Cellmembran struktur Flashcards

1
Q

Vad består membranen mest av?

A

protein, polära lipider, och kolhydrater i form av glykoproteiner och glykolipider.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Hur har vissa nervcellers ett myelin hölje?

A

Deras plasmamembran är utsträck och slår in cellen många gånger, vilket fungerar som en elektrisk isolator ( =leder inte ström)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Vad består myelinet mest av till skillnad från bakteriers, mitokondria och kloroplasters membran?

A

Myelinet består mest av lipider, medan de andra nämnda har mer protein än lipider,

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Vad består råttors hepatocyter plasmamembran mest av? Säg de fem största från 1 -5

A
  1. Kolesterol 2. fosfatidylkoliner 3. Sfingolipider 4. Mindre lipider 5. fosfoatidyletanolamin
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Vad besår vårt plasmamembran av, säg de tre största:

A

% i vikt:
30 % protein, 30% fosfolipider, 19% sterol (kolesterol),

( sen finns det andra lipider t ex galaktolipider, plasmalogens)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Vilka roller har de ytliga glykoproteiner i plasmamembranet?

A

Socker-delen av yt-glykoproteiner påverkar veckningen av proteiner, deras stabilitet och intracellulär destination, och de spelar en betydande roll när ligander binder specifikt till receptorer

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Vilka laddningar är membranen permeabla för?

A

De är permeabla för icke-polära blandningar, men icke-permeabla för de flesta polära eller laddade lösningar.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Hur är membranets dubbellager uppbyggt?

A

Fosfolipider där de icke-polära delarna av lipiden i de båda lagrena, går mot insidan och de polära huvudgrupperna utåt.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Hur är proteiner inbäddade i detta dubbellager?

A

De håls genom hydrofoba interaktioner mellan membran-lipiderna och hydrofoba domän i proteinet.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Hur kan lipider och protein i membranet var rörlig och göra så protein ligger assymetriskt?

A
Eftersom de flesta interaktioner mellan delarna är icke-kovalenta, så lipider och protein kan röra sig fritt.
Finns flippase (flyttar fosfatidylinositol?) , floppase(flyttar fosfatidylkolin?) och scramblase, som flyttar lipider hursomhelst?
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Vad får lipiderna att lägga sig i dubbellager i vatten?

A

Hydrofoba interaktioner bland lipider får de hydrofila utåt och hydrofoba inåt.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Tre typer av lipid-aggregat kan formas när amfipatiska (molekyler med motsatta löslighettendenser) lipider mixas i vatten, vilka?

A

Miceller, två-dimensionellt dubbellager och vesiklar.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Vad är micell och när är det gynnsamt att skapa en?

A

Amfipatiska molekyler som lägger sig med hydrofoba delar agreggerade i det inre, där vatten är exkluderat, och deras hydrofila huvud ut måt vatten. Denna form är gynnad när huvudgruppens kross-sektions area är större än acylgruppens sidokedj-a/or, te x hos fria fettsyror, lysfosfolipider (fosfolipider utan en fettsyra, och tvättmedel som t ex natriumdodecylsulfat,

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

När är två-dimensionellt dubbelagret gynnat?

A

När huvudgruppens kross-sektions area är likt acylgruppen sidokedj-a/or, t ex hos glycerofosfolipider och sfingolipider.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Varför är två-dimensionellt dubbelagret relativt ostabilt (labilt).

A

Deras hydrofoba delar är i kontakt med vatten på kanterna och kan spontant veckas bakå och bilda en ytlig sfär (klot), en vesikel

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Det finns tre typer protein som har olika association med membranet, vilka?

A

Integrala membran-protein. Perifer membran- protein.

Amfitrofiska protein, (de finns även i cytosol)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Hur är integrala membran-protein associerade (bundna) med membran?

A

Associerat med dubbellager, resultat av hydrofoba interaktioner mellan membran-lipider och hydrofoba domän på proteinet

Dessa tas bara bort av agenter som ingriper i hydrofoba interaktioner, t ex rengöringsmedel eller denatueringar.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

Hur är perifera membran-protein associerade (bundna) med membran?

