Enzymer

Question 1

Vad är det som gör att energibarriären sjunker och därmed påskyndar reaktionen?

Answer 1

Nästan alla enzymer har i sin struktur en grupp atomer som hjälper till att stabilisera ett transitionstillstånd. Det är denna stabilisering som gör att energibarriären sjunker varvid reaktionen påskyndas. Ett visst antal molekyler har tillräckligt mycket energi för att nå transitionstillståndet, energin som måste tillföras kallas den fria energin (Delta G).

Question 2

Vad är den så kallade aktiveringsenergin? Vad gör enzym med den?

Answer 2

För att en reaktion ska ske krävs att en viss mängd energi tillförs, Delta G.
Utan enzym är denna energi stor, medan i närvaro av enzym är aktiverinsenergin lägre.

Question 3

Vad är serinproteaser? Ge exempel

Answer 3

Proteolytiska enzym som innehåller aminosyran serine i active site. T ex trypsin, chymotrypsin, elastas, thrombin

Question 4

Vilken energi ger den sänkta aktiveringsenergin?

Answer 4

En bindningsenergi som uppkommer mellan interaktioner mellan enzym och substrat. Denna bindningsenergi sänker aktiveringsenergin.

Question 5

Ge exempel på vad som kan denatuera ett protein, och därmed förlorar sin aktivitet?

Answer 5

Urea, vatten, Ph, mm denatuerar protein

Question 6

Vissa enzymer behöver en kofaktor för sin aktivitet. Vad är det för nåt, ge två exempel:

Answer 6

1. Oorganisk jon
2. Koenzym - en organisk kofaktor.
   En kofaktor är en kemisk förening som binder till enzymer för att bidra till dess katalytiska förmåga.
   Enzym utan kofaktorer kan enbart katalysera reaktioner genom egenskaper som finns hos de aminosyror den är uppbyggd av.

Question 7

Vad menas med apoenzym?

Answer 7

Apoenzym är benämning på ett enzyms proteindel, dvs. enzymet utan koenzym eller andra kofaktorer, vilken kräver en kofaktor. (t.ex. metalljoner).

Question 8

Vad menas med holoenzym?

Answer 8

holoenzym avses hela det aktiva enzymet med alla komponenter. proteindelen + kofaktor

Question 9

Vad menas med prostetisk grupp?

Answer 9

En kofaktor som är starkt (ofta kovalent) bunden till proteinet kallas
prostetisk grupp.
Prostetisk grupp bibehåller stabila bindningar till enzymet under reaktion.
Exempel:
(ett hem t ex i hemoglobin, myoglobin

Question 10

Säg två exempel på koenzym:

Answer 10

Acetyl CoA – en acyl-donator.

ATP – en fosfat-donator

Question 11

Vad menas med Vo?

Answer 11

Vo är initialhastigheten vid substratkoncentrationen [S]

Question 12

Vad menas med Km?

Answer 12

Km (Michaelis konstanten) är ett värde på affiniteten av substratet för enzymet, d v s hur pass bra substratet binder till enzymet.

Question 13

Vad menas med Kcat?

Answer 13

Omsättningstal Kcat (turnover number) anger hur många substratmolekyler som omvandlas till produkt per tidsenhet av en enzymmolekyl då allt enzym är mättat.

Kcat = Vmax / [E]total

Question 14

Vad händer när [S]&raquo_space; (är mycket större) än Km?

Answer 14

Reaktionshastigheten närmar sig Vmax.

Låga Km-enzymer har hög affinitet för S, t ex hexokinase.

Question 15

Vad händer när [S] &laquo_space;Km?

Answer 15

När [S] är mycket mindre än Km, är reaktionshastigheten ungefär proportionell till substrat- koncentrationen.
Höga Km-enzymer har låg affinitet för S, t ex glukokinase.

Question 16

Vad händer när [S] = Km?

Answer 16

Vo, initialhastigheten, blir halva maxhastigheten, Vmax / 2

Question 17

Vad menas med kompetitiv hämning av enzym? Vad händer med Vmax? Ge exempel!

Answer 17

Substrat och inhibitor har samma säte. Hämmare (I) konkurrerar med substrat genom att binda reversibelt till det aktiva sätet. EI-komplexet ger ingen produkt. Hög koncentration av substratet kan konkurrera ut hämmaren.
Vmax blir samma.
Ex. – etanol konkurrerar ut metanol ur alkoholdehydrogenas

Question 18

Vad menas med icke-kompetitiv hämning av enzym? Vad händer med Km och Vmax?

Answer 18

Inhibitor binder reversibelt bara till ES-komplexet. Bindningssäten för inhibitor och substrat är olika. Substratet kan inte konkurrera ut hämmaren. Vid icke-kompetetiv hämning krävs att substratet sitter i aktiva sätet för att hämmaren skall binda (hämmaren låser fast substratet). Både Km och Vmax ändras.

Question 19

Vad menas blandad enzymhämmning?

Answer 19

Hämmare binder reversibelt och oberoende av substratet till ett annat bindningssäte på enzymet, d v s både EI och ESI bildas. Hämmaren låser fast substratet. (Ex. – blyförgiftning)

Question 20

Vad menas med non-kompetitiv hämning (specialfall? Vad händer med Km och Vmax?

Answer 20

När EI bildas binder S lika bra,förmågan för inhibitorn att binda in är exakt samma även om substrat bundit in eller inte. Konstant Km värde, sänkt Vmax.

Question 21

Vad menas med irreversibel inhibering? Ge exempel.

Answer 21

Hämmare binder permanent till enzymet genom kovalenta bindningar eller väldigt stabila icke-kovalenta bindningar. T ex pencilin på glykopeptid- transeptidas.

Question 22

Vad gör serineproteaser, active site som innehåller aminosyrn serine?

Answer 22

Enzymer i denna familj, serinproteaser, katalyserar samma reaktion: klyvning av en peptidbindning.

Question 23

Vad menas med steady-state-tillstånd?

Answer 23

Enzymet är alltid mättat med substrat under det sk steady-state-tillståndet, där konc. av ES-komplexet är konstant.

Question 24

Enzymer regleras av bl a allosterism. Vad är alloster?

Answer 24

Alloster- små bindningar bryts och bildas om

Det är positiv modulator för att aktivera enzymet.

Question 25

Vad är kompartmentalisation?

Answer 25

Man lagrar enzymer i specifika delar, vilket kan hålla dem borta från att göra skada eller ge rätt förutsättningar för aktivitet.

Question 26

När större protein, mer än 50 kDalton, ska in i cellkärnan, vad drar in den?

Answer 26

Importin binder till proteinet, och RAN/GDP drar med sig proteinet in.

Question 27

Hur binder importin till proteinet?

Answer 27

Cargo som är vårt protein, har en NLS. Importin, finns både alfa och beta, de binder till specifika NLS:er.

Question 28

Vad är GEF?

Answer 28

Guanin nukleotid exchange factor, byter ut GDP till GTP hos RAN.

Question 29

Vad är GAP?

Answer 29

GTPase-activating protein, som hydrolyserar GTP till GDP och då släpps importin, och RAN/GDP återbildas.