Enzymkinetik Flashcards
Var i enzymet binder substratet?
Till active site
Vilka sätt finns det att reglera enzymaktivitet?
Enzymmängd - långsam reglering via t.ex. genreglering
Kovalent modifiering av enzymet - medellång tid, ofta fosforylering
Alloster reglering - snabb effekt
Vilka huvudenzymklasser finns det?
Oxidoreduktas
Tranferas
Hydrolas
Lyase
Isomeras
Ligas
Vilka är förutsättningarna för Michaelis- Menten kinetik?
- V0-mätningar
- Substratmängden får ej vara begränsande
- ingen koopoerativitet
- ingen diffusion
- kan endast studera en typ av substrat i taget
Vad plottas på axlarna i en Michaelis-Menten graf?
S mot V
Substrat konc. (X-axel) Mot hastighet (Y-axel)
Vilken är Michaeliskonstanten?
Km
Vilka typer av reversibla inhibitorer finns det och vad menas med en irreveersible inhibitporer?
Reversibla inhibitorer kan vara kompetitiva, non-kometitiva och okompetetiva
En irreversibel inhibitor binder ofta kovalent
Hur definieras en kompetitiv inhibitor?
Tävlar med substraten om inbindning till active site.
Km höjs (mer sub behövs för att komma upp i Vmax) affiniteten för substraten minskar
Vmax påverkas ej eftersom vid tillräckligt hög konc. Av sub kommer sub att konkurrera ut inhibitor
Hur definieras en non-kompetitiv inhibitor?
Binder till annat site på enzymet (lik alloster reglering)
Sänker Vmax (maximala produktbildningshastigheten sänks)
Km är oförändrad (enzymets affinitet för sub)
Hur definieras en okompetativ inhibitor?
Binder till samma activa site som substraten och låser fast substratet.
Km sänks (affiniteten för substratet ökar eftersom det är fastlåst)
Vmax sänks (den maximala omvandlingshastigheten/produkthastigheten sänks)
Vad är en kofaktor vs koenzym?
Kofaktor är en hjälpfaktor/hjälpmolekyl som behövd vid katalys
Kan vara oorganiska joner/föreningar som t.ex. metalljoner
Koenzym är organiska föreningar, ofta B-vbit
Vad är Km?
Substatkoncentrationen vid halva Vmax
- ger en uppfattning om enzymets affinitet för substratet. Ett högt Km betyder att det behövs mycket substrat för att enzymet ska komma upp i halva maxomvandlingshastigheten och affiniteten är låg
Vad ger Kcat?
Turnover number
Antalet substratmolekyler som omvandlas till produkt per sekund.
Vmax/ konc substrat
Mäts i katal (s^-1)
Vad är Vmax?
Maximal omvandlingshastighet vid obegränsat substrat
Direkt beroende av koncentrationen av E,
Tre punker för att studera enzymaktivetet?
Val av substrat + val av inmärkning
Substratmängs och enzymmängd - prova sig fram
Miljö som pH, kofaktorer etc