A

Genom elektrostatiska interaktioner och vätebindningar med hydrofila delar av integral-protein och med de polära huvudgrupperna av membran-lipiderna.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

Hur kan perifera membran-protein bli utsläppta?

A

åtgärder som interagerar med de elektrostatisa interaktionerna eller bryter vätebidningarna: en vanlig agent är karbonat vid hög pH.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

Hur är amfitrofiska protein associerade (bundna) med membran?

A

I vissa fall proteinets icke-kovalenta interaktion med ett membran- protein eller lipid,

ibland en eller fler lipider kovalent fäst till det amfitrofiska proteinet.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

Hur är amfitrofiska proteins reversibla association med membranet?

A

Den är reglerad (generellt), t ex fosforylering eller bindande av ligand kan tvinga en konformation ändring i proteint, och öppnar upp ett membran-bindande säte

22
Q

Vad menas med glukosylering?

A

Glykosylering är då kolhydrater (till exempel socker) tillfogas ett protein

23
Q

Glykoproteins glykosylerade delar finns i plasmamembran alltid?

A

I den extracellulära ytan av dubbellagret.

24
Q

Integrala proteins starka fäste till membranet är ett resultat av hydrofoba interaktioner mellan membran-lipider och hydrofoba domän på proteinet. Var finns de hydrofoba domänen?

A
  • En del protein har en ensam hydrofobisk sekvens i mitten (som i glykoforin) eller på amin-(N-terminal) eller karboxyl terminalen (C).
  • Andra har flera hydrofoba sekvenser, och när det är en alfa-helix konformation, är den tillräckligt lång att spänna över hela dubbellagret.
25
Vad är speciellt med proteinet bacteriorhodopsin?
Den har sju väldigt hydrofob interna sekvenser som krossar dubbellagret 7 gånger.
26
Vad är bacteriorhodopsin för nåt?
En ljus-driven proton pump som finns i det lilla membranet hos bakterien Halobacterium salinarum.
27
Hur fäster proteinet bacteriorhodopsin, vilket är vanligt bland proteiner, i membranet?
Proteinet fäster i membranet genom hydrofoba interaktioner mellan de icke-polära aminosrorna och fettsyra acetyl-grupperna av membran-lipiderna.
28
Vad är ringformiga (annular) lipider?
De formar ett dubbellager runt protein, (ungefär som fosfolipider i dubbellager). Dessa fosfolipider ligger på proteinet yta,och deras huvudgrupp interagerar med polära aminosyror på inre och yttre membran-ytan, och deras sidokedjor bundna med icke-polära rester (residues).
29
Hur lång måste en alfa-helix sekvens vara för att spänna över hela dubbellagret, som är 30 Å. En alfa-helix är 1,5 Å per aminosyrarest.
Enligt uträkning 30/1,5 = måste alfa-helix sekvens vara 20 rester, men man säger 20-25 rester.
30
En polypeptidkedja i membranet, omgiven av lipider och utan vattenmolekyler att interagera med, tenderar att forma sig?
Inga vattenmolekyler att bilda vätebindningar med, kommer kedjan tendera att forma sig som alfa-helixar eller Beta-flak, i vilka intra-kedje-vätebindningar är maximerade.
31
Om en helix alla aminosyrors sidokedjor är ickepolära, i membranet, hur påverkar det formen?
Hydrofoba interaktioner med omgivande lipider stabilisera helixen ännu mer
32
Vad menas med en exorgon reaktion?
Är en spontan reaktion, vilket betyder att ändringen i fri energi är negativ. Den ger alltså energi till omgivningen. Tex när väte och syre reagerar och bildar vatten.
33
Vad menas med endorgon reaktion?
En icke-spontan reaktion, kräver arbete för att gå. Tex när vatten sönderdelas till väte och syre
34
Vilka aminosyror är exorgoniska?
Aminosyrarester som är laddade eller polära, (sidogruppen bestämmer ju bl a egenskapen)
35
Vilka aminosyror är endergoniska?
De med aromatiska eller alifatiska kolväte sidokedjor.
36
Man mäter ett transmembran-proteins polaritet av dess aminosyrasekvens genom ett hydropatiskt index, där man mäter ändringen i fria energin när en aminosyras sidokedja går från en hydrofobisk lösning till vatten. Hur mäter man?
Man mäter i fönster i 7-20 rester. Man ritar ut resten i mitten, t ex nummer 4 vid 1-7 rester. En region med mer än 20 rester med hög hydropatiskt index tros vara ett transmembran segment, (Det var ju så många som krävdes för att gå igenom hela membranet)
37
När protein har flera helikal -regioner som är membran-täckande, kallas de?
Integrala protein typ 3 eller typ 4. | T ex glykoforin och bacteriorhodopsin.
38
Vad är speciellt med transmembran-proteinen Tyrosin (Trp) och Tryptofan (Trp).
De finns i gränsytan mellan lipider och vatten. Deras sidokedjor kan interagera med både de centrala lipiderna och det vattniniga på både sidor av membranet.
39
Generell dubbellager-regel av aminosyrors plats är den positiva-insida regeln?
De positivt laddade Lys, His och Arg är mer vanliga i den cytoplasmatiska sidan av membranet.
40
När bildas Beta tunnor av membranprotein, vanliga hos bakterier?
När 20 eller fler transmembran-segment formar Beta flask som lägger sig som en cylinder. Utan vattenmolekyler maximeras deras intra-kedje vätebindningar, (precis som alfa helix)
41
Vad är poriner?
Protein som tillåter visa polära lösningar korsa det yttre membranet av gram-negativa bakterier, t ex E.coli, vilka har många Beta-tunnor som täcker den polära transmembran-passagen.
42
Hur många rester i en Beta konformation krävs för spänna över membranet?
Bara 7 till 9 stycken, polypeptidkedjan i Betakonformation är mer utrsträckt än i en alfa-helix.
43
Vad är speciellt med Beta strängar av membran-protein?
Varanan rest i det membran-täckande segmentet är hydrofobt och interagerar med det dubbellagrets lipider. De andra rester kan vara, men behöver inte, vara hydrofila. Aromatiska sidokedjor är vanliga i gränsytan lipid/protein.
44
En del membran-protein innehåller en eller flera kovalent bundna lipider, vilka typer kan det vara?
- Långa kedjor med fettsyror. - Terpenoider (ibland kallade isoprenoider). - steroler (eller steroidalkoholer) - derivat av fosfatidylinotisol.
45
Vad hjälper det ganska svaga fästet av proteinet till lipider i membranet?
Många protein är fästa till mer än en lipid. Andra interaktioner kan hjälpa, som joniska attraktioner mellan positivt laddad Lysin i proteinet och negativt laddade lipid-huvudgrupper.
46
Vad är GPI-protein.
Det är glykosylfosfatidylinositol-kopplade proteiner (GPI). De är intergrala protein och finns bara på det extracellulära membranet.
47
Glykoproteiner i membranet är orienterade så deras oligosackarid-bärande domän finns?
På den extracellulära ytan
48
Hur är fettsyror uppbyggda?
De består av ogrenad kolväte-kedja med en terminal karboxylgrupp. Strukturella lipider och triglycerider har lång-kedja fettsyror, vilket innebär 14 eller fler kol.
49
Vad innehåller omättade fettsyror?
De innehåller en eller fler dubbelbindningar.
50
Vad är sfingolipider?
Är derivat av ceramid, vilket formas av esterfikation av en fett-acyl med singosin som aminogrupp. Olika sfingolipider finns beroende på den fuktionella gruppen till den terminala hydroxylgruppen av ceramid. Sfingolipider finns främst i den vita märgen i CNS.
51
Sfingomyelin?
Fosforylkolin fäst till ceramid. Finns i cellmembran, t ex nervvävnad, blodceller. Är med i signal-överföring.