Cellmembran struktur Flashcards

1
Q

Vad består membranen mest av?

A

protein, polära lipider, och kolhydrater i form av glykoproteiner och glykolipider.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Hur har vissa nervcellers ett myelin hölje?

A

Deras plasmamembran är utsträck och slår in cellen många gånger, vilket fungerar som en elektrisk isolator ( =leder inte ström)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Vad består myelinet mest av till skillnad från bakteriers, mitokondria och kloroplasters membran?

A

Myelinet består mest av lipider, medan de andra nämnda har mer protein än lipider,

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Vad består råttors hepatocyter plasmamembran mest av? Säg de fem största från 1 -5

A
  1. Kolesterol 2. fosfatidylkoliner 3. Sfingolipider 4. Mindre lipider 5. fosfoatidyletanolamin
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Vad besår vårt plasmamembran av, säg de tre största:

A

% i vikt:
30 % protein, 30% fosfolipider, 19% sterol (kolesterol),

( sen finns det andra lipider t ex galaktolipider, plasmalogens)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Vilka roller har de ytliga glykoproteiner i plasmamembranet?

A

Socker-delen av yt-glykoproteiner påverkar veckningen av proteiner, deras stabilitet och intracellulär destination, och de spelar en betydande roll när ligander binder specifikt till receptorer

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Vilka laddningar är membranen permeabla för?

A

De är permeabla för icke-polära blandningar, men icke-permeabla för de flesta polära eller laddade lösningar.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Hur är membranets dubbellager uppbyggt?

A

Fosfolipider där de icke-polära delarna av lipiden i de båda lagrena, går mot insidan och de polära huvudgrupperna utåt.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Hur är proteiner inbäddade i detta dubbellager?

A

De håls genom hydrofoba interaktioner mellan membran-lipiderna och hydrofoba domän i proteinet.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Hur kan lipider och protein i membranet var rörlig och göra så protein ligger assymetriskt?

A
Eftersom de flesta interaktioner mellan delarna är icke-kovalenta, så lipider och protein kan röra sig fritt.
Finns flippase (flyttar fosfatidylinositol?) , floppase(flyttar fosfatidylkolin?) och scramblase, som flyttar lipider hursomhelst?
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Vad får lipiderna att lägga sig i dubbellager i vatten?

A

Hydrofoba interaktioner bland lipider får de hydrofila utåt och hydrofoba inåt.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Tre typer av lipid-aggregat kan formas när amfipatiska (molekyler med motsatta löslighettendenser) lipider mixas i vatten, vilka?

A

Miceller, två-dimensionellt dubbellager och vesiklar.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Vad är micell och när är det gynnsamt att skapa en?

A

Amfipatiska molekyler som lägger sig med hydrofoba delar agreggerade i det inre, där vatten är exkluderat, och deras hydrofila huvud ut måt vatten. Denna form är gynnad när huvudgruppens kross-sektions area är större än acylgruppens sidokedj-a/or, te x hos fria fettsyror, lysfosfolipider (fosfolipider utan en fettsyra, och tvättmedel som t ex natriumdodecylsulfat,

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

När är två-dimensionellt dubbelagret gynnat?

A

När huvudgruppens kross-sektions area är likt acylgruppen sidokedj-a/or, t ex hos glycerofosfolipider och sfingolipider.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Varför är två-dimensionellt dubbelagret relativt ostabilt (labilt).

A

Deras hydrofoba delar är i kontakt med vatten på kanterna och kan spontant veckas bakå och bilda en ytlig sfär (klot), en vesikel

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Det finns tre typer protein som har olika association med membranet, vilka?

A

Integrala membran-protein. Perifer membran- protein.

Amfitrofiska protein, (de finns även i cytosol)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Hur är integrala membran-protein associerade (bundna) med membran?

A

Associerat med dubbellager, resultat av hydrofoba interaktioner mellan membran-lipider och hydrofoba domän på proteinet

Dessa tas bara bort av agenter som ingriper i hydrofoba interaktioner, t ex rengöringsmedel eller denatueringar.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

Hur är perifera membran-protein associerade (bundna) med membran?

A

Genom elektrostatiska interaktioner och vätebindningar med hydrofila delar av integral-protein och med de polära huvudgrupperna av membran-lipiderna.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

Hur kan perifera membran-protein bli utsläppta?

A

åtgärder som interagerar med de elektrostatisa interaktionerna eller bryter vätebidningarna: en vanlig agent är karbonat vid hög pH.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

Hur är amfitrofiska protein associerade (bundna) med membran?

A

I vissa fall proteinets icke-kovalenta interaktion med ett membran- protein eller lipid,

ibland en eller fler lipider kovalent fäst till det amfitrofiska proteinet.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

Hur är amfitrofiska proteins reversibla association med membranet?

A

Den är reglerad (generellt), t ex fosforylering eller bindande av ligand kan tvinga en konformation ändring i proteint, och öppnar upp ett membran-bindande säte

22
Q

Vad menas med glukosylering?

A

Glykosylering är då kolhydrater (till exempel socker) tillfogas ett protein

23
Q

Glykoproteins glykosylerade delar finns i plasmamembran alltid?

A

I den extracellulära ytan av dubbellagret.

24
Q

Integrala proteins starka fäste till membranet är ett resultat av hydrofoba interaktioner mellan membran-lipider och hydrofoba domän på proteinet. Var finns de hydrofoba domänen?

A
  • En del protein har en ensam hydrofobisk sekvens i mitten (som i glykoforin) eller på amin-(N-terminal) eller karboxyl terminalen (C).
  • Andra har flera hydrofoba sekvenser, och när det är en alfa-helix konformation, är den tillräckligt lång att spänna över hela dubbellagret.
25
Q

Vad är speciellt med proteinet bacteriorhodopsin?

A

Den har sju väldigt hydrofob interna sekvenser som krossar dubbellagret 7 gånger.

26
Q

Vad är bacteriorhodopsin för nåt?

A

En ljus-driven proton pump som finns i det lilla membranet hos bakterien Halobacterium salinarum.

27
Q

Hur fäster proteinet bacteriorhodopsin, vilket är vanligt bland proteiner, i membranet?

A

Proteinet fäster i membranet genom hydrofoba interaktioner mellan de icke-polära aminosrorna och fettsyra acetyl-grupperna av membran-lipiderna.

28
Q

Vad är ringformiga (annular) lipider?

A

De formar ett dubbellager runt protein, (ungefär som fosfolipider i dubbellager).
Dessa fosfolipider ligger på proteinet yta,och deras huvudgrupp interagerar med polära aminosyror på inre och yttre membran-ytan, och deras sidokedjor bundna med icke-polära rester (residues).

29
Q

Hur lång måste en alfa-helix sekvens vara för att spänna över hela dubbellagret, som är 30 Å. En alfa-helix är 1,5 Å per aminosyrarest.

A

Enligt uträkning 30/1,5 = måste alfa-helix sekvens vara 20 rester, men man säger 20-25 rester.

30
Q

En polypeptidkedja i membranet, omgiven av lipider och utan vattenmolekyler att interagera med, tenderar att forma sig?

A

Inga vattenmolekyler att bilda vätebindningar med, kommer kedjan tendera att forma sig som alfa-helixar eller Beta-flak, i vilka intra-kedje-vätebindningar är maximerade.

31
Q

Om en helix alla aminosyrors sidokedjor är ickepolära, i membranet, hur påverkar det formen?

A

Hydrofoba interaktioner med omgivande lipider stabilisera helixen ännu mer

32
Q

Vad menas med en exorgon reaktion?

A

Är en spontan reaktion, vilket betyder att ändringen i fri energi är negativ. Den ger alltså energi till omgivningen. Tex när väte och syre reagerar och bildar vatten.

33
Q

Vad menas med endorgon reaktion?

A

En icke-spontan reaktion, kräver arbete för att gå. Tex när vatten sönderdelas till väte och syre

34
Q

Vilka aminosyror är exorgoniska?

A

Aminosyrarester som är laddade eller polära, (sidogruppen bestämmer ju bl a egenskapen)

35
Q

Vilka aminosyror är endergoniska?

A

De med aromatiska eller alifatiska kolväte sidokedjor.

36
Q

Man mäter ett transmembran-proteins polaritet av dess aminosyrasekvens genom ett hydropatiskt index, där man mäter ändringen i fria energin när en aminosyras sidokedja går från en hydrofobisk lösning till vatten. Hur mäter man?

A

Man mäter i fönster i 7-20 rester. Man ritar ut resten i mitten, t ex nummer 4 vid 1-7 rester.
En region med mer än 20 rester med hög hydropatiskt index tros vara ett transmembran segment, (Det var ju så många som krävdes för att gå igenom hela membranet)

37
Q

När protein har flera helikal -regioner som är membran-täckande, kallas de?

A

Integrala protein typ 3 eller typ 4.

T ex glykoforin och bacteriorhodopsin.

38
Q

Vad är speciellt med transmembran-proteinen Tyrosin (Trp) och Tryptofan (Trp).

A

De finns i gränsytan mellan lipider och vatten. Deras sidokedjor kan interagera med både de centrala lipiderna och det vattniniga på både sidor av membranet.

39
Q

Generell dubbellager-regel av aminosyrors plats är den positiva-insida regeln?

A

De positivt laddade Lys, His och Arg är mer vanliga i den cytoplasmatiska sidan av membranet.

40
Q

När bildas Beta tunnor av membranprotein, vanliga hos bakterier?

A

När 20 eller fler transmembran-segment formar Beta flask som lägger sig som en cylinder.
Utan vattenmolekyler maximeras deras intra-kedje vätebindningar, (precis som alfa helix)

41
Q

Vad är poriner?

A

Protein som tillåter visa polära lösningar korsa det yttre membranet av gram-negativa bakterier, t ex E.coli, vilka har många Beta-tunnor som täcker den polära transmembran-passagen.

42
Q

Hur många rester i en Beta konformation krävs för spänna över membranet?

A

Bara 7 till 9 stycken, polypeptidkedjan i Betakonformation är mer utrsträckt än i en alfa-helix.

43
Q

Vad är speciellt med Beta strängar av membran-protein?

A

Varanan rest i det membran-täckande segmentet är hydrofobt och interagerar med det dubbellagrets lipider. De andra rester kan vara, men behöver inte, vara hydrofila.
Aromatiska sidokedjor är vanliga i gränsytan lipid/protein.

44
Q

En del membran-protein innehåller en eller flera kovalent bundna lipider, vilka typer kan det vara?

A
  • Långa kedjor med fettsyror.
  • Terpenoider (ibland kallade isoprenoider).
  • steroler (eller steroidalkoholer)
  • derivat av fosfatidylinotisol.
45
Q

Vad hjälper det ganska svaga fästet av proteinet till lipider i membranet?

A

Många protein är fästa till mer än en lipid.
Andra interaktioner kan hjälpa, som joniska attraktioner mellan positivt laddad Lysin i proteinet och negativt laddade lipid-huvudgrupper.

46
Q

Vad är GPI-protein.

A

Det är glykosylfosfatidylinositol-kopplade proteiner (GPI). De är intergrala protein och finns bara på det extracellulära membranet.

47
Q

Glykoproteiner i membranet är orienterade så deras oligosackarid-bärande domän finns?

A

På den extracellulära ytan

48
Q

Hur är fettsyror uppbyggda?

A

De består av ogrenad kolväte-kedja med en terminal karboxylgrupp. Strukturella lipider och triglycerider har lång-kedja fettsyror, vilket innebär 14 eller fler kol.

49
Q

Vad innehåller omättade fettsyror?

A

De innehåller en eller fler dubbelbindningar.

50
Q

Vad är sfingolipider?

A

Är derivat av ceramid, vilket formas av esterfikation av en fett-acyl med singosin som aminogrupp. Olika sfingolipider finns beroende på den fuktionella gruppen till den terminala hydroxylgruppen av ceramid. Sfingolipider finns främst i den vita märgen i CNS.

51
Q

Sfingomyelin?

A

Fosforylkolin fäst till ceramid. Finns i cellmembran, t ex nervvävnad, blodceller. Är med i signal-överföring.