy typ enzymu posiada odmienny kształt, dzięki temu może współdziałać tylko z innymi, konkretnymi substancjami, których kształt jest dopasowany do enzymu. Czyli każdy typ enzymu katalizuje tylko określony proces.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Co to jest centrum aktywne?

A

Centrum aktywne to miejsce za pomocą którego apoenzym łączy się z substratem (lub koenzymem lub grupą prostetyczną), który będzie katalizowany.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Z czym może połączyć się apoenzym dzięki centrum allosterycznego?

A

Centrum allosteryczne nie występuje w każdym apoenzymie. Dzięki niemu enzym może połączyć się z koenzymem lub grupą prostetyczną.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Czym są koenzymy?

A

Koenzymy to substancje o charakterze od białek, przez cukry aż po witaminy.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Jak łączą się koenzymy z apoenzymem i co powodują?

A

Koenzymy łączą się z apoenzymem tymczasowo. Powodują jego aktywację, dzięki czemu może katalizować daną przemianę.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Jak łączą się grupy prostetyczne z apoenzymem i co powodują?

A

Grupy prostetyczne również odpowiadają za pobudzenie enzymu, ale one łączą się z nim na stałe, aż do jego zużycia lub zniszczenia.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Czym jest haloenzym?

A

Haloenzym to apoenzym połączony z dodatkową substancją, która nie stanowi substratu (czyli np. apoenzym+grupa prostetyczna lub apoenzym+koenzym).

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Czym jest kompleks enzym-substrat?

A

Kompleks enzym-substrat to nietrwałe połączenie aktywnego enzymu z przyłączonym do niego substratem.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

Co się dzieje w czasie istnienia kompleksu?

A

W czasie istnienia kompleksu substrat ulega modyfikacji, dzięki której osłabiają się wiązania chemiczne.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

Co jest niezbędne do zajścia reakcji?

A

Do zajścia reakcji niezbędne jest rozerwanie wiązań chemicznych.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

Jak powstaje kompleks enzym-produkt?

A

Kompleks enzym-produkt powstaje przez przemianę cząsteczki substratu w produkt.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

Kiedy dochodzi do kataliz z użyciem energii?

A

Do kataliz z użyciem energii dochodzi gdy kompleks enzym-produkt rozpadnie się uwalniając oba komponenty.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

Co określa liczba obrotów?

A

Liczba obrotów określa jak wiele cząsteczek substratów, i cząsteczek enzymu może zamienić się w produkty w jednostce czasu (np. w ciągu jednej sekundy).

23
Q

Wymień grupy enzymów.

A
  1. Oksydoreduktazy
  2. Transferazy
  3. Hydrolazy
  4. Liazy
  5. Izomerazy
  6. Ligazy
24
Q

Jaki typ reakcji katalizują oksydoreduktazy?

A

Oksydoreduktazy katalizują reakcję redoks (utlenianie i redukcję związków).

25
Jaki typ reakcji katalizują transferazy?
Transferazy katalizują reakcje podczas, których dochodzi do przenoszenia grup funkcyjnych między cząsteczkami.
26
Jaki typ reakcji katalizują hydrolazy?
Hydrolazy katalizują reakcje rozkładu z udziałem wody (np. hydroliza skrobi).
27
Jaki typ reakcji katalizują liazy?
Liazy katalizują reakcje rozpadu (bez udziału wody).
28
Jaki typ reakcji katalizują izomerazy?
Izomerazy katalizują reakcje przegrupowań wewnątrzcząsteczkowych, zmiany danego izomeru na inny.
29
Jaki typ reakcji katalizują ligazy?
Ligazy katalizują reakcje, w których dochodzi do syntezy związku przez powstanie wiązań między węglem a atomem innego pierwiastka (np. C-C; C-N; C-S).
30
Co to są proenzymy i po co one są?
Proenzymy to enzymy w postaci nieaktywnej, aby móc je "włączyć" dopiero w środowisku odpowiedniej reakcji.
31
Co jest potrzebne do aktywacji proenzymu?
Do aktywacji proenzymu potrzebny jest czynnik w postaci koenzymu/grupy prostetycznej lub odpowiednich warunków środowiska (temperatury, składu chemicznego macierzy, odczynu pH).
32
Co to jest kompartmentacja?
Kompartmentacja to podział komórki na obszary o różnych warunkach. Jego przyczyną jest rozbudowana siateczka śródplazmatyczna.
33
Jakie czynniki wpływają na aktywność enzymu?
Czynniki wpływające na aktywność enzymu: 1. Temperatura środowiska 2. Odczyn pH 3. Substancje chemiczne
34
W jaki sposób temperatura środowiska wpływa na aktywność enzymu?
Aktywność enzymu rośnie wraz ze wzrostem temperatury, aż do 45st. C - powyżej białko budujące enzym ulega denaturacji - centrum aktywne zostaje zniekształcone i żaden substrat nie może się z nim połączyć. Wyjątkiem są enzymy obecne w komórkach Archeabater - prokariontów żyjących w gorących źródłach, ze względu na unikalną strukturę.
35
W jaki sposób odczyn pH wpływa na aktywność enzymu?
Każdy enzym posiada określoną wartość pH, które jest optymalne dla jego działania. Przykłady enzymów: a) amylaza ślinowa pH=7 b) pepsyna pH=2 c) trypsyna pH=8 d) nukleaza pH=8 e) amylaza trzustkowa pH=8
36
W jaki sposób substancje chemiczne wpływają na aktywność enzymu?
Substancje, które wywołują wzrost aktywności enzymu nazywane są aktywatorami. Popularną substancją tego typu jest koenzym A (w skrócie CoA). Substancje, które powodują spadek aktywności enzymu są nazywane inhibitorami.
37
Co wyraża krzywa Michaelisa-Mentena?
Krzywa Michaelisa-Mentena wyraża stosunek szybkości reakcji do stężenia substratu.
38
Jakiej wartości odpowiada stała Michaelisa-Mentena?
Stała Michaelisa-Mentena (KM) odpowiada wartości stężenia substratu, przy której szybkość reakcji jest równa połowie szybkości maksymalnej jaką może osiągnąć enzym.
39
Czym jest Vmax?
Vmax to prędkość maksymalna jaką enzym może teoretycznie nadać katalizowanej reakcji w optymalnych dla siebie warunkach.
40
Czym jest KM?
KM to stała Michaelisa-Mentena - to wartość stężenia substratu, przy którym prędkość reakcji równa się połowie Vmax.
41
Wyjaśnij zależność pomiędzy wartością KM, a aktywnością enzymu.
Im niższą wartość KM ma dany enzym (w określonych warunkach) tym jest bardziej aktywny, więc działają na niego czynniki o wartości najbardziej zbliżonej do optimum.
42
Co to są aktywatory?
Aktywatory to substancje powodujące wzrost aktywności enzymu.
43
Co to są inhibitory?
Inhibitory to substancje powodujące zahamowanie działania enzymu.
44
Wymień rodzaje inhibicji.
1. Inhibicja kompetencyjna 2. Inhibicja niekompetencyjna 3. Inhibicja allosteryczna
45
Na czym polega inhibicja kompetencyjna?
* Inhibicja kompetencyjna polega na podobieństwie cząsteczki inhibitora i substratu. * Inhibitor kompetencyjny łączy się z enzymem w miejscu centrum aktywnego. * Powstaje kompleks, który uniemożliwia enzymowi łączenie się z substratami i katalizowanie reakcji.
46
W jakim przypadku skuteczność inhibicji kompetencyjnej rośnie?
Skuteczność inhibicji kompetencyjnej rośnie wraz ze stężeniem inhibitora kompetencyjnego, ale można ją zniwelować przez wzrost stężenia substratu.
47
Na czym polega inhibicja niekompetencyjna?
* W inhibicji niekompetencyjnej inhibitor i substrat nie wykazują podobieństwa. * Inhibitor niekompetencyjny łączy się z enzymem w innym miejscu niż centrum aktywne, jednak to połączenie skutkuje zmianą kształtu centrum aktywnego - w wyniku czego substrat nie może utworzyć kompleksu z enzymem
48
W jakim przypadku skuteczność inhibicji niekompetencyjnej rośnie?
Skuteczność inhibicji niekompetencyjnej rośnie wraz ze stężeniem inhibitora niekompetencyjnego, a wzrost stężenia substratu w ogóle nie ma wpływu na to zjawisko.
49
Na czym polega inhibicja allosteryczna?
* Inhibicja allosteryczna polega na tym, że inhibitor allosteryczny łączy się z enzymem w miejscu centrum allosterycznego w wyniku czego cały enzym zmienia swoją strukturę i staje się nieaktywny. * Inhibitorem allosterycznym zazwyczaj jest produkt końcowy jakiegoś szeregu przemian - to zjawisko to tzw. mechanizm stężeń zwrotnych ujmnych.
50
Na czym polega sprzężenie zwrotne?
Sprzężenie zwrotne polega na wpływie produkty ostatniej reakcji szlaku na przemianę, która zachodzi gdzieś w początkowych etapach szlaku.
51
Czy sprzężenie zwrotne dotyczy również cykli metabolicznych?
Nie. Sprzężenie zwrotne dotyczy wyłącznie szlaków metabolicznych.
52
Jaki jest podział sprzężenia zwrotnego w zależności od tego, w jaki sposób produkt wpłynie na przemianę?
W zależności od tego, w jaki sposób produkt wpłynie na przemianę wyróżnia się sprzężenia zwrotne dodatnie i ujemne.
53
Jak sprzężenie zwrotne dodatnie wpływa na przemianę?
Sprzężenie zwrotne dodatnie zwiększa efektywność przemiany.
54
Jak sprzężenie zwrotne ujemne wpływa na przemianę?
Sprzężenie zwrotne ujemne zmniejsza efektywność przemiany